上海海洋大学学报  2015, Vol. 24 Issue (2): 167-173   PDF    
斑马鱼尾加压素Ⅱ受体基因组织表达的研究
胡聪聪, 吕为群     
上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306
摘要:尾加压素Ⅱ受体(Urotensin Ⅱ receptor,UT)是一种7次跨膜G蛋白偶联受体,是目前发现的具有最强收缩血管作用的尾加压素Ⅱ的特异性受体。斑马鱼中存在4种不同的UT-like基因(uts2r1,uts2r2,uts2r3uts2r4),分别位于斑马鱼4条不同染色体上。这4种uts2r基因核苷酸序列各不相同,uts2r1位于3号染色体上,其与12号染色体上的uts2r2基因蛋白序列相似度最高为47%,与6号染色体上的uts2r3和16号染色体上的uts2r4蛋白相似度分别是41.6%和33%。通过设计特异引物检测每种uts2r基因在斑马鱼成鱼各组织中的表达情况,结果显示3号染色体上的uts2r1基因在肾脏中表达量最高,6号染色体上的uts2r2基因在脊髓中表达量最高,12号染色体上的uts2r3基因在心脏中表达量最高,而16号染色体上的uts2r4基因在背肌中表达量最高。
研究亮点: 目前关于UT的研究大多都集中在12号染色体上,有关它们不同拷贝在鱼类发育过程中的生理功能和作用机制的研究还相对缺乏。本实验对斑马鱼不同拷贝uts2r在各组织中的表达进行研究,为深入研究上述基因的生理功能及调控机制提供基础资料。
关键词斑马鱼    染色体    uts2r基因    基因表达    

尾加压素Ⅱ受体(UT)最初是通过逆向药理学方法筛选出来的一种7次跨膜G蛋白偶联受体[1](G-protein coupled receptor14,GPR14),同源性比较发现与生长抑素和阿片肽受体具有很高的同源性[2]。UT有着很短的N末端,在每个跨膜结构有一个高度保守的残基,D/ERY基序(超二级结构)位于第3个跨膜结构域和第2个胞内环的交界处,NPFLY基序在第7个跨膜结构域处,在UT的胞质尾区有潜在的丝氨酸和苏氨酸磷酸化位点[3]。UT在N末端结构域有两个潜在的N糖基化位点,在第一和第二个胞外环有两个半胱氨酸残基,可能参与二硫键的形成[4]

作为UT特异性配体的UⅡ(尾加压素Ⅱ)最早是从硬骨鱼的脊髓尾部下垂体中分离出的生长抑素样环肽。UⅡ/UT系统在其他动物中的研究主要集中在平滑肌收缩[5]、心血管活性[6, 7]和自主活性[6]等方面,在鱼类中对其的研究主要集中在渗透压调节功能上[8],例如在罗非鱼中抑制催乳素的释放[9]和青鳉鱼中通过鳃上皮的NaCl转运方面[10]。越来越多的研究表明UⅡ/UT系统具有广泛的生物学功能,其中UⅡ/UT系统研究得最为透彻的作用是在正常和病理条件下对心血管系统的调节。Ca2+通路、酪氨酸激酶、p38MAPK、ERK1/2,RhoA/ROCK和PKC/CPI-17系统都参与了由UT激活诱导的缩血管效应[11, 12, 13, 14]。因此人们大胆地推测,UT活化会引起大量的钙增敏,这就能解释为什么UⅡ是迄今为止最有效的肌收缩剂。

UⅡ及其受体UT因其在人类多种疾病中的作用而成为近年来医学研究的热点,而在最先发现UⅡ的物种鱼中却少有报道,对其在鱼中的生理功能更是知之甚少。由于斑马鱼具有生殖周期短,繁殖能力强等特点[15],使其在与人类疾病相关的基因及其功能和人类疾病模型的研究中显示出重要的意义。研究表明斑马鱼中存在4种uts2r基因[16],本文主要以斑马鱼为模型,旨在研究斑马鱼中4种uts2r基因的表达,并为以后深入研究作为UⅡ受体的uts2r基因在鱼类中的生理功能打下坚实基础。

1 材料与方法 1.1 实验材料

实验动物为Tubingen 品系斑马鱼,源自中国海洋大学段存明教授实验室,培养在自动循环水养殖系统中,光照黑暗比为14∶10。胚胎通过正常交配受精获得,在28.5 ℃胚胎培养液中控光培养,分别取3条雌性成年斑马鱼的脑、眼睛、鳃、心脏、胃、肝脏、脾、肠、肾、卵巢、前脊、尾部神经系统(caudal neurosecretory system,CNSS)和背侧肌肉组织,置于RNA提取液RNAiso plus(TaKaRa)中转移至-80 ℃低温保存备用。

1.2 实验方法 1.2.1 总RNA的提取和cDNA的合成

取-80 ℃保存的样品用研磨棒于冰上研磨,参照RNAiso plus说明书抽提RNA,用DNase Ⅰ去除基因组DNA污染,所得的RNA保存于-80 ℃。利用Promega反转录系统,以总RNA为模板,oligo(dT)为引物于65 ℃反应10 min,冰上放置5 min后,加入M-MLV反转录酶和buffer、抑制剂等反转成cDNA,保存于-80 ℃冰箱备用。

1.2.2 UT生物信息学分析

斑马鱼中查找到了4种uts2r基因,分别位于3、6、12和16号染色体上,通过http://www.ensembl.org/查找到了每种序列包含的外显子、内含子情况,并对这4种序列进行了对比和同源性分析。通过DNAMAN软件,推导出其相对应的氨基酸序列,并对这4种蛋白序列进行了同源性比对。

1.2.3 qRT-PCR分析

qRT-PCR分析所用仪器为ABI 7500荧光定量PCR仪。应用primer 5.0引物设计软件根据UT基因、斑马鱼β-actin和18S rRNA序列设计特异性引物(表1)。PCR反应体系20 μL,包括cDNA模板2 μL,上下游引物各0.4 μL,SYBR ExTaq 10 μL和Rox Reference Dye Ⅱ 0.4 μL,剩下的体积用灭过菌的双蒸水补足。反应条件为95 ℃预变性30 s,95 ℃变性5 s,60 ℃延伸34 s,40个循环,PCR反应结束后,对扩增产物进行熔解曲线分析,检测反应特异性,确定产物是否是单一的目的片段,根据2-ΔΔCt计算法进行相对定量分析。

表1 基因引物序列 Tab 1. Primer pair sequences used for real-time qPCR amplifications
1.3 数据处理与统计分析

实验数据均用平均值±标准误(Mean±SE)表示,采用SPSS 17.0统计软件对指标进行分析。若有显著性差异,再用LSD法(最小差异显著法)和Duncan氏法进行多重比较,以P<0.05为显著差异;用GraphPad Prism 5.0软件作图。

2 结果 2.1 斑马鱼UT蛋白序列比对和同源性分析

根据TOSTIVINT等报道的斑马鱼4种uts2r基因,进行了生物信息学分析,结果表明斑马鱼3号染色体上uts2r1 mRNA全长1 140 bp,1 071 bp的ORF编码356个氨基酸;6号染色体上的uts2r2 mRNA全长1 505 bp,包括268 bp 5′UTR,1 020 bp ORF编码339个氨基酸,217 bp 3′UTR;12号染色体上的uts2r3 mRNA全长2 459 bp,包括388 bp 5′UTR,1 143 bp ORF编码380个氨基酸,928 bp 3′UTR;16号染色体上的uts2r4 mRNA全长1 817 bp,包括350 bp 3′UTR,1 161 bp ORF编码386个氨基酸,290 bp 3′UTR。通过http://www.ensembl.org/网站,我们查找到了3号和6号染色体上的uts2r基因均有一个外显子,无内含子序列,12号染色体上的uts2r基因有两个外显子和一个内含子序列,16号染色体上的uts2r4基因有两个剪接变异体,其中一个只有一个外显子无内含子,而另外一个有两个外显子和一个内含子(图1)。UT包含7个跨膜结构区,分别用TMD1-7表示,(E/D)RY和NPx2-3Y基序也标注在了蛋白序列对比图中(图2)。同源性分析发现:3号染色体上的UT蛋白序列与12号、6号和16号染色体上的蛋白相似度分别是47%、41.6%和33%(图3)。

图1 4组染色体上UT内含子外显子分布情况 Fig.1 Exon and intron distribution of four different UT genes on different chromosomes 白色的部分表示内含子区域,浅灰色部分表示非编码区,深灰色的部分表示蛋白编码区。
The white part represents intron region,light gray part represents the non-coding region,dark part represents the protein coding region.

图2 斑马鱼4条染色体上的UT蛋白序列对比图 Fig.2 Protein sequence aligment of zebrafish UT from four chromosomes TMD1-7表示7个跨膜结构区,实框表示E/DRY基序,虚框表示第七个跨膜结构区中的NPx2-3Y基序,深灰色表示蛋白序列完全重合,浅灰色表示蛋白序列重合度为75%。
TMD1-7 refers to UT seven transmembrane domain,solid frame is marked E / DRY motif ,virtual box represents the NPx2-3Y motif in the seventh transmembrane region,the amino acid residues that are identical are shaded in dark grey,while light gray portion indicates the degree of protein sequence overlap of 75%.

图3 4条染色体上的UT蛋白序列相似度 Fig.3 Protein sequence homology of UTs on four chromosomes
2.2 斑马鱼uts2r基因的组织表达

荧光定量PCR结果显示斑马鱼uts2r在雌性成鱼各组织中均有一定量的表达,但表达量最高的组织各不相同,其中3号染色体上uts2r基因在肾脏中表达量最高,相对于其他组织均有显著性差异(P<0.05),其次是在脑组织中表达较高,卵巢、CNSS和背肌组织之间表达量也无显著性差异,眼、鳃、心、胃、肝、脾、肠、卵巢、脊髓和背肌组织表达量无显著性差异(图4a)。6号染色体上uts2r基因在脊髓中表达量最高,其次是在卵巢、CNSS和背肌组织中表达较高,脑、眼、鳃、心、胃、肝、脾、肠组织之间表达量无显著性差异(图4b)。12号染色体上uts2r基因在心脏中表达量最高,其次是在背肌、眼和鳃组织中表达较高,脑、胃、肝、脾、肠、肾、卵巢、脊髓、CNSS组织间表达量无显著性差异(图4c)。而16号染色体上uts2r基因却在背肌中表达量最高,其次是在鳃、肾、脊髓和脑组织中表达较高,脑、鳃、肾之间表达量无显著性差异,脑、脊髓之间表达量无显著性差异,眼、心、胃、肝、脾、肠、卵巢、CNSS之间表达无显著性差异(图4d)。

图4 成年雌性斑马鱼各UT基因在不同组织中的表达谱 Fig.4 Tissue distribution of UT mRNA in adult female zebrafish 结果以平均值±标准误表示,不同的字母代表存在显著性差异(P<0.05)。
The result is expressed as mena±SE,there are significant differences between different letters (P<0.05).
3 讨论

来自斑马鱼的4个uts2r基因,分别位于不同染色体上,编码不同的氨基酸序列。有研究表明uts2r基因家族通过基因局部复制来增加家族成员[16],因此分析了斑马鱼4个uts2r基因蛋白的同源性,比对结果发现,3号染色体与12号染色体上的UT蛋白序列的相似度最高为47%,这两种uts2r基因来自同一原始uts2r的可能性最大,而与6号和16号染色体上UT蛋白序列相似度分别为41.6%和33%(图3),低同源性可能带来生理功能的分化。由于UT属于A类G蛋白偶联受体家族,这个家族有一个特性是在第7个跨膜结构域包含NPFLY基序,而3号和12号染色体上的UT恰好符合这一特性,可能3号和12号染色体上的uts2r基因在斑马鱼中作为一种A类G蛋白偶联受体发挥一定的生理作用。

在对鱼类CNSS早期的研究中发现在渗透压调节中起到了一定的作用,UⅡ作为CNSS的主要分泌物之一也必然参与到了渗透压的调节中。有研究称欧洲川鲽在海水中的血浆UⅡ浓度明显高于淡水中的UⅡ浓度,并且当将川鲽从海水转到淡水时,在鳃和肾中,UT mRNA的表达量会降低,而当鱼从淡水转入海水时,UT mRNA在肾中的表达量会升高,这些变化也与血浆中的渗透压和离子浓度的变化一致[17, 18, 19]。荧光定量PCR结果显示,3号染色体上的uts2r1基因在肾中的表达量最高,可能该基因在渗透压调节方面起着主要作用,而鳃中表达量相对较高的12号和16号染色体上的uts2r基因可能在渗透压调节中发挥着辅助作用。在大鼠、小鼠和人中,UT在脑和脊髓中有广泛的表达[20, 21],本研究结果显示,6号染色体上的uts2r2基因在脊髓和CNSS中有着高表达量,3号染色体上的uts2r1基因在脑和CNSS中表达量较高,这暗示着这两个基因可能与运动机能中的调节作用有关。UⅡ是目前发现的最强的血管收缩剂,UⅡ的收缩血管效应是直接由其特异性受体UT介导的,12号染色体上的uts2r3基因在心脏中表达量最高,表明该基因功能可能与心血管功能十分相关。而16号染色体上的uts2r4基因在肌肉中表达量最高,可能该基因与斑马鱼运动功能相关。但是这4个基因究竟在斑马鱼中发挥着单独生理作用或者共同作用来行使生理功能还需要进一步研究和验证。

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The studies of urotensin Ⅱ receptor gene expression in zebrafish tissues
HU Congcong, LÜ Weiqun     
College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China
Abstract: Urotensin Ⅱ receptor is a seven-transmembrane G protein-coupled receptor, and it is a specific receptor for urotensin Ⅱ which is the most potent mammalian vasoconstrictor to date. There are four different UT-like genes(uts2r1, uts2r2, uts2r3 and uts2r4) in zebrafish, located on four different chromosomes, while the nucleotide sequence of these uts2r gene varies, UT of chromosome 3 and chromosome 12 shared the highest homology of 47%, and shared 41.6% and 33% homology with the uts2r gene from 6th chromosome and 16th chromosome, respectively. Specific primers were designed for each gene analyzing mRNA expression of different adult fish tissues. Quantitative PCR results showed that uts2r1 gene on chromosome 3 has the highest expression level in the kidney, uts2r2 gene on chromosome 6 has the highest expression level in the spinal cord, and uts2r3 gene on chromosome 12 expressed the highest level in the heart, while the highest peak of uts2r4 mRNA on 16th chromosome expression emerged in the dorsal muscles.
Key words: zebrafish    chromosome    uts2r gene    gene expression