中华流行病学杂志  2018, Vol. 39 Issue (5): 678-681   PDF    
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2018.05.027
中华医学会主办。
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段星, 王可然, 王继宝, 叶润华, 王译葵, 杨锦, 杨涛, 周素娟, 杨跃诚, 姚仕堂, 段松, 何纳.
Duan Xing, Wang Keran, Wang Jibao, Ye Runhua, Wang Yikui, Yang Jin, Yang Tao, Zhou Sujuan, Yang Yuecheng, Yao Shitang, Duan Song, He Na.
云南省德宏傣族景颇族自治州2016年新报告艾滋病病毒感染者的基因亚型分析
HIV gene subtypes of newly reported HIV/AIDS cases in Dehong Dai and Jingpo autonomous prefecture of Yunnan province, 2016
中华流行病学杂志, 2018, 39(5): 678-681
Chinese Journal of Epidemiology, 2018, 39(5): 678-681
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2018.05.027

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收稿日期: 2017-09-30
云南省德宏傣族景颇族自治州2016年新报告艾滋病病毒感染者的基因亚型分析
段星1, 王可然2, 王继宝1, 叶润华1, 王译葵1, 杨锦1, 杨涛1, 周素娟2, 杨跃诚1, 姚仕堂1, 段松1, 何纳2     
1. 678400 芒市, 云南省德宏傣族景颇族自治州疾病预防控制中心;
2. 200032 上海, 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室、公共卫生安全教育部重点实验室
摘要: 目的 分析2016年云南省德宏傣族景颇族自治州(德宏州)新报告HIV感染者HIV基因亚型,了解中国籍和缅甸籍HIV感染者基因亚型分布特征。方法 对2016年德宏州新报告的HIV感染者提取核酸,使用RT-PCR法对HIV基因gagenvpol进行反转录扩增,直接测序扩增产物,综合分析3个基因的测序结果,确定最终基因亚型。结果 2016年德宏州新报告HIV感染者1 112例,成功测定基因亚型的感染者860例。C亚型所占比例最大(占33.6%,289/860);其后为独特重组(unique recombinant forms,URFs)(占28.4%,244/860)、CRF01_AE(占18.6%,160/860)等亚型;URFs中主要包括4种形式的重组,其中以CRF01_AE和C亚型重组为主。缅甸籍感染者的亚型分布与民族和传播方式相关。结论 德宏州2016年新报告HIV感染者基因亚型主要集中在C、URFs和CRF01_AE亚型,URFs分布依然复杂多样。
关键词: 艾滋病病毒     艾滋病病毒感染者     基因亚型    
HIV gene subtypes of newly reported HIV/AIDS cases in Dehong Dai and Jingpo autonomous prefecture of Yunnan province, 2016
Duan Xing1, Wang Keran2, Wang Jibao1, Ye Runhua1, Wang Yikui1, Yang Jin1, Yang Tao1, Zhou Sujuan2, Yang Yuecheng1, Yao Shitang1, Duan Song1, He Na2     
1. Dehong Dai and Jingpo Autonomous Prefectural Center for Disease Control and Prevention, Mangshi 678400, China;
2. Department of Epidemiology, School of Public Health, Key Laboratory for Public Health Safety of Ministry of Education, Fudan University, Shanghai 200032, China
Corresponding author: He Na, Email: nhe@shmu.edu.cn
Fund program: AIDS Control and Prevention Project in National Key Areas; National Science and Technology Major Project of China (2013ZX10004-906); National Natural Science Foundation of China (81373062)
Abstract: Objective To explore distribution of HIV gene subtypes among newly reported HIV/AIDS cases from China and Myanmar in Dehong Dai and Jingpo prefecture of Yunnan province in 2016. Methods We conducted DNA extractions from newly reported HIV/AIDS cases in 2016. The gag, env and pol genes were amplified by using reverse transcription-PCR (RT-PCR) and sequenced to identify HIV subtypes. Results A total of 1 112 newly diagnosed HIV cases were reported in Dehong in 2016, and the HIV subtypes were identified for 860 cases. Subtype C was predominant (33.6%), followed by unique recombinant forms (URFs) (28.4%), CRF01_AE (18.6%) and so on. URFs include four recombination, among which the recombination of CRF01_AE and C subtype were predominant. The HIV subtype distribution was associated with nationality and transmission route in HIV/AIDS cases from Myanmar. Conclusions The gene subtypes of C, URFs and CRF01_AE were mainly distributed; distribution of URFs remained complex and diverse among newly reported HIV/AIDS cases in Dehong in 2016.
Key words: HIV     HIV/AIDS cases     Gene subtypes    

云南省德宏傣族景颇族自治州(德宏州)HIV流行严重[1],更由于其与缅甸等其他东南亚国家的人员流动和交流,呈现出较为独特的亚型分布表现[2]。持续的HIV亚型分布监测有利于了解HIV传播动态和流行趋势。本研究探讨2016年德宏州新报告的中国籍和缅甸籍HIV感染者HIV基因亚型分布特征,为有效防控HIV和提高干预措施效果评估质量提供科学依据。

对象与方法

1.研究对象:以德宏州2016年新报告HIV感染者(即首次HIV抗体检测结果阳性)为研究对象,取其参加抗病毒治疗前血浆标本,进行病毒polgagenv基因扩增。

2.方法:

(1)扩增HIV polgag以及env基因区:3个基因均使用TaKaRa One RNA PCR Kit(AMV)进行各基因的反转录,并用TIANGEN 2×Taq PCR MasterMix进行第二轮PCR扩增。各条基因引物见参考文献[5]、PCR体系配置见文献[3-4]。第二轮PCR产物经1%的琼脂糖凝胶电泳鉴定,所有阳性者送北京诺赛基因组研究中心有限公司测序。

(2)基因亚型分析:首先使用软件LaserGene 7.1对原始序列进行序列拼接处理,然后提交至美国Los Alamos国家实验室HIV核酸序列库(http://www.hiv.lanl.gov),并使用网站在线软件HIV-Blast将上传的序列与数据库的参考序列进行比对,初步判定亚型。使用MEGA 7软件将样本的所有序列与国际参考株进行排列和比对,并使用其Phylogeny模块中的Neighbor-Joining(N-J)法构建系统进化树,根据进化树上样本的序列与国际参考株的亲缘关系进一步确认亚型。然后将相关序列上载至jpHMM网站(http://jphmm.gobics.de/)进行重组分析,得到基因组嵌合结构。根据亚型及其断点和基因组嵌合结构与HIV sequence database(https://www.hiv.lanl.gov/content/sequence/HIV/CRFs/CRFs.html)提供的目前已公布的90例CRFs(Circulating recombinant forms)进行比较,确认样本的CRFs和URFs(Unique recombinant forms)。

3.统计学分析:使用Excel 2013软件整理数据,SPSS 22.0软件对数据进行统计分析。计数资料采用χ2检验;当其中有至少一个格子理论频数<5,使用Fisher确切概率法。P<0.05为差异有统计学意义,双侧检验。

结果

1.一般情况:2016年德宏州新报告1 112例HIV感染者,中国籍有395例(35.5%),缅甸籍有717例(65.5%),对其全部进行病毒polgagenv基因扩增,最终分型成功的病例共860例(77.3%),包括中国籍346例(40.2%),缅甸籍514例(59.8%)。见表 1

表 1 2016年德宏州新报告HIV感染者人口学及HIV亚型分布特征

2.基因亚型分布:成功分型的感染者中,C(33.6%)、URFs(28.4%)以及CRF01_AE(18.6%)为两国新发感染者最多的3种亚型。在244例URFs中,CRF01_AE与C亚型重组48例(5.6%),BC亚型重组46例(5.3%),CRF01_AE与B和C亚型重组30例(3.5%),8例CRF01_AE与B亚型重组(0.9%)。151个标本有1个基因片段分型结果,310个标本有2个基因片段分型结果,399个标本有3个基因片段分型结果。见表 2

表 2 2016年德宏州新报告HIV感染者HIV亚型基因片段分型结果

3. HIV亚型分布的影响因素:根据国籍进行分层分析发现,在中国籍的346例已知亚型的感染者中,亚型的分布与感染者的性别、年龄、民族、传播方式并无显著关联,但是傣族(16.4%)和汉族(18.6%)拥有相对较高比例的CRF01_AE,而景颇族有较高比例的其他亚型(32.9%),其他民族的URFs所占比例是最高的(40.7%)。在缅甸籍感染者中,HIV亚型与民族和传播方式有着显著关联,傣族和汉族拥有较高比例的CRF01_AE,而景颇族有较高比例的其他亚型,但是傣族是URFs比例最多的民族:异性传播以C亚型的比例最高,因静脉吸毒感染HIV的新报告病例以C亚型和URFs为最多的两种亚型。见表 3

表 3 2016年德宏州新报告中国籍与缅甸籍HIV感染者HIV亚型分布影响因素
讨论

2016年分型成功的860例感染者中,人口学分布和2015年基本一致[5]。云南省德宏州经异性传播的亚型分布特点与我国其他地区相同[6-7],CRF01_AE在异性性传播中比较常见;但是整体而言、B、C亚型重组分布较少[8-9],可能与云南省德宏州本身的HIV流行特点有关。而在缅甸籍感染者中可以发现,民族和传播方式是影响亚型分布的重要因素。与2015年相似,异性传播主要是以C亚型为主,而经静脉吸毒传播的亚型分布则有更高比例的URFs,一方面说明多人多次静脉吸毒共用针具可能会导致较多的新型HIV亚型重组的出现;同时,除共用针具外的其他传播途径也可能是URFs产生的原因。

2016年德宏州新报告HIV感染者亚型分布与2015年大体一致[5],依然复杂多样,C、URFs和CRF01_AE是分布最多的3个亚型。不同于我国内陆其他省份[2, 6-7],URFs毒株始终在德宏州HIV亚型分布中占有较大比例,显示出该地区HIV的流行复杂性和重组多样性。但2016年度HIV感染者亚型分布也呈现出新的变化,与2015年相比[5],2016年URFs的分布比例小于C亚型,位于第二位。而且对于已知亚型和CRFs而言,2016年新报告感染者的分布更为集中,主要集中在C和CRF01_AE型。位于东南亚的柬埔寨、缅甸和泰国主要是以B、C和CRF01_AE亚型为主;越南是以CRF01_AE亚型为主[10-11];而在中国内陆地区,主要是以B、C亚型重组和CRF01_AE为主[2]。本次研究中未发现CRF07_BC亚型,但13例有相似断点和基因组嵌合结构样本的polenv区与CRF07_BC的断点和基因组嵌合结构相似,仅gag区不同,疑似为CRF07_BC变异产生的新型CRFs。2016年HIV亚型分布变化提示云南省德宏州受到东南亚其他国家HIV疫情较大影响,尤其是已知亚型分布趋于以东南亚其他国家流行特点。

2016年德宏州新报告HIV感染者860例,占当年全部新报告病例的77.3%(860/1 112),代表性较好,基本反映德宏州HIV流行亚型分布现状。在860个已分型标本中,有151个标本只有1个基因片段,其中有50个标本的亚型是由pol基因确定,该基因片段长,所含信息量大,既往文献也有单独使用pol基因判断亚型[12-13];由于HIV是RNA病毒,其基因变异大且较难获得完整的核酸片段,虽然使用一个基因判断的亚型可能不够全面,但是可以作为标本的初步分型结果。建议未来可以使用全基因组测序的方法准确得到HIV的分型结果。本研究分型成功率为77.3%,仍有提升的空间。

综上所述,云南省德宏州HIV亚型分布复杂多样,有>50%的新发HIV感染者均为缅甸籍,缅甸籍感染者可能作为传染源,使HIV的亚型分布呈现复杂化发展,有必要对德宏州新报告HIV感染者开展持续的亚型监测,为未来更好地检测和控制HIV疫情提供科学依据。


利益冲突:
参考文献
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