类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis, RA)与系统性红斑狼疮(systematic lupus erythematosus, SLE)是病因不明的自身免疫性疾病, 认为与环境、免疫、多基因遗传等因素有关, 至今仍无有效的治疗方法。国外研究发现〔1-3〕, 蛋白酪氨酸磷酸酶N22(Protein Tyrosine Phosphatase 22, PTPN22)基因是RA及S L E的易感基因, 其单核苷酸多态性(Single-nucleotid poly-morphism, SNP) 1858 C/T被认为是RA及SLE的易感位点, 但对不同种族、不同地域人群的研究结果并不完全一致。为了解贵州省汉族人群RA及SLE与PTPN22基因1858C/T多态性的相关性, 本研究选取2005-2006年贵阳医学院附属医院部分确诊病例和健康体检者进行了观察。现将结果报告如下。
1 对象与方法 1.1 对象(1) RA病例组:选取贵阳医学院附属医院2005 -2006年住院及门诊确诊的RA病例110例, 其中女性75例, 男性35例, 均为汉族, 年龄16~76岁, 平均33.2岁; 诊断均符合美国风湿协会(ACR) 1987年诊断标准〔4〕。(2) SLE病例组:选取贵阳医学院附属医院2005-2006年住院及门诊确诊的SLE病例98例, 其中女性70例, 男性28例, 均为汉族, 年龄15~76岁, 平均33.8岁, 诊断均符合美国风湿协会系统性红斑狼疮1982年诊断标准〔4〕。(3) 正常对照组:在贵阳医学院附属医院门诊健康体检者中随机选取120人, 其中女性80人, 男性40人, 均为汉族, 年龄18~62岁, 平均33岁。
1.2 方法 1.2.1 标本采集及基因组DNA提取抽取调查对象外周血2 mL, -20 ℃冰冻保存, 基因组DNA提取采用酚-氯仿抽提法, 其A260/A280为1.6~1.8, 使用时DNA终浓度为100~300 ng/μL。
1.2.2 PTPN22基因1858C/T位点多态性分析(1) PCR扩增:以基因组为模板, 扩增包含PTPN22 1858C/T位点的片段。引物序列〔5〕:上游引物5′-TCA CCA GCT TCC TCA ACC ACA-3′, 下游引物5′-GAT AAT GTT GCT TCA ACG GAA TTT A-3′, 扩增片段为215 bp; 引物由上海生工生物工程技术有限公司合成。反应体系为25 μL, 含10 ×PCR buffer 2.5 μL, 2.5 mmol dNTP 2.0 μL, 10 pmol/μL引物各1.5 μL, 二甲基亚砜(DMSO) 1.2 μL, 模板2 μL,Taq酶0.5 μL (1.25U), 总体积25 μL。循环参数: 94 ℃预变性2 min; 94 ℃变性30 s, 60 ℃退火30 s, 72 ℃延伸30 s, 35次循环; 72 ℃延伸2 min。以上反应均在梯度扩增仪(英国TECHNE公司)上完成, PCR产物经2%琼脂糖凝胶电泳, BIO-RAD凝胶成像扫描仪上观察结果。(2) 限制性片段长度多态性分析:用限制性内切酶Xcm Ⅰ(美国NEB公司; 识别位点5′CCANNNNN′NNNNTGG 3′)消化PCR产物; 反应体系: PCR产物3.5 μL, 10 ×缓冲液(NEB)2 μL, Xcm Ⅰ 0.6 μL, 加水至20 μL, 混合后瞬时离心, 37 ℃孵育14~16 h。8%聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)、银染色观察其多态性, 若为1858C, PCR产物不能被Xcm Ⅰ切割; 若1858C突变为T, 则提供1个Xcm Ⅰ切割位点, 215 bp的PCR产物则被Xcm Ⅰ切割成169和46 bp。
2 结果 2.1 PCR扩增产物鉴定(图 1)
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注:1:50 bp Ladder Maker;2~9:阳性扩增产物条带(215 bp)。 图 1 PTPN22基因PCR产物的电泳结果 |
包含1858C/T多态位点的PTPN22基因的PCR扩增产物经2%琼脂糖凝胶电泳, 在200~250 bp间约215 b p处可见一明显条带, 与理论预期相符。
2.2 多态性电泳图谱(图 2)
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注:1~12:CC型;13:50 bp ladder Mark。 图 2 Xem Ⅰ酶切PTPN22基因扩增产物的电泳结果 |
215 bp DNA扩增产物为CC型,不能被切割;可切割为169与46 bp的酶切产物为TT型;可切割为215,169与46 bp 3个产物的为CT型。
2.3 3组基因型频率比较110例RA病例、98例SLE病例与120名正常对照者的PTPN22 1858C/T基因型均为CC型, 1858C等位基因频率均为100%。
3 讨论Matthias Pierer等〔5〕研究发现, PTPN22基因的错义单核苷酸多态性1858C/T与RA及SLE等自身免疫性疾病遗传性相关, RA与PTPN22的T等位基因的携带有关, 并且疾病的程度、类风湿因子(Rheumatoid factor, RF)状况与抗环瓜氨酸肽(anti-cyclic citrullinated peptide, CCP)抗体的状况与T等位基因的携带也有关系。美国、澳大利亚、法国、英国〔6-9〕等国家也相继报道了PTPN22基因突变与RA及SLE等自身免疫性疾病相关, 均指出PTPN22是一种RA及SLE的易感基因, 但对不同种族、不同地域人群的研究结果并不完全一致, 说明这种遗传相关性与种族差异有关。IkariK等〔10〕研究发现, 日本正常人群与RA人群中均未发现1858C/T多态性, 他认为PTPN22基因多态性仅与部分种族群体相关。本研究对贵州省人群RA及SLE的PTPN22基因1858C/T多态性观察结果显示, RA患者组及SLE患者组与正常对照组中均未发现1858T突变基因, 与Ikari的研究结果一致, 提示PTPN22基因1858C/T多态性与贵州省汉族人群RA及SLE可能无相关性。但有条件时应进一步扩大病例和地区的研究。
| [1] | Oliver JE, Worthington J, Silman AJ. Genetic epidemiology of rheumatoid arthritis[J]. Curr Opin Rheumatol, 2006, 18(2) : 141–146. DOI:10.1097/01.bor.0000209425.84775.23 |
| [2] | Begovich AB, Carlton VE, Honigberg LA, et al. A missense single-nucleotide polymorphism in a gene encoding a protein tyrosine phosphatase (PTPN22) is associated with rtieumatoid arthri-tis[J]. Am J Hum Genet, 2004, 75(2) : 330–337. DOI:10.1086/422827 |
| [3] | Kyogoku C, Langefeld CD, Ortmann WA, et al. Genetic association of the R620W polymorphism of protein tyrosine phosphatase PTPN22 with human SLE[J]. Am J Hum Genet, 2004, 75(3) : 504–507. DOI:10.1086/423790 |
| [4] | 张乃峥. 临床风湿病学[M]. 上海: 上海科学技术出版社, 1999: 126-193. |
| [5] | Pierer M, Kaitenhauser S, Arnold S, et al. Association of PTPN22 1858 single-nucleotide polymorphism with rheumatoid arthritis in a German cohort: higher frequency of the risk allele in male compared to female patients[J]. Arthritis Res Ther, 2006, 8(3) : R75. DOI:10.1186/ar1945 |
| [6] | Carlton VB, Hu X, Chokkalingam AP, et al. PTPN22 genetic variation: evidence for multiple variants associated with rheumatoid arthritis[J]. Am J Hum Genet, 2005, 77(4) : 567–581. DOI:10.1086/468189 |
| [7] | Zheng W, She JX. Genetic association between a lymphoid tyrosine phosphatase (PTPN22) and type 1 diabetes[J]. Diabetes, 2005, 54 : 906–908. DOI:10.2337/diabetes.54.3.906 |
| [8] | Dieude P, Gamier S, Michou L, et al. Rheumatoid arthritis seropositive for the rheumatoid factor is linked to the protein tyrosine phosphatase nonreceptor 22-620W allele[J]. Arthritis Res T-her, 2005, 7(6) : R1200–R1207. DOI:10.1186/ar1812 |
| [9] | Velaga MR, Wilson V, Jennings CE, et al. The codon 620 tryptophan allele of the lymphoid tyrosine phosphstase (LYP) gene is a major determinant of Graves'disease[J]. The Journal of Clinical Endocrinology Metabolism, 2004, 89(11) : 5862–5865. DOI:10.1210/jc.2004-1108 |
| [10] | Ikari K, Momohara S, Inoue E, et al. Haplotype analysis revealed no association between the PTPN22 gene and RA in a Japanese population[J]. Rheumatology (Oxford), 2006, 45(11) : 1345–1348. DOI:10.1093/rheumatology/kel169 |
2009, Vol. 25
