中华流行病学杂志  2018, Vol. 39 Issue (4): 491-494   PDF    
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2018.04.021
中华医学会主办。
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王茜, 李木丽, 陈叶, 王冰, 陶晓燕, 朱武洋.
Wang Qian, Li Muli, Chen Ye, Wang Bing, Tao Xiaoyan, Zhu Wuyang.
中国不同地区狂犬病病毒种群分布的差异
Differences on geographic distribution of rabies virus lineages in China
中华流行病学杂志, 2018, 39(4): 491-494
Chinese Journal of Epidemiology, 2018, 39(4): 491-494
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2018.04.021

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收稿日期: 2017-08-08
中国不同地区狂犬病病毒种群分布的差异
王茜1, 李木丽2, 陈叶3, 王冰3, 陶晓燕1, 朱武洋1     
1. 102206 北京, 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;
2. 518020 深圳市人民医院病理科;
3. 110031 沈阳市疾病预防控制中心
摘要: 目的 明确我国不同地区流行的狂犬病病毒种群类别及其流行特征。方法 汇总GenBank数据库所有中国狂犬病流行株的N、G和全基因组序列以及国家狂犬病实验室新测定毒株序列,分别构建N基因和G基因种系发生树,明确每个毒株的种群归属。统计各地区流行株的种群类别及不同种群的毒株数量。结果 全国共流行6个毒株群(ChinaⅠ~Ⅵ),云南和湖南是我国大陆种群最丰富省份,均有多达4个群流行;河南、福建等6省份均有3个毒株群流行;上海、江西等8省份皆流行2个病毒种群;北京、天津等14省份目前只监测到1个毒株群流行。优势毒株群ChinaⅠ已蔓延至我国东北部和西部地区,共计覆盖25个省份;China Ⅲ群近年在内蒙古、新疆地区的野生动物中流行且溢出至家畜中;China Ⅳ是青海、西藏地区的流行种群,同时流行于内蒙古、黑龙江地区的野生动物中。结论 我国不同地区狂犬病病毒种群类别和数量差异明显。
关键词: 狂犬病     狂犬病病毒     种群     流行     分布    
Differences on geographic distribution of rabies virus lineages in China
Wang Qian1, Li Muli2, Chen Ye3, Wang Bing3, Tao Xiaoyan1, Zhu Wuyang1     
1. National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 102206, China;
2. Department of Pathology, Shenzhen People's Hospital, Shenzhen 518020, China;
3. Shenyang Center for Disease Control and Prevention, Shenyang 110031, China
Corresponding author: Tao Xiaoyan, E-mail:txy212@126.com; Zhu Wuyang, E-mail:zhuwuyang1971@sina.com
Fund program: National Key Research Program of China (2016YFD0500400); National Natural Science Foundation of China (31500152)
Abstract: Objective To study the lineages of rabies virus and the epidemic characteristics in different provincial populations of China, to provide information for the development of control and prevention measures in each respective provinces. Methods Full length N and G genes and full-genome of epidemic strains of rabies virus collected in China were downloaded from GenBank and combined with newly sequenced strains by our lab. Each strain was classified under six lineages of China rabies by constructing phylogenetic trees based on the N or G sequences. Numbers of strains and lineages in each province were counted and compared. Results Six lineages (China Ⅰ-Ⅵ) were prevalent in China, with 4 found in Yunnan and Hunan. In 6 provinces, including Henan and Fujian, 3 lineages were found. In 8 provinces, including Shanghai and Jiangxi, 2 lineages were found Only 1 lineage, were found in Beijing, Tianjin and other 12 provinces. the China Ⅰ, was the dominant one in 25 provinces. In recent years, China Ⅲ had been found in wild animals and spread over livestock in Inner Mongolia and Xinjiang areas. Qinghai and Tibet had been influenced by China Ⅳ, which also been found in wild animals of Inner Mongolia and Heilongjiang. Conclusion There had been obvious differences in lineages and strain numbers of rabies virus identified in different provinces in China.
Key words: Rabies     Rabies virus     Lineage     Epidemic     Distribution    

狂犬病疫情在我国有明显的地域差异。自2005年起国家狂犬病监测实验室在全国范围开展病原学监测,已初步确定我国流行的狂犬病病毒(RABV)可分为6个种群(ChinaⅠ~Ⅵ),每个毒株群的规模和流行范围各不相同[1-4]。尽管2013年在吉林省蝙蝠中监测到Ikrut病毒[5],表明我国还存在狂犬病病毒属(Lyssavirus)蝙蝠狂犬病的流行,但影响人狂犬病疫情的仍是RABV[6-7]。我国狂犬病防控疫情更多是以省为单位,甚至范围更小[8],而不同省份流行的RABV病原是否有差异,是单一种群的流行还是多种群病毒交叉存在,不同种群病毒在区域水平的分布特点尚未明确。为此本研究探讨我国各省份RABV流行的种群类别和不同种群的流行规模及流行范围变化,为当地有针对性地制定有效防控措施提供科学依据。

资料与方法

1.资料来源:中国狂犬病流行株(即街毒株,不包括固定毒株、疫苗株和基因突变株等衍生毒株)的N、G基因和基因组全序列及毒株背景信息来源于美国NCBI网站GenBank数据库(截至2016年12月31日),经Excel 2013软件整理为“中国狂犬病流行株基因数据库”,包括712个毒株。再纳入本实验室2015年在辽宁省监测到的2个毒株[6],数据库流行株总数为714个。纳入的流行株宿主来源包括病例、犬、狐狸、鼬獾、貉、牛、骡、驴、羊、骆驼、猪、马、鹿和鼠13种动物。

2.种系发生分析:病毒N、G基因在进化分析中的地位是等同[2-3, 9],有N基因或全基因组的毒株选取N基因全序,只有G基因序列的毒株整理G基因全序,以MEGA 7.0软件构建N和G基因种系发生树[6],明确各毒株的种群(China Ⅰ~ Ⅵ)划分。

结果

1. RABV种群地区分布:云南和湖南是我国大陆RABV种群最丰富的省份,均有4个种群类型流行,且均以China Ⅰ群为主;河南、福建、贵州、广西、宁夏和内蒙古6个省份均为3个种群同时流行,种群类型也较为丰富;东部地区的上海、江苏、浙江、山东、安徽、江西和西南部地区的重庆以及东北部地区的吉林8省份均有2个种群共存;其余14个省份目前只监测到1个毒株群流行(表 1)。

表 1 我国不同省份狂犬病病毒种群流行情况

2. RABV种群流行规模:我国目前流行的RABV种群依然为ChinaⅠ~Ⅵ,类型未增加[2-3]图 1)。China Ⅰ是我国的优势种群,毒株数量占我国流行株总数的74.79%,分布范围广泛(25个省份),不仅贯通南北地区,且已蔓延至东北部和西部地区。目前只有西部地区的西藏、青海、新疆以及东北部地区的黑龙江尚未监测到China Ⅰ;南部地区的广东作为传统高发省份,尚未发现有China Ⅰ流行,可能与毒株数据较少有关[2]

注:A、B、C分别为ChinaⅠ~Ⅵ群分布,D为ChinaⅣ~Ⅵ群分布;地图版本为ArcGIS10.3.1 图 1 我国狂犬病病毒种群(China Ⅰ~Ⅵ)地域分布

China Ⅱ的流行规模仅次于China Ⅰ,数量占我国毒株总数的15.67%,主要分布于我国南部省份(广东、广西)、东部省份(福建、江西、浙江、安徽、山东、上海)以及西南部省份(云南、贵州)和中部省份(湖南、河南);1986年自宁夏分离的1株病毒也属China Ⅱ。

China Ⅲ的数量占我国毒株总数的4.62%,目前已流行于吉林、江苏、内蒙古、湖南、福建、河南、新疆、贵州和云南9个省份,相比较China Ⅰ和Ⅱ,分布较为分散。

其他3个种群,毒株数量较少,流行区域局限。China Ⅳ数量占我国毒株总数的1.40%,在内蒙古、青海、西藏和黑龙江4省份有报道;目前China Ⅴ仅自重庆、宁夏和湖南3个省份的标本中分离到,占我国毒株总数的1.82%;China Ⅵ数量占我国毒株总数的1.68%,目前仅分布于云南和广西地区。

讨论

目前我国不同省份流行的病原种群数量为1~4种,通常疫情较为严重且持续时间较长的省份其病原种群类型较多[2],如2001和2002年高居全国疫情首位且之后长期列前5位的湖南省,病原种群类型多达4个,凸显该地区在病原传播扩散中的汇集、中转作用[10]。云南省也拥有丰富的病原种群类型[11]。宁夏地区2000年前后基本处于无疫情状态,自2011年后才开始疫情上升,有3个种群类型,属于China Ⅱ和Ⅴ的毒株均是1986年分离获得,近年监测到的流行株均属于China Ⅰ[12]。以往的研究结果提示China Ⅰ在1996年以后替代China Ⅱ成为目前优势毒株群[2],宁夏地区上一流行阶段的种群(China Ⅱ、Ⅴ)可能已经不复存在,目前只受China Ⅰ的影响,该地区种群的多样性是长期监测的结果。因此病原数量少的省份(如广东)更应持续开展监测。

根据最新分析数据,我国大陆分布的RABV病原种群类别依然是6群,而随着监测的深入开展,各种群的流行规模均有所扩展,如以往推测[2, 6],China Ⅰ仍为目前狂犬病疫情优势毒株群,已扩散至我国东北及西部地区。尚未被China Ⅰ入侵的青海、西藏和黑龙江,目前流行的种群为主要在野生动物中流行的China Ⅳ,与以犬传播为主的China Ⅰ不同,尚未在与人更为密切的犬中建立循环,当地疫情主要是野生动物狂犬病溢出的结果,所以一般疫情上升压力较小[6]。因此,流行病原种群不同的省份应采取不同针对性的防控措施。


利益冲突:
参考文献
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