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基于改进的遗传算法的模糊聚类算法
张永库1, 尹灵雪2 , 孙劲光1
1. 辽宁工程技术大学 电子与信息工程学院, 辽宁 葫芦岛 125105;
2. 辽宁工程技术大学 研究生学院, 辽宁 葫芦岛 125105
基金项目: 国家自然科学基金资助项目(61172144);国家科技支撑计划资助项目(2013BAH12F02);辽宁省教育厅科学研究一般资助项目(L201432).    
摘要: 针对传统的模糊C均值聚类(fuzzy C-means clustering)算法容易陷入局部最优解,并且对初始值敏感的缺陷,提出一种基于改进的遗传算法的模糊聚类算法。该算法针对遗传算法的早熟问题提出一种改进的遗传算法,并将其应用于FCM算法,来寻找全局最优的聚类中心。实验表明,该算法与基于传统遗传算法的FCM算法相比,具有更强的寻优能力,更优的聚类效果。
关键词: 模糊C均值算法     聚类分析     遗传算法     动态分析     模糊聚类     初始值     避免早熟     全局最优     局部最优    
Fuzzy clustering algorithm based on the improved genetic algorithm
ZHANG Yongku1, YIN Lingxue2 , SUN Jinguang1    
1. College of Electronics and Information Engineering, Liaoning Technical University, Liaoning 125105, China;
2. Institute of Graduate, Liaoning Technical University, Liaoning 125105, China
Abstract: The traditional fuzzy C-means(FCM) clustering algorithm is prone to fall into the solution of local optimum and is sensitive to initial value. Aiming at these drawbacks, a fuzzy C-means based on the improved genetic algorithm is presented. The improved genetic algorithm is employed to optimise the FCM algorithm, finding the cluster center of the global optimum. Finally, the experimental results show that compared with the traditional FCM, the proposed algorithm has stronger optimisation ability and better clustering effect.
Key words: fuzzy C-means clustering     cluster analysis     genetic algorithm     dynamic analysis     fuzzy clustering     initial values     premature contraction avoidance     global optimum     local optimum    

作为一种无监督的学习方法,聚类分析被视为机器学习研究以及数据挖掘应用中的一个主要内容。它仅根据在数据中发现的描述对象及其关系的信息,将数据对象分组,其目标是,组内的对象相互之间是相似的,而不同组中的对象是不同的[1]。由于现实生活中许多问题是在类属方面存在模糊性的,那么对其进行划分界限明确的聚类分析显然是不恰当的。L.A.Zedeh提出了一种用模糊集理论来解决的聚类问题,即模糊聚类分析。在大量的模糊聚类算法中,应用的最为广泛的算法便是基于目标函数的模糊C均值算法(FCM)。FCM作为聚类分析中的一个重要研究领域,目前针对其研究的应用已经非常广泛。但该算法易陷入局部最优解和对初始值敏感[2]。文献[3]提出将遗传算法(genetic algorithm)应用于FCM,利用GA的全局搜索性能去确定最佳聚类数并寻找到全局最优聚类中心,即GA-FCM算法[3]。近些年来,GA-FCM算法得到了十分广泛的应用[4, 5, 6],众多学者针对GA-FCM提出了改进的算法,LIU Su-hua[7]等将模拟退火算法引入了GA中,以此来改进GA的早熟问题,进而获得较好的聚类效果,与此同时改进GA的交叉算子和变异算子。 Feryel Souami等提出的文献[8]使用了一种新的适应度函数,从而避免了存储和计算隶属度矩阵在效率上的浪费[8]

这些算法用不同的方法来对GA-FCM进行了改进并且取得了良好的效果。为了进一步优化GA-FCM所达到的聚类效果,改进GA所存在的早熟问题,本文通过对GA的选择算子进行改进,并非每次循环都进行选择,而是通过目前种群中个体的多样性动态决定选择操作是否发生,进而提出了一个新的Dynamic GA-FCM算法,改进了GA的早熟问题,通过人工数据以及经典数据集的仿真实验,表明本文所提出的改进方法确实具有更佳的聚类性能。

1 FCM算法

模糊C均值聚类(FCM)最早是由JAMES C. BEZDEK等人在参考文献[9]中提出来的,FCM算法基于模糊划分,用隶属度来确定每一个数据点属于某一个聚类的程度,最终实现被划分到同一簇的对象之间相似度最大,而不同簇之间的相似度最小[1]

它把向量xi(i=1,2,…,n)分为cV={V1,V2,…,Vc},并求出每一组的聚类中心 A={A1,A2,…,Ac},每一个向量xi用值在0~1的隶属度来表示其属于各个组的程度。一个数据集的隶属度之和恒等于1。即隶属度矩阵U必须满足如下条件:

uij=1时表示第j个对象完全属于第i个类,uij=0时表示第j个对象完全不属于第i个类。

FCM的目标函数为

dij=‖Aixj‖为第i个聚类中心和第j个数据点之间的欧几里德距离;其中λ∈[1,∞),它是一个加权指数。 在式(1)约束条件下对式(2)应用拉格朗日乘法,求导得:

为了使目标函数J在已经给定的约束条件下取得极小值,FCM算法基本步骤如下:

1) 随机生成c个聚类中心{A1,A2,…,Ac}。

2) 根据式(4),计算求得隶属矩阵U,使其符合式(1)中的约束条件。

3) 根据式(2)计算目标函数值。若它小于某个确定的阈值,或者它相对上一次目标函数值的改变量小于某一个给定阈值,则算法终止。

4) 用式(3)计算得到新的聚类中心。返回2)。

2 遗传算法

John H. Holland在20世纪60年代提出遗传算法,该算法是一种基于遗传学中的自然选择和适者生存机制而产生的简单、强健、有效的优化技术[10]。GA中所求问题的可行解使用个体即染色体来表示,并且每一个体以STRING类型进行编码,该算法以遗传学为基础,每一个体都按照提前设计好的适应度函数来计算该个体的适应度值,然后按照优胜劣汰原则并且通过全局并行搜索来不断地获得更加优秀的个体,进而获得更加优秀的种群[11]。编码的方法、对种群的初始化、设计适应度函数、遗传算子以及各个参数的设置,以上5部分是遗传算法的主要部分[12]

而上述提到的遗传算子,其中主要包括选择算子、交叉算子、和变异算子。以下为基本遗传算法的步骤:

1) 随机产生染色体种群,每一个染色体都代表一个所求解问题的解决方案。

2) 计算种群中每一个染色体的适应度值。

3) 重复以下步骤,直到完成一个新的种群的产生。

①根据每个个体的适应度值从种群中选择2个父代染色体。适应度值越高,被选中作为父代染色体的概率越大。

②给定一个交叉概率Pc,若2个父代染色体交叉则形成新的子代染色体。若未发生交叉,则其子代染色体与父代染色体相同。

4) 用新产生的种群代替原来的种群。

5) 给定一个变异概率Pm,种群中每个个体以该概率发生变异,产生新的子代。

6) 用新产生的种群代替原来的种群。

7) 如果新种群满足了终止条件,则跳出循环,并且返回种群中的最佳解决方案,得到所求问题的最优解。

8) 回到2)。

3 Dynamic GA-FCM

GA-FCM算法虽然在一定程度上改善了模糊C均值算法对初始聚类中心敏感的问题,但遗传算法的早熟问题却严重影响了聚类算法的准确性[13]。在传统的GA-FCM算法中,由于早熟问题而产生的局部最优聚类中心,可能会降低该算法聚类的质量[14]

基于以上问题,本文将传统遗传算法进行改进,目的是降低其发生早熟现象的概率,从而提高聚类的质量。早熟问题发生的最主要原因就是选择的速度过快,而产生新个体的速度过慢[15]。 在遗传算法中,新个体的产生是通过交叉算子和变异算子来实现,因此可以通过增加交叉和变异算子实现的次数来加快产生新个体的速度,但同时,若种群中个体的多样性过高,即产生新个体的速度过快,又会导致种群中个体所保存的解决方案的信息将会被丢失,并且很难实现最终的收敛,或收敛的速度过慢。为了能够平衡种群中个体的多样性和稳定性,本文将遗传算法中的选择算子进行改进,使其根据当前种群中个体的多样性,来自适应的调整选择的速度。进而保证种群中个体的多样性保持在适当的水平,不会过高,也不会过低。由于传统的GA-FCM每次计算适应度函数值时都需要计算隶属度矩阵,这大大增加了实现算法所用的时间,在本算法中,采用了Feryel Souami等提出的新的适应度函数公式[8],计算适应度时不再计算隶属度矩阵,缩短了算法所用时间[20]

3.1 染色体编码和初始种群产生

染色体编码有很多种方式,本文采用了浮点数编码。初始种群的产生采用了随机生成,方法为:在所给出的参与聚类分析的n个样本点中,随机的抽取c个样本点,将其作为c个聚类的聚类中心,并通过染色体表示出来,其中c为聚类数。即1条染色体可以使用由c个基因位组成的浮点码串{A1A2A3,…,Ac}表示,重复进行m次(m为种群大小),得到初始种群。 如图 1所示,为一个由4个二维聚类中心组成的染色体,其中Ai1Ai2(∀i=1,2,…,c)皆为浮点数。

图 1 染色体的表示方式Fig. 1 Representation of a chromosome
3.2 适应度函数

对于所求解问题,解决方案的好坏通过每一个个体的适应度值来评价。而适应度值则是根据事先定义好的适应度函数计算得到的。

传统GA-FCM算法的适应度函数需要使用隶属度矩阵,而每次循环中,隶属度矩阵的更新花费大量的时间,在很大程度上降低了算法的效率,为了解决这一问题,Hathaway和 Bezdek基于式(2)提出了一个新的FCM目标函数的形式,Feryel Souami就是基于该目标函数以及Frigui所提出的竞争凝聚(competitive agglomeration)算法,提出了一个新的适应度函数[19],该适应度函数定义如下:

式中:t为种群解决方案的代数,ab为2个常量。

其中,d可以是欧几里得距离,也可以是其他距离。在本文中,使用了欧几里得距离,为模糊指数。

3.3 选择操作

选择操作就是从种群中选择适应度值较高的个体,将其保留到下一代种群,适应度值越高的个体,被保留到下一代的概率就越高,反之则越小,选择操作使种群中个体的适应度值不断的接近于最优解。本文使用轮盘赌选择法。该方法是一种回放式随机采样法,种群中每一个个体被选择的概率为

式中:F(indi)为第i个个体的适应度值,为种群中所有个体,即m个个体的适应度值之和。

3.4 交叉操作

本文算法采用了离散重组的一点交叉,假设有染色体对xa(t)=(xa1,xa2,…,xai ,…,xac),xb(t)=(xb1,xb2,…,xbi,…,xbc)。其中i∈(1,2,…,c),t为遗传算法迭代次数。每个染色体的任意2个相邻基因位之间设立一个交叉点,从左到右依次为1,2,…,c-1,总共c-1个不同的交叉点。每一对染色体以Pc概率来进行交叉,在c-1个交叉点中随机的选择一点,交换2个染色体自该交叉点以后的所有基因。

3.5 变异操作

对每一个个体的每一个基因位,产生随机数p,当pPm时,对此基因位进行随机变异操作,在参与聚类分析的样本集中随机的抽取一个对象,代替此基因位的基因,作为新聚类中心,生成下一代种群。

变异概率Pm一般很小,通常在0.001~0.1,如果变异概率过大,就会破坏很多优良个体,可能无法得到最优解,而如果变异概率过小,个体则无法变异到更优的解,导致算法收敛速度变慢,只能达到局部最优解。

3.6 保持种群多样性

在聚类分析中,传统的遗传算法当种群中各个体的目标函数值趋向一致或者趋向局部最优时,对于交叉算子以及变异算子来说,不易生成新的最优个体的结构,因而搜索范围将局限于局部最优的区域,只能取得局部最优的结果,即早熟。针对这一问题,在本算法中,当种群中的各个体其目标函数值趋向一致时,根据种群的多样性度量值,动态决定选择操作是否发生,而非每次循环都进行选择,只有当种群的多样性度量值大于所期望的最低多样性度量值时,才进行选择操作。

本算法采用标准偏差法(standard deviation)来度量种群的多样性,标准偏差法是Kenny Q. Zhu在文献[16]中所介绍的。根据该方法,种群的多样性度量值为

式中:m为种群大小,fi为第i个个体的适应度值,为种群中所有个体适应度值的平均值。

而最低多样性度量值,本算法根据Kim Nguyen等在文献[17]所提出的模型,将其定义为

式中:Stdmin(0)为种群初始多样性度量值,b为种群当前的迭代次数。

3.7 Dynamic GA-FCM算法描述

Dynamic GA-FCM算法的思想是先随机选择m个个体,组成大小为m的种群,然后计算种群的多样性度量值,若种群的多样性小于给定阈值,则不进行选择操作,对种群中的个体不断的循环进行交叉操作和变异操作,增加种群中个体的多样性,直至种群多样性大于给定阈值。当种群多样性度量值大于阈值时,则按照原遗传算法的流程,顺序进行选择、交叉、以及变异操作。交叉算子和变异算子的作用是产生新的个体,每次交叉变异结束,用新个体代替原个体保留在种群中。通过该种思想,使种群中个体的多样性动态控制选择算子实现的速度。由于选择算子的作用主要是实现种群的收敛,故通过本文的动态选择可以动态的调整种群收敛速度。将上述过程不断循环,最终求得全局最优解。

算法的步骤为:

1) 参数初始化,种群大小m,交叉概率Pc,变异概率Pm,聚类数c

2) 初始化由m个个体组成的初始种群,每个个体由c个聚类中心组成;

3) 对于每一个个体,用式(5)~(7)计算该个体的适应度值F(indi),其中i=1,2,…,m

4) 根据适应度值F(indi)用式(9)、(10)计算出种群中个体的多样性度量值Stddev(P)是否大于最低多样性度量值Stdmin,若是,则执行5),否则执行6);

5) 根据适应度值F(indi),用式(8)计算出选择概率,执行选择操作;

6) 对种群中各个体执行交叉和变异操作产生新个体;

7) 将新个体代替原个体保留在种群中;

8) 若在一定迭代次数L内种群的性能没有改进或达到了最大迭代次数it,跳出循环,否则执行步骤3)。

3.8 算法复杂性分析

算法的时间复杂度可以用来度量算法运行的时间,表示算法计算效率的高低,其大小反映了算法性能的优劣,不考虑硬件及环境因素,假设每一次执行时硬件条件和环境条件是相同的,设有n个待聚类对象,聚类中心个数为c,种群大小为m,算法的迭代次数为L,则本文算法的时间复杂度为O(Lncm),以下为对时间复杂度的说明。

1) 以算法的一次迭代为例,从待聚类的n个对象中随机选取m个个体作为初始种群,其中每个个体由c个对象组成,代表c个聚类中心,其时间复杂度为O(cm)。

2) 求解种群中每个个体适应度时,需要遍历n个待聚类对象与该个体所代表的c个聚类中心的距离矩阵Dc×n,其时间复杂度为O(nc),由于需要计算种群中m个个体的适应度,那么该步骤总共消耗的时间为O(ncm)。

3) 计算种群中个体的多样性度量值Stddev(P)需要对种群中所有个体的适应度进行遍历,时间复杂度为O(m)。

4) 选择操作需要计算种群中每个个体的选择概率并根据选择概率重新选择m个个体,时间复杂度为O(2m)。

5) 交叉操作过程中,需要对种群中m个个体进行遍历,时间复杂度为O(m)。

6) 变异操作同样要遍历种群中m个个体,时间复杂度为O(m)。

7) 在每一次迭代完成后需要判断是否已经达到终止条件,此操作的时间复杂度为O(1)。

通过以上的分析可以得到1)~7)的时间复杂度为O(5m+cm+ncm+1)。整体算法的迭代次数为L,则本文算法的整体运行时间为O((5m+cm+ncm+1)L)。当数据规模逐渐增大,即n趋于无穷大时,本文算法的时间复杂度为O(Lncm)。

4 实验结果与分析

为检验Dynamic GA-FCM算法的有效性以及可行性,将 Dynamic GA-FCM算法、传统GA-FCM算法、K-means算法以及Helo′lna Alves Arnaldo等人在文献[18]所提出的改进FCM算法进行性能比较,分别选用人工数据集、UCI数据集以及数字数据集进行测试。Dynamic GA-FCM和传统GA-FCM算法中模糊指数=2,种群个体总数m=100,种群最大迭代次数it=100,变异概率Pm=0.05,交叉概率Pc=0.8。

4.1 人工数据实验

本节将人工数据分成2组,以测试Dynamic GA-FCM算法的性能,表一给出了人工数据集的性质。

表 1 人工数据集的数据特征 Table 1 Artificial data sets characteristics
数据集 对象数/个 维数 类个数
Long1 1000 2 2
Spiral 1000 2 2
Lineblobs 266 2 3
Square1 1000 2 4
4.1.1 人工数据集I

人工数据集I是3个具有复杂的流形分布的数据集,分别为数据集 Long1,Spiral以及Lineblobs。以下分别展示了上述 3 种算法对人工数据集I的聚类结果,使数据分布情况及聚类效果更为直观的显现。对于每个数据集,独立运行了50次。表 2列出了各个算法在求解以上3个聚类问题时得到的聚类的正确率平均值。从表 2中的统计数据和如图 2~4所示的聚类结果可以清楚的看到,对于 Long1,Spiral和Lineblobs这3个具有明显的流形分布特点的数据集,本文所提出的算法在总体上较之其他的3种算法,聚类效果更优。

表 2 人工数据集I的聚类结果Table 2 Clustering results on artificial data sets I
数据集平均准确率
GA-FCM k-means 文献[13] 本文算法
Spiral 0.592 0 0.589 8 0.600 1 0.681 3
Long1 0.520 1 0.515 4 0.547 3 0.652 2
Lineblobs 0.741 0 0.743 5 0.743 1 0.853 2
图 2 不同算法对Spiral的聚类结果Fig. 2 Clustering results on Spiral
图 3 不同算法对Long1的聚类结果Fig. 3 Clustering results on Long1
图 4 不同算法对Lineblobs的聚类结果Fig. 4 Clustering results on Lineblobs
4.1.2 人工数据集II

人工数据集II选取具有球形分布的数据集Square1,以下分别给出4种算法对于Square1的聚类结果。 同样,对于该数据集,独立地运行50次,在表 3中列出了各算法求解Square1数据集时所得到的聚类正确率平均值。从表 3中的统计数据以及图 5所示的聚类结果可以看出,对于Square1这个球形分布的数据集,上述4种算法的聚类效果都比较好,且比较接近。

表 3 人工数据集II的聚类结果Table 3 Clustering results on artificial data sets II
数据集平均准确率
GA-FCM k-means 文献[13] 本文算法
MNIST 0.990 0 0.990 0 0.990 0 0.990 0
图 5 不同算法对Square1的聚类结果Fig. 5 Clustering results on Square1
4.2 UCI数据实验

此外,选择了3个UCI数据集分别的对4种算法进行了测试,以便更加全面的考察算法的性能。数据集来自http://archive.ics.uci.edu/ml/,分别为Iris数据集、Glass数据集以及Teaching Assistant Evaluation数据集,表 4给出了UCI数据集的性质。

表 4 UCI数据集的数据特征Table 4 UCI data sets characteristics
数据集对象数/个 维数 类个数
TAE 151 6 3
Glass 214 10 7
Iris 150 4 3

对每个数据集独立的运行50次后,表 5分别列出了各个算法在求解这3个聚类问题时所得到的聚类正确率平均值。从实验结果中可以看到,对于 Iris,TAE,Glass这3个UCI数据集,本文算法较之另外3种算法更优,说明本文的算法对于现实世界的数据聚类的问题有着很好的性能。

UCI
表 5 在UCI数据集下的聚类结果Table 5 Clustering results on UCI data sets
数据集平均准确率
GA-FCM k-means 文献[13] 本文算法
Iris 0.810 2 0.807 9 0.893 5 0.903 9
TAE 0.701 6 0.699 7 0.762 6 0.802 4
Glass 0.732 5 0.722 5 0.803 0 0.817 2
4.3 数字数据集实验

为了进一步评估算法的性能,本文又在著名的 USPS和MNIST 2个数字数据集上基于归一化互信息(normalized mutual information,NMI),进行了4种算法的对比实验。NMI是一个外部评价标准,用其来评价在某个数据集上的聚类结果与这一数据集的真实划分的相近程度,NMI越大,说明聚类性能越好。

4.3.1 USPS数据集

USPS数据集总共有9 298个16 × 16维的灰度图像样本,其中 2 007个为测试样本,其余为训练样本。本实验选取所有测试样本作为聚类分析数据集,分别执行以下4组实验:

USPS-08:包含数字0 、8的灰度图像测试样本;

USPS-358:包含数字3、5 、8的灰度图像测试样本;

USPS-1234:包含数字 1、2、3、4 的灰度图像测试样本;

USPS-024679:包含数字 0、2、4、6、7、9 的灰度图像测试样本。

其中USPS-08和USPS-358这2组数据较难识别,USPS-1234 和 USPS-024679则相对容易一些。

对每组数据独立的运行50次后,表 6给出了NMI标准下4种算法的实验结果。

表 6 4组USPS数据集在NMI标准下的实验结果Table 6 Four clustering results on USPS at the NMI standard
数据集 GA-FCM k-means 文献[13] 本文算法
USPS-08 0.676 4 0.612 1 0.681 4 0.732 1
USPS-358 0.525 3 0.482 1 0.521 8 0.559 4
USPS-1234 0.752 3 0.724 7 0.760 7 0.800 7
USPS-024679 0.701 3 0.704 2 0.709 8 0.745 6

实验结果表明,本文算法的NMI值比比另外3种算法的对应值大,这说明本文算法在USPS数据集上的聚类划分结果,相比另外3种算法,有所提高。

4.3.2 MNIST数据集

MNIST数据集中每个字符标准化为16×16的灰度图像,总共有70 000个样例。对于0~9每一个数字都选取200个字符用于实验,独立运行50次后,表 7为4种算法的实验结果

表 7 MNIST数据集在NMI标准下的实验结果Table 7 Clustering results on MNIST
数据集 GA-FCM k-means 文献[13] 本文算法
MNIST 0.542 3 0.524 1 0.604 2 0.668 7

从实验结果可以看出,本文算法在NMI上优于其他3种算法。

5 结束语

本文为了克服传统的基于GA的FCM算法中存在的早熟问题,在GA中通过种群中个体的多样性来动态的控制GA选择算子实现的速度,即动态控制了收敛速度,进而设计了Dynamic GA-FCM算法。通过与传统GA-FCM算法、K-means算法以及Helo′lna Alves Arnaldo等在文献[18]所提出的改进FCM算法进行对比实验,实验结果表明,本文提出的Dynamic GA-FCM算法具有更好的聚类效果。

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DOI: 10.3969/j.issn.1673-4785.201503033
中国人工智能学会和哈尔滨工程大学联合主办。
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文章信息

张永库, 尹灵雪, 孙劲光
ZHANG Yongku, YIN Lingxue, SUN Jinguang
基于改进的遗传算法的模糊聚类算法
Fuzzy clustering algorithm based on the improved genetic algorithm
智能系统学报, 2015, 10(04): 627-635.
CAAI Transactions on Intelligent Systems, 2015, 10(04): 627-635.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-4785.201503033

文章历史

收稿日期: 2015-03-18
网络出版日期: 2015-07-02

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