2. 深圳市疾病预防控制中心毒理研究室
沉默信息调控子2(the silent information regulator2,SIR2) 是一种高度保守,具有烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotimide adenosine dinucleotide,NAD)依赖性的组蛋白去乙酰基转移酶,调控酵母、蠕虫和果蝇的生命周期,及哺乳动物的应激反应。SIR2参与转录和重组沉默,对于染色质沉默及细胞其他一些功能具有重要作用。哺乳动物有7种SIR2同源体SIRT1-SIRT7,SIRT1是与酵母SIR2最接近的同源物。SIRT1作用一系列底物,调控细胞对氧化应激和基因毒性的抑制作用[1],对其生物学特性作用机制的深入研究,有助于揭示其在细胞衰老及年龄相关性疾病中的重要作用。
1 SIRTl生物学特性Sirtuinl(SIRTl)是NAD+依赖的去乙酰基转移酶,在表遗传基因沉默、DNA重组和修复、细胞周期、微管组装和衰老调控中起重要作用。人SIRT1定位于10q21.3,基因组序列33660bp,有9个外显子编码,从80 bp(exon6) 到2120bp(exon9) 。在Sirt1开放阅读框架之前,除了一个350bp CpG岛之外,基因组5端显示一个CCAAT盒,许多NF-kappaB和GATA转录因子结合位点。人SirtlmRNA为4107bp,有一个2244bp开放阅读框架,编码747aa的蛋白质,分子量81.7 kDa,等电点4.55[2]。
基于酵母转录抑制子同源性,人类有3类特异的组蛋白去乙酰基转移酶(histone deacetylase,HDACs)。I类和II类HDACs分别是酵母蛋白和组蛋白去乙酰基转移酶A1的同源物,可被曲古抑菌素(trichostatin A,TSA)和其他一些含羟氨基相关的有效抑制剂抑制。III类HDACs即Sir相关蛋白sirtuins(SIRTs),是酵母SIR2p同源物,是一种TSA不敏感的组蛋白去乙酰基转移酶,需要NAD作为辅助因子,作为一种染色质沉默子调控芽殖酵母的重组-基因组稳定性和衰老。
SIRT1-7均有高度保守的催化结构域。在体外其酶活性主要体现于组蛋白底物,但最近研究显示,其主要对核内和胞质内非组蛋白有去乙酰化作用。SIRT1是一种核内蛋白,通过p53调控细胞的应激反应和存活,还对TAFI68(Tara box-结合蛋白相关因子I),PCAF(p300/CBP-associated factor),成肌细胞决定蛋白,p300和Forkhead转录因子(FOXOs),核因子kappa B p65亚单位及Ku70调聚蛋白[3]有脱乙酰化作用。
2 SIRTl与转录因子哺乳动物SIRT1可使组蛋白H3氨基末端赖氨酸9和14,H4赖氨酸16去乙酰化,也与不同的转录因子相互作用并参与调控,如p53,FOXOs,脂肪调控因子和过氧化物酶增殖活化受体-γ(PPAR-γ)等。
2.1 SIRT1与p53SIRT1使p53去乙酰化,调控体内依赖p53的过程,具有乙酰基-赖氨酸特异性,直接发生在p53C端赖氨酸382位点,促进其序列特异性结合,抑制其转录活性[4, 5]。SIRT1去乙酰化反应能直接与I类和II类HDACs共同作用,联合调控p53。此外SIRT1能通过募集到p53靶启动子处,介导其抑制性功能,导致低乙酰化核小体转录沉默。染色质免疫沉淀实验中,SIRTl与p53靶基因p21启动子相关。目前已观察到SIRTl在体内直接结合至人类P53蛋白,并使其K382残基去乙酰化,这一去乙酰化功能作为一种转录因子在p21WAF1启动子区域削弱P53蛋白活性[4]。SIRT1与p53结合,调控对氧化应激和DNA损伤的p53依赖性凋亡。
SIRTl抑制对DNA损伤和氧化应激的p53依赖性凋亡,并在依托泊苷或照射状态下促使细胞存活。p53与相互作用,发生去乙酰化,表明代谢和衰老之间的关联。SIRT1表达降低p53转化靶基因和诱导衰老及凋亡的能力,而一个显著的负向作用则是加强p53介导的对氧化应激反应的凋亡,这一效应是否要求p53直接去乙酰化,或是否对p53反应基因启动子功能受限,而通过其组蛋白去乙酰基转移酶活性抑制靶基因转录仍不清楚。但有研究表明,SIRT1和NAD水平在哺乳动物中能偶联氧化应激和代谢与p53相互作用。
2.2 SIRT1与FOXOs遗传学研究显示,在Celegans中,胰岛素/胰岛素样生长因子(insulin-like growth factor,IGF)信号传导调控长寿[6],该信号触发激酶级联反应,包括磷脂酰肌醇-3激酶可导致促衰变因子(decay-accelerating factor,DAF-16) 磷酸化及线虫FOXO转录因子。
SIRT1作用于FOXO家族,调控细胞对应激的反应。FOXO蛋白家族,是胰岛素信号途径的传感器和生物体长寿的调控子。FOXOs调控代谢、细胞周期、应激耐受、DNA损伤修复和凋亡[7]。根据靶基因FOXOs不同,SIRT1功能也有所不同。在体内,SIRT1与FOXO1相互作用,使FOXO1在赖氨酸242,245和262去乙酰化,并使之活化[8],抑制其活性。SIRT1可依赖其去乙酰化酶活性,降低乙酰化FOXO1的含量[9]。
在细胞内,SIRT1和FOXO3形成复合体,对氧化应激反应,使FOXO3去乙酰化,对FOXO3有双重效应,增加FOXO3能力,诱导细胞周期停滞,拮抗氧化应激,抑制FOXO3诱导细胞死亡的功能[10]。过氧化氢诱导FOXO4乙酰化,抑制其转录活性。SIRT1结合乙酰化的FOXO4并恢复其活性。SIRT1活化FOXO1和FOXO4,通过诱导p27kipl,促使细胞周期停滞。通过提高锰过氧化物歧化酶表达水平,SIRT1也诱导细胞对氧化应激的抵抗作用。SIRT1抑制FOXO3和其他一些FOXOs活性。
2.3 SIRT1与其他SIRT1也调控其他一些转录因子。SIRT1抑制脂肪形成的关键调控因子PPAR-γ,与其结合至同一DNA序列,为辅抑制物。在限制饮食情况下,SIRTl募集至PPAR-γDNA结合位点,与辅助因子核受体辅抑制剂(NCoR)和类维生素A和甲状腺素受体沉默调控子(SMRT)共同作用[11]。
SIRTl上调促进脂解和脂肪丢失。SIRT1抑制NF-κB转录活性,使其亚单位RelA/p65在赖氨酸310去乙酰化[12]。SIRT1能够保护细胞,防止p53诱导的凋亡,但也可能通过抑制NF-κB增加凋亡。RNA聚合酶I复合体亚单位TAFI 68,增加TAFI 68与rDNA启动子结合,诱导哺乳动物rDNA转录,SIRT1使其去乙酰化,从而抑制rDNA转录[13]。
通过RNA干扰下调SIRT1水平,SIRT1是NAD补充的下游靶点,保护细胞。SIRTl催化PARP活化的核心结构域,NAD补充可防止其转录调控能力丢失。心脏功能失常时,PARP活化及伴随SIRTl能力下降,调控p53转录后乙酰化。在应激的心肌细胞,细胞NAD活性丢失,联系PARP活化和SIRTl酶活性降低,共同作用于心功能失常时心肌细胞死亡[14]。
SIRT1是许多细胞过程的关键调控子,也能抑制Forkhead转录基因家族,改变胰岛素信号途径,提高对氧化应激的抑制作用,减轻凋亡[15]。SIRT1使DNA修复因子Ku70的关键赖氨酸残基去乙酰化,而阻止预凋亡因子Bax进入线粒体,抑制应激诱导的凋亡细胞死亡[10]。
3 SIRTl与热量限制热量限制功能以一种被动的方式降低氧化和其他损伤,从而导致生命周期延长,可以调控从酵母到哺乳动物等生物体的生命周期,主要影响脂肪组织的能量贮存,脂肪组织是控制生命周期的关键器官。在酵母,热量限制(calori crestriction,CR)通过活化SIR2延缓衰老。
哺乳动物中SIRT1是活化热量限制的关键元件,即脂肪动员。SIRT1抑制PPAR-γ,抑制脂肪细胞中脂质聚集,其过表达可降低脂肪形成,而RNA干扰加速脂肪形成。在分化的脂肪细胞,SIRT1上调促进脂解和脂肪丢失。大鼠和人类细胞中,CR诱导SIRT1表达。胰岛素和胰岛素样生长因子(IGF-1) 削弱这一反应。CR诱导SIRTl表达,延长生命周期,促使不可替代的细胞长期存活[16]。酵母中CR诱导SIR2活性上调,为CR效应的生命周期延长所需要。啮齿类动物,SIRT1表达增加,对脂肪、肝脏、肾脏和脑组织中持续的CR起反应。
4 SIRTl与衰老近年来,衰老的基本生物学研究受到重视,鉴定了单一基因直接或间接调控不同模型生物体的衰老过程。SIRTl连接代谢,基因组稳定性和生命周期。基因组稳定性降低与生命周期缩短相关。在S cerevisiae,SIR2作为NAD依赖的组蛋白去乙酰基转移酶抑制基因重组,关闭多基因位点的转录。SIR2家族成员在调节热量限制中起基础的作用,延长从酵母到哺乳动物的生命周期[17]。
SIRT1在哺乳动物长寿中的作用还未直接检测,因为单纯SIRT1敲除动物易发多种发育缺陷而早期死亡。SIRT1有许多靶基因,调控细胞对氧化应激和基因毒性应激的抑制。
SIRT1直接修饰染色质和沉默转录,SIRT2和SIRT3分别是定位于细胞质和线粒体,不是染色质相关,而不具有这种作用。目前没有关于SIRT4-7的更多信息,但这些仍可能是通过基因组稳定性调控长寿的侯选蛋白[18]。
Fabrizio等推测SIRT1可能通过调节葡萄糖和脂肪代谢调控生命周期[19]。大多SIRT1缺失小鼠在胚胎发育时死亡,然而到成年期后显示正常。是否缺失SIRT1的成年鼠有较短的生命周期或较长的生命周期仍不清楚。Chua K F等[20]研究表明,SIR2抑制基因组不稳定性,延长生命周期,但发现缺失SIRT1的小鼠胚胎纤维原细胞显著抑制重复性衰老,在慢性的亚致死性氧化应激情况下,缺失SIRT1,与增殖能力提高相关。另外,SIRT1缺失细胞调控p19(ARF)(衰老调控因子)或下游p53能力,在急性DNA损伤或致癌基因表达情况下,SIRTl缺失细胞显示p19(ARF)诱导和细胞周期停滞。研究表明SIRTl对慢性细胞应激反应功能仍不确定。Lemieux ME等研究发现,SIRT1影响IGF途径,Sirtl-/-动物显示一些较长生命周期的表型,体重和脂肪减少,较小的垂体体积和较低水平的自由IGF-1[21]。SIRT1敲除和转基因动物生命周期的研究,有助于理解其在哺乳动物衰老中的作用,尤其是研究SIRT1缺失在热量限制条件下是否延长寿命[22]。
FlachsbartF等[23]研究SIRT1基因的一般等位基因变异与人类长寿的关联,整个基因中有5个单核苷酸多态性位点,包括启动子区域,研究对象为德国1573名长寿个体(90多岁和百岁或以上),未发现任一SNPs与长寿基因型有关,说明其序列变异体对人类长寿无显著影响,但并不排除等位基因变异体可能在直接调控子或下游底物作用,从而对于延长人类长寿有重要作用。
5 展望从原始细菌到真核细胞,沉默信息调控子基因家族在生物体基因组中高度保守,其编码SIR蛋白参与基因沉默到DNA修复等许多不同过程。尽管SIRT1参与细胞存活和应激抵抗,但与衰老的直接关系仍不清楚。
需深入研究SIRT1多种功能:(1) 鉴定SIRT1生物学底物及与其之间的作用是否具有特异性;(2) 明确SIRTs之间的相互作用助于揭开衰老的复杂机制;(3) 如何调控转录机制,是否对FOXO1,FOXO3和FOXO4的抑制活性延伸到其他FOXO因子;(4) 是否使PPAR-γ及靶基因的组蛋白去乙酰化;(5) 对于SIRT1缺陷,改变IGF-1/胰岛素水平对衰老样表型起作用,是否包含在其对CR反应中及如何调控;(6) 是否在限制饮食情况下,NAD/NADP比值或其他代谢改变会影响到SIRT1功能,从而上调新陈代谢达到最佳长寿状态;(7) SIRTl缺陷是否影响DNA损伤修复,进一步影响碱基切除修复核心因子如Polβ,XRCC1,PARP-1等活性;(8) 是否通过染色质效应抑制重组和基因组不稳定性,这一效应是否参与调控哺乳动物衰老。
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