中国公共卫生  2008, Vol. 24 Issue (5): 623-624   PDF    
不明原因发热病人血清中登革病毒核酸检测
周永兵1,2, 左丽1, 刘伟1, 谢庭华3, 何成友4, 王定明5     
1. 贵阳医学院免疫学教研室, 贵阳 550004;
2. 江苏省镇江市第一人民医院;
3. 贵州省独山县疾病预防控制中心;
4. 贵州省兴义市疾病预防控制中心;
5. 贵州省疾病预防控制中心
摘要目的 对贵州省独山县、兴义市两地夏秋季不明原因发热病人血清进行登革病毒(DEN)核酸检测,以了解贵州省人群DEN的感染情况. 方法 2005年6~10月份,收集贵州省独山县、兴义市不明原因发热病人血清356份;用常规碘化钠法提取发热病人血清总RNA,用DEN NS1基因区特异性通用引物进行逆转录-聚合酶链式反应法(RT-PCR),对部分目的条带进行序列测定,并进行氨基酸序列预测和序列同源性分析. 结果 贵州省独山县、兴义市两地夏秋季不明发热病人血清中DEN NS1基因区的核酸阳性率为9.83%(35/356);对其中7份标本(兴义5份,独山2份)进行序列测定,均为DEN-2;根据核酸序列进行同源性分析,证实其与DEN-2-43同源性较高,为97.4%(525/539),7份标本之间的同源性为97.6%(526/539). 结论 贵州省独山县、兴义市两地人群中存在DEN感染.
关键词贵州     登革病毒     核酸检测     序列分析    
Detection and separate of Dengue virus nucleic acid in blood serum of patients with unknown fever in Guizhou
ZHOU Yong-bing, ZUO Li, LIU Wei, et al     
Department of Immunology, Guiyang Medical College Guiyang 550004, China
Abstract: Objective To detect Dengue virus nucleic acid in blood serum of patients with unknown fever in Dushan and Xing yi of Guizhou,China in the summer and autumns.Inquiry into the sourec,the evolution characteristics and the relation between the base change and virulence,lay the foundation for immuno genicity and immunologic protection of Deng ue virus. Methods Distill Dengue virus DN A by reverse transcriptase polymerase chain reaction(RT-PCR)and detect target cDNA and inoculate C6/36 cells with the blood serum. Results Positive probability of Dengue virus nucleic acid is 98%(35/356) in the blood serum samples and seven samples(five of Dushan and and two of Xingyi)were carr ied through sequence analysis.They are Dengue virus type 2(DEN-2)through sequence analysis and phylogenic tree,with the same source of DEN- 2-44 and DEN-2-43,and the same with DEN-2-M that detected from Aedes albo pictus in Guizhou in 2003.Inoculat ing C6/36 cells with the blood serum,positive probability is 1.6%(6/356)from RT-PCR detection. Conclusion There was Dengue virus infection among the population of Guizhou province,China.
Key words: Dengue virus     sequence analysis     virus separate    

登革病毒(Dengue Virus,DEN)是白纹伊蚊(Aedes albopictus)及埃及伊蚊(Aedes aegypti)传播黄病毒属(flaviviridae)的家族成员,为一种单股正链RNA病毒。目前,贵州省DEN尚无感染疫情报告,但贵州省白纹伊蚊分布密度较高,并对DEN普遍易感[1]。2002年本实验室从贵州省麻尾地区的自然界白纹伊蚊体内分离到1株DEN-2;证明兴义市等地自然界白纹伊蚊体内存在DEN核酸,贵州省具备DEN感染自然条件。本研究于2005年6~10月采集贵州省独山县、兴义市不明原因发热病人的血清标本进行检测分析,旨在为贵州省预防和控制DEN感染提供科学依据。

1 材料与方法 1.1 标本

于2005年6~10月由独山县、兴义市疾病预防控制中心协助采集不明原因发热病人血清356份。

1.2 方法 1.2.1 DEN

NS1基因区通用引物的合成根据《全国登革热监测方案》提供的DEN NS1区DEN1~4型通用引物,由北京赛百盛公合成1对扩增序列长度均为539bp引物。引物序列为:上游引物(P+):5′-GTGCACATTGACAGAACA-3′下游引物(P-):5′-CTTTCTATCCAATAACCCAT-3′。

1.2.2 总RNA提取

改良碘化钠法提取血清中总RNA。

1.2.3 逆转录-聚合酶链式反应法(RT-PCR)

取样本RNA作为模板作逆转录合成cDNA链,然后进行PCR扩增。循环反应条件:RT,42℃ 60min,95℃ 5min;PCR,94℃预变性5min;94℃ 40s,55℃ 45s,72℃ 60s,进行30次循环。UVP-凝胶成像仪观察成像并记录实验结果。同时作阳性对照(DEN-2参考株的cDNA作模板)和C6/36细胞对照,以监控扩增质量。

2 结果 2.1 RT-PCR法检测登革病毒核酸

发热病人血清标本接种于6/36细胞,用登革热病毒(DEN NS1)基因区特异性引物经RT-PCR检测病毒核酸,可见在500~600bp范围内有一条带,与预期的539bp相符,而正常C6/36细胞上清未见到任何条带。对1~3份标本的DEN病毒核酸进行了序列测定。结果与相应血清中直接PCR检测到DEN NS1核酸序列一致。从356份血清标本中检测到DEN检酸35份,阳性率为9.83%。由大连宝生物工程有限公司对其中7份标本的PCR产物进行纯化并测序。结果显示,7份DEN NS1基因部分碱基序列与NGC株分别比较有差别,不同标本DEN NS1基因部分碱基序列也有差异(表 1)。

表 1 7份标本DEN-NS1部分序列与NGC株相应序列比较

2.2 序列同源性分析

结果显示,将测序所知的核苷酸序列与基因库(GenBank)中选取16株较完整的DEN-2 NS1区相应的核酸序列资料(海南DEN-2-04株、海南DEN-2-44、马来西亚Nc-001474株、泰国16681株、台湾Taiwan-1008株、古巴Cuba205/97株、印度尼西亚TB16i株、多米尼加DR23/01株、牙买加Jamaica/N.1409株、澳大利亚TSV01株、福建FJ-10株、福建FJ-11株、广西DEN-43株、日本ThNH81/93株、法国H/IMTSSA-MART/98-703株、NGC株),进行多组核酸序列同源性比较,结果与DEN-2-43同源性较高,为97.4%(525/539);7份株本之间的同源性为97.6%(526/539)(图 1)。

图 1 DEN-2 NS1基因区核酸序列同源性比较

3 讨论

DEN主要由埃及伊蚊及白纹伊蚊传播的RNA病毒,其流行病学是一个非常复杂的过程。目前对其流行规律、流行间隔时间及致病机制尚不完全清楚[2]。我国目前登革热(DF)流行地区均处于北纬23°5′以南的热带及临近热带的亚热带地区[3],其流行与白纹伊蚊的分布及带毒率有着密切关系[4]。贵州省位于北纬24°38′~29°14′之间,虽无埃及伊蚊分布,但有白纹伊蚊的广泛分布且对DEN普遍易感。与我省毗邻的广西、云南等省近年来均有DEN感染流行或者从自然界蚊体内分离到DEN的报道。本实验室2002年从贵州省麻尾地区的自然蚊虫体内成功地分离出1株DEN-2,证明兴义市等地自然界白纹伊蚊体内存在DEN核酸,说明贵州省存在DEN感染流行的可能性。本研究通过对贵州省独山县、兴义市两地夏秋季不明原因发热病人血清中进行DNE核酸检测,其阳性率为9.83%。证明贵州省独山县、兴义市两地人群中存在DEN的散发感染。对其部分RT-PCR产物进序列测定,结果显示其碱基序列与NGC株之间存在一定的差异,相互之间也存在差异。

参考文献
[1] 舒莉萍, 左丽, 赵星, 等. 贵州白纹伊蚊对登革病毒易感性的研究[J]. 中华实验和临床病毒学杂志, 2004, 18(3) : 234–237.
[2] De Oliveira Poerseh c, Pavoni DP, Queiroz MH, et al. Dengue virus infections[J]. Clin Viml, 2005, 32 : 272–277.
[3] 张海林, 自登云, 龚正达. 云南省登革热流行病学调查分析[J]. 地方病通报, 1999, 14(3) : 50–53.
[4] Vijayakumar TS, Chandy S, Stahish N, et al. Is Dengue emerging a major public health problem[J]. Indian J Med Res, 2005, 121(2) : 100–107.