南京农业大学学报  2015, Vol. 38 Issue (3): 369-374   PDF    
http://dx.doi.org/10.7685/j.issn.1000-2030.2015.03.003
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马华, 程春燕, 徐建, 娄群峰, 李季, 陈劲枫. 2015.
MA Hua, CHENG Chunyan, XU Jian, LOU Qunfeng, LI Ji, CHEN Jinfeng. 2015.
黄瓜-酸黄瓜渐渗系的验证及其抗蔓枯病筛选
Verification of cucumber-sour cucumber introgression lines and screening resistant to gummy stem blight
南京农业大学学报, 38(3): 369-374
Journal of Nanjing Agricultural University, 38(3): 369-374.
http://dx.doi.org/10.7685/j.issn.1000-2030.2015.03.003

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收稿日期:2014-08-20
黄瓜-酸黄瓜渐渗系的验证及其抗蔓枯病筛选
马华, 程春燕, 徐建, 娄群峰, 李季, 陈劲枫     
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/园艺学院, 江苏 南京 210095
摘要[目的] 验证黄瓜-酸黄瓜渐渗系群体真实性,获得渐渗系中抗蔓枯病株系。[方法] 通过观察统计渐渗系群体的重要农艺性状,利用酸黄瓜特异的SSR标记检测渐渗系材料的真实性,并采用温室苗期人工接种鉴定的方法,对黄瓜-酸黄瓜种间杂交后代(86份渐渗系)群体进行苗期接种鉴定,筛选抗蔓枯病材料。[结果] 这些渐渗系在植物学性状上介于两亲本之间,具有部分野生种特有性状,如黑刺、节间短、多分枝等;SSR分子标记能在渐渗系中扩增出野生酸黄瓜的特异DNA片段,从分子水平上证实其为野生酸黄瓜与栽培黄瓜种间杂交后代;从黄瓜-酸黄瓜渐渗系群体中筛选出8份抗性材料,分别为CSIL2、CSIL41、CSIL49、CSIL52、CSIL57、CSIL58、CSIL59、CSIL72,占供试材料的9%。[结论] 通过远缘杂交培育渐渗系是拓宽作物遗传的基础,从渐渗系中筛选的8份抗性材料为开展黄瓜抗蔓枯病育种研究提供了抗源材料,同时也为黄瓜抗蔓枯病育种实践奠定了基础。
关键词黄瓜     渐渗系     蔓枯病     鉴定     SSR分子标记    
Verification of cucumber-sour cucumber introgression lines and screening resistant to gummy stem blight
MA Hua, CHENG Chunyan, XU Jian, LOU Qunfeng, LI Ji, CHEN Jinfeng     
State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement/College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China
Abstract: [Objectives] The aim of this study is to validate the introgression lines derived from the cross of cucumber and sour cucumber, and obtain materials resistant to gummy stem blight from introgression lines. [Methods] Seedlings of 86 introgression lines descended from cucumber-sour cucumber hybrids were subjected to artificial inoculation under greenhouse condition to screen for materials resistant to gummy stem blight. And agronomical traits were observed and analyzed as well. SSR specific to sour cucumber parent were used for confirming the introgression lines. [Results] The results showed that the introgression lines carryied some sour cucumber morphological traits, such as black spine, short internode and multi-branching. SSR analysis indicated that the introgression lines could amplify sour cucumber specific bands which confirmed these introgression lines containing chromosomal fragments from sour cucumber. Based on these analyses, 8 resistant materials(CSIL2, CSIL41, CSIL49, CSIL52, CSIL57, CSIL58, CSIL59, CSIL72)were selected from the cucumber-sour cucumber introgression lines, accounting for 9% of the tested materials. [Conclusions] Introgression lines descended from wide hybridization can be used to broaden the genetic base of crops, and the 8 resistant materials selected from cucumber introgression lines provide resistant resource for genetic research of gummy stem blight and breeding practices.
Keywords: cucumber     introgression line     gummy stem blight     identification     SSR markers    

黄瓜(Cucumis sativus L.)是世界十大蔬菜之一,主要分布于温带和亚热带地区。据联合国粮食与农业组织(FAO)统计,2010年中国黄瓜的栽培面积为988 680 hm2,总产量达到40.71×106 t,是世界上最大的黄瓜生产和消费国。近年来,随着设施黄瓜的不断发展,黄瓜蔓枯病(Mycosphaerella melonis)成为继根结线虫病后危害黄瓜生产的第二大病害。该病害在设施中遇高温高湿条件多发,黄瓜可减产20%左右,严重的将导致提前拉秧甚至绝收,这对黄瓜商品化生产造成严重影响[1, 2]

黄瓜遗传背景狭窄,抗病资源比较匮乏,野生种或野生近缘种在长期进化过程中积累了抗逆遗传因子,为作物遗传改良提供了良好材料[3]。通过远缘杂交获得渐渗系是拓宽植物遗传背景提高抗逆性的有效手段。自Eshed和Zamir提出了渐渗系(introgression line,IL)群体后,在番茄、拟南芥、甜瓜、莴苣、小麦、水稻、大麦等作物上[4]已相继构建了渐渗系群体。目前已报道的番茄IL群体共6个,其中利用渐渗系群体Lycopersicon pennellii经全基因组筛选后发现6个抗枯萎病位点[5];在水稻上利用渐渗系群体克隆出多个抗白叶枯病基因,如Xa 21、Xa27[6],同时利用东乡野生稻-栽培稻渐渗系阐明了高世代渐渗后代的基因组遗传变异和甲基化变化的分子机制。这充分说明渐渗系群体在挖掘、利用近缘种质资源,影响作物生长发育、产量、抗逆性等复杂性状上发挥着重要作用,同时为挖掘QTL,特别是效应较小的QTL提供了一项强有力的工具[7, 8]

黄瓜野生种Cucumis hystrix Chakr.(2n=24),是一个原产中国云南甜瓜属的珍稀野生种,经过多年多次抗性鉴定,明确该野生种对蔓枯病上具有良好的抗性[9, 10]。Chen等[11]成功实现了其与栽培黄瓜(C.sativus L.,2n=14)的种间杂交,并通过染色体加倍合成了新的异源四倍体Cucumis×hytivus。通过将该异源四倍体和栽培黄瓜‘北京截头’进行回交、自交,获得了一系列具有不同表型性状的渐渗育种材料。本试验以此渐渗系为供试材料,通过形态学统计、SSR分子标记筛选、苗期人工接种鉴定,筛选鉴定出抗蔓枯病的渐渗系材料,为黄瓜抗蔓枯病遗传研究和育种奠定基础。 1 材料与方法 1.1 供试植株

黄瓜-酸黄瓜渐渗系(野生种C.hystrix与普通栽培黄瓜‘北京截头’种间杂交后代)86份,普通栽培黄瓜‘北京截头’(感病对照),均由南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室黄瓜研究室提供。 1.2 农艺性状观察

对田间种植的黄瓜-酸黄瓜渐渗系群体农艺性状进行观察和测量,性状主要包括主节间长、分枝数、叶色、叶形、叶片长、叶片宽、叶柄长、商品瓜形、商品瓜皮色、刺色、瓜长、瓜把长以及种瓜质量。调查方法参照文献[12]1.3 SSR分析

采用CTAB法提取黄瓜叶片基因组DNA,SSR引物来自黄瓜基因组测序图谱[13],由英潍捷基(上海)贸易有限公司合成。SSR总反应体系为20 μL,包括ddH2O 12.7 μL,10×Buffer 2.0 μL,2.0 mmol · L-1,MgCl2 0.6 μL,2.5 mmol · L-1的dNTP 1.6 μL,引物各1 μL,5 U Taq DNA 0.1 μL,1 μL模板DNA。SSR扩增程序为:94℃ 5 min;94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 1 min,30个循环;72℃ 5 min,最后4℃保存。PCR扩增产物在70 g · L-1变性聚丙烯酰胺凝胶上电泳,银染检测。 1.4 接种处理 1.4.1 供试病原菌

选取本实验室前期分离纯化的强致病力蔓枯病菌菌种A1为接种病菌,PDA试管保存于4℃冰箱,由浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所培养产孢。 1.4.2 病原菌培养

将保存在4℃冰箱的蔓枯病菌活化到PDA培养基上培养,25℃暗培养7 d后进行4 d紫外灯光照处理(12 h紫外灯/12 h黑暗),诱导分生孢子产生[14]1.4.3 分生孢子悬浮液的制备

用5~10 mL无菌水冲洗病原菌培养基表面,用L型玻璃棒轻轻刮培养基表层,获得的孢子悬浮液经4层纱布过滤,除去菌丝、琼脂等杂质的孢子粗提液作为母液。用乳酸调整孢子悬浮液的pH值至3.5~4.0,在显微镜下使用血球计数板统计悬浮液的孢子数,将接种孢子浓度配制至1×106 mL-1,接种前,加入2.5 g · L-1明胶作为表面活性剂。 1.4.4 接种鉴定

2013年9月6日将供试材料播种于72孔穴盘进行育苗,每个编号播种10株,置于温度25℃、相对湿度为80%的温室中。于9月13日黄 瓜幼苗第1片真叶展平时移苗至营养钵(口径12 cm ,底径10 cm,高8 cm)中,每钵1株。待幼苗长至3~4片真叶时进行人工喷雾接种,对照植株接种无菌水。基质由草炭和蛭石(质量比为1 ∶ 1)混合而成。接种孢子悬浮液浓度为1×106 mL-1。接种后覆盖棚膜3 d,遮光密闭,保证棚内相对湿度92%~95%,温度21~25℃。接种1周后统计叶部病级,统计部位为从茎基部起4片真叶。按如下公式计算病情指数:病情指数(DI)=∑(病级×该病级株数)/(最高病级×调查总株数)×100。DI≤15为高抗(HR);15<DI≤45为抗(R);45<DI≤75为感(S);75<DI为高感(HS)。

叶片病级分级标准[15]:0级:无症状;1~2级:零星感染;3~4级:少量小斑点;5~6级:20%~50%叶面积有小斑点;7~8级:植株萎蔫且斑点超过叶面积50%;9级:植株死亡。 2 结果与分析 2.1 黄瓜-酸黄瓜渐渗系农艺性状观察

对黄瓜-酸黄瓜86份渐渗系材料进行了田间农艺性状观察,发现渐渗系性状介于两亲本之间,具有部分野生种特有性状,如黑刺、节间短、多分枝等特点。其中筛选出的8份抗性渐渗系材料部分农艺性状见表 2。由表 2可见:CSIL59主节间最长,为12.3 cm;CSIL2主节间最短,为8.3 cm;CSIL52分枝数为10,是8份材料中最接近亲本野生种酸黄瓜,具有多分枝性状;CSIL59分枝数为2,接近轮回亲本‘北京截头’,具有少分枝特点;叶色中除CSIL59颜色为黄绿,其他均为绿色;叶形中CSIL41为掌状叶形,其他均为心状五角或掌状五角叶形;商品瓜瓜形中CSIL2为卵圆形、CSIL49为短棒状、CSIL72为短圆筒,其他均为长圆筒;商品瓜瓜皮色CSIL2、CSIL58、CSIL59、CSIL72为绿色,其他4种为浅绿色;CSIL2无瓜刺,其他均为白色;瓜把长为1.4~4.9 cm,种瓜为300~1 250 g。田间农艺性状显示,该渐渗系群体中具有部分野生酸黄瓜特有的性状,说明该渐渗系为种间杂交后代,渐渗系中含有野生酸黄瓜的外源片段。

表 1 8份抗蔓枯病渐渗系材料形态学特征 Table 1 Morphology of 8 introgression lines resistant to gummy stem blight
编号Code主节间长/cmInternodelength分枝数Number ofbranches叶色Leafcolor叶形Leafshape叶片长/cmLeaflength叶片宽/cmLeafwidth叶柄长/cmPetiolelength商品瓜瓜形Goodsmelon-shaped商品瓜瓜皮色Goodsrind color瓜刺色Spinecolor瓜长/cmMelonlength瓜把长/cmCarpopodiumlength种瓜质量/gMelonsweight
酸黄瓜C.hystrix4.114墨绿Dark green心状五角Heart pentagon10.511.75.2纺锤形Fusiform绿色Green黑色Black4.60.511
北京截头Beijingjietou14.52绿Green心状五角Heart pentagon25.528.521.5长圆筒Long cylindrical墨绿Dark green白色White33.55.7550
CSIL28.38绿Green心状五角Heart pentagon22.820.114.6卵圆形Ovoid绿Green无刺Stingless17.51.4425
CSIL4110.83绿Green掌状Palmate31.026.819.1长圆筒Long cylindrical浅绿Light green白色White24.83.0500
CSIL4912.05绿Green心状五角Heart pentagon25.426.022.0短棒Short rod浅绿Light green白色White16.84.9350
CSIL5211.710绿Green掌状五角Palmate pentagon28.524.323.3长圆筒Long cylindrical浅绿Light green白色White33.02.8500
CSIL578.83绿Green心状五角Heart pentagon24.222.818.3长圆筒Long cylindrical浅绿Light green白色White28.81.91 250
CSIL5810.56绿Green心状五角Heart pentagon25.826.314.5长圆筒Long cylindrical绿Green白色White22.33.2300
CSIL5912.32黄绿Yellow green掌状五角Palmate pentagon27.826.018.2长圆筒Long cylindrical绿Green白色White24.73.1350
CSIL7211.60绿Green心状五角Heart pentagon25.425.816.8短圆筒Short cylindrical绿Green白色White21.52.5350
2.2 黄瓜-酸黄瓜渐渗系SSR分子标记鉴定

在形态学鉴定的基础上,对渐渗系群体进行了分子鉴定。利用已经公布的黄瓜染色体上995对SSR标记对双亲之间的多态性进行筛选,检测出359对标记在亲本间具有多态性,多态性比率为35.8%,其中有112对标记可在回交世代中扩增出来自酸黄瓜的特异片段,SSR标记对回交自交后代导入片段检测如图 1所示。这个结果提供了此渐渗系群体为酸黄瓜与‘北京截头’的实证,说明野生酸黄瓜的DNA片段已经通过种间杂交及回交方式将其渐渗到后代基因组中,为渐渗系的真实性提供了可靠证明。

图 1 标记16130在双亲和86份渐渗系中的扩增结果 Fig. 1 The amplification of marker 16130 in parents and 86 introgression lines M:DNA marker;H:野生酸黄瓜Sour-cucumber;C:普通栽培黄瓜‘北京截头’Cultivated cucumber‘Beijingjietou’;1~86:渐渗系Introgression lines
2.3 黄瓜-酸黄瓜渐渗系抗病鉴定

表 2可见:供试材料中未发现对蔓枯病免疫和高抗的材料,86份群体间抗性存在明显的差异,其中表现抗性的有8份,分别为CSIL2、CSIL41、CSIL49、CSIL52、CSIL57、CSIL58、CSIL59、CSIL72,占总材料9%,其中CSIL72抗病性最强(病情指数为36);表现感病的材料有64份,占总材料74%;表现高感的材料有14份,占总材料17%。

表 2 渐渗系蔓枯病的抗性 Table 2 Introgression lines resistance to gummy stem blight
编号Code平均病级The averagedisease level病情指数Diseaseindex抗性类型Resistancetype编号Code平均病级The averagedisease level病情指数Diseaseindex抗性类型Resistancetype编号Code平均病级The averagedisease level病情指数Diseaseindex抗性类型Resistancetype
CSIL16.00±1.04467SCSIL306.17±1.03069SCSIL593.33±0.81637R
CSIL24.00±1.04444RCSIL316.00±1.05467SCSIL605.86±1.06965S
CSIL35.00±0.85356SCSIL325.91±1.04466SCSIL615.20±0.63258S
CSIL47.00±0.94378HSCSIL336.33±1.00070SCSIL626.60±0.84373S
CSIL56.40±0.96671SCSIL346.00±1.04467SCSIL636.75±0.70775S
CSIL65.83±1.03065SCSIL356.27±1.00966SCSIL648.00±1.15589HS
CSIL75.00±0.85356SCSIL366.27±1.00966SCSIL657.50±0.92683HS
CSIL86.60±0.84373SCSIL377.00±1.15578HSCSIL665.50±0.92661S
CSIL97.55±0.93484HSCSIL385.50±0.92661SCSIL675.25±0.70758S
CSIL106.64±0.80974SCSIL395.60±0.96662SCSIL685.67±1.03363S
CSIL115.36±0.80960SCSIL406.00±1.05467SCSIL696.40±0.96671S
CSIL126.50±0.92667SCSIL413.89±1.05443RCSIL705.00±0.00056S
CSIL136.50±0.90572SCSIL425.29±0.75659SCSIL714.50±0.92650S
CSIL144.78±0.66753SCSIL435.44±0.88260SCSIL723.22±0.66736R
CSIL155.00±0.89456SCSIL447.50±1.00083HSCSIL735.00±1.00056S
CSIL165.55±0.93462SCSIL457.00±1.26578HSCSIL746.50±0.92672S
CSIL175.20±0.63258SCSIL465.40±0.89460SCSIL756.33±1.03370S
CSIL185.75±1.03564SCSIL477.00±1.63378HSCSIL765.75±1.03564S
CSIL196.11±1.05468SCSIL487.00±0.94378HSCSIL775.25±0.70758S
CSIL204.82±0.60354SCSIL493.80±1.09542RCSIL786.25±1.03569S
CSIL216.09±1.04468SCSIL505.22±0.66758SCSIL796.40±0.96671S
CSIL225.80±1.03364SCSIL515.00±0.0056SCSIL807.40±0.89482HS
CSIL235.89±1.05465SCSIL524.00±1.09544RCSIL817.75±1.03586HS
CSIL246.00±1.04459SCSIL537.40±0.89482HSCSIL825.89±1.05465S
CSIL255.33±0.77859SCSIL544.60±0.84351SCSIL835.33±0.81659S
CSIL264.82±0.60354SCSIL555.40±0.84360SCSIL846.50±0.92672S
CSIL276.09±1.04468SCSIL567.29±0.75681HSCSIL857.22±0.66780HS
CSIL286.75±0.70775SCSIL573.50±0.92639RCSIL866.00±1.06967S
CSIL296.11±1.05461SCSIL584.00±1.15544RC7.25±0.70781HS
S:感;HS:高感;C:北京截头。
Note:R:Resistance;S:Susceptible;HS:High susceptible;C:Beijingjietou.

田间观察表明:抗蔓枯病的黄瓜渐渗系材料如CSIL72,染病后叶片仅形成零星状病斑,且多发于植株基部1~2片老叶,病情发展较慢且较轻,病斑不会扩大或蔓延成片,叶缘并未形成“V”型病斑,而感病材料接种后病情发展较快,易在叶缘处形成典型“V”型病斑,由外缘向中心发展并不断扩大蔓延成片,且叶片渐渐褪绿发黄,导致病情严重,抗感渐渗系材料在茎基部发病情况差异显著,一般叶部发病较轻的单株茎基部发病也相对较轻,反之,则较重。但茎基部发病较轻的单株叶部发病不一定较轻,两者并未发现明显关联性。 3 讨论

从野生资源中发掘有益基因,大量筛选具有野生外源基因的特异种质,对于种质遗传特性研究或直接用于常规育种的性状转育具有重要意义,早期已在水稻和番茄上实践并获得成功[16, 17]。通过构建种间渐渗系可有效转育野生种中的优良性状,拓宽现有资源育种的瓶颈,具有巨大利用价值。目前,在水稻和小麦等主要作物上已开展了通过渐渗系转移和利用野生种有利基因的研究,如在水稻上利用渐渗系鉴定和定位了多个抗白叶枯病、抗褐飞虱、抗稻瘟病基因[18, 19];在小麦中则利用普通小麦-提莫菲维小麦渐渗系定位了抗白粉病基因Pm 6 [20, 21]。另外,小麦中利用渐渗系群体,通过二倍体/多倍体穿梭作图策略,图位克隆法克隆到了小麦抗叶锈病基因Lr21 [22]。这些研究充分体现了渐渗系在野生种优异基因的发掘上具有巨大优势。

黄瓜蔓枯病抗病资源比较缺乏,且我国研究起步较晚、研究较少,遗传基础狭窄,变异率仅为3%~8%,这已成为黄瓜抗病性改良的瓶颈问题。前人在黄瓜抗蔓枯病研究中曾进行了抗性品种筛选,由于前人鉴定的品种均来源于不同地区,背景差异较大,环境效应影响较大,抗病稳定性相对较差,不能获得永久的种质资源库。然而渐渗系群体是永久群体,不同的研究者可在不同时间、不同地点进行试验,所获得的结果可在数据库中累加,且在多次回交中使得连锁基因间重组率提高,可缩小QTL作图区间,降低连锁累赘的影响。Ren等[13]通过野生酸黄瓜与栽培黄瓜‘北京截头’的种间杂交,染色体加倍合成新的异源四倍体,再与栽培黄瓜‘北京截头’进行回交、自交,获得了具有不同表型性状的渐渗育种材料,经证实,黄瓜-酸黄瓜渐渗系中蕴含多种有益外源基因。利用SSR分子标记对回交自交后代进行检测,能快速准确对比渐渗系与野生酸黄瓜片段异同。本研究通过对黄瓜-酸黄瓜种间渐渗系苗期人工接种鉴定和筛选,从86份渐渗系中筛选出8份抗性材料、64份感病材料和14份高感的材料,所获得的8份抗蔓枯病渐渗系材料可直接利用其渐渗系的优势,用于黄瓜抗蔓枯病育种研究,为抗蔓枯病遗传特性、机制研究及基因定位等工作提供有利材料,同时也可直接用于育种实践。利用苗期进行温室人工接种抗性鉴定的方法,可减少田间自然发病鉴定导致的不可控环境中生物及非生物对植物造成的影响从而干扰鉴定结果[23],也可减少离体接种鉴定导致黄瓜鉴定过程中叶片失水严重,叶片失绿黄化,影响幼苗正常生长发育等因素带来的结果差异,苗期鉴定既简单经济又方便可靠,不仅省时省力,更能加快品种的抗性筛选过程,这种方法在番茄、大白菜等作物上均有报道[24, 25]

通过远缘杂交或渐渗杂交获得的种间杂交渐渗系可用于拓宽黄瓜的遗传基础,突破长期限制传统育种遗传背景狭窄的瓶颈;也可构成普通栽培黄瓜遗传改良的优异外源基因库,用于种质遗传特性分析和发掘不同抗性的优异基因源,进一步挖掘野生资源基因库中有益QTL。在此基础上也可明确抗原的遗传规律,通过杂交、回交等手段获得多抗品种,提高黄瓜综合性状,是提高黄瓜抗病性和抗逆性的重要途径。将黄瓜-酸黄瓜渐渗系中优异的种质资源加以利用,这对于打破黄瓜遗传背景狭窄的瓶颈状态并发掘野生资源优异基因及其精细定位、基因的图位克隆及品种的遗传改良等具有广泛的应用前景。

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