中国医科大学学报  2021, Vol. 50 Issue (3): 235-240

文章信息

刘倩, 赵芳坤, 孔珺
LIU Qian, ZHAO Fangkun, KONG Jun
眼部干细胞研究热点的文献计量学分析
Bibliometric analysis of ocular stem cells
中国医科大学学报, 2021, 50(3): 235-240
Journal of China Medical University, 2021, 50(3): 235-240

文章历史

收稿日期:2020-08-31
网络出版时间:2021-03-18 14:35
眼部干细胞研究热点的文献计量学分析
刘倩 , 赵芳坤 , 孔珺     
中国医科大学附属第四医院眼科, 中国医科大学眼科医院, 辽宁省晶状体学重点实验室, 沈阳 110005
摘要目的 通过对近10年发表的眼部干细胞相关文献进行计量学分析,探索眼部干细胞研究的重点与热点、进展与趋势。方法 收集Web of Science核心合集(WoSCC)2010年至2019年眼部干细胞相关文献,运用VOSviewer 1.6.14对关键词、研究者、研究机构、国家、杂志、论文发表时间和引文等条目进行关系网络构建以及可视化分析。结果 共检索文献1 664篇,发文和引用最多的国家和杂志分别是美国和《Investigative Ophthalmology & Visual Science》。机构发文量最高的是日本的Keio University。作者聚类分析和关键词共现分析共同揭示了眼部干细胞近10年研究的热点和趋势。结论 眼部干细胞研究的热点和趋势主要聚集在眼部正常发育的调控、体外干细胞分化眼部组织、眼表疾病的干细胞治疗和干细胞移植后眼部并发症这4个方面。
关键词干细胞    眼部    VOSviewer    文献计量学    
Bibliometric analysis of ocular stem cells
Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Eye Hospital of China Medical University, Key Lens Laboratory of Liaoning Province, Shenyang 110005, China
Abstract: Objective To explore the key points, hotspots, progress, and trends of stem cell studies in ophthalmology through a bibliometric analysis. Methods Relevant studies were obtained from the Web of Science Core Collection (WoSCC) between 2010 and 2019. The bibliometric method and VOSviewer 1.6.14 were used to visualize the keywords, authors, research institutions, countries, journals, citations, and annual publication numbers in this field. Results A total of 1 664 related studies were obtained. The United States and Investigative Ophthalmology & Visual Science ranked first among the countries and journals, respectively, with the most cited frequency and publications. Keio University was the organization that published the maximum number of papers. The research trends and hotspots were revealed through co-authorship analysis and keyword co-occurrence analysis. Conclusion The hotspots and trends mainly focus on the following aspects: regulation of eye development, differentiation of eye tissues in vitro, treatment of ocular surface diseases through stem cell transplantation, and ocular complications after hematopoietic stem cell transplantation.
Keywords: stem cell    eye    VOSviewer    bibliometrics    

干细胞具有无限分裂、增殖及分化成为体内多种细胞的能力,为多种疾病的治疗提供了新的思路[1]。视网膜色素变性、Stargardt黄斑营养不良及年龄相关性黄斑变性等眼部不可逆性致盲眼病目前在临床上没有有效的治疗方法,近年来干细胞分化光感受器细胞及视网膜色素上皮细胞进行视网膜下腔移植,成为此类疾病未来可能有效的治疗手段[2]。基于眼部干细胞相关研究的重要性与研究数量的众多性,对此研究领域的文献进行科学的分析十分必要。

文献计量学分析是一种利用统计方法对大量文献进行分析,进而衡量和评估研究影响力的重要工具[3]。VOSviewer和CiteSpace是用于构建可视化文献计量网络的软件工具[4]。为进一步认识眼部干细胞的研究热点和趋势,本研究应用文献计量学分析方法以及VOSviewer和CiteSpace工具,对国际上该领域近10年的相关文献进行梳理与可视化分析,获得该领域研究热点,以期对未来眼部干细胞的基础研究和临床应用提供参考和借鉴。

1 材料与方法 1.1 资料与数据收集

以Web of Science核心数据库(www.webofscience.com)为数据源,按照以下检索策略:TS=(“stem cells” OR “stem cell” OR “progenitor cells” OR “progenitor cell”)AND TS=“eye”,时间跨度为“2010年至2019年”,文献类型为“article”,进行检索,将数据按照纯文本格式导出。

1.2 数据可视化分析

将收集的数据导入VOSviewer软件(1.6.14版本)和CiteSpace软件,进行数据可视化分析。应用VOSviewer对关键词、研究者、研究机构、国家、杂志、论文发表时间和引文等条目进行关系网络构建以及可视化分析。此外,还重点关注了由关键词构建的共现分析,以明确眼部干细胞研究中的热点与趋势。

2 结果 2.1 文献分布特点

2010年至2019年共有63个国家/地区参与了该领域的研究,共计发表 1 664篇文献。排名前10位国家的总发文数量占98.3%,其中,美国发文最多(689篇,41.4%),其次为中国(199篇,12.0%)、德国(159篇9.6%)。用VOSviewer 1.6.14软件绘制国家/地区密度知识图谱(图 1A),有31个国家/地区的发文量≥10篇,每个国家在图中都有对应的密度颜色,密度大小依赖于元素的数量以及重要性,密度越大,颜色越暖,颜色越暖代表其在眼部干细胞研究中贡献越多,权重越高,反之,颜色越冷权重越低。结果显示,美国居于本研究领域的主导地位。从年发文数量上看,2010年至2015年,每年发文数量逐年增长,2016年至2019年,每年发文数量稳定在150篇以上(图 1B)。文献分布于464种期刊,发文量前3位的杂志是《Investigative Ophthalmology & Visual Science》 《PLos One》 《Cornea》,分别占总发文量的7.3%、4.9%、3.8%,表 1所示为排名前10位的文献来源杂志。

表 1 2010年至2019年眼部干细胞研究领域发文量排名前10位的杂志 Tab.1 Top 10 major journals in stem cell and eye study from 2010 to 2019
Rank Journal Count(%) Citations
1 Investigative Ophthalmology & Visual Science 122(7.3) 2 382
2 Plos One 81(4.9) 1 572
3 Cornea 63(3.8) 797
4 Experimental Eye Research 57(3.4) 800
5 Development 44(2.6) 1 193
6 Stem Cells 37(2.2) 1 422
7 Developmental Biology 37(2.2) 651
8 Scientific Reports 35(2.1) 391
9 Molecular Vision 34(2.0) 484
10 Ocular Surface 27(1.6) 363

2.2 研究机构合作网络

共1 813家机构参与了该领域的研究,其中发文量排名前3位的机构为日本Keio University,美国Harvard Medical School和Harvard University,发文量前10位的其他机构见表 2。通过VOSviewer绘制机构合作网络图谱(图 1C),选取发文量≥10篇的71个机构,其中有70个机构存在合作关系。图中每个节点表示1个机构,节点大小表示发文量。节点之间的联系表示协作,联系强度越大,合作越紧密。

A, country density of publications in stem cell and eye research from 2010 to 2019; B, annual documents in stem cell and eye research from 2010 to 2019; C, cooperation network of organizations in stem cell and eye research from 2010 to 2019. 图 1 2010年至2019年眼部干细胞领域文献分布特点与机构合作网络图 Fig.1 The distribution of publications and cooperation network of organizations in stem cell and eye research from 2010 to 2019

表 2 2010年至2019年眼部干细胞研究领域发文量排名前10位的机构 Tab.2 Top 10 productive organizations in stem cell and eye study from 2010 to 2019
Rank Organization Country Count(%)
1 Keio University Japan 39(2.3)
2 Harvard Medical School USA 30(1.8)
3 Harvard University USA 28(1.7)
4 Johns Hopkins University USA 26(1.6)
5 University College London England 26(1.6)
6 University of Toronto Canada 26(1.6)
7 L V Prasad Eye Institute India 25(1.5)
8 University of California Los Angeles USA 25(1.5)
9 The National Eye Institute USA 23(1.4)
10 Sun Yat-sen University China 23(1.4)

2.3 作者及其研究领域

用VOSviewer软件绘制作者合作网络图谱,在8 592名作者中,发文量≥5篇的作者共有127名(图 2A),而其中有合作关系的作者数量为60名(图 2B),将最小聚类值设为10,共产生了以下3个聚类:以作者TSUBOTA K,OGAWA Y,SHIMMURA S等为主的绿色聚类;以作者SANGWAN VS,BASU S,HOLLAND EJ等为主的红色聚类,以及以作者CVEKL A,LIU Y等为主的蓝色聚类。

A, main authors in stem cell and eye study from 2010 to 2019;B, co-authorship network of main authors in stem cell and eye study. 图 2 2010年至2019年眼部干细胞领域作者及作者合作网络图 Fig.2 Authors and co-authorship network of main authors in stem cell and eye study from 2010 to 2019

2.4 引用频次前10位的文章

表 3所示为2010年至2019年该领域发表的文章被引用次数最多的10篇文章标题、发表杂志、发表年度、被引用次数和主要观点。在引用次数排名前10位的文章里,有2篇发表于《Lancet》,其余分别发表于《Nature》 《Cell》等期刊上。

表 3 2010年至2019年眼部干细胞研究领域引用频率前10位的文章及主要观点 Tab.3 Top 10 stem cell and eye research papers with the most citation frequency
Rank Title Journal Year Citations Main conclusion
1 Self-organizing optic-cup morphogenesis in three-
dimensional culture
Nature 2011 860 A successful process in 3D culture of mouse
embryonic stem cells to generate visual cup
2 Embryonic stem cell trials for macular degeneration:
a preliminary report
Lancet 2012 794 Subretinal space transplantation of human
embryonic stem cell derived retinal pigment
epithelial cells for the treatment of macular
degeneration
3 Human embryonic stem cell-derived retinal pigment
epithelium in patients with age-related macular
degeneration and Stargardt’s macular dystrophy:
follow-up of two open-label phase 1/2 studies
Lancet 2015 505 A long-time safety and follow up of macular
degeneration treatment with human embryonic
stem cell derived retinal pigment epithelial
transplantation
4 The Rd8 mutation of the Crb1 gene is present in
vendor lines of C57BL/6N mice and embryonic
stem cells,and confounds ocular induced mutant
phenotypes
Investigative Ophthalmology & Visual Science 2012 339 Crb1 mutation is usual in the substrain of
C57BL/6N which is a common tool mouse to
generate transgenic mice or embryonic stem
(ES)cells
5 Generation of three-dimensional retinal tissue with
functional photoreceptors from human iPSCs
Nature Communications 2014 245 An eye disease model: a 3D retinal tissue
generated by human induced pluripotent
stem cells in vitro
6 Optic vesicle-like structures derived from human
pluripotent stem cells facilitate a customized
approach to retinal disease treatment
Stem Cells 2011 212 Utilize human embryonic stem cell and
human induced pluripotent stem cell to
generate an Optic Vesicle-like structures
7 Sox2 roles in neural stem cells International Journal of Biochemistry & Cell Biology 2010 183 The function of Sox2 in the development of
eye and brain neuronal systems
8 Transplantation of adult mouse iPS cell-derived
photoreceptor precursors restores retinal structure
and function in degenerative mice
PLos One 2011 183 A successful case in mouse induced pluripotent
stem cell producing the functional photoreceptors
to treat the retina degeneration
9 Neuroprotective effects of intravitreal mesenchymal
stem cell transplantation in experimental glaucoma
Investigative Ophthalmology & Visual Science 2010 170 Local transplantation of mesenchymal stem
cell protects the optic nerve in an animal
glaucoma model
10 Tet3 CXXC domain and dioxygenase activity
cooperatively regulate key genes for xenopus eye and
neural development
Cell 2012 149 The function of Tet3 during the development
of eye and neuro

2.5 眼部干细胞研究热点及演变

本研究用CiteSpace对关键词进行了突发分析,图 3A所示为从2010年开始的前39个突发的关键词开始和结束的时间、突发的强度,以及随着时间的改变突发关键词的改变。“photoreceptor”“pluripotent stem cell”“epithelial cell”“macular degeneration”“glaucoma”“limbal stem cell deficiency”“growth factor”等关键词突发一直持续至2019年。为了进一步发现眼部干细胞研究关键词之间的联系,本研究用VOSviewer在1 664篇文献中进行了关键词分析,在7 397个关键词中,设置最小出现频次20次,共有140个关键词达到要求,同一颜色的关键词属于同一聚类,共形成了红、绿、蓝、黄4个聚类(图 3B)。

A, burst analysis of keywords in stem cell and eye study from 2010 to 2019;B, co-occurrence network of keywords in stem cell and eye study from 2010 to 2019. 图 3 2010年至2019年眼部干细胞领域关键词突发分析与关键词共现分析图 Fig.3 Burst analysis of keywords and co-occurrence network of keywords in stem cell and eye study from 2010 to 2019

3 讨论

本研究应用VOSviewer对Web of Science核心合集中近10年关于眼部干细胞研究的1 664篇文章进行了文献计量学分析,初步了解了该领域的研究发展状况。文章分布结果显示:(1)美国作为该领域发文量第一的国家,其文章累计引用频次16 885次,同样位居第一,中国和德国虽然排名第二和第三,但其发文量和引用频次远低于美国,国家密度图结果也凸显了美国在该领域中的地位;(2)前5年发文数量持续增长,后5年发文数量稳定维持在≥150篇/年,说明眼部干细胞的研究一直受到研究者的青睐;(3)杂志的分布分析中,《Investigative Ophthalmology & Visual Science》以最高的发文量和引用数位居第一。

从机构分布的地理位置来看,发文量前10位的机构中有5个机构位于美国,然后各有1个机构位于日本、英国、加拿大、印度和中国。从单一机构发文量来看,位于日本的Keio University以发文数39(2.3%)的优势位居第一。而机构合作网络图(图 1C)显示,不同机构间存在相互联系和合作,位于同一颜色聚类距离越近的机构联系越紧密。

从作者合作分析来看,众多作者中存在合作关系的作者共产生了3个聚类,同一颜色代表同一聚类,位于同一聚类的作者合作紧密,研究方向及主题具有一定的相似性。聚类1(红色):以作者SANGWAN VS,BASU S,HOLLAND EJ等为主,其主要研究内容为角膜缘干细胞缺乏的治疗[5]、角膜损伤与角膜再生[6]、眼表干细胞移植[7]。聚类2(绿色):以作者TSUBOTA K,OGAWA Y,SHIMMURA S等为主,其主要研究内容为造血干细胞移植后并发症的诊断、疾病机制和治疗[8]相关,造血干细胞移植后并发症干眼症的治疗与机制研究[9],泪腺和角膜内皮的再生[10],诱导多能干细胞的免疫学特性[11]。聚类3(蓝色):以作者CVEKL A,ASHERY-PADAN R等为主,其主要研究内容为眼部组织的正常发育过程,转录因子(如PAX6等)在眼部发育中的作用等,如晶状体[12]、视网膜[13]、视网膜色素上皮细胞分化与脉络膜血管系统[14]发育。

关键词凝聚了论文主要思想和要点,它出现频次的多少反映了研究者对该领域关注度的大小。出现频次越高的关键词,越有可能成为研究的热点。关键词的突发是指特定时间段内的数据量显著异常于其他时间段,即关键词出现的频次明显增多。图 3A展示了近10年眼部干细胞研究中的39个突发关键词,关键词的突发分析提示了特定时间段中研究者共同关注的热点以及随着时间突发关键词的转变,有助于纵向动态观察热点的变化。“photoreceptor”“pluripotent stem cell”“macular degeneration” “glaucoma” “limbal stem cell deficiency”等是一直延续至2019年的突发关键词,说明现在仍是该领域内研究的热点。而VOSviewer的关键词共现分析将高频关键词按照相关度进行聚类,便于分类分析眼部干细胞研究的热点。VOSviewer的关键词共现分析一共产生4个聚类:聚类1(红色)的关键词主要研究的是关于正常眼部发育中的基因表达和细胞分化的过程;聚类2(绿色)主要体现的是在体外模拟体内眼部发育环境,使用干细胞再生眼部组织,治疗眼部变性型疾病;聚类3(蓝色)是关于干细胞在眼表疾病治疗中的应用;聚类4(黄色)主要是关于造血干细胞移植后常见并发症慢性移植物抗宿主病和干眼症相关研究。

本研究将文献计量学与可视化制图分析相结合,更好地展示了眼部干细胞相关的研究进展以及影响力排名靠前的国家、机构和研究者,并展示了该领域中有影响力和高被引用的论文,为研究人员提供了有用的信息。本研究的不足之处在于,在作者聚类分析时,重点分析了联系比较紧密的3个聚类中的作者,而未纳入独立作者的研究方向。此外,本研究纳入的文献语言为英语,可能会在一定程度上影响分析的全面性。

综上所述,2010年至2019年在眼部干细胞研究中,影响力最大的国家、杂志和机构分别为美国、《Investigative Ophthalmology & Visual Science》和Keio University。眼部干细胞研究的热点和趋势主要聚集在眼部正常发育的调控、体外干细胞分化眼部组织、干细胞眼表疾病的治疗和干细胞移植后眼部并发症这4个方面。

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