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  药物分析杂志   2019, Vol. 39 Issue (3): 551-556.  DOI: 10.16155/j.0254-1793.2019.03.25
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兰青阔, 赵新, 陈锐, 刘征辉, 朱珠, 王成, 沈晓玲, 刘娜, 王燕, 陈利智, 王永. 基于LAMP的中药材川贝母真伪鉴别方法的建立[J]. 药物分析杂志, 2019, 39(3): 551-556. DOI: 10.16155/j.0254-1793.2019.03.25.
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LAN Qing-kuo, ZHAO Xin, CHEN Rui, LIU Zheng-hui, ZHU Zhu, WANG Cheng, SHEN Xiao-ling, LIU Na, WANG Yan, CHEN Li-zhi, WANG Yong. Authentication of Fritillaria cirrhosa based on loop-mediate isothermal amplification[J]. Chinese Journal of Pharmaceutical Analysis, 2019, 39(3): 551-556. DOI: 10.16155/j.0254-1793.2019.03.25.
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基金项目

科技部国际合作项目:农产品质量安全分子检测技术研究(2006DFA32380);天津市科技计划项目:中药质量现状评价与标准研究(05SYSYGX25000)

第一作者

兰青阔, Tel:(022)27950467, E-mail:lanqingkuo@163.com

通信作者

王永, Tel:(022)27950467, E-mail:wytaas@126.com

文章历史

修改日期:2018-11-21
基于LAMP的中药材川贝母真伪鉴别方法的建立
兰青阔 1, 赵新 1, 陈锐 1, 刘征辉 1, 朱珠 1, 王成 1, 沈晓玲 1, 刘娜 1, 王燕 2, 陈利智 2, 王永 1    
1. 天津市农业质量标准与检测技术研究所, 天津 300381;
2. 天津农学院农学系, 天津 300384
摘要目的:基于荧光-环状等温扩增技术,建立川贝母快速检测方法,实现中药材川贝母的荧光可视化快速鉴定。方法:依据川贝母物种特异性序列设计5套LAMP引物,并测试方法特异性和灵敏度。结果:引物Set1扩增效率最高;使用该引物建立的川贝母LAMP检测方法仅能够在6种川贝母基源药材中扩增出扩增曲线和荧光变化,在伊贝母、浙贝母、平贝母等7种常见混淆品中无扩增产物,方法特异性良好;方法检测灵敏度为0.1%。结论:本研究建立的基于LAMP的川贝母鉴定方法具有较好的特异性和灵敏度,其快速、操作简单、易观察的优点,填补了中药材川贝母真伪快速筛查的技术空白。
关键词川贝母    环状等温扩增技术    真伪鉴定    检测方法    分子检测    
Authentication of Fritillaria cirrhosa based on loop-mediate isothermal amplification
LAN Qing-kuo1, ZHAO Xin1, CHEN Rui1, LIU Zheng-hui1, ZHU Zhu1, WANG Cheng1, SHEN Xiao-ling1, LIU Na1, WANG Yan2, CHEN Li-zhi2, WANG Yong1    
1. Tianjin Institute of Agricultural Quality Standard and Testing Technology, Tianjin 300381, China;
2. Tianjin Agricultural University, Tianjin 300384, China
Abstract: Objective: To establish rapid visual identification method for Fritillaria cirrhosa based on loop-mediated isothermal amplification.Methods: According to the DNA sequence of the target, five sets of primers were designed and screened by amplification efficiency. Specificity and sensitivity of the method was validated.Results: The LAMP detection method established by using primer set1 showed best performance on amplification efficiency, specificity and sensitivity. Turbidity and fluorescence changes could be observed in 6 kinds of Fritillariae, and there was no amplification product in 7 common adulterants. The sensitivity of the LAMP method was 0.1%.Conclusion: The proposed LAMP method is specific, sensitive, accurate and simple and easy to observe, which fills the gap for the authentication of Fritillaria cirrhosa.
Keywords: Fritillaria cirrhosa    loop-mediated isothermal amplification    authentication    detection method    molecular identification    

川贝母是我国传统名贵中药材,具有化痰止咳的功效[1],已被广泛应用于中成药中[2]。川贝母的正品包括川贝母(F. cirrhosa D. Don)、暗紫贝母(F. unibracteata Hsiao et K. C. Hsia)、甘肃贝母(F. przewalskii Maxim.)、梭砂贝母(F. delavayi Franch.)、太白贝母(F. taipaiensis P. Y. Li)、瓦布贝母[F. unibracteata Hsiao et K. C. Hsia var. wabuensis(S. Y. Tang et S. C.Yue)Z. D. Liu,S. Wang et S. C. Chen]。与川贝母同属贝母属的常见混淆品有伊贝母[包括新疆贝母(F. walujewii Schrenk.)和伊犁贝母(F. pallidiflorae Schrenk.)]、浙贝母(F. thunbergii Miq.)、湖北贝母(F. hupehensis Hsiao et K.C.Hsia)、平贝母(F. ussuriensis Maxim)。因形态相似,川贝母很容易与贝母属中的其他物种混淆使用,严重影响临床疗效[3-4]。因此,建立快速、便捷、操作性强的川贝母鉴别方法,对中药材市场的监管及中医中药的健康发展具有重要的现实意义。

环状等温扩增技术(loop mediated isothermal ampli fication,LAMP)[5]是一种新颖的核酸扩增技术,它依赖于识别靶DNA上6个特定区域的4~6条引物和具有链置换活性的Bst DNA聚合酶,在恒温条件下高效扩增靶标序列,反应结果可通过肉眼观察,具有高特异性、快速、灵敏、操作简单等特点。自2000年该技术产生以来,在引物设计[6]、反应速度[7-8]和产物检测[9-10]方面都有较大改进,在临床疾病的诊断、流行性细菌以及病毒的检测等方面应用广泛[11-13]

本研究基于荧光-LAMP,依据川贝母物种特异性序列设计5套LAMP引物,并测试特异性和灵敏度,建立了川贝母快速检测方法。

1 仪器与试药 1.1 仪器

LA-320CE实时浊度仪(日本荣研),金属加热块(Labnet),微量核酸蛋白测定仪(ND-1000),Mettler Toledo PL602-L分析天平(精度0.01 g);组织研磨仪(Retsch MM400),高速离心机(Thermo PICO 21)。

1.2 试药

新型植物基因组DNA提取试剂盒(天根,DP320),环介导等温扩增法DNA扩增试剂盒(蓝谱生物)。

2 方法与结果 2.1 DNA提取方法

试验材料基因组DNA使用新型植物基因组DNA提取试剂盒进行提取。DNA提取液使用核酸蛋白测定仪测量DNA的浓度,并统一稀释至25 ng· µL-1,4 ℃保存备用。

2.2 LAMP引物的设计

参照文献[14]中获得的川贝母特异性序列,经测序验证后用于LAMP引物设计。引物设计使用在线设计软件PrimerExplorer V5(LAMP Primer designing software,http://primerexplorer.jp/e/),共设计LAMP引物5套(见表 1),由金唯智公司合成,纯化级别为HPLC。

表 1 川贝母物种特异性引物、探针 Tab.1 Species-specific primers and probes for Fritillaria

每套引物中,将每条引物配制成浓度为100 µmol·L-1的母液,取外引物F3、B3母液各1 µL,内引物FIP、BIP母液各8 µL,环引物(LF和/或LB)母液各1 µL,灭菌去离子水补足20 µL并充分混合,即为引物混合溶液。

2.3 LAMP反应体系

浊度法LAMP反应体系总体积为25 µL,其中2×反应液(RM)12.5 µL,Bst DNA聚合酶(Bst DNA Polymerase)1 µL,引物混合溶液1 µL,DNA模板(25 ng· µL-1)1 µL,用灭菌去离子水补至25 µL,充分混匀后,置于LA-320CE浊度仪中;反应程序为63 ℃扩增60 min,80 ℃灭活2 min。反应过程中,对反应管浊度进行实时测量,每6 s检测反应管在650 nm处吸收度,生成浊度变化曲线,当反应体系浊度超过0.25以及浊度的变化速率大于0.1时,结果判定为阳性。

可视法LAMP反应体系总体积也为25 µL,是在浊度法LAMP反应体系中再加入显色剂1 µL(钙黄绿素和氯化锰),用灭菌去离子水补至25 µL,充分混匀后,置于金属加热块上,于63 ℃温浴60 min。反应结束后,通过肉眼观察反应体系的颜色变化判定结果,颜色由黄色变为浅绿色判断为阳性。

2.4 川贝母LAMP方法引物筛选

以川贝母基因组DNA(10%)为模板,对设计的5套候选引物进行浊度法LAMP反应。结果(图 1)表明,第1、4、5号引物的扩增体系有浊度信号,出现时间为29.32、31.42、32.54 min,变化速率为0.177、0.175、0.164,其中1号引物信号出现时间最早(图 1-A),变化速率最高(图 1-B),表明扩增效率最好,因此确定选择引物Set 1为川贝母环状等温扩增鉴定引物。

A.浊度变化曲线(turbidity change curve)B.浊度变化速率(turbidity change rate) 图 1 川贝母候选引物LAMP扩增结果 Fig.1 Primer screening of Fritillaria cirrhosa LAMP assay
2.5 方法特异性测试

分别以6种川贝母基源植物和7种常见混淆品为对象(10%基因组DNA为模板),测试建立的川贝母LAMP鉴定方法对常见混淆品特异性。基源植物中川贝母购自中国食品药品检定研究院,暗紫贝母、甘肃贝母、梭砂贝母、太白贝母、瓦布贝母由本实验室收集保存,并经DNA条形码测序方法验证。常见混淆品中平贝母、伊贝母购自中国食品药品检定研究院;新疆贝母、浙贝母、东贝母、土贝母、皖贝母由本实验室收集保存,并经DNA条形码测序方法验证。

结果显示,本方法能够从6种川贝母基源植物的DNA样品反应管中检测出浊度曲线(图 2-A2-B),可视化检测时,对应反应管也发生由黄色转为绿色的颜色变化(图 2-C),反应结果为阳性;而在7种混淆品DNA样品反应管中均未检测出浊度(图 2-D2-E)和荧光变化(图 2-F),反应结果为阴性。上述结果表明,本研究建立的方法具有良好的特异性。

图 2 川贝母LAMP特异性测试结果 Fig.2 Specificity of Fritillaria cirrhosa LAMP assay
2.6 方法灵敏度测试

将提取的川贝母基因组DNA(25 ng· µL-1)用鲑鱼精DNA(25 ng· µL-1)进行梯度稀释,稀释梯度依次为100%、10%、1%、0.1%、0.01%和0%,并以此为模板进行LAMP扩增反应,测试方法的灵敏度。结果表明,浊度法LAMP反应在含量为100%~0.1%样品反应管中均检测到浊度信号变化(图 3-A),开始时间分别为20.5、29.2、39.1和49.2 min;可视化LAMP反应在含量为100%~0.1%样品反应管中均明显观察到颜色变化(图 3-B),反应结果为阳性。说明本研究建立的川贝母LAMP检测方法灵敏度可达到0.1%。

图 3 川贝母LAMP检测方法灵敏度结果 Fig.3 Sensitivity of Fritillaria cirrhosa LAMP assay
3 讨论

以往的川贝母鉴别方法有形态学特征鉴别[15-16]、有效成分理化鉴别[17]和PCR鉴别等[1]。形态学特征鉴别仍然是目前最常见的鉴别方法,但是该方法要求技术人员具备较强的中药学背景及丰富的识别经验,不易掌握;有效成分理化鉴别方法针对川贝母中有效成分进行光谱和色谱分析,能有效鉴别出中药材功能成分的高低,但是不能满足药材身份鉴定的要求;随着PCR技术的发展和对检测要求的不断提高,各种PCR技术被用于川贝母的鉴别当中[18-19]。在2015年版《中华人民共和国药典》一部中[18],新增了川贝母PCR-RFLP鉴别,该方法具有灵敏度高和准确度高的特点。罗达龙等[19]利用实时荧光PCR的SYBR Green染料法,实现了川贝母与平贝母、浙贝母、土贝母的特异性鉴别。但是上述基于PCR技术的鉴别方法需要PCR仪等专门的仪器设备,难以满足快速检测的需求。LAMP已经是食品检测、监测和监管的重要技术手段,特别是对于生产车间、市场加工品等临检,能够满足现场获得结果的需求。

本研究以川贝母物种特异性序列为靶标,建立基于荧光-LAMP川贝母鉴别方法。该方法具备以下特点:①速度快:恒温扩增在1 h内能够获得检测结果,如果配合快速DNA提取技术[20],可以在1.5 h内完成从样品到结果整个鉴别过程;②操作简单:仅需要将LAMP Reaction MIX、显色剂和模板按比例混合,置于恒温加热块上扩增即可获得结果,不需要特殊的技术人才和高精尖的设备,便于操作和携带;③闭管观察结果:采用新型钙黄绿素染料,检测反应结束后,无需开盖,即可裸眼观察结果,减少了开盖带来的产物污染的影响,有效避免假阳性的产生;④灵敏度高:本方法灵敏度达0.1%,能够满足中药材、中成药中川贝母成分的检测。

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