文章信息
- 彭瑾瑜, 陈曦, 贺健梅, 郑军, 覃碧云, 江洋. 2014.
- Peng Jinyu, Chen Xi, He Jianmei, Zheng Jun, Qin Biyun, Jiang Yang. 2014.
- 白细胞介素-28B和平衡性核苷转运载体1基因多态性与HIV/HCV合并感染者HCV自发清除的关系研究
- Relationship between interleukin 28B, equilibrative nucleoside transporters 1 gene polymorphisms and spontaneous clearance of HCV in HIV/HCV co-infectors
- 中华流行病学杂志, 2015, 36(4): 379-382
- Chinese Journal of Epidemiology, 2015, 36(4): 379-382
- http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2015.04.018
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文章历史
- 投稿日期:2014-10-09
研究显示,白细胞介素-28B(IL-28B)基因的一研究显示,白细胞介素-28B(IL-28B)基因的一些单核苷酸多态性(SNP)位点与HCV 感染者的 HCV自发清除、慢性感染和治疗效果密切关联[1, 2, 3]。 细胞膜上的一种载体蛋白-平衡性核苷转运载体1 (equilibrative nucleoside transporters 1,ENT1)对利 巴韦林在肝细胞中的转运和摄入起重要作用,ENT1基因多态性可能影响抗HCV治疗效果[4]。
HIV/HCV 合并感染已成为艾滋病患者死亡的 主要原因之一[5]。本研究对湖南省HIV/HCV 合并 感染者IL-28B和ENT1 基因多态性进行研究。
对象与方法1. 研究对象:湖南省HIV-1/HCV 合并感染者, 共107 例。将研究对象分为两组:①慢性丙肝组:诊 断标准符合卫生部颁布的《丙型病毒性肝炎诊断标 准》(WS 213-2008),HCV 抗体阳性超过6 个月, HCV-RNA 仍为阳性。②自发清除组:HCV抗体阳 性,而HCV-RNA阴性,没有慢性丙肝病史。两组均 未接受干扰素联合利巴韦林抗病毒及抗反转录病毒 治疗。同时收集两组人群人口学、感染途径、肝功 能、CD4+T淋巴细胞资料。
2. 实验室检测:收集两组研究对象EDTA抗凝 血,检测CD4+T 淋巴细胞后分离血浆和淋巴细胞富 集液,-70 ℃保存待检。
(1)HCV抗体检测:用酶联免疫吸附试验检测, 试剂为珠海丽珠试剂股份有限公司的HCV抗体诊 断试剂盒。
(2)HCV核酸定量和基因分型:采用实时荧光 定量PCR 方法检测,检测下限为15 IU/ml。试剂由 上海复星长征医学科学有限公司提供,仪器为美国 ABI公司的7500Fast荧光定量PCR仪。
(3)IL-28B和ENT1 基因多态性分析:采用德国 Qiagen 公司的全血DNA 提取试剂盒提取基因组 DNA,利用多重PCR 扩增目的基因、多重连接酶检 测反应连接基因片段,测序,然后对IL-28B基因的3 个SNPs 位点(rs12980275、rs12979860 和rs8099917) 和ENT1 基因的1 个SNP 位点(rs760370)进行分 型。引物rs12980275(FP:5′-CTA TTA ACC CCT CCC GCT AC-3′和RP:5′-ATG AGG TGC TGA GAG AAG TC-3′);rs12979860(FP:5′- TCG TGC CTG TCG TGT ACT GA-3′和RP:5′-AGC GCG GAG TGC AAT TCAAC-3′);rs8099917(FP:5′-CAA TTT GTC ACT GTT CCT CC-3′和RP:5′-ACT GTA TAC AGC ATG GTT CC-3′);rs760370(FP: 5′- TTG AGG GAA CGT GTA TGG TG -3′和RP: 5′- CCA AGC TTA CTT GGG TGG AG -3′)。PCR 反应条件:95 ℃ 2 min;94 ℃ 30 s,53 ℃ 1 min, 65 ℃ 30 s,35 个循环;65 ℃ 10 min。
(4)CD4+T 淋巴细胞计数:采用美国BD公司生 产的FACSCalibur流式细胞仪和相关试剂。
3. 统计学分析:用SPSS 19.0 软件处理数据,计 量资料用x±s 表示,采用t 检验;计数资料用χ2检验, 以P<0.05 为差异具有统计学意义,理论频数<5 时 使用Fisher 精确检验。对样本人群中IL-28B 和 ENT1 基因的SNPs进行H-W遗传平衡分析使用χ2检 验。SNPs 间的连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)用Haploview 4.2软件分析[6]。
结果1. 一般特征:107 例HIV/HCV合并感染者中,男 性83 例,女性24 例,年龄为(36.84±7.2)岁,平均 CD4+T淋巴细胞数为(282.0±196.7)cells/μl,主要为 静脉吸毒途径感染(83 例,占77.5%)。其中慢性肝 炎组80 例,自发清除组27 例,两组年龄、性别、 CD4+T淋巴细胞数和感染途径差异无统计学意义, 肝功能指标ALT和AST差异有统计学意义,总胆红 素(Total Bilirubin,TB)和血小板(Platelet,PLT)差异 无统计学意义。慢性肝炎组的平均HCV-RNA (log10)含量为5.90 IU/ml,其中18 例为HCV 基因1 型感染,见表 1。
2. IL-28B和ENT1 基因SNPs 位点H-W遗传平 衡分析:107 例HIV/HCV 合并感染者中,rs12980275 位点AA型90 例(84.1%),AG型15 例(14.0%),GG 型2 例(1.9% );rs12979860 位点CC 型90 例 (84.1%),CT 型16 例(15.0%),TT 型1 例(0.9%);rs8099917 位点TT 型90 例(84.1%),TG 型16 例 (15.0%),GG型1 例(0.9%);rs760370 位点AA型60 例(56.1%),AG 型39 例(36.4%),GG 型8 例 (7.5%)。H-W遗传平衡检验显示,慢性肝炎组和自 发清除组均P>0.05,4 个基因型频率符合遗传平衡 法则,分布均匀,具有群体代表性。
3. IL-28B和ENT1 基因的SNPs 与HCV自发清 除的相关性分析:对慢性肝炎组和自发清除组 IL-28B 基因的3 个SNPs 位点rs12980275、 rs12979860 及rs8099917 的基因型和3 者的单体型 (AA,CC,TT)进行比较,均P<0.05,差异有统计学 意义,在自发清除组中rs12980275 位点的AA 基因 型、rs12979860 位点的CC基因型、rs8099917 位点的 TT 基因型以及3 者的单体型(AA,CC,TT)频率均 为100%,高于慢性肝炎组,差异有统计学意义。而 rs760370 的基因型在两组间差异无统计学意义,P> 0.05,见表 2。
4. IL-28B 和ENT1 基因4 个SNPs 的LD 分析: 在IL-28B 基因3 个位点rs12980275、rs12979860 和 rs8099917 的基因型分别以AA、CC 和TT 为主, rs12980275 和rs12979860、rs12980275 和rs8099917 的r2=0.94,rs12979860 和rs8099917 的r2=1.00,3 个 位点间存在高度LD。ENT1 基因的rs760370 位点与 这3个位点的r2远小于0.50,LD程度低,见图 1。
讨论本研究显示,湖南省HIV/HCV合并感染人群的 IL-28B的rs12980275、rs12979860 和rs8099917 主要基因型分别为AA、CC和TT型,均占84.1%,次要基 因型分别为AG/GG、CT/TT 和TG/GG。在HCV 自 发清除组,3 个SNPs 位点均为主要基因型,未发现 其他基因型。而在慢性肝炎组,主要基因型频率 均<80%,提示IL-28B的rs12980275、rs12979860 和 rs8099917 主要基因型(AA、CC 和TT 型)可能与 HCV自发清除相关。本研究还显示,IL-28B基因的 3 个SNPs 存在着高度LD(r2>0.94),提示可选择某 个位点作为标签SNP预测HCV感染后的转归。
国内外关于中国人群的IL-28B基因型分布与 本研究稍有所不同[1, 7, 8, 9]。Thomas 等[1]发现在华裔人 群中rs12979860 的CC 基因型约占93.6%~97.5%, 而非洲裔人群只占23.1%~54.8%。而Rao 等[8]发现 在中国河北省有偿献血人群中rs12980275 的AA基 因型和rs8099917 的TT 基因型分别占86.0% 和 86.7%,与本研究基本一致,但是rs12979860 的CC 基因型只占48.5%,远低于本研究数据,可能与研究 人群来源、地区和种族等因素有关。Rao等[8]的研究 显示,rs12980275、rs12979860 和rs8099917 呈现高度 LD,与本研究一致。国外对HCV感染人群进行全 基因组关联分析,研究发现宿主基因IL-28B变异在 HCV 感染后的自发清除方面起到关键作用[1, 10, 11, 12]。 Rauch 等[11]对347 例HCV 自发清除者和1 015 例慢 性HCV 感染患者研究显示,在IL-28B 附近有7 个 SNPs 位点与HCV自发清除相关,最有意义的能强 烈预测HCV自发清除的位点是rs8099917。IL-28B 编码的干扰素-λ3 主要功能包括抗病毒、抗细胞增 值和调节适应性免疫应答,而IL-28B基因编码区上 游的位点rs12980275、rs12979860 和rs8099917 的主 要基因型携带者有较高的HCV自发清除率,一般认 为在DNA的启动子或增强子附近位点对基因转录 有很大影响,推测这3 个SNPs 可能影响了IL-28B基因的表达水平,从而影响宿主干扰素-λ的合成有 关。但是本研究也发现,即使在IL-28B基因的3 个 SNPs 的主要基因型中,也只有30.0%(27/90)的携带 者发生了HCV自发清除,所以不能只依靠基因多态 性进行HCV感染后转归预测,应结合病毒基因型、 病毒载量、种族、临床症状等进行综合评判。
Morello 等[4]发现ENT1 基因rs760370 位点的 GG基因型更容易获得抗HCV治疗的快速应答。但 在本研究中,rs760370 的基因型分布在慢性肝炎组 和自发清除组中的差异无统计学意义,提示其与 HCV自发清除无关。
对于HIV/HCV 合并感染者来说,首先进行抗 HIV 治疗还是抗HCV治疗一直存在争议。在HCV 单独感染者有20%~30%会发生自发清除[13],本研 究中也有25.2%(27/107)的HIV/HCV合并感染者发 生了HCV自发清除,提示即使感染了HIV,HCV感 染仍有一定比例自愈,所以应进一步开展研究,比较 HIV/HCV合并感染者和HCV单独感染者的HCV自 发清除率及影响因素。本研究显示,IL-28B基因多 态性对HCV自发清除具有很强的预测价值,建议针 对携带IL-28B次要基因型的HIV/HCV合并感染者 立即开展抗HCV 治疗,因为该人群不太可能发生 HCV自发清除,而对携带主要基因型的感染者可以 根据临床症状和CD4+T淋巴细胞数首先开展抗反转 录病毒治疗,确定HCV 无法自发清除后再进行抗 HCV治疗。
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