文章信息
- 段星, 王可然, 王继宝, 叶润华, 王译葵, 杨锦, 杨涛, 周素娟, 杨跃诚, 姚仕堂, 段松, 何纳.
- Duan Xing, Wang Keran, Wang Jibao, Ye Runhua, Wang Yikui, Yang Jin, Yang Tao, Zhou Sujuan, Yang Yuecheng, Yao Shitang, Duan Song, He Na.
- 云南省德宏傣族景颇族自治州2016年新报告艾滋病病毒感染者的基因亚型分析
- HIV gene subtypes of newly reported HIV/AIDS cases in Dehong Dai and Jingpo autonomous prefecture of Yunnan province, 2016
- 中华流行病学杂志, 2018, 39(5): 678-681
- Chinese Journal of Epidemiology, 2018, 39(5): 678-681
- http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2018.05.027
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文章历史
收稿日期: 2017-09-30
2. 200032 上海, 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室、公共卫生安全教育部重点实验室
2. Department of Epidemiology, School of Public Health, Key Laboratory for Public Health Safety of Ministry of Education, Fudan University, Shanghai 200032, China
云南省德宏傣族景颇族自治州(德宏州)HIV流行严重[1],更由于其与缅甸等其他东南亚国家的人员流动和交流,呈现出较为独特的亚型分布表现[2]。持续的HIV亚型分布监测有利于了解HIV传播动态和流行趋势。本研究探讨2016年德宏州新报告的中国籍和缅甸籍HIV感染者HIV基因亚型分布特征,为有效防控HIV和提高干预措施效果评估质量提供科学依据。
对象与方法1.研究对象:以德宏州2016年新报告HIV感染者(即首次HIV抗体检测结果阳性)为研究对象,取其参加抗病毒治疗前血浆标本,进行病毒pol、gag、env基因扩增。
2.方法:
(1)扩增HIV pol、gag以及env基因区:3个基因均使用TaKaRa One RNA PCR Kit(AMV)进行各基因的反转录,并用TIANGEN 2×Taq PCR MasterMix进行第二轮PCR扩增。各条基因引物见参考文献[5]、PCR体系配置见文献[3-4]。第二轮PCR产物经1%的琼脂糖凝胶电泳鉴定,所有阳性者送北京诺赛基因组研究中心有限公司测序。
(2)基因亚型分析:首先使用软件LaserGene 7.1对原始序列进行序列拼接处理,然后提交至美国Los Alamos国家实验室HIV核酸序列库(http://www.hiv.lanl.gov),并使用网站在线软件HIV-Blast将上传的序列与数据库的参考序列进行比对,初步判定亚型。使用MEGA 7软件将样本的所有序列与国际参考株进行排列和比对,并使用其Phylogeny模块中的Neighbor-Joining(N-J)法构建系统进化树,根据进化树上样本的序列与国际参考株的亲缘关系进一步确认亚型。然后将相关序列上载至jpHMM网站(http://jphmm.gobics.de/)进行重组分析,得到基因组嵌合结构。根据亚型及其断点和基因组嵌合结构与HIV sequence database(https://www.hiv.lanl.gov/content/sequence/HIV/CRFs/CRFs.html)提供的目前已公布的90例CRFs(Circulating recombinant forms)进行比较,确认样本的CRFs和URFs(Unique recombinant forms)。
3.统计学分析:使用Excel 2013软件整理数据,SPSS 22.0软件对数据进行统计分析。计数资料采用χ2检验;当其中有至少一个格子理论频数<5,使用Fisher确切概率法。P<0.05为差异有统计学意义,双侧检验。
结果1.一般情况:2016年德宏州新报告1 112例HIV感染者,中国籍有395例(35.5%),缅甸籍有717例(65.5%),对其全部进行病毒pol、gag、env基因扩增,最终分型成功的病例共860例(77.3%),包括中国籍346例(40.2%),缅甸籍514例(59.8%)。见表 1。
2.基因亚型分布:成功分型的感染者中,C(33.6%)、URFs(28.4%)以及CRF01_AE(18.6%)为两国新发感染者最多的3种亚型。在244例URFs中,CRF01_AE与C亚型重组48例(5.6%),BC亚型重组46例(5.3%),CRF01_AE与B和C亚型重组30例(3.5%),8例CRF01_AE与B亚型重组(0.9%)。151个标本有1个基因片段分型结果,310个标本有2个基因片段分型结果,399个标本有3个基因片段分型结果。见表 2。
3. HIV亚型分布的影响因素:根据国籍进行分层分析发现,在中国籍的346例已知亚型的感染者中,亚型的分布与感染者的性别、年龄、民族、传播方式并无显著关联,但是傣族(16.4%)和汉族(18.6%)拥有相对较高比例的CRF01_AE,而景颇族有较高比例的其他亚型(32.9%),其他民族的URFs所占比例是最高的(40.7%)。在缅甸籍感染者中,HIV亚型与民族和传播方式有着显著关联,傣族和汉族拥有较高比例的CRF01_AE,而景颇族有较高比例的其他亚型,但是傣族是URFs比例最多的民族:异性传播以C亚型的比例最高,因静脉吸毒感染HIV的新报告病例以C亚型和URFs为最多的两种亚型。见表 3。
讨论2016年分型成功的860例感染者中,人口学分布和2015年基本一致[5]。云南省德宏州经异性传播的亚型分布特点与我国其他地区相同[6-7],CRF01_AE在异性性传播中比较常见;但是整体而言、B、C亚型重组分布较少[8-9],可能与云南省德宏州本身的HIV流行特点有关。而在缅甸籍感染者中可以发现,民族和传播方式是影响亚型分布的重要因素。与2015年相似,异性传播主要是以C亚型为主,而经静脉吸毒传播的亚型分布则有更高比例的URFs,一方面说明多人多次静脉吸毒共用针具可能会导致较多的新型HIV亚型重组的出现;同时,除共用针具外的其他传播途径也可能是URFs产生的原因。
2016年德宏州新报告HIV感染者亚型分布与2015年大体一致[5],依然复杂多样,C、URFs和CRF01_AE是分布最多的3个亚型。不同于我国内陆其他省份[2, 6-7],URFs毒株始终在德宏州HIV亚型分布中占有较大比例,显示出该地区HIV的流行复杂性和重组多样性。但2016年度HIV感染者亚型分布也呈现出新的变化,与2015年相比[5],2016年URFs的分布比例小于C亚型,位于第二位。而且对于已知亚型和CRFs而言,2016年新报告感染者的分布更为集中,主要集中在C和CRF01_AE型。位于东南亚的柬埔寨、缅甸和泰国主要是以B、C和CRF01_AE亚型为主;越南是以CRF01_AE亚型为主[10-11];而在中国内陆地区,主要是以B、C亚型重组和CRF01_AE为主[2]。本次研究中未发现CRF07_BC亚型,但13例有相似断点和基因组嵌合结构样本的pol、env区与CRF07_BC的断点和基因组嵌合结构相似,仅gag区不同,疑似为CRF07_BC变异产生的新型CRFs。2016年HIV亚型分布变化提示云南省德宏州受到东南亚其他国家HIV疫情较大影响,尤其是已知亚型分布趋于以东南亚其他国家流行特点。
2016年德宏州新报告HIV感染者860例,占当年全部新报告病例的77.3%(860/1 112),代表性较好,基本反映德宏州HIV流行亚型分布现状。在860个已分型标本中,有151个标本只有1个基因片段,其中有50个标本的亚型是由pol基因确定,该基因片段长,所含信息量大,既往文献也有单独使用pol基因判断亚型[12-13];由于HIV是RNA病毒,其基因变异大且较难获得完整的核酸片段,虽然使用一个基因判断的亚型可能不够全面,但是可以作为标本的初步分型结果。建议未来可以使用全基因组测序的方法准确得到HIV的分型结果。本研究分型成功率为77.3%,仍有提升的空间。
综上所述,云南省德宏州HIV亚型分布复杂多样,有>50%的新发HIV感染者均为缅甸籍,缅甸籍感染者可能作为传染源,使HIV的亚型分布呈现复杂化发展,有必要对德宏州新报告HIV感染者开展持续的亚型监测,为未来更好地检测和控制HIV疫情提供科学依据。
利益冲突: 无
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