支气管哮喘(简称哮喘)是多种基因环境因素之间的相互作用导致的复杂遗传病。据估计遗传因素占哮喘发病风险因素的35%~80%[1]。Gasdermin B基因(gasdermin B,GSDM B)属于gasdermin家族成员之一,位于染色体17q12~21区域内(该染色体区域已被证实与哮喘密切相关)[2]。鞘脂合成调节器因子3基因(sphingo-lipid biosynthesis regulator 3,ORMDL 3)也位于染色体 17q21 上,与GSDM B基因比邻。GSDM B与ORMDL 3基因受到共同单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的影响,其中rs7216389、rs4794820、rs11650680基因与哮喘的遗传相关性已在波多黎各等几个种族被证实[3, 4, 5, 6]。但在中国广东人群还鲜有报道。本研究选择2014年3月—2015年3月在广东医学院附属医院确诊的哮喘患者394例,分析哮喘与GSDM B/ORMDL 3基因多态性的相关性。
1 对象与方法 1.1 对象选择2014年3月—2015年3月在广东医学院附属医院确诊的哮喘患者394例,所有患者均符合《支气管哮喘防治指南》标准[7],已除外合并有其他呼吸道疾病和其他引起喘息、胸闷、咳嗽的疾病,包括心功能异常和胃食管返流等。对照组为同期来自广东医学院附属医院的健康体检者395名,为与哮喘组无血缘关系的汉族南方人群,无个人哮喘病史和哮喘病家族史,无肺部其他疾病史,肺通气功能检查正常。所有研究对象均签署知情同意书。
1.2 肺功能检测肺功能检测参照文献中描述方法进行[8]。
1.3 血清IgE水平和外周血嗜酸性粒细胞检测分别采集哮喘患者和健康对照组静脉血2 mL,外周血嗜酸性粒细胞计数及百分比,血清IgE水平均由血常规检测获得。
1.4 DNA提取和基因型鉴定采集患者和对照组人群静脉全血,用血液DNA提取试剂盒(中国北京天根生物有限公司,)提取基因组DNA,操作步骤按照说明书操作。共计789个DNA样本用于3个SNPs(rs7216389、rs4794820、rs11650680)的分型分析,基因型鉴定采用SNaPshot技术,具体操作步骤参照文献[9]。
1.5 统计分析采用软件SPSS 19.0一般数据统计分析。哮喘患者和对照组的基因位点频率、基因型分布统计采用在线软件SNPStarts(http://bioinfo.iconcologia.net/snpstats/start.htm)[10]。位点频率和基因型的离散程度采用哈迪温伯格平衡分析(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)。哮喘组与对照组或不同吸烟状态组之间比较肺功能和血清IgE、外周血嗜酸性粒细胞采用双尾t检验(正态分布数据)或曼-惠特尼U检验(非正态分布数据),比值比(odd ratio,OR),95%置信区间(confidence intervals,95%CI)。以上数据的组间差异性计算采用单因素方差分析(正态分布数据)或Kruskal-Wallis检验(非正态分布数据)。以上P<0.05差异有统计学意义。
2 结 果 2.1 一般情况哮喘患者394例,男性173 例(44%)和女性221例(56%),年龄20~69岁,平均年龄45.37岁;健康对照组395人,包括男性173 人(44%)和女性222人(56%),年龄25~65岁,平均年龄45.23岁。哮喘组与对照组的年龄(P=0.8907)、性别(P=0.9720)组成无明显差异。与对照组相比,哮喘组血清IgE明显升高[哮喘组(542.00±792.00)IU/mL,对照组(48.00±56.00)IU/mL,P<0.0001)],肺功能明显下降,最大呼气量(forced expiratory volume,FEV):哮喘组(91.24±15.38)%,对照组(74.95±24.70%);FEV/用力肺活量(forced vital capacity,FVC):哮喘组(88.61±8.80)%,对照组(72.72±14.97)%;均为P<0.0001)。哮喘组与对照组之间吸烟状态无明显差异(P=0.0800)。
2.2 rs7216389、rs4794820、rs11650680基因型和基因位点分布(表 1)| 表 1 哮喘组与对照组rs7216389、rs4794820、rs11650680基因型与基因位点分布 |
哮喘组与对照组GSDMB/ORMDL3基因的3个SNP位点(rs7216389、rs4794820、rs11650680)频率分布均符合Hardy-Weinberg equilibrium(HWE)平衡(均为P>0.05)。最小位点频率(minor allele frequency,MAF)分别为rs7216389,C=0.22;rs4794820,A=0.24;rs11650680,T=0.22;与国际人类基因组单体型图计划北京汉族人群(CHB_Hapmap)中的对应基因MAF值rs7216389 C=0.336;rs4794820 A=0.419;rs11650680 T=0.219接近。在SNP位点rs7216389中,C/T与C/C基因型明显降低哮喘发病风险(P<0.000 1)。但是,由于杂合子C/T比例较高,哮喘组位点T/C比例明显高于对照组(P<0.000 1)。在SNP位点rs4794820中,G/A与A/A基因型明显降低哮喘发病风险(P<0.0001。哮喘组位点G/A比例明显高于对照组(P<0.000 1)。在SNP位点rs11650680中,哮喘组与对照组基因型分布无统计学差异(P=0.072 0)。SNP的C/T比例在哮喘组与对照组间也无统计学差异(P=0.170 0)。中国南方汉族人群中rs7216389的C/C和rs4794820的G/A和A/A明显降低哮喘发病风险,而rs11650680位点变异与哮喘发病风险无明显相关性。
2.3 基因型和基因位点性别分层分布(表 2)| 表 2 哮喘组与对照组rs7216389、rs4794820、rs11650680基因型与基因位点性别分层分布 |
rs7216389和rs4794820SNP变异在男性和女性中均可降低发病风险,其中在男性中的相关性更高一些;而rs11650680的位点变异在男性和女性中均与哮喘发病风险无关。
2.4 哮喘患者吸烟行为与rs7216389、rs4794820、rs11650680位点多态性的相关性(表 3)| 表 3 哮喘患者吸烟组、戒烟组、非吸烟组rs7216389、rs4794820、rs11650680位点基因型频率分布 |
哮喘患者吸烟组中,rs7216389 T/T型和rs11650680 C/C型高于戒烟与非吸烟组,而rs4794820 A/A型低于非吸烟组(χ2检验,均P<0.05)。
3 讨 论本研究通过789例病例-对照研究证实了GSDM B/ORMDL 3基因相关的SNP rs7216389和rs4794820位点变异与中国广东汉族成人哮喘发病风险相关,而rs11650680位点变异与哮喘风险无显著相关性。吸烟的哮喘患者非保护型rs7216389 T/T和rs11650680 C/C高于戒烟与非吸烟组,而保护型rs4794820 A/A型低于非吸烟组。在本研究中,GSDM B/ORMDL 3基因的SNP位点rs7216389 C/C和rs4794820 A/A是保护型,可降低哮喘风险,而rs7216389 T/T和rs4794820 G/G是哮喘风险型。rs7216389位于GSDM B基因的第一个内含子内,rs4794820在GSDM B基因周围并与rs7216389强连锁(r2=0.87)[11, 12]。研究显示rs7216389调控GSDM B和ORMDL 3基因的表达,并在哮喘中引起白介素(interleukine 17,IL-17)的释放[13, 14],这可能是rs7216389和rs4794820变异影响哮喘的机制之一。香港大学在华人哮喘中的研究发现rs7216389 T/T基因型能明显增强哮喘患者的气道高反应性[15],是对本研究的另一个理论支持rs11650680位于GSDM B和ORMDL 3基因上游,与rs7216389、rs4794820同在17q21染色体上[12]。有研究发现rs11650680与rs4794820共同参与调节上皮细胞炎症反应和气道高反应性[16]。rs11650680 C/T基因型降低日本女性患哮喘的风险[12],但在本研究中,我们在中国汉族南方人群中虽然发现rs11650680 CT型在哮喘患者中分布高于对照组(哮喘145(36.8%)vs.对照116(29.4%)),女性中(哮喘85(38.5%)vs.对照66(29.7%))但未能得到有统计意义的结果(P=0.1900)。此研究差异可能与本研究的样本量小于上述研究样本量或民族遗传基因差异有关。哮喘的发生发展受到环境因素的影响,在哮喘的特定发展阶段环境因素对病情影响尤其重要[17]。在这些因素中,生命早期烟草烟雾暴露与遗传因素相互作用是哮喘的重要诱发因素[18, 19, 20, 21]。研究显示烟草暴露与人类染色体17q21区域相互作用促进哮喘的发病风险[19]。如前所述,rs7216389 C/C和rs4794820 A/A是哮喘发病风险的保护因素,在其他研究中,rs11650680 T/T也被发现可能对儿童哮喘有保护作用[22]。而本研究发现吸烟的哮喘患者rs7216389 T/T和rs11650680 C/C高于戒烟与非吸烟组,而保护型rs4794820 A/A型低于非吸烟组,因此吸烟与rs7216389、rs4794820、rs11650680交互作用可能是吸烟增加哮喘发病风险的机制之一。本研究也存在一些局限之处。首先,如上所述,由于样本量的限制可能导致一个Ⅱ型错误,掩盖了本来存在的阳性SNP与哮喘的相关性(rs11650680);其次,对照组虽然是体检健康的人群,但是由于对于对照组过敏状态的信息了解不充分,其中不能完全排除未能诊断的哮喘患者,这会降低研究中SNP位点与哮喘的相关强度。
总之,GSDM B/ORMDL 3基因的SNP位点rs7216389、rs4794820与中国南方汉族人群哮喘发病密切相关,吸烟患者rs7216389、rs4794820、rs11650680变异,增加哮喘风险。在将来的研究中,如果能进一步深入SNP位点调节GSDM B/ORMDL 3基因的分子机制,以及以上SNP位点与其他环境因素的交互作用,将是哮喘研究的良好课题。
| [1] | Ober C,Yao TC.The genetics of asthma and allergic disease:a 21st century perspective[J].Immunological Reviews,2011,242(1):10-30. |
| [2] | Marinho S,Custovic A,Marsden P,et al.17q12-21 variants are associated with asthma and interact with active smoking in an adult population from the United Kingdom[J].Annals of Allergy,Asthma and Immunology,2012,108(6):402-411,409. |
| [3] | Moffatt MF,Gut IG,Demenais F,et al.A large-scale,consortium-based genomewide association study of asthma[J].The New England Journal of Medicine,2010,363(13):1211-1221. |
| [4] | Ferreira MA,McRae AF,Medland SE,et al.Association between ORMDL3,IL1RL1 and a deletion on chromosome 17q21 with asthma risk in Australia[J].European Journal of Human Genetics,2011,19(4):458-464. |
| [5] | Galanter J,Choudhry S,Eng C,et al.ORMDL3 gene is associated with asthma in three ethnically diverse populations[J].American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine,2008,177(11):1194-1200. |
| [6] | Blekic M,Kljaic Bukvic B,Aberle N,et al.17q12-21 and asthma:interactions with early-life environmental exposures[J].Annals of Allergy,Asthma and Immunology,2013,110(5):347-353,342. |
| [7] | 中华医学会呼吸病学分会哮喘学组,中华医学会全科医学分会.中国支气管哮喘防治指南[J].中华结核和呼吸杂志,2012,36(5):331-336. |
| [8] | Wang Y,Li D,Ma G,et al:Increases in peripheral SIRT1:a new biological characteristic of asthma[J].Respirology,2015,20(7):1066-1072. |
| [9] | Ma G,Yin J,Fu J,et al.Association of a miRNA-137 polymorphism with schizophrenia in a Southern Chinese Han population[J].Biomed Research International,2014,2014:751267. |
| [10] | Sole X,Guino E,Valls J,et al.SNPStats:a web tool for the analysis of association studies[J].Bioinformatics,2006,22(15):1928-1929. |
| [11] | Wu H,Romieu I,Sienra-Monge JJ,et al.Genetic variation in ORM1-like 3(ORMDL3)and gasdermin-like(GSDML)and childhood asthma[J].Allergy,2009,64(4):629-635. |
| [12] | Miyake Y,Tanaka K,Arakawa M.Association between 17q12-21 variants and asthma in Japanese women:rs11650680 polymorphism as potential genetic marker for asthma[J].DNA and Cell Biology,2014,33(8):531-536. |
| [13] | Lluis A,Schedel M,Liu J,et al.Asthma-associated polymorphisms in 17q21 influence cord blood ORMDL3 and GSDMA gene expression and IL-17 secretion[J].The Journal of Allergy and Clinical Immunology,2011,127(6):1587-1594,1586. |
| [14] | Moffatt MF,Kabesch M,Liang L,et al.Genetic variants regulating ORMDL3 expression contribute to the risk of childhood asthma[J].Nature,2007,448(7152):470-473. |
| [15] | Sy HY,Ko FW,Chu HY,et al.Asthma and bronchodilator responsiveness are associated with polymorphic markers of ARG1,CRHR2 and chromosome 17q21[J].Pharmacogenetics and Genomics,2012,22(7):517-524. |
| [16] | Zhao CN,Fan Y,Huang JJ,et al.The association of GSDMB and ORMDL3 gene polymorphisms with asthma:a meta-analysis[J].Allergy,Asthma and Immunology Research,2015,7(2):175-185. |
| [17] | 周兰岛,解继胜,赵洋,等.被动吸烟与家养宠物对儿童哮喘及哮喘样症状影响[J].中国公共卫生,2013,29(4):559-561. |
| [18] | Choudhry S,Avila PC,Nazario S,et al.CD14 tobacco gene-environment interaction modifies asthma severity and immunoglobulin E levels in Latinos with asthma[J].American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine,2005,172(2):173-182. |
| [19] | Dizier MH,Bouzigon E,Guilloud-Bataille M,et al.Evidence for gene x smoking exposure interactions in a genome-wide linkage screen of asthma and bronchial hyper-responsiveness in EGEA families[J].European Journal of Human Genetics,2007,15(7):810-815. |
| [20] | Meyers DA,Postma DS,Stine OC,et al.Genome screen for asthma and bronchial hyperresponsiveness:interactions with passive smoke exposure[J].The Journal of Allergy and Clinical Immunology,2005,115(6):1169-1175. |
| [21] | 吴金贵,钮春瑾,唐传喜,等.上海某区4-15岁儿童少年哮喘环境影响因素分析[J].环境与职业医学,2010,27(4):193-197. |
| [22] | Shi H,Cheng D,Yi L,et al.Association between ORMDL3 polymorphism and susceptibility to asthma:a meta-analysis[J].International Journal of Clinical and Experimental Medicine,2015,8(3):3173-3183. |
2016, Vol. 32

