2. 泰山医学院生物科学学院
先天性心脏病(congenital heart disease,CHD) 是一类胚胎期心血管系统发育异常所引起的先天畸形,是人类发病率最高的出生缺陷,在足月和活产的新生儿中,CHD的发病率为4‰~10‰,目前已成为中国城市0~5岁婴幼儿死亡的首要原因[1]。CHD的病因及发病机制尚不清楚,目前认为大多数CHD是环境因素与遗传因素共同作用所致的多基因遗传病。近年来,在研究基因-环境交互作用的方法学上进展较快,包括分层分析方法(病例对照研究或单纯病例研究)、采用多因素logistic回归模型分析方法以及相对危险度的方法等[2, 3, 4]。本研究采用以医院为基础的病例对照研究方法,对2012年7月—2013年10月在山东省4家医院胸外科住院的137例CHD患儿及同期住院的132例无CHD及其他畸形的其他疾病患儿母亲进行问卷调查,并采集患儿空腹外周静脉血进行DNA提取和基因检测,应用叉生分析方法分析CHD致病MTHFR基因C677T位点突变与环境因素(孕期患病情况)的交互作用,旨在为CHD的病因研究提供新的分析方法。结果报告如下。 1 对象与方法 1.1 对象
将2012年7月—2013年10月在泰安市中心医院、泰安市儿童医院、济南市儿童医院及泰山医学院附属医院胸外科住院的137例CHD患儿作为病例组;选择此4家医院同期住院的132例无CHD及其他畸形的其他疾病患儿作为对照组。病例组与对照组患儿年龄均<14岁。所有CHD患儿均为经过临床诊断、彩色多普勒超声心动图诊断、X线检查确诊,并排除心脏血管之外的其他畸形者。 1.2 方法 1.2.1 问卷调查
自行设计调查问卷,由2组患儿的母亲在经统一培训的调查员指导下自行填写,填写完成后由调查员进行完整性、逻辑性检查无误后,当场收回问卷。内容包括患儿的性别、年龄及患儿母亲的年龄、文化程度、母亲孕期是否患病(包括感冒、发烧、妊高症等)。 1.2.2 标本采集
抽取病例组与对照组患儿的空腹外周静脉血2 mL,乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA)-Na2抗凝,置于-70 ℃ 冰箱备用。 1.2.3 DNA提取和基因检测
DNA提取和PCR扩增采用大连宝生物公司的全血DNA提取试剂盒,操作按说明书进行。PCR扩增所用上游引物:5′-TGA AGG AGA AGG TGT CTG CGG GA-3′,下游引物:5′-AGG ACG GTG CGG TGA GAG TG-3′。PCR反应体系总体积50 μL,PCR反应条件:95 ℃ 预变性5 min,然后40个循环(94 ℃ 变性30 s,55 ℃ 复性39 s,72 ℃ 延伸30 s),72 ℃ 延伸7 min,最后置于4 ℃ 保存。经PCR产物酶切后聚丙烯酰胺凝胶电泳观察结果判定各基因型。 1.3 统计分析
采用Excel 2007建立数据库,应用SPSS 13.0统计软件进行 χ2检验和秩和检验,采用叉生分析表法[4, 5, 6, 7] 分析CHD致病MTHFR基因C677T位点突变与环境因素(孕期患病情况)的交互作用。 2 结 果 2.1 一般情况
病例组137例CHD患儿中,男童72例(52.55%),女童65例(47.45%),中位年龄为2.26岁;患儿母亲年龄22~38岁,中位年龄为27.77岁;母亲文化程度初中及以下21人(15.33%),高中及职高85人(62.04%),大专及以上31人(22.63%)。对照组132例其他疾病患儿中,男童79例(59.85%),女童53例(40.15%),中位年龄为2.59岁;患儿母亲年龄22~37岁,中位年龄为26.83岁;母亲文化程度初中及以下10人(7.57%),高中及职高88人(66.67%),大专及以上34人(25.76%)。2组患儿及患儿母亲一般情况比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。 2.2 2组患儿MTHFR基因677位点基因型、等位基因频率比较(表 1)
对照组患儿MTHFR基因677位点基因分布Hardy-Weiberg遗传平衡检验结果显示,对照组MTHFR基因遗传平衡,具有人群代表性(χ2=3.651,P=0.161)。病例组与对照组MTHFR 677位点全基因型和等位基因频率比较,差异均有统计意义(χ2=13.045、17.045,P<0.01)。分别对病例组和对照组患儿CC、CT、TT 3种基因型频率进行比较,结果显示,2组患儿CC和TT基因型频率差异均有统计意义(χ2=8.411、10.181,P<0.01),CT基因型频率差异无统计意义(P>0.05)。
| 表 1 病例组与对照组患儿MTHFR基因677位点基因型频率比较 |
病例组137例CHD患儿中,MTHFR基因 677位点突变109例(79.56%),CHD患儿母亲孕期患病61例(44.53%);对照组132例其他疾病患儿中,MTHFR基因 677位点突变84例(63.64%),患儿母亲孕期患病21例(15.91%)。叉生分析结果显示,CHD致病MTHFR基因C677T位点突变与环境因素(孕期患病情况)基于相加模型的交互作用差异有统计学意义(U=2.060,P=0.020),各评价指标:SI=4.85,AP=70%,AP*=79%,RERI=5.64;基于相乘模型交互作用差异无统计学意义(P>0.05)。
| 表 2 MTHFR基因 677位点突变与环境因素交互作用叉生分析表 |
对于多基因、多环境因子及其交互作用的复杂疾病,需要利用统计方法例如叉生分析、logistic回归模型等来分析基因和环境因素的交互作用。本研究应用叉生分析表法以母亲孕期是否患感冒、发烧、妊高症为环境因素(E),MTHFR基因C677T位点突变为遗传因素(G),比较基于不同模型(相加和相乘模型)的2个因素对CHD的交互作用,结果显示,CHD致病MTHFR基因C677T位点突变与环境因素(孕期患病情况)基于相加模型的交互作用差异有统计学意义(U=2.060,P=0.020),基于相乘模型交互作用差异无统计学意义(P>0.05)。说明2个因素对CHD的交互作用表现为相加效应,但不具有相乘交互作用,与本课题组前期应用logtistic模型分析的结果一致[2, 8]。相加模型各评价指标:SI=4.85,说明2个因素间存在正相加交互作用,即同时存在2个因素时会使效应增强;AP=70%,说明因素间的交互作用较强;AP*=79%,说明由基因和环境2个因素引起的疾病效应中归因于两因素交互作用的比例相对较大;RERI=5.64,说明描述归因于交互作用的危险度较大。
本次分析可以看出,叉生分析表作为病例对照研究中基本的流行病学分析单元,具有计算简单、直观、信息量丰富等特点。利用叉生分析结果识别基因-基因、基因-环境的交互作用,可以合理地解释基因之间及基因与环境之间的交互作用。但是此分析方法也存在不足之处,即叉生分析表只可以分析2个二分类因素间的交互作用,末考虑其他不参加叉生分析的基因与环境因素的作用,所以应将其与多因素回归分析(如基于相乘模型的logistic回归分析、基于广义相对危险度模型的分析)相结合[6],才能得到更为合理的信息。因此,叉生分析表在流行病学分析,尤其是交互作用的分析中,其作用需要进一步挖掘利用。
| [1] | 杨思源.小儿心脏病学[M].3版.北京:人民卫生出版社,2005:85-96. |
| [2] | 李栋,纪龙,刘一志,等.孕期疾病与5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因对先天性心脏病影响的病例-对照研究[J].中国预防医学杂志,2013,14(8):586-589. |
| [3] | 仇小强,钟秋安,曹小云,等.孕期环境暴露因素与先天性心脏病关系[J].中国公共卫生,2008,24(5):601-602. |
| [4] | 王培桦,沈洪兵,陈峰,等.叉生分析在基因-环境交互作用研究中的应用与意义[J].中华流行病学杂志,2005,26(1):54-57. |
| [5] | 袁芳,刘盼盼,徐进,等.基因-基因(环境)交互作用分析方法的比较[J].宁波大学学报:理工版,2012,25(4):115-120. |
| [6] | 生利健,李金梅,方军凯,等.叉生分析在复杂疾病基因-基因、基因-环境交互作用研究中的应用[J].中国医院统计,2011,18(3):193-196. |
| [7] | Ottman R.Gene-environment interaction: definitions and study designs[J].Prev Med,1996,25:764-770. |
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2015, Vol. 31

