过去十年里，我国研究与试验发展(R & D)经费投入保持了年均超20%的高速增长，而关于科研经费分配制度的争议却也日渐增多。焦点问题有二：一是，竞争性的项目分配体制被科学家与官员间的“关系”所绑架，导致产生不健康的科研风气；二是，科研项目经费管理中“重物轻人”，科研人员的智力劳动价值得不到应有的体现，极大地抑制了科学家的创造积极性。

十八届三中全会后，伴随全面深化改革的推进，政府为完善科技经费管理制度做出了更加积极的政策尝试。最令人瞩目的是，2014年3月国务院印发《关于改进加强中央财政科研项目和资金管理的若干意见》(国发〔2014〕11号)(以下简称《意见》)，对改进加强中央财政民口科研项目和资金管理做出全面部署，为推进科技经费管理改革迈出关键一步。《意见》明确提出科研项目实行分类管理、改进项目管理流程以及加强项目和资金监管等八项二十九条措施，突出体现了通过人力资本补偿调动创新积极性的改革方向。必须认识到，回归“以人为本”的管理理念，认可科研人员智力劳动的价值，对于长期拘于国有资产管理思路的科技管理体制来说是一个重大突破。因为，深化科技管理体制改革的场域是我国当前正处在社会经济发展的转型时期，产权制度、收入分配制度等均需完善。在各项配套制度亟待改革的背景下，推动在科研项目经费中合理安排科研人员的绩效支出，承认科研组织和科学家对科研成果的收益权，无疑是推进全面深化改革的一个有益探索。

但同时仍需正视的是，《意见》虽然直接有效地解决了问题二，却对问题一却作用有限。我们当然不能期望《意见》可以一劳永逸地解决当前科研经费管理中存在的所有问题，这需要多项措施的配合。但如何解决问题一，改善被“关系”所绑架的分配机制，降低“关系成本”，对于当前的科研经费管理而言是十分紧要的问题，需要引起我们的更多关注。

上个世纪80年代中期，我国政府为“使科学技术成果迅速应用于生产，使科学技术人员的作用得到充分发挥，大大解放科学技术生产力，促进科技和社会的发展”，启动了科技体制改革。改革的核心内容之一即是缩减各级科研机构的事业费变为竞争性项目经费，用于行业技术工作和国家重大科研项目。之后伴随政府财政科技投入的逐年增长，一直坚持着竞争性项目分配的改革方向。2005年，中央财政稳定性支持经费与竞争性项目经费的支出比例达到2:8。竞争性项目，虽然一定程度上有利于促进科研经费配置效率的提高，但也滋生了学术不端和急功近利的不良科研风气。

事实上，近年来有关我国竞争性项目经费分配问题的质疑和论战不断——规范的项目管理流程背后却是官员操控程序。为什么官员能够操控程序？为什么项目所应体现的国家需求，却被技术官僚和少数科学家的“关系”所绑架？面对这样的局面，有必要进一步在科研经费管理的顶层设计上深化改革，增加稳定支持经费，特别是增加高水平研究、创新人才、科研院所、公益性行业的稳定性经费支持力度，以稳定科研人员预期，减少“关系成本”对科研人员带来的干扰。