中国公共卫生  2010, Vol. 26 Issue (12): 1542-1543   PDF    
肠炎沙门菌临床分离株耐药性与耐药基因分析
刘雯静, 邱少富, 王勇, 王中强, 陈琛, 李婧, 张伶, 杜昕颖, 汪舟佳, 薛文仲, 黄留玉, 宋宏彬, 刘雪林    
中国人民解放军疾病预防控制所卫生学评价研究中心, 北京100071
摘要: 目的 对分离自北京、广州、新疆3个地区腹泻病人粪便标本中的肠炎沙门菌菌株进行耐药性监测,并分析其耐药基因的变异情况。方法 应用生化试验、血清凝集试验对分离的疑似沙门菌菌株进行鉴定。采用K-B药敏纸片法对鉴定出的肠炎沙门菌进行抗生素敏感性试验。利用PCR技术扩增其耐药基因DNA促旋酶gyrA基因和拓扑异构酶parC基因,同时进行测序。结果 共分离鉴定出20株肠炎沙门菌,分离菌株对环丙沙星、庆大霉素、头孢他定、亚胺培南的敏感率为100%,对萘啶酸耐药;75%的菌株呈现多重耐药性(multidrug resistance,MDR)序列比对结果显示gyrA基因Asp87及Gly133密码子处发生了点突变,其中Gly133是新的突变点。未发现parC基因密码子突变。结论 肠炎沙门菌临床分离株MDR情况比较严重,对萘啶酸普遍耐药,这可能与20株菌的gyrA基因QRDR的突变相关。为防止多重耐药现象的蔓延和加重,除了应加强耐药性及耐药性相关基因的实验室监测外,临床治疗沙门菌感染时需慎用抗生素。
关键词: 肠炎沙门菌     多重耐药性     DNA促旋酶gyrA基因     拓扑异构酶parC基因     喹诺酮耐药决定区    
Antimicrobial susceptibility test and resistance gene analysis of clinical isolates of Salmonella enteritidis
LIU Wen-jing, QIU Shao-fu, WANG Yong,et al    
Hygienic Assessment Center, Institute for Disease Control and Prevention, People's Liberation Army, Beijing 100071, China
Abstract: Objective To analyze drug resistance and the mutations of resistance genes of Samlonella enteritidis isolated from diarrhea patients in China.Methods The suspected strains were identified with conventional biochemical test and serum agglutination test.Antibiotic susceptibility test was performed according to KB methods.The DNA gyrase A and to poisomerase IV parC genes were amplified by PCR technique,and the amplified products were sequenced.Results Totally 20 Samlonella enteritid is strains were identified.All of the strains were sensitive to cipro floxacin,gentamycin,ceftazidmie and imipenem,and resistant to nalidixic acid.Of all strains,75% presented multi drugre sistance(MDR).Nucleotide sequence analysis showed that all of the strains had mutations in codonsAsp87 and Gly133 in quinolone resistance determining region(QRDR)of gyrAgene,while the Gly133 point mutation was novel.Mutation was not found in parC gene.Conclusion The results showed severe multi drug resistance of clinically isolated strains of Salmenella enteritidis,and nalidix acid resistance is common.This is probably attributable to pointmutations in QRDR of gyrA gene.The an tibiotics should be prudently used for the treatment of Samlonella infections.
Key words: Salmonella enteritidis     multi drug resistance     DNA gyrase A(gyrA)     topoisomerase IV(parC)     quinolone resistance determining region    

细菌性食物中毒是食源性疾病最主要的危险因素,其中沙门菌是常见的食源性疾病的首要病原菌之一1。肠炎沙门菌是沙门菌的一种常见血清型,也是引起食物中毒的重要病原菌。监测肠炎沙门菌的耐药性及其耐药基因的变异情况,对人类感染沙门菌的预防和控制具有重大意义。本研究对北京、新疆、广州3个地区的肠炎沙门菌临床分离株进行抗生素敏感性试验并对其耐药基因DNA促旋酶gy rA基因和拓扑异构酶parC基因进行PCR扩增和序列分析,旨在为临床治疗提供参考依据。

1 材料与方法 1.1 材料 1.1.1 菌株来源

菌株分离自200份腹泻标本(北京地区 49份,广州43份,新疆108份),腹泻标本由3个地区的医院提供。

1.1.2 试剂

LB肉汤增菌液、沙门/志贺菌选择性(Salmo-nella/Shigella,SS)琼脂、克氏双糖、营养琼脂、米勒-欣顿 (Mueller-Hinton,MH)琼脂(北京陆桥公司)、沙门菌属诊断血清(Murex,Dartford,United Kingdom)、0.85% NaCl、药敏纸片 (美国Oxiod公司)、细菌基因组DNA提取试剂盒(天根公司)、10 X ExTaq Buffer、ExTaq、dNTP、DL2000 DNA Marker (英国TAKARA公司)、引物(上海生工公司)。

1.1.3 主要仪器

PCR仪、水浴锅、37℃温箱、37℃摇床、台式高速离心机、电泳仪、电泳槽。

1.2 方法 1.2.1 菌株的分离鉴定

将3地区上送的菌液接种于LB肉汤增菌液37℃摇床培养过夜,次日,接种于沙门/志贺菌选择性SS平板37℃温箱过夜,然后挑取单克隆菌落接双糖斜面 37℃过夜,对疑似沙门菌的菌株用沙门菌属多价血清鉴定为沙门菌属后,再用沙门菌属诊断血清确认血清型。

1.2.2 抗生素敏感性试验

采用K-B药敏纸片法对肠炎沙门菌进行抗生素敏感性试验。大肠埃希菌ATCC25922和金黄色葡萄球菌25923作质控,结果判读采用美国临床实验室标准化协会(CLSI)标准2

1.2.3 gyrA、parC基因的PCR扩增

用DNA提取试剂盒提取基因组做模板,模板浓度稀释至100 ng/μL,根据沙门菌耐药基因gyrA、parC的喹诺酮耐药决定区(quino loneresistance-determining reg ion,QRDR)查找引物,引物序列参考文献〔3〕,由上海生工生物技术有限公司合成。PCR反应体系如下:50 μL体系,10 × EXTaq buffer (Mg2+plus)5 μL,EXTaq 0.3 μL,dNTP 4 μL,模板2 μL,上下游引物各1.5 μL,加灭菌纯水至50 μL。反应条件:94℃5 min,94℃30s,55℃30 s,72℃1 min,30个循环,最后72℃延伸5 min。1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增结果。

1.2.4 测序及分析

PCR产物送北京中科希林公司测序,采用双向测序,应用DNAStar软件整理序列后输入NCBI数据库中与野生敏感株Ty2进行blast分析。

2 结 果 2.1 菌株分离鉴定

共分离鉴定出20株肠炎沙门菌新疆地区7株,广州地区8株,北京地区5株。

2.2 抗生素敏感性试验

结果表明所有菌株均对环丙沙星、 庆大霉素、头孢他定和亚胺培南敏感,95%(19/20)的菌株对氟哌酸、氯霉素和左氧氟沙星敏感,比较敏感的有头孢噻肟 75%(15/20)、氨苄西林/舒巴坦75%(15/20)、阿莫西林/克拉维酸70%(14/20)。对萘啶酸普遍耐药,其次是氨苄西林 75%(15/20)、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑50%(10/20)、头孢噻肟 15%(3/20)、四环素5%(1/20)。耐3种或3种以上抗生素的菌株达75%(15/20),其中广州地区的多重耐药(Multidrug resistance,MDR)菌株占35%(7/20),新疆占30%(6/ 20),北京占10%(2/20)。

2.3 PCR产物电泳结果(图 1,2)
注: M: DNA m ark er D2000; 1 ~ 10: 10株肠炎沙门菌gyrA 基因PCR扩增目的片段; 11: 阴性对照。 图 1 部分菌株gyrA 基因PCR 产物电泳图

注: M: DNA m arker D2000; 1~ 10: 10 株肠炎沙门菌parC 基因PCR扩增目的片段; 11: 阴性对照。 图 2 部分菌株parC基因PCR 产物电泳图

20株菌gy rA、parC基因 PCR扩增结果均为阳性,目的片段大小分别为620,413 bp。

2.4 耐药基因测序

与野生敏感株Ty2序列比对结果显示,20株肠炎沙门菌gyrA基因Asp8及Gly133密码子处发生了点突变,3株Asp8% Asn、2株Asp8% Gly、15株Asp8% Tyr,20株Gly133% Glu,其中Gly133是新的突变点。未发现parC基因密码子突变。

3 讨 论

本研究结果显示,肠炎沙门菌对庆大霉素、头孢他定、亚胺培南的敏感率达100%,未检测到对环丙沙星耐药,这与某些报道一致4, 5。左氧氟沙星、氯霉素、氟哌酸的敏感率也较高,达95%(19/20),可为肠炎沙门菌感染的临床治疗提供一定参考。

近年来,肠炎沙门菌的耐药日益加重,对喹诺酮类等一线抗生素耐药的多重耐药(MDR)现象越来越多。陈建辉等6报道了一起由严重多重耐药的肠炎沙门菌引起的婴幼儿迁延性腹泻。本研究结果显示,20株肠炎沙门菌中75%(15//20) 的菌株对3种或3种以上抗生素耐药,其中广州地区的多重耐药(MDR)菌株占35%(7/20),新疆占30%(6/20),北京占 10%(2/20)。本研究中的菌株对萘啶酸均耐药,这可能与gyrA基因喹诺酮耐药决定区(QRDR)的突变相关。所有菌株的gy rA基因喹诺酮耐药决定区(QRDR)均存在Asp87、Gly133密码子的突变,Ser83和Asp87是喹诺酮类耐药株最常见的gy rA基因的突变密码子7, 8, 9, 10, 11,本研究未发现Ser83密码子突变,而普遍存在Asp87突变。gyrA基因编码DNA促旋酶的A亚基,包含喹诺酮耐药决定区,是一种Ⅱ型拓扑异构酶,在DNA超螺旋的形成中起重要作用,是喹诺酮类药物作用的首要靶位,parC基因编码DNA拓扑异构酶IV的一个亚基,与 gyrA基因是同源的,该基因编码喹诺酮类药物作用的次级靶位12。本研究未发现parC基因突变。G ly133密码子突变是新的突变,其对沙门菌耐药性的影响和作用尚不明确,有待进一步的研究。肠炎沙门菌临床分离株多重耐药情况严重及可能与抗生素的使用不当有关,腹泻患者就诊前不规范服用抗生素或者医院治疗时不合理的滥用抗生素导致了细菌对萘啶酸、氨苄西林、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑、头孢噻肟、四环素的耐药,给沙门菌感染的控制和治疗带来不利影响。为防止多重耐药的蔓延和加重,应加强对细菌耐药性和耐药基因的监测,并规范临床及畜牧业抗生素的应用。

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