中国公共卫生  2009, Vol. 25 Issue (5): 574-575   PDF    
猪链球菌2型多重PCR鉴定方法建立
胡玉山, 刘俊华, 庞杏林, 候水平, 邓志爱, 陈守义     
广东省广州市疾病预防控制中心微检科, 510080
摘要: 目的 建立猪链球菌2型多重PCR鉴定方法。 方法 根据猪链球菌种特异基因16S rRNA序列和猪链球菌2型特异性荚膜多糖编码基因cps2 J基因序列, 设计和合成2对特异引物, 通过条件和体系优化, 建立多重PCR检测方法。 结果 猪链球菌2型参考株及18株分离株均扩增到清晰的目的条带, 而6株非猪链球菌2型参考菌株不能扩增出目的条带。 结论 多重PCR可以用于猪链球菌2型检测, 特异性和敏感性好, 为该病的快速诊断和分子流行病学调查提供了新的技术方法。
关键词猪链球菌2型     多重PCR     鉴定分析    
A multiplex PCR assay application in identification of Streptococcus suis type 2
HU Yu-shan, LIU Jun-hua, PANG Xing-lin, et al     
The Center for Disease Control and Prevention of Guangzhou, Guangzhou 510080, China
Abstract: Objective To develop a rapid identification method for Streptococcus suis type 2 with multiplex PCR assay. Methods According to specific sequence of Streptococcus suis type 2, two pairs of multiplex PCR priners were designed for Streptococcus suis amplification and identification.Then the amplification conditions were optinized. Results The ain gene fragment for 17 isolates and 1 reference of Streptococcus suis type 2 were amplified with multiplex PCR assay, but it could not be amplified for 6 other reference bacteria. Conclusion The multiplex PCR assay could be used to identify and provide a new methodology for Streptococcus suis type 2 identification.
Key words: Streptococcus suis type 2     multiplex PCR assay     identification    

传统的微生物学检验技术能够分离出猪链球菌, 但很容易同时分离出其他种的链球菌, 近些年来应用的几种分离技术方法通常既费时又费力, 而且敏感性不高1。为了更好地预防猪链球菌病的发生, 有效控制病原菌的传播与流行, 必须建立快速、敏感且特异的诊断方法。猪链球菌2型是流行最广、致病性最强的猪链球菌血清型2。同时,16S rRNA基因是猪链球菌种特异基因3,荚膜多糖编码基因cps2J是猪链球菌2型特异基因4。因此,本研究根据GenBank中报道的猪链球菌种特异基因16S rRNA基因序列和猪链球菌2型特异性荚膜多糖编码基因cps2J基因序列,设计和合成2对特异引物,通过对反应条件和体系进行优化,建立猪链球菌2型多重PCR检测方法。

1 材料与方法 1.1 材料

(1)猪链球菌2型菌株:共18株,其中分离自花都医院患者3株(2007SF0165, 2006SF0140, 2006SF0146,广州市疾病预防控制中心保存),分离自病猪14株(华南农业大学),猪链球菌2型参考菌株1株(98HAH33,达安生物有限公司惠赠); (2)其他菌株:溶血性链球菌CMCC32210,鼠伤寒沙门菌CMCC50115,金黄色葡萄球菌ATCC25923,大肠埃希菌ATCC25922, 变形杆菌CMCC49005,副溶血性弧菌ATCC4750等(均为本室保存)。

1.2 方法 1.2.1 菌株培养和模板DNA提取

将菌株复苏后接种于相应的增菌培养基培养18~24 h然后转种至血平板培养18~24 h, 在平板上挑取2~3个单个菌落与100 μl灭菌纯水研磨混匀,95 ℃ 10 min, 10 000 r/min离心5 min, 取上清作为DNA模板。

1.2.2 多重PCR引物设计与合成

根据GenBank中报道的猪链球菌种特异基因16S rRNA序列(Genbank accession No.NC 009443 SSU98_0578)和猪链球菌2型特异性荚膜多糖编码基因cps2J基因序列(Genbank accession No.NC 009443 SSU98_0818),运用Primer 5.0设计2对特异引物,16S rRNA上游引物:5′-cagtatttaccgcatggtagatat-3′, 下游引物:5′-gtaagataccgtcaagtgagaa-3′, 扩增片段为300 bp左右,cps2J上游引物:5′-gttgagtccttatacacctgtt-3′,下游引物:5′-cagaaaattcatattgtccacc-3′,扩增片段为450 bp左右,引物由上海生工公司合成。

1.2.3 多重PCR扩增及条件优化

分别采用单一引物,对扩增相应目的基因片段进行PCR扩增条件摸索, 然后进行多重PCR扩增条件筛选及优化。最后采用多重PCR扩增的条件:50 μl PCR反应体系中,含10×PCR反应缓冲液5.0 μl, 25 mmol/L MgCl 23.0 μl, 10 mmol/L dNTP 1.0 μl, 16S rRNA上游引物(25 pmol/μl) 1.0 μl, 16S rRNA下游引物(25 pmol/μl)1.0 μl, cps2J上游引物(25 pmol/μl) 1.0 μl, cps2J下游引物(25 pmol/μl) 1.0 μl, 模板DNA 5.0 μl, Taq酶(5 U/μl) 0.6 μl, 灭菌双蒸水补足至总体积50 μl。将PCR反应体系置于PCR热循环仪上, 94 ℃ 5 min; 94 ℃ 30 s, 60 ℃ 30 s, 72 ℃ 60 s共30个循环。最后, 72 ℃延伸10 min。

1.2.4 PCR扩增产物电泳检测

取5 μl PCR产物和1 μl 6×上样缓冲液充分混匀置2.0%琼脂糖凝胶(含溴化乙锭替代物Goldview)电泳。电压5 V/cm, 电流40 mA, 电泳缓冲液0.5×三羟甲基氨基甲烷-硼酸盐-乙二胺四乙酸(TBE)。凝胶成像仪观察结果并拍照。

1.2.5 敏感性试验

猪链球菌血平板培养基37 ℃培养18~24 h后,刮取菌落用灭菌双蒸水配成1个麦氏浓度菌悬液, 再以灭菌双蒸水对猪链球菌株进行10倍连续稀释, 得到100~108 cfu/ ml的浓度, 从各浓度度中取5 μl进行多重PCR分析, 评价其敏感性。

2 结果 2.1 单一引物PCR扩增(图 1图 2)
注:M:100 bp marker; 1:溶血性链球菌; 2:200 7SF0 165;3:2006SF0140;4:2006SF0146;5:98HAH33;6:鼠伤寒沙门菌; 7:金黄色葡萄球菌。 图 1 16S rRNA PCR扩增

注:M:100 bp marker; 1:溶血性链球菌; 2:2007SF0165;3:2006SF0140;4:2006SF0146;5:98HAH33;6:鼠伤寒沙门菌; 7:金黄色葡萄球菌。 图 2 cps2J PCR扩增

16S rRNA基因片段引物均能扩增出18株猪链球菌2型, 产物大小约为300 bp左右, 而在同一条件下扩增的溶血性链球菌、鼠伤寒沙门菌、金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、变形杆菌、副溶血性弧菌等均未扩增出目的片段。cps2J基因同样在18株猪链球菌2型中能扩增出450 bp左右的目的片段, 而同时参与扩增的溶血性链球菌、鼠伤寒沙门菌、金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、变形杆菌、副溶血性弧菌等均未见目的片段。表明所设计的PCR引物的扩增结果特异性很高。

2.2 多重PCR扩增(图 3)
注:M:100 bp marker; 1:溶血性链球菌; 2:2007SF0165;3:2006SF0140;4:2006SF0146;5:98HAH33;6:鼠伤寒沙门菌; 7:金黄色葡萄球菌。 图 3 16S rRNA与cps2J多重PCR扩增

多重PCR均能扩增出18株猪链球菌2型。图 3可见, 4株猪链球菌2型均扩增出300 bp左右的16S rRNA基因片段和450 bp左右的cps2J基因片段, 溶血性链球菌、鼠伤寒沙门菌、金黄色葡萄球菌, 都未扩增出任何目的片段, 表明此方法用于猪链球菌2型的快速鉴定特异性较高。

2.3 多重PCR敏感性

PCR在所作的稀释度中, 10 cfu/ ml以上均很好的扩增出了目的条带, 敏感性较高。

3 讨论

由猪链球菌引发的猪链球菌病是全球性公共卫生问题, 在世界许多国家均有报道, 并引起广泛流行5。目前PCR技术在病原菌的检测与诊断方面被广泛应用。本研究设计的多重PCR反应体系共有2对引物, 在一个反应体系里有4条引物, 而多重PCR并非单一引物对PCR的简单组合6。在进行条件摸索时发现, Mg2+、dNTPs、酶的用量以及循环条件等均需进行优化, 尤其是DNA链退火温度。适当提高Mg2+、dNTPs的浓度, 能取得较好效果, 酶的用量与单独扩增相似时, 效果已很理想, 量不宜过大, 否则会出现拖带和非特异扩增。本文结果表明, 该特异多重PCR方法简便、快速, 同时特异性和敏感性也良好, 并且仪器试剂成本低, 技术容易掌握, 适合基层单位应用。

参考文献
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