2019, Vol. 40
文章信息
- 于悦, 郭新慧, 严寒秋, 高志勇, 李伟红, 刘白薇, 王全意.
- Yu Yue, Guo Xinhui, Yan Hanqiu, Gao Zhiyong, Li Weihong, Liu Baiwei, Wang Quanyi.
- 札如病毒急性胃肠炎暴发特征系统综述
- Systematic review on the characteristics of acute gastroenteritis outbreaks caused by sapovirus
- 中华流行病学杂志, 2019, 40(1): 93-98
- Chinese Journal of Epidemiology, 2019, 40(1): 93-98
- http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2019.01.019
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文章历史
收稿日期: 2018-07-19
2. 北京市房山区疾病预防控制中心 102446
2. Fangshan District Center for Diseases Control and Prevention, Beijing 102446, China Yu Yue and Guo Xinhui contributed equally to the article
札如病毒（sapovirus，SaV）和诺如病毒同属于人杯状病毒，是引起人急性胃肠炎的重要病原体之一。SaV为单股正链RNA病毒，基因组全长7.3~7.5 kb，根据衣壳区蛋白全基因序列可将SaV分为5个基因组（GⅠ~GⅤ），其中GⅠ、GⅡ、GⅣ和GⅤ感染人类[1]。世界范围内SaV急性胃肠炎暴发时有报道，为了解SaV急性胃肠炎暴发特征，为防控工作提供依据，本研究对发表的SaV急性胃肠炎暴发文献进行了系统综述。
资料与方法1.文献检索：以“札如病毒”或“扎如病毒”或“札幌样病毒”或“札幌病毒”或“扎幌病毒”或“扎幌样病毒”为关键词在中国知网、万方数据库检索，或以“Sapovirus”或“Sapporo-like virus”在PubMed、Web of Science数据库检索，再从搜索到的文献确定SaV急性胃肠炎暴发文献。
2.文献纳入标准：①发表于2018年1月以前；②能提供SaV急性胃肠炎暴发发生时间、发生地点等流行病学信息；③PCR检测患者粪便或呕吐物SaV核酸阳性。
3.文献排除标准：符合其中之一即被排除：①可疑SaV感染；②与其他病原混合感染；③未找到全文且摘要未提及有效信息的文献；④语言不是中文或英文，且无英文摘要的文献；⑤综述类文献。
4.数据提取和统计学分析：用WPS 2016软件建立数据库，进行数据录入、整理。重复报道的案例仅统计1次，将重复报道文献包含的信息进行归纳整合。文献信息收集内容包括疫情发生时间、地点、场所、发病人数、人群分布、传播途径、病毒基因型、患者临床症状等。从文献检索、评价、数据提取均采用双人独立分析，结果不一致时再由第3人进行仲裁。采用SPSS 20.0统计学软件分析，不同组间率的比较采用χ2检验。以P＜0.05为差异有统计学意义。
结果1.文献整理情况：根据检索策略，通过Note Express去重，初步检索得到1 578篇文献。通过阅读题目和摘要，筛选出52篇SaV急性胃肠炎暴发相关文献。排除18篇，其中12篇涉及混合感染，2篇涉及重复报告，3篇非中/英文文献且无法获得具体信息，1篇信息不全。最终纳入34篇文献。见表 1。
2.流行病学特征：34篇文献报告SaV急性胃肠炎暴发146起，发生时间范围为1976年10月至2016年4月。46起暴发提供了具体病例数，单起暴发涉及病例5~656人，中位数为23人，共涉及病例3 298人。40起暴发提供疫情持续时间，中位数为8 d（1~31 d）。18起暴发有罹患率信息，最高76.47%，最低5.54%，中位数为20.71%。仅2起报告了SaV潜伏期，但结果较为相近，最短分别为14.5 h和18.0 h，最长分别为64.0 h和66.5 h，中位数分别为32 h和38 h。26起暴发可获得患者年龄信息，发病人群以＜18岁未成年人为主，占67.16%（906/1 349）。
（1）时间分布：共140起暴发获得疫情发生年份资料，最早报告于1976年，年份分布见图 1。其中，2007-2008年以及2011-2013年属高发年份。
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| 图 1 1976-2016年札如病毒急性胃肠炎暴发年报告疫情起数 |
138起暴发报告了发生月份，均发生于北半球。SaV急性胃肠炎四季均有报告，疫情主要发生在冬春季。8月发生暴发最少（2起）；12月发生暴发最多（25起），主要发生于温度较低月份，见图 2。
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| 图 2 1976-2016年札如病毒急性胃肠炎暴发按月累计报告疫情起数 |
（2）地区分布：146起暴发报告来自亚洲、北美洲和欧洲地区，分布在11个国家，均位于北半球。日本报告暴发最多（49起），其次为加拿大（43起）、美国（19起）、荷兰（19起）、中国（6起）、德国（2起）、瑞典（2起）、西班牙（2起）、克罗地亚（2起）、奥地利（1起）和匈牙利（1起）。我国报告的6起SaV急性胃肠炎暴发均来自东南沿海地区，其中厦门市2起、深圳市2起、上海市1起、台湾地区1起。
（3）场所分布：共141起暴发可以获得发生场所资料，报告最多的为托幼机构（48/141，34.04%），其次是长期看护机构（41/141，29.08%）、医院（16/141，11.35 %）、学校（13/141，9.22%）、养老院（8/141，5.67%）和社区（6/141，4.26%），酒店或餐馆（4/141，2.84%），福利院、轮船、公司和康复中心各1起。
（4）传播途径：146起疫情中，39起报告了传播途径，其中29起为人与人传播（74.36%），7起（17.95%）为食源性传播，3起（7.69%）疑似食源性传播。
（5）病原学特征：146起暴发中，确定病毒组别的有119起。其中，51起疫情（42.86%）由GⅠ组SaV引起，45起（37.82%）由GⅣ组SaV引起，18起（15.13%）由GⅡ组SaV引起，4起（3.36%）由GⅤ组SaV引起，1起（0.84%）由GⅡ-GⅣ组重组SaV引起。57起暴发报告了基因型别，GⅠ.2占比最多（28/57，49.12%），其次为GⅠ.1（8）、GⅣ.1（7）、GⅡ.3（6）、GⅠ.3（3）、GⅡ.1（3）、GⅡ.2（1）和GⅡ.5（1）。SaV暴发在2007-2008年和2011-2013年出现报告高峰，2007年SaV的优势流行株为GⅣ组，2008、2011-2013年的流行优势株则为GⅠ组。
（6）临床症状：31起暴发共1 704例病例具有临床症状信息，腹泻最常见（1 331/1 704，78.12%），然后分别为恶心（829/1 198，69.20%）、腹痛（840/1 328，63.25%）、呕吐（824/1 704，48.36%）以及发热（529/1 531，34.53%）。
25起基因型明确的暴发中，GⅠ组和GⅣ组SaV感染所致胃肠炎临床表现以腹泻（722/808，89.34%；310/416，74.54%）为主，GⅤ组SaV感染呕吐较多（206/309，66.67%）。3种基因组SaV感染患者之间腹泻和呕吐发生率两两比较差异均有统计学意义（P＜0.001）。
讨论日本学者于1979年报告了发生于札幌市的1起SaV急性胃肠炎暴发[7]，本研究中1976年的SaV疫情为日本学者2017年对历史保存样本回顾性调查发现[34]。1976-2006年文献报告的SaV暴发数量较少，2007-2008年以及2011-2013年报告较多。本研究结果显示，SaV暴发偏好温度较低月份，冬季高发。Dey等[36]对2003-2009年日本5个地区（札幌、东京、舞鹤、大阪、佐贺）共3 232例散发婴幼儿胃肠炎患者进行了SaV检测，10月至次年3月检出率最高，与本研究结果相似。冬季人们室外活动减少，集体单位室内人员密度较大，SaV在封闭的空间内便于传播，因而易发生感染暴发。日本、加拿大、美国和荷兰等国报告疫情较多，这些国家大多属于温带气候。分析原因：这些国家传染病的防控工作开展较好，检验技术水平更先进，能够及时发现并报告疫情；另一方面，这些地区冬季相对较长，温度较低，有利于SaV的生存传播；此外，这些国家都为沿海国家，沿海地区贝类的生产和消费较为常见，贝类可被SaV污染[37]，人类接触或食用贝类可能导致暴发[33]。从场所来看，暴发主要发生在托幼机构、长期看护机构、医院和学校等。分析可能的原因其一是由于儿童、老年人等人群免疫力较为低下，且没有养成良好的卫生习惯或卫生意识较差，是SaV的易感人群；其二是这些场所大多人口密集，且共同用餐、使用公共餐具、使用公共空间，易造成传染病的传播。
本研究发现，GⅠ组和GⅣ组病毒是SaV暴发中的优势流行株，而在散发病例中优势流行株主要为GⅠ组和GⅡ组[38]。可能不同型别SaV感染特点有所差异，但仍需更多研究证实。2007年SaV的优势流行株为GⅣ组，2008、2011-2013年的流行优势株则为GⅠ组。SaV感染后可产生短期的基因型特异性免疫，但对其他基因型无免疫保护[39]。2007年GⅣ组毒株出现引起疫情报告增加，感染过GⅣ组毒株的人群获得对该基因型的免疫保护，但对其他基因型无保护性免疫。随后2008年GⅠ组毒株活动增加，由于感染后免疫保护期较短，2011-2013年GⅠ组毒株又引起疫情报告增加。本研究结果显示不同基因型SaV感染者的临床症状不完全相同，GⅠ组和GⅣ组SaV感染者腹泻症状多见，GⅤ组SaV感染者较多有呕吐症状。这些差异可能是不同型别病原特性不同，也可能是患者年龄因素干扰所致，尚需进一步研究。目前SaV监测和研究对象主要是腹泻患者，但并非所有患者均有腹泻症状，因此在选择监测或研究对象时要予以注意。本研究仅有57起暴发报告了具体基因型，而且多数仅有衣壳区基因分型，大多数暴发没有确定基因型，不利于流行病学研究和疾病防控。建议以后的研究尽可能进行病原型别鉴定，最好同时确定聚合酶区和衣壳区分型，以及时发现重组株。
世界范围内SaV暴发的报告不多，远少于诺如病毒。分析原因：SaV可能不易感染人类且传播力不如诺如病毒；感染后症状轻于诺如病毒[1]，暴发可能不易被识别；检测手段尚不普及，许多国家和地区没有开展SaV检测，无法发现暴发。目前SaV的致病机制、感染量、在外环境中的存活能力、机体免疫保护机制、宿主易感性等尚不明确[1]。因而前述的一些推测尚无证据支持。
本研究存在不足。多数疫情没有报告暴发持续时间、达到峰值时间、罹患率等，因而无法对相关流行病学特征进行详细分析；经济发达国家及地区SaV暴发更容易被报告和发表，导致地区分布分析可能存在偏倚；绝大多数长期看护机构发生的暴发没有报告患者的具体年龄，患者年龄分析时低估了老年人患者比例；多数暴发没有报告传播途径，水源性传播没有报告，可能对暴发传播途径占比有一定影响；受实验室检测技术限制，多数毒株没有详细的基因分型，无法详细分析其分子流行病学特征。
近年来我国诺如病毒急性胃肠炎暴发监测工作已取得较大进展，其流行特征已有基本了解，也出台了相应防控方案。但我国SaV暴发报告较少，开展检测工作的地区不多，其流行特征尚不明确，亦需要开展相应的培训工作和制定相应的防控方案，在有条件的地区开展监测工作。实际工作中如果疑似诺如病毒的疫情未有检测到病原，需排除SaV感染。
综上所述，SaV暴发主要为发达国家报告，寒冷月份高发，常发生于托幼机构和长期看护机构，主要流行株为GⅠ组和GⅣ组。我国SaV暴发防控工作较为落后，需开展相应的培训工作，在有条件的地区开展SaV暴发监测工作。
利益冲突 所有作者均声明不存在利益冲突
| [1] |
Oka T, Wang QH, Katayama K, et al. Comprehensive review of human sapoviruses[J]. Clin Microbiol Rev, 2015, 28(1): 32-53. DOI:10.1128/CMR.00011-14 |
| [2] |
Kobayashi S, Fujiwara N, Yasui Y, et al. A foodborne outbreak of sapovirus linked to catered box lunches in Japan[J]. Arch Virol, 2012, 157(10): 1995-1997. DOI:10.1007/s00705-012-1394-8 |
| [3] |
Usuku S, Kumazaki M. A gastroenteritis outbreak attributed to sapovirusgenogroup V in Yokohama, Japan[J]. Jpn J Infect Dis, 2014, 67(5): 411-412. DOI:10.7883/yoken.67.411 |
| [4] |
Johansson PJH, Bergentoft K, Larsson PA, et al. A nosocomial sapovirus-associated outbreak of gastroenteritis in adults[J]. Scand J Infect Dis, 2005, 37(3): 200-204. DOI:10.1080/00365540410020974 |
| [5] |
Wu FT, Oka T, Takeda N, et al. Acute gastroenteritis caused by Gi/2 sapovirus, Taiwan, 2007[J]. Emerg Infect Dis, 2008, 14(7): 1169-1171. DOI:10.3201/eid1407.071531 |
| [6] |
Usuku S, Kumazaki M, Kitamura K, et al. An outbreak of food-borne gastroenteritis due to sapovirus among junior high school students[J]. Jpn J Infect Dis, 2008, 61(6): 438-441. DOI:10.1097/QAI.0b013e31817c1ed0 |
| [7] |
Chiba S, Sakuma Y, Kogasaka R, et al. An outbreak of gastroenteritis associated with calicivirus in an infant home[J]. J Med Virol, 1979, 4(4): 249-254. DOI:10.1002/jmv.1890040402 |
| [8] |
Yoshida T, Kasuo S, Azegami Y, et al. Characterization of sapoviruses detected in gastroenteritis outbreaks and identification of asymptomatic adults with high viral load[J]. J Clin Virol, 2009, 45(1): 67-71. DOI:10.1016/j.jcv.2009.03.003 |
| [9] |
Miyoshi M, Yoshizumi S, Kanda N, et al. Different genotypic sapoviruses detected in two simultaneous outbreaks of gastroenteritis among schoolchildren in the same school district in Hokkaido, Japan[J]. Jpn J Infect Dis, 2010, 63(1): 75-78. DOI:10.1258/ijsa.2009.008500 |
| [10] |
Hergens MP, Öhd JN, Alm E, et al. Investigation of a food-borne outbreak of gastroenteritis in a school canteen revealed a variant of sapovirusgenogroup V not detected by standard PCR, Sollentuna, Sweden, 2016[J]. Eurosurveillance, 2017, 22(22): 30543. DOI:10.2807/1560-7917.ES.2017.22.22.30543 |
| [11] |
Yamashita Y, Ootsuka Y, Kondo R, et al. Molecular characterization of Sapovirus detected in a gastroenteritis outbreak at a wedding hall[J]. J Med Virol, 2010, 82(4): 720-726. DOI:10.1002/jmv.21646 |
| [12] |
Akihara S, Phan TG, Nguyen TA, et al. Existence of multiple outbreaks of viral gastroenteritis among infants in a day care center in Japan[J]. Arch Virol, 2005, 150(10): 2061-2075. DOI:10.1007/s00705-005-0540-y |
| [13] |
Hansman GS, Saito H, Shibata C, et al. Outbreak of gastroenteritis due to sapovirus[J]. J Clin Microbiol, 2007, 45(4): 1347-1349. DOI:10.1128/JCM.01854-06 |
| [14] |
Nidaira M, Taira K, Kato T, et al. Phylogenetic analysis of sapovirus detected from an outbreak of acute gastroenteritis on Ishigaki Island (Okinawa Prefecture, Japan) in 2012[J]. Jpn J Infect Dis, 2014, 67(2): 141-143. DOI:10.7883/yoken.67.141 |
| [15] |
Hansman GS, Ishida S, Yoshizumi S, et al. Recombinant sapovirus gastroenteritis, Japan[J]. Emerg Infect Dis, 2007, 13(5): 786-788. DOI:10.3201/eid1305.070049 |
| [16] |
Hassan-Rios E, Torres P, Munoz E, et al. Sapovirus gastroenteritis in preschool center, Puerto Rico, 2011[J]. Emerg Infect Dis, 2013, 19(1): 174-175. DOI:10.3201/eid1901.120690 |
| [17] |
Torner N, Martinez A, Broner S, et al. Epidemiology of acute gastroenteritis outbreaks caused by human calicivirus (norovirus and sapovirus) in Catalonia:a two year prospective study, 2010-2011[J]. PLoS One, 2016, 11(4): e0152503. DOI:10.1371/journal.pone.0152503 |
| [18] |
Oka T, Doan YH, Haga K, et al. Genetic characterization of rare genotype GⅡ.5 sapovirus strain detected from a suspected food-borne gastroenteritis outbreak among adults in Japan in 2010[J]. Jpn J Infect Dis, 2017, 70(2): 223-224. DOI:10.7883/yoken.JJID.2016.468 |
| [19] |
Herman KM, Hall AJ, Gould LH. Outbreaks attributed to fresh leafy vegetables, United States, 1973-2012[J]. Epidemiol Infect, 2015, 143(14): 3011-3021. DOI:10.1017/S0950268815000047 |
| [20] |
Ike AC, Hartelt K, Oehme RM, et al. Detection and characterization of sapoviruses in outbreaks of gastroenteritis in southwest Germany[J]. J Clin Virol, 2008, 43(1): 37-41. DOI:10.1016/j.jcv.2008.04.003 |
| [21] |
Iritani N, Yamamoto SP, Abe N, et al. Epidemics of GⅠ.2 sapovirus in gastroenteritis outbreaks during 2012-2013 in Osaka city, Japan[J]. J Med Virol, 2016, 88(7): 1187-1193. DOI:10.1002/jmv.24451 |
| [22] |
Svraka S, Vennema H, van der Veer B, et al. Epidemiology and genotype analysis of emerging sapovirus-associated infections across Europe[J]. J Clin Microbiol, 2010, 48(6): 2191-2198. DOI:10.1128/JCM.02427-09 |
| [23] |
Pang XL, Lee BE, Tyrrell GJ, et al. Epidemiology and genotype analysis of sapovirus associated with gastroenteritis outbreaks in Alberta, Canada:2004-2007[J]. J Infect Dis, 2009, 199(4): 547-551. DOI:10.1086/596210 |
| [24] |
Lee LE, Cebelinski EA, Fuller C, et al. Sapovirus outbreaks in long-term care facilities, Oregon and Minnesota, USA, 2002-2009[J]. Emerg Infect Dis, 2012, 18(5): 873-876. DOI:10.3201/eid1805.111843 |
| [25] |
徐春华, 王志, 王健. 一起小学札如病毒急性胃肠炎聚集性疫情调查[J]. 中国消毒学杂志, 2014, 31(5): 490-492. Xu CH, Wang Z, Wang J. Investigation on the cause of clustering outbreak of acute sapovirus gastroenteritis epidemic in primary students[J]. Chin J Disinfect, 2014, 31(5): 490-492. |
| [26] |
龙冬玲, 庄辉元, 靳淼, 等. 一起由札如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情的分子流行病学研究[J]. 国际病毒学杂志, 2017, 24(3): 183-186. Long DL, Zhuang HY, Jin M, et al. Molecular epidemiology of an acute gastroenteritis outbreak caused by sapovirus[J]. Int J Virol, 2017, 24(3): 183-186. DOI:10.3760/cma.j.issn.1673-4092.2017.03.009 |
| [27] |
何雅青, 卓菲, 张海龙, 等. 一起札如病毒所致成年人急性胃肠炎暴发的分子流行病学研究[J]. 疾病监测, 2012, 27(2): 101-103. He YQ, Zhuo F, Zhang HL, et al. Molecular epidemiology of a cute gastroenteritis outbreak caused by Sapovirus in Adults[J]. Dis Surveill, 2012, 27(2): 101-103. DOI:10.3784/j.issn.1003-9961.2012.2.006 |
| [28] |
颜玉炳, 苏成豪. 札如病毒致幼托儿童急性胃肠炎爆发疫情特征分析[J]. 中国校医, 2016, 30(5): 364-366. Yan YB, Su CH. Analysis of epidemiological characteristics of acute gastroenteritis outbreaks caused by sapovirus in preschool children[J]. Chin J School Doctor, 2016, 30(5): 364-366. |
| [29] |
Sakai Y, Nakata S, Tatsumi M, et al. Clinical severity of norwalk virus and sapporo virus gastroenteritis in children in Hokkaido, Japan[J]. Pediatr Infect Dis J, 2001, 20(9): 849-853. DOI:10.1097/00006454-200109000-00005 |
| [30] |
Mikula C, Springer B, Reichart S, et al. Sapovirus in adults in rehabilitation center, upper Austria[J]. Emerg Infect Dis, 2010, 16(7): 1186-1187. DOI:10.3201/eid1607.091789 |
| [31] |
Sala MR, Broner S, Moreno A, et al. Cases of acute gastroenteritis due to calicivirus in outbreaks:clinical differences by age and aetiologicalagent[J]. Clin Microbiol Infect, 2014, 20(8): 793-798. DOI:10.1111/1469-0691.12522 |
| [32] |
Ishida S, Yoshizumi S, Miyoshi M, et al. Characterization of sapoviruses detected in Hokkaido, Japan[J]. Jpn J Infect Dis, 2008, 61(6): 504-506. |
| [33] |
Iritani N, Kaida A, Abe N, et al. Detection and genetic characterization of human enteric viruses in oyster-associated gastroenteritis outbreaks between 2001 and 2012 in Osaka city, Japan[J]. J Med Virol, 2014, 86(12): 2019-2025. DOI:10.1002/jmv.23883 |
| [34] |
Mori K, Nagano M, Kimoto K, et al. Detection of enteric viruses in fecal specimens from nonbacterial foodborne gastroenteritis outbreaks in Tokyo, Japan between 1966 and 1983[J]. Jpn J Infect Dis, 2017, 70(2): 143-151. DOI:10.7883/yoken.JJID.2015.456 |
| [35] |
Péter P, Zoltán K, Andrea K, et al. First gastroenteritis outbreak caused by sapovirus (GⅠ2) in Hungary-part of an international epidemic?[J]. Orv Hetil, 2009, 150(26): 1223-1229. DOI:10.1556/OH.2009.28628 |
| [36] |
Dey SK, Phathammavong O, Nguyen TD, et al. Seasonal pattern and genotype distribution of sapovirus infection in Japan, 2003-2009[J]. Epidemiol Infect, 2012, 140(1): 74-77. DOI:10.1017/S0950268811000240 |
| [37] |
Varela MF, Hooper AS, Rivadulla E, et al. Human sapovirus in mussels from Ría do Burgo, A Coruña (Spain)[J]. Food Environ Virol, 2016, 8(3): 187-193. DOI:10.1007/s12560-016-9242-8 |
| [38] |
周锦辉, 严寒秋, 高志勇. 人类札如病毒流行概况[J]. 国际病毒学杂志, 2017, 24(2): 133-136. Zhou JH, Yan HQ, Gao ZY. Advarces in epidemiology of human sapovirus[J]. Int J Virol, 2017, 24(2): 133-136. DOI:10.3760/cma.j.issn.1673-4092.2017.02.016 |
| [39] |
Harada S, Oka T, Tokuoka E, et al. A confirmation of sapovirus re-infection gastroenteritis cases with different genogroups and genetic shifts in the evolving sapovirus genotypes, 2002-2011[J]. Arch Virol, 2013, 158(12): 2641-2642. DOI:10.1007/s00705-013-1757-9 |