中国公共卫生  2015, Vol. 31 Issue (5): 578-580   PDF    
脑膜炎奈瑟菌检测及基因分群
熊长辉, 杨梦, 刘晓青, 徐晓倩, 王鹏, 袁辉     
江西省疾病预防控制中心传染病所, 江西 南昌 330029
摘要目的 建立多重聚合酶链反应(PCR)技术对脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis, Nm)的快速诊断及分群方法。方法 应用多重PCR技术对本实验室保存的70株已鉴定Nm进行核酸鉴定及基因分群, 同时检测23例流行性脑脊髓膜炎(简称流脑)疑似病例脑脊液标本中脑膜炎奈瑟菌特异性DNA片段。用传统的细菌培养法和血清凝集法作对照, 比较其特异性。结果 68株Nm的多重PCR检测结果与血清分群结果一致, 2株血清未能分群的Nm经多重PCR检测为C群;23例流脑疑似病例脑脊液标本经多重PCR检测有5例为C群, 1例为A群,1例为B群,阳性检出率为30.43%。传统的病原分离培养、生化鉴定和血清学鉴定出4例为C群, 阳性检出率为17.39%。结论 多重PCR技术对脑膜炎奈瑟菌检测的特异性优于传统的细菌培养法以及血清凝集法。
关键词多重PCR     脑膜炎奈瑟菌     基因分群    
Application of multiplex PCR technology in rapid detection and genotype of Neisseria meningitidis
XIONG Chang-hui, YANG Meng, LIU Xiao-qing, et al    
Department of Infectious Disease, Jiangxi Provincial Center for Disease Control and Prevention, Nanchang, Jiangxi Provonce 330029, China
Abstract: Objective To study rapid detection and genotype of Neisseria meningitidis(Nm) using multiplex PCR detection technology.Methods Seventy strains of Nm were detected with multiplex PCR and the amplified Nm specific DNA fragments in cerebrospinal fluid samples from 23 suspected meningitis cases were also detected with electrophoresis; the results of the detections were compared with conventional staining on smears and bacterium separation technology.Results The genotyping results of 68 Nm strains were consistent with those of serotyping and 2 Nm strains undetected with serotyping were identified by multiplex PCR as group C.The positive detection rate was 30.43% by using multiplex PCR and higher than that by conventional staining on smears and bacterium separation technology(17.39%) for the detections of the 23 suspected meningitidis cases.Conclusion The sensitivity and specificity of multiplex PCR were higher than those of serum agglutination reaction for the identification and group-typing of Nm.
Key words: multiplex PCR     Neisseria meningitidis     genotype    

流脑是由脑膜炎奈瑟菌引起的起病急,病情发展迅速,如果治疗不及时很快引起死亡的急性呼吸道传染病。建立特异、快速的脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)检测与分群方法,提高病原菌的检出率,有效控制传染源,是控制流脑流行的最有效的途径。传统细菌分离培养、染色镜检、生化鉴定和血清学分群等检测方法不但费时费力,且检测结果受抗生素使用及其他非特异性因素的影响,检出率低。而Nm至少包括13个血清群,全球90%以上的流脑病人均有A、B、C、Y和W135群引起[1]。本研究采用多重PCR方法同时检测及鉴别Nm的A、B、C、Y和W135 5个血清群,结果报告如下。

1 材料与方法 1.1 标准菌株及样本

Nm各群的阳性对照质控菌株(中国药品生物制品检定所)分别为29019(A群)、29061(B群)、29012(C群)、29303(Y群)和29057(W135群)。阴性对照菌株为肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌和乳糖奈瑟氏菌(江西省疾病预防控制中心传染病所实验室分离并保存)。70份Nm分离株(江西省近年流脑临床患者、暴发疫情及带菌者调查中带菌者分离鉴定)23份疑似流脑病人脑脊液标本(江西省市县级疾病预防控制中心)。

1.2 试剂与培养基

营养琼脂、多粘菌素B、万古霉素(北京陆桥有限公司)。卵黄双抗平板、巧克力双抗平板本实验室自配。API NH 鉴定试剂(法国梅里埃公司),脑膜炎奈瑟菌单克隆抗体诊断血清(美国BD公司)。Taq酶、10×PCR buffer、dNTP Mixture、Marker(100 bp DNA Ladder)、Marker(500 bp)、6×Loading Buffer(宝生物工程(大连)有限公司)。PCR引物(上海生工公司合成)。PCR引物根据参考文献[2, 3, 4]设计(表 1)。

表 1 扩增Nm各群所用引物
1.3 主要仪器 微量高速离心机(德国eppendorf公司)、PCR

扩增仪(美国Bio-Rad公司)、自动凝胶成像仪(美国Bio-Rad公司)、电泳仪(中国上海天能科技有限公司TANONEPS-100)、超净工作台(中国苏净安泰SW-CJ-2FD)、培养箱(日本EYELA SLI-1200)、高速冷冻离心机(德国SIGMA 3-18K)、生物安全柜(美国Thermo公司)。

1.4 方法 1.4.1 PCR检测方法

挑取菌落于100 μL去离子水于eppendorf管中,放于金属裂解仪中100 ℃ 15 min 后,12 000 r/min 离心5 min,取上清即为PCR 扩增模板。将脑脊液吸取100 μL于 eppendorf管中,放于金属裂解仪中100 ℃ 15 min 后,12 000 r/min 离心5 min,取上清液用于PCR 扩增。反应总体积25 μL,在200 μL 管中依次加入:10×buffer 2.5 μL;dNTPS(每种dNTP 溶液浓度为2.5 mmoL/L) 2 μL ;引物每条1 μL(终浓度1 μmoL/L) ;Taq 酶0.5 μL(5 U/μL);超纯水8 μL ;模板2 μL 。以阳性对照质控菌株作阳性对照,肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌和乳糖奈瑟氏菌作阴性对照。反应程序:94 ℃ 5 min,变性模板DNA ;然后94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 45 s,35个循环;最后72 ℃延伸10 min 。PCR产物用3%琼脂糖凝胶电泳,500 bp 和100 bp DNA Ladder Marker作参照。

1.4.2 传统的细菌培养法和血清凝集法

取50 μL 脑脊液直接接种于巧克力培养基,37 ℃ 5%~10% CO2环境中培养18~24 h,观察细菌生长情况,挑取可疑菌落作氧化酶试验、革兰染色筛选,再采用API NH生化鉴定至种,采用A、B、C、Y、W135各群单克隆抗体血清分型。血清凝集分群按常规玻片凝集方法进行。

2 结果 2.1 PCR检测结果

70株Nm经多重PCR检测结果为8株A群,12株B群,48株C群和2株W135群,68株与血清分群结果一致。2株血清未能分群的菌株多重PCR检测结果为C群。检出率分别为100%和97.14%。23例流脑疑似病人的脑脊液标本5份检出NmC群siaD(C) 基因,1份检出NmA群Orf-2基因,1份检出NmB群siaD(B)基因。

2.2 传统的细菌培养法和血清凝集法结果(图 1)

23例流脑疑似病人的脑脊液标本作细菌培养,4份脑脊液标本培养出可疑脑膜炎奈瑟氏菌。经染色均为革兰阴性双球菌,氧化酶试验阳性,葡萄糖、麦芽糖均(+),蔗糖、乳糖、果糖均(-),血清学分群鉴定确认4株可疑菌株均为C群脑膜炎奈瑟氏菌,与多重PCR检测结果一致。多重PCR和病原分离培养检出率分别为30.43%和17.39%。Nm菌各群的特异基因均能准确的确定实验所检测的Nm菌株的血清群,作为对照的其他群Nm和阴性对照的金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌及乳糖奈瑟氏菌菌株均为阴性。

注:10:Marker;1~9依次为:NmA、NmB、NmC、NmY、NmW135、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌和乳糖奈瑟氏菌 图 1 多重PCR Nm各群的阳性对照质控菌株和阴性对照菌株扩增情况
3 讨 论

中国流脑的流行一直以A群为主,2003年以后开始出现C群流脑的暴发和局部地区的流行,近年来一些地区也出现了B群、X群、W135群等感染病例的报道[5, 6, 7]。A群和C群Nm感染可以通过疫苗接种进行预防,但是其它血清群的Nm尚无相应的疫苗,目前只能通过提前用药进行预防,因此,为了采取正确的防治措施,在流脑的诊断中有必要对Nm进行分群检测,这也有助于掌握Nm的血清群流行情况,以便针对性地接种或研发疫苗。快速检测和鉴定病原菌及分群,是及时有效地诊断、控制与预防流脑传播的重要手段。经典的检测方法包括增菌、分离培养、生化或血清学鉴定。这些方法操作繁琐、费时,也受到许多因素的影响,容易造成漏检。而且,对于那些在采样之前接受过抗生素治疗的病例,病原分离率会有一定程度的降低,另外,样品质量、培养条件、诊断血清的质量等一些因素也能影响培养阳性率。普通PCR[8]Nm的鉴定及分群是传统方法的一个飞越,但是对Nm的鉴定及分群时需要对每个血清群配置一个反应体系,即一个实验仅能对一个靶基因进行分析,操作时比较麻烦。虽然有人研发了荧光PCR[9, 10, 11],但是此方法对设备的要求较高,购买昂贵,实验室难以普及。

多重PCR以其突出的优越性得到了广泛的应用,自1988年Chamberlian等[12]首次提出这一概念起,多重PCR技术已被广泛应用于核酸诊断的许多领域,包括基因敲除分析[13]、突变和多态性分析[14]、定量分析以及RNA检测等。在感染性疾病领域,多重PCR技术也己经显示出它的价值。普通PCR及多重PCR对Nm基因分群的目的是了解其血清群,大多数情况下,与血清分群结果一致,但也有少数菌株,因为群特异性基因中有缺失、插入或滑移错配,使其荚膜不能正常表达,表现为血清不可分群,而这种基因序列的改变未能通过基因分群体现出来,因此出现了基因群与血清群不一致的情况[15, 16]

参考文献
[1] Stephens DS.Conquering the meningococcus[J].FEMS Microbiol Reviews,2007,31:3-14.
[2] Borrow R,Claus H,Guiver M,et al.Non-culture diagnosis and serogroup determination of meningococcal B an d C infection by a sialyltransferase(siaD) PCR ELISA[J].Epidemiol Infect,1997,118:111-117.
[3] Fraisier C,Stor R,Tenebray B,et al.Use of a new single multiplex PCR-based assay for direct simultaneous characterization of six Neisseria meningitidis serogroups[J].Journal of Clinical Microbiology,2009:2662-2666.
[4] Mlling P,Jacobsson S,Backman A,et al.Direct and rapid identification and genogrouping of meningococci and porA amplification by Light Cycler PCR[J].J Clin Microbiol,2002,40:4531-4535.
[5] Shao Z,Li W,Ren J,et al.Identification of a new Neisseria meningitidis serogroup C clone from Anhui province,China[J].Lancet,2006,367(9508):419-423.
[6] 汤健闻,梁华庆,吕冬艳.1962-2005年百色市流脑流行趋势分析[J].应用预防医学,2006,12(2):102-103.
[7] 徐丽.我国流脑发病的形势与预防[J].疾病监测,2002,(2):74.
[8] 熊长辉, 杨梦, 袁辉, 等.PCR 技术在流行性脑脊髓膜炎诊断中的应用研究[J].中国热带医学, 2009, 9(9):1660-1661.
[9] Thomas JD,Hatcher CP,Satterfield DA,et al.sodC-based real-time PCR for detection of Neisseria meningitidis[J].PLoS One 2011,6:319-321.
[10] Mothershed EA,Sacchi CT,Whitney AM,et al.Use of real-time PCR to resolve slide agglutination discrepancies in serogroup identification of Neisseria meningitidis[J].Clin Microbiol,2004,42:320-328.
[11] 杨艳, 汪川, 苏红卫, 等.脑膜炎奈瑟菌荧光定量PCR法检测[J].中国公共卫生, 2009,25(9):1086-1087.
[12] Chamberlain JS,Gibbs RA,Rainer JE,et al.Deletion screening of the Duchenne muscular dystrophy locus via multiplex DNA amplification[J].Nucleic Acids Res,1988,16(23):41-56.
[13] Gannon VP,King RK,Kim JY,et al.Rapid and sensitive method for detection of shiga-like toxin producing Escherichia coli in ground beef using the polymerase chain reaction locus via multiplex DNA amplification[J].Appl Environ Microbiol,1992,58(12):3809-3815.
[14] Rithidech KN,Dunn JJ,Gordon CR.Combining multiplex and touchdown PCR to screen murine microsatellite polymorphisms[J].Biotechniques,1997,23(1):36,40,42,44.
[15] Dolan-Livengood JM,Miller YK,Martin LE,et al.Genetic basis for nongroupable Neisseria meningitids[J].Infect.Dis,2003,187:1616-1628.
[16] Wber MV,Claus H,Maiden MC,et al.Genetic mechanisms for loss of encapsulation in polysialyltransferase-gene-positive meningococci isolated from healthy carriers[J].Med Microbiol,2006,296(7):475-84.