中国公共卫生  2017, Vol. 33 Issue (2): 298-301   PDF    
一起疑似病毒性脑膜炎暴发病原学检测分析
严菊英, 秦淑文, 吕华坤, 孙逸, 茅海燕, 张严峻     
浙江省疾病预防控制中心微生物检验所病毒检验科, 杭州 310051
摘要目的 2014年10月浙江省金华市荣光小学发生疑似病毒性脑膜炎暴发疫情,为及时查明病因,分析病原的分子特征并进行病原溯源。 方法 开展流行病学调查,采集患者脑脊液和咽拭子样本6份,检测人类肠道病毒(HEV)核酸和分离病毒,对HEV分离株VP1基因测序,进行同源性与进化分析。 结果 在全校328名学生中,发病7例,罹患率2.13%。患者年龄7~8岁;临床症状为发热、头痛、呕吐等;从5例患者6份样本中均检测到HEV核酸,其中3份脑脊液中分离到3株肠道病毒埃可30型(echovirus 30,E30);新分离株与E30原型株之间VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为81.8%和91.8%~92.1%;进化分析显示:新分离株位于E30 G基因亚型分支上,与2013年浙江省CHN/ZJ/RA-72/13株亲缘关系最近。 结论 引起2014年10月浙江省金华市荣光小学聚集性病毒性脑膜炎暴发疫情的病原为E30 G基因亚型病毒。
关键词暴发     病毒性脑膜炎     埃柯病毒30型     G基因亚型     VP1基因    
Pathological and molecular characteristics of a viral meningitis outbreak among pupils in Jinhua city of Zhejiang province, 2014
YAN Ju-ying, QIN Shu-wen, LÜ Hua-kun, et al     
Laboratory for Viral Detection, Microbial Detection Institute, Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention, Hangzhou, Zhejiang Province 310051, China
Abstract: Objective To identify and trace the pathogen of a suspected viral meningitis outbreak in a primary school in Jinhua city of Zhejiang province in 2014. Methods Epidemiological investigation was conducted and 3 specimens of cerebrospinal fluids (CSF) and 3 of throat swab were sampled from suspected patients for isolation and detection of human enterovirus (HEV) nucleic acid.Then VP1 genes of the isolated virus were sequenced for the construction of phylogenetic tree and homologous analysis. Results Totally 7 cases aged 7 to 8 years were identified among 328 pupils in the school, with a morbidity of 2.13%.All the cases had symptoms of headache, fever, and vomiting.Six specimens from 5 patients were positive for HEV nucleotide and 3 strains of echovirus 30 (E30) were isolated from CSF specimens.The homology of nucleotide sequences of the VP1 gene was 81.8% and that of amino acid sequences ranged from 91.8% to 92.1% between the 3 isolated strains and the prototype strain Bastianni of E30, respectively.The phylogenetic tree of VP1 gene showed that the E30 strains isolated belong to the E30 G subtype and are of close homology to CHN/ZJ/RA-72/13 strain isolated in Zhejiang province in 2013. Conclusion The viral meningitis outbreak among pupils in Jinhua city of Zhejiang province in 2014 was caused by echovirus 30 G genotype.
Key words: outbreak     viral meningitis     echovirus 30     G genotype     VP1 gene    

病毒性脑膜炎 (viral meningitis),是由各种病毒引起的一组以精神和意识障碍为突出表现的中枢神经系统感染性疾病。引起病毒性脑膜炎的病原有人类肠道病毒 (human erterovirus, HEV) 中埃柯病毒、柯萨奇病毒、流行性腮腺炎病毒和单纯疱疹病毒等,据研究80%的病毒性脑膜炎病例是由HEV引起。埃柯病毒30型 (echovirus 30, E30) 是HEV的一个血清型,是引起世界各地病毒性脑膜炎最常见病原之一[1-3]。2002-2004年浙江省和江苏省也发生了E30引起的病毒性脑膜炎暴发疫情[4-5]。2014年浙江省金华市荣光小学发生了疑似病毒性脑膜炎暴发疫情,为迅速查明病因与病原的分子特征,及时采取有效的控制措施,本研究于2014年10月在浙江省金华市荣光小学采集5例患者6份咽拭子和脑脊液标本进行病原学研究。现将结果报告如下。

1 材料与方法 1.1 疫情概况

10月21日,金华市疾病预防控制中心接到金华市荣光小学疫情报告,该校发生疑似病毒性脑膜炎病例4例,目前均在住院治疗,存在聚集性可能。接报后,金华市疾病预防控制中心立即组织开展调查。情况如下:1) 金华市荣光小学位于金华市婺城新区文津路1号,为2012年开始招生的民办寄宿制小学,目前全校共3个年级11个班级328名学生,教职工30人。2) 首发病例:王某某,男,二 (4) 班,2007年1月18日出生,患儿于10月12日上午8时30分出现头痛,以颞部及前额部为主,伴有呕吐10余次,吐出为内容物,于10时左右出现发热,最高38.6℃,查血常规白细胞14.18×109/L,中性粒细胞84.1%,淋巴细胞10.1%,血红蛋白151 g/L,血小板398×109/L。CRP < 0.5 mg/L。头颅CT未见明显异常;咽充血,双侧扁桃体Ⅱ度肿大,无脓性分泌物,两肺呼吸音粗,四肢肌力、肌张力正常,双侧巴氏征、布氏征阴性,金华市中心医院拟“病毒性脑膜炎”收治入院。

1.2 病例纳入与样本采集

10月1日-10月26日,金华市荣光小学中,有出现发热、头痛伴呕吐之一,脑脊液单核细胞增多或者治疗上采取甘露醇等降颅压效果明显的所有学生及教职工。开展流行病学调查,搜索到7例病例,对其中的5例采集3份咽拭子和3份脑脊液,样本冷藏运送到实验室。

1.3 检测方法 1.3.1 HEV核酸检测

从3份咽拭子和3份脑脊液提取HEV核酸 (RNA提取试剂盒, 德国Qiagen公司);实时荧光定量-聚合酶链反应 (real-time PCR)[6]检测核酸[荧光RT-PCR试剂盒, 宝生物工程 (大连) 有限公司]。

1.3.2 病毒分离与鉴定

采用人横纹肌瘤细胞 (human rhabdomyosarcoma, RD) 和人喉表皮样癌细胞 (human epidermoid cancer cells, Hep-2)(中国CDC病毒病预防控制所脊髓灰质炎病毒室) 培养法分离HEV[7]。阳性分离物采用HEV real-time PCR方法进行鉴定。

1.3.3 VP1基因扩增

HEV分离株采用RT-PCR方法扩增VP1基因并测序[宝生物工程 (大连) 有限公司试剂]。引物序列和反应条件参考文献[7],扩增片段876 bp。

1.3.4 测序与进化分析

采用PCR扩增产物纯化后直接测序[生工生物工程 (上海) 股份有限公司完成]。数据处理采用DNAMAN 6.0和ClustalX 2.0。采用MEGA 6.2软件构建进化树,建树方法采用邻接法 (neighbor-joining, NJ),可信度评估采用1 000 bp值,USA/Charles/E6株作为外群对照。

2 结果 2.1 流行病学特征

全校328名学生中,发病7例,罹患率2.13%(7/328),无教职工发病;7例患者为5例男性2例女性,年龄在7 8岁,分布于2个班级,发病时间集中在10月12日-10月26日;患者均有发热 (38.5℃以上)、头痛、呕吐症状,5例有扁桃体肿大,2例有脑电图异常,7例均无胃肠道症状、脑膜刺激征和神经精神改变。脑脊液显示无色透明清亮,糖及氯化物正常,有核细胞增多。7例患者4例住院治疗,所有患者经治疗均已痊愈,其余学生和教职工经流行病学追踪调查至最后1例病例发病后10 d,未发生新病例。

2.2 HEV核酸检测和病毒分离 (表 1)
表 1 疑似病例样本中HEV检测与病毒型别

3份咽拭子和3份脑脊液样本HEV核酸检测均阳性,从3份脑脊液样本中分离到3株HEV,经VP1基因全长测序,确定病毒型别为E30。

2.3 VP1基因同源性

3株E30 VP1区测序, 获得全长876个核苷酸,推导编码292个氨基酸,3株新分离株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为99.9%~100.0%和99.7%~100.0%,新分离株与原型株 (Bastianni) 之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为81.8%和91.8%~92.1%, 与浙江省2002-2014年E30分离株之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为86.2%~99.5%和%98.3%~100.0%,其中与浙江省CHN/ZJ/RA-72/13株同源性最高,核苷酸和氨基酸分别为99.4%~99.5%和99.7%~100.0%。

2.4 进化分析 (图 1)
注:浙江省E30分离株采用VP1全长核苷酸序列 (876bp) 与GenBank下载的E30毒株序列采用NJ构建进化树, boostrap值取1000;USA/Charles/E6作为外群对照;●为本次疫情分离株 (毒株) 命名:国家/省份/市-患者姓/分离年份,◆为浙江省2002-2014年分离株 (毒株) 命名:国家/省份/市或县-标本编号/分离年份, ZJ:浙江,JH:金华,RA:瑞安,WZ:温州,LC:鹿城,QZ:衢州,LH:临海,PT:普陀,HuZ:湖州,YQ:乐清,ZuJ:诸暨;下载序列为:国家/毒株名称Gen Bank accession number 图 1 2014年浙江省E30分离株VP1区进化分析

3株E30测序数据已登录GenBank, 登录号为CHN/ZJ/JH-Chen/14:KP995772、CHN/ZJ/JH-Li/14:KP995773和CHN/ZJ/JH-Hu/14:KP995774。3株E30与浙江省历年E30分离株和GenBank下载的不同时期、不同国家毒株序列构建进化树。从VP1基因进化树可见全球E30分成8个基因型 (A-H), 浙江省E30明显地分成2簇,分别位于G和H基因亚型分支上,新分离E30(标注●的毒株) 与浙江省2011-2014年E30(标注▲的毒株) 紧密的聚集在一起,并位于G基因亚型分支上,尤其与2013年CHN/ZJ/RA-72/13株具有最近的亲缘关系,而与浙江省2002-2004年分离的3株 (CHN/ZJ/ZuJ-12/02、CHN/ZJ/YQ-50/04和CHN/ZJ/LH-63/04) H基因型E30亲缘关系相对较远。

3 讨论

本研究对金华市荣光小学疑似病毒性脑膜炎暴发疫情进行流行病学调查,在328名学生中发病7例,罹患率2.13%。从5例患者6份样本中均检测到HEV核酸,其中3份脑脊液中分离到3株E30,由于从脑脊液中分离到同一血清型肠道病毒,对疫情病原的诊断具有确证意义,说明引起该起疫情的病原为E30。为了及时控制疫情,采取了一系列措施,如每天开展晨检,对教室、宿舍、厕所、餐饮具等消毒,针对性地开展健康教育工作,要求勤洗手、喝开水、吃熟食,由于措施得力,经流行病学追踪调查至最后一例病例发病后10 d,未发现新病例,疫情得到了及时控制。遗憾的是疫情有效控制后,未能对病原的传播方式进一步深入调查。本研究对E30分离株进行VP1区测序分析,由于该区域是肠道病毒衣壳蛋白中位于最外层的部分,大部分抗原决定簇也位于此,对该段序列的分析是毒株分型及其变异规律分析的有效手段[8]。本次疫情分离的3株E30与原型株Bastianni之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为81.8%和91.8%~92.1%,根据肠道病毒同一血清型核苷酸和氨基酸同源性应分别超过75%和88%的原则[9],从分子水平上进一步肯定了本次疫情的病原为E30。新分离的3株E30之间VP1区核苷酸和氨基酸同源性很高,分别为99.9%~100.0%和99.7%~100.0%,提示这些病原来源相同。依据病毒VP1基因全长876个核苷酸序列,将全球流行的E30分为8个基因型 (A~H)[10]。浙江省2002-2014年E30在VP1基因进化树上位于G和H基因亚型上,本次疫情分离株属于G基因亚型,3株E30紧密地聚集在一起,与浙江省2013-2014年E30亲缘关系很近,尤其与CHN/ZJ/RA-72/13株具有最近的亲缘关系,与福建省2011年分离株 (CHN/ACSF11-13) 也有较近的亲缘关系,而与浙江省2002-2004年分离的3株H基因型E30亲缘关系相对较远,进化分析提示:引起本次疫情的E30 G基因亚型病毒最有可能来源于近几年在浙江省环境中循环却常常导致病毒性脑膜炎的病原[6, 11]。浙江省自2002年以来,通过设立监测点开展对病毒性脑膜炎病原的监测,研究显示E30是引起浙江省病毒性脑膜炎病例的主要病原,2002-2013年浙江省E30的检出占HEV各血清型的11.7% 28.8%[6, 11],高于1970-2008年美国的4.5% 10.1%[2, 12],监测数据提示:E30一直在浙江省环境中循环,并且活动强度较大,常常引起病毒性脑膜炎散发病例和暴发疫情,因此,必须加强监测,及时掌握病原体的遗传变异及致病性的改变,为传染病的预警及防控提供科学依据。

参考文献
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