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  药物分析杂志   2018, Vol. 38 Issue (11): 1893-1898.  DOI: 10.16155/j.0254-1793.2018.11.07
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重组药物相关蛋白质量分析专栏

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陶磊, 丁有学, 李永红, 韩春梅, 史新昌, 裴德宁, 饶春明. 重组假丝酵母尿酸酶中聚合物的分析与评价[J]. 药物分析杂志, 2018, 38(11): 1893-1898. DOI: 10.16155/j.0254-1793.2018.11.07.
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TAO Lei, DING You-xue, LI Yong-hong, HAN Chun-mei, SHI Xin-chang, PEI De-ning, RAO Chun-ming. Analysis and evaluation of polymers in recombinant Candida uricase[J]. Chinese Journal of Pharmaceutical Analysis, 2018, 38(11): 1893-1898. DOI: 10.16155/j.0254-1793.2018.11.07.
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基金项目

药品医疗器械审评审批制度改革专项课题(ZG2017-3-02);十三五科技重大专项课题“生物类似药质量相似性评价体系建设研究”(2015ZX09501008)

第一作者

陶磊, Tel:(010)67095586;E-mail:taolei01@nifdc.org.cn;
丁有学, Tel:(010)67095684;E-mail:dingyouxue@nifdc.org.cn

通信作者

裴德宁, Tel:(010)67095586;E-mail:peidening@nifdc.org.cn
饶春明, Tel:(010)67095380;E-mail:raocm@nifdc.org.cn

文章历史

收稿日期:2018-07-17
重组假丝酵母尿酸酶中聚合物的分析与评价
陶磊 , 丁有学 , 李永红 , 韩春梅 , 史新昌 , 裴德宁 , 饶春明     
中国食品药品检定研究院, 卫生部生物技术产品检定方法及其标准化重点实验室, 北京 100050
摘要目的:分析重组假丝酵母尿酸酶中聚合物的形成原因及其对结构功能的影响。方法:通过分子排阻高效液相色谱(SEC-HPLC)结合多角度激光散射仪分离聚合物并测定其相对分子质量;将含有聚合物的蛋白进行还原及非还原十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),确定聚合物的形成是否与二硫键有关;通过液质联用仪鉴定聚合物中存在的二硫键;通过测定圆二色谱评价聚合物的形成对蛋白二级结构的影响;通过多角度激光散射仪测定二硫键形成对蛋白稳定性的影响;通过酶活性测定评价聚合物形成对酶活性的影响。结果:重组假丝酵母尿酸酶正常以同源四聚体的形式存在,37℃条件下可通过链间二硫键形成更高级别的聚合物,高级聚合物的形成对蛋白二级结构及稳定性的影响不大,但会降低酶活性。结论:本文综合多种手段对尿酸酶中聚合物的成因及影响进行分析,测定结果可为该制品的后续研究及质量控制提供依据。
关键词假丝酵母    尿酸酶    聚合物    二硫键    液相色谱质谱联用    质量控制    
Analysis and evaluation of polymers in recombinant Candida uricase
TAO Lei, DING You-xue, LI Yong-hong, HAN Chun-mei, SHI Xin-chang, PEI De-ning, RAO Chun-ming    
National Institutes for Food and Drug Control, Key Laboratory of Ministry of Health for Research on Quality and Standardization of Biotech Products, Beijing 100050, China
Abstract: Objective: To analyze the cause of polymers in recombinant Candida uricase and its effect on structure and function.Methods: The polymers were separated by size exclusion-high performance liquid chromatography(SEC-HPLC) combined with multi-angle laser light scattering(MALLS) to measure their relative molecular weights. The proteins containing polymers were analyzed by reduced and non-reduced sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis(SDS-PAGE) to determine whether the formation of polymers was related to disulfide bonds. The disulfide bonds in the polymers were identified by liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS); The influence of polymers formation on secondary structure of protein was evaluated by circular dichroism. The disulfide bonds' effect on thermal stability of protein was determined by MALLS. The enzyme activity was also measured to determine whether it was affected by polymerization.Results: The protein normally exists in the form of homologous tetramers, and higher level polymers can be formed gradually through inter-chain disulfide bonds at 37℃. The formation of higher level polymers has no significant effect on secondary structure and stability of protein, but it could reduce its enzyme activity.Conclusion: The causes and effects of polymers in uricase were analyzed by various methods, which can provide basis for the follow-up research and quality control of the products.
Key words: Candida    uricase    polymers    disulfide bond    UPLC-MS    quality control    

尿酸酶可以将尿酸氧化为水溶性更好的尿囊素,更利于排出体外。在进化过程中,人类的尿酸酶基因成为假基因,尿酸代谢缓慢甚至出现障碍[1-2],血尿酸水平比其他含有正常尿酸酶的哺乳动物高出3~10倍,因此更易罹患高尿酸血症[3]。重组尿酸酶是一种很有前景的降尿酸药物,它直接作用于尿酸本身,几乎不存在与其他药物的相互作用[4],并且可以消除关节处已经形成的尿酸结晶[5],适用于各种类型的高尿酸血症[6-9]。重组假丝酵母尿酸酶是将假丝酵母的尿酸酶基因转入大肠杆菌表达生产的,与其他物种的尿酸酶相比,假丝酵母尿酸酶具有活性高及水溶性好的特点。重组假丝酵母尿酸酶由302个氨基酸组成,相对分子质量为34064,以同源四聚体的形式发挥酶活性。

作为治疗用重组蛋白药物,制品相关蛋白是质量控制中的关键环节。制品相关蛋白是指在重组蛋白药物在生产和/或贮藏过程中形成的预期制品的变异体,如聚合物、修饰产物及降解产物等。如果这些变异体在活性、有效性和安全性方面与预期制品不同,称为制品相关杂质;如果它们具有一定活性且对制剂的安全性和有效性无有害影响,则称为制品相关物质。其中,聚合物是比较常见的一类制品相关蛋白,聚合物的形成机制非常复杂,主要涉及三方面的原因:蛋白本身的理化特性;蛋白溶液的pH、盐浓度与种类等;外部因素的刺激,如温度、光照、反复冻融、冷冻干燥、氧化环境及容器材质等。蛋白聚集可引起重组蛋白药物免疫原性的升高,在质量控制中应密切关注。前期研究结果显示,重组假丝酵母尿酸酶很容易形成聚合物,本文针对聚合物的形成机制及其对蛋白结构功能的影响展开了研究。

1 材料 1.1 仪器

Waters Alliance 2695高效液相色谱仪(Waters公司);XCell SureLockTM蛋白电泳仪(Thermo公司);Acquity UPLC-Xevo G2-S液质联用仪(Waters公司);Jasco J-810圆二色谱仪(JASCO公司);Dawn Heleos多角度激光散射仪(Wyatt Technology公司);96孔石英板及SpectraMax M5酶标仪(Molecular Devices公司)。

1.2 试药

超纯水由密理博超纯水机制备;乙腈为色谱纯;甲酸、盐酸、三氟乙酸、尿酸均为分析纯;三羟甲基氨基甲烷(Tris)购自Solarbio公司,分析纯;氯化钠、磷酸氢二钠、磷酸二氢钠、盐酸胍购自国药集团化学试剂有限公司,均为分析纯;二硫苏糖醇(纯度≥99%)、碘乙酰胺(纯度≥99%)、胰蛋白酶(货号T6567)均购自Sigma Aldrich公司,为蛋白质组学级;电泳胶(NuPAGE® 4%~12% Bis-Tris gel)购自Invitrogen公司;重组假丝酵母尿酸酶样品为本实验室表达和纯化。

2 方法与结果 2.1 样品前处理

为保证样品的稳定,重组假丝酵母尿酸酶纯化后置-70 ℃保存,测定前将样品取出并置室温融化,即得“-70 ℃保存的样品”。为分析重组假丝酵母尿酸酶的聚集特性以及聚集对结构、功能的影响,将刚融化后的-70 ℃保存的样品置37 ℃分别孵育2、4、6、20 h,即得37 ℃孵育2、4、6、20 h的样品。

2.2 SEC-HPLC分析

色谱条件:采用Yarra SEC-2000色谱柱(300 mm×7.8 mm,3 µm),以20 mmol·L-1 Tris-盐酸-0.1 mol·L-1的氯化钠缓冲液(pH 8.0)为流动相,等度洗脱,流速0.5 mL·min-1,柱温35 ℃,检测器采用紫外检测器与多角度激光散射检测器串联,紫外检测波长280 nm,采集时间30 min。

样品稀释及测定:将-70 ℃保存的样品及37 ℃孵育2、4、6、20 h的样品分别用流动相将蛋白质量浓度稀释至1 mg·mL-1,10 000 r·min-1离心5 min后取上清上样测定,进样量50 µL。

结果显示:样品在37 ℃放置的过程中,聚集产物逐渐形成,聚合物的峰面积百分比从最初的2%增加到30%(见图 1),说明重组假丝酵母尿酸酶性质不稳定,很容易形成聚合物。通过多角度激光散射仪测定相对分子质量(见图 2)发现:主峰中蛋白的相对分子质量约为1.4×105,说明主峰中的蛋白以四聚体的形式存在;另外2种高聚体的相对分子质量分别为3.0×105、5.5×105,分别对应八聚体与十六聚体,说明重组假丝酵母尿酸酶在四聚体的基础上进一步形成高级聚合物。

图 1 尿酸酶样品的SEC-HPLC色谱图 Figure 1 SEC-HPLC chromatograms of uricase samples

图 2 多角度激光散射仪测定尿酸酶聚合物的相对分子质量 Figure 2 Relative molecular mass of uricase polymers detected by MALLS
2.3 SDS-PAGE电泳分析

取-70 ℃保存的样品,进行非还原SDS-PAGE分析;取37 ℃孵育20 h的样品,同时进行还原及非还原SDS-PAGE分析。上样量均为10 µg,采用Invitrogen公司预制电泳胶,考马斯亮蓝染色,具体方法参见《中华人民共和国药典》三部(2015年版)通则0541电泳法第五法SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法。

电泳结果见图 3,-70 ℃保存的样品非还原电泳后呈现单体条带,说明重组假丝酵母尿酸酶的四聚体形式是通过非共价键作用形成的,因为电泳试剂中的十二烷基硫酸钠将非共价键破坏,四聚体变为单体。37 ℃孵育20 h的样品在非还原电泳时存在单体条带和二聚体条带,还原电泳时二聚体条带消失,说明二聚体是通过链间二硫键形成的。以上结果说明,重组假丝酵母尿酸酶在37 ℃孵育的过程中,链间二硫键形成并导致了高级聚合物的出现。

图 3 尿酸酶的SDS-PAGE测定结果 Figure 3 SDS-PAGE results of uricase
2.4 液质联用分析

液质联用条件:采用BEH 300 C4色谱柱(2.1 mm×50 mm,3.5 µm),以0.1%的甲酸水溶液(A)-0.1%的甲酸乙腈溶液(B)为流动相,梯度洗脱(0~60 min,99%A→40%A),流速0.2 mL·min-1,柱温40 ℃;样品池温度10 ℃;质谱仪采用正离子、灵敏度、MSE模式采集数据,毛细管电压3 kV,Cone电压40 V,去溶剂气体温度350 ℃,源温120 ℃,去溶剂气体流速800 L·h-1,扫描范围m/z 50~2 000;采用UNIFI操作软件对各肽段进行分析鉴定。样品的酶解及测定:取37 ℃孵育20 h的样品200 µL,加入5 mol·L-1盐酸胍-0.1 mol·L-1 Tris-盐酸缓冲液(pH 8.3)800 µL,混匀后加入孔径为10 000的超滤管,10 000 r·min-1离心10 min,弃去下层滤过液,用5 mol·L-1盐酸胍-0.1 mol·L-1 Tris-盐酸缓冲液(pH 8.3)将上层溶液补足至约1 mL,10 000 r·min-1离心10 min,取出上层溶液,用5 mol·L-1盐酸胍-0.1 mol·L-1 Tris-盐酸缓冲液(pH 8.3)调节质量浓度至1 mg·mL-1;从中取200 µL,加入0.7 mol·L-1碘乙酰胺溶液6 µL,室温避光反应30 min;加入0.1 mol·L-1的Tris-盐酸缓冲液(pH 7.5)800 µL,混匀后加入孔径为10 000的超滤管,10 000 r·min-1离心10 min,弃去下层滤过液,用0.1 mol·L-1的Tris-盐酸缓冲液(pH 7.5)将上层溶液补足至约1 mL,10 000 r·min-1离心10 min,取出上层溶液,用0.1 mol·L-1的Tris-盐酸缓冲液(pH 7.5)调节质量浓度至0.5 mg·mL-1;从中取0.3 mL,加入胰蛋白酶10 µg,37 ℃温育7 h;完毕后加入30 µL 10%三氟乙酸溶液终止反应,10 000 r·min-1离心5 min,取上清上样测定,进样量10 µL。

通过碘乙酰胺将样品中游离的巯基封闭,避免了在酶切过程中新的二硫键形成。酶切后进行液质联用检测,通过理论相对分子质量与实测相对分子质量的匹配鉴定二硫键连接肽段。结果发现以下二硫键配对方式:Cys249-Cys292、Cys249-Cys267、Cys292-Cys167、Cys292-Cys38(见图 4),这些二硫键的形成导致了高级聚合物的出现。

图 4 液质联用法鉴定二硫键配对方式 Figure 4 Identification of disulfide bonds pairing by UPLC-MS
2.5 圆二色谱分析

圆二色谱条件:带宽1 nm,响应时间1 s,灵敏度模式为standard,检测范围193~240 nm,数据间隔0.1 nm,扫描速度100 nm·min-1,数据叠加次数为4。

样品处理及测定:各取-70 ℃保存的样品及37 ℃孵育20 h的样品200 µL,分别加入0.1 mol·L-1的磷酸盐缓冲液(pH 7.0)800 µL,混匀后加入孔径为10 000的超滤管,10 000 r·min-1离心10 min,弃去下层滤过液,用0.1 mol·L-1的磷酸盐缓冲液(pH 7.0)将上层溶液补足至约1 mL,10 000 r·min-1离心10 min,取出上层溶液,用0.1 mol·L-1的磷酸盐缓冲液(pH 7.0)调节蛋白质量浓度至0.15 mg·mL-1,分别测定圆二色谱。

测定结果显示,两者的圆二色谱基本一致(见图 5),说明高级聚合物的形成对蛋白二级结构的影响不大。

图 5 尿酸酶的圆二色谱图 Figure 5 Circular dichroism spectra of uricase
2.6 热稳定性分析

多角度激光散射仪条件:采集时间5 s;温度范围25~70 ℃;温度升高速度1 ℃·min-1

样品处理及测定:取-70 ℃保存的样品,用超纯水调节蛋白质量浓度至2 mg·mL-1,平分为2份,1份加入二硫苏糖醇至终浓度为2 mmol·L-1,另1份加相同体积的超纯水,分别混匀并采用动态光散射法测定转变温度。

本实验以蛋白发生聚集时的临界温度(转变温度)作为评价热稳定性的指标。1份样品直接加热测定转变温度,另1份样品中加入二硫苏糖醇后测定转变温度,因为二硫苏糖醇形成的还原环境可避免二硫键的形成,藉此评价二硫键形成对蛋白稳定性的影响。结果显示2种条件下蛋白的转变温度仅有1.8 ℃的差异,说明二硫键的形成对蛋白的热稳定性影响不大。见图 6

图 6 动态光散射测定转变温度 Figure 6 Transition temperature detected by dynamic light scattering(DLS)
2.7 酶活性测定

样品活性测定:用0.1 mol·L-1磷酸盐缓冲液(pH 7.0)溶解适量尿酸制备150 µmol·L-1尿酸溶液,并预热至37 ℃;将-70 ℃保存的样品及37 ℃孵育20 h的样品”用0.1 mol·L-1磷酸盐缓冲液(pH 7.0)分别稀释至10 µg·mL-1,各取30 µL分别加入96孔石英板,另取30 µL 0.1 mol·L-1磷酸盐缓冲液(pH 7.0)加入96孔石英板做阴性对照,以上各孔分别加入270 µL尿酸溶液并混匀,另取300 µL 0.1 mol·L-1的磷酸盐缓冲液(pH 7.0)加入石英板作空白对照,将石英板放入酶标仪在37 ℃进行动态检测,检测波长293 nm,每30 s检测1次,测定10 min,记录检测数据。根据单位时间尿酸的消耗量计算酶活性。

检测结果显示:-70 ℃保存的样品的酶活性为(9.2±0.1)U·mg-1n=3),37 ℃放置20 h后酶活性降为(8.3±0.2)U·mg-1n=3),两者经t检验显示存在显著差异(P<0.05),说明高级蛋白聚合物的形成降低了酶活性。

3 讨论

本文对重组假丝酵母尿酸酶中聚合物的聚集方式及其对结构功能的影响展开研究,结果显示:重组假丝酵母尿酸酶正常以同源四聚体的形式存在,与文献报道[10-11]一致;在37 ℃放置过程中,由于链间二硫键的形成导致高级聚合物的出现,新形成的二硫键包括Cys249-Cys292、Cys249-Cys267、Cys292-Cys167、Cys292-Cys38;高级聚合物的形成对蛋白的二级结构及热稳定性影响不大,但是可以造成酶活性的降低。

蛋白是对温度变化比较敏感的一类物质,本文展示了重组假丝酵母尿酸酶在37 ℃放置时可以产生高级聚合物。除此之外,25、4、-20、-70 ℃的分析结果显示:在25 ℃与4 ℃放置时,重组假丝酵母尿酸酶同样有高级聚合物生成,只是聚集速度相对较慢,在-20 ℃与-70 ℃放置时蛋白相对比较稳定。

本实验中,蛋白聚集造成了酶活性的降低,但是蛋白的二级结构却未发生明显的改变。文献报道,重组假丝酵母尿酸酶的活性中心涉及Lys 11、Tyr 59、Phe 161、Arg 178、Gln 234、Asn 260、His 262[16],部分氨基酸残基与参与形成二硫键的半胱氨酸残基比较接近,如Cys 157、Cys 249,因此推测:由于链间二硫键的形成导致酶活性中心的氨基酸残基的相对位置发生改变,虽然对于蛋白整体结构来说变化不大,但这些关键部位的细微结构变化降低了该蛋白的酶活性。

蛋白的聚集方式有多种分类形式,包括聚集是否伴随着结构改变、聚集反应的可逆与否、共价键形成的聚集还是非共价键形成的聚集等[12]。本文的实验结果显示重组假丝酵母尿酸酶的同源四聚体是通过非共价键形成的,更高级别的聚合物则是通过共价键形成的。蛋白聚集是治疗用重组蛋白药物应重点关注的方面,因为它是引起免疫原性的重要原因[13-14],而免疫原性可导致抗药抗体的生成,并进一步造成蛋白药代动力学性质改变及疗效消失,甚至超敏反应,严重影响治疗用重组蛋白药物的安全性和有效性[15]

综上所述,本研究对重组假丝酵母尿酸酶聚合物的形成原因及影响进行了分析,分析结果可为该制品的后续研究及质量控制提供依据。

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