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文章信息
- 黄思邈, 黄龙, 莫春横, 李娟, 王亚军
- HUANG Simiao, HUANG Long, MO Chunheng, LI Juan, WANG Yajun
- 家鸡G蛋白偶联受体139基因的结构、序列及表达特征分析
- Characterization of the Structure and Tissue Expression of Chicken G Protein-coupled Receptor (GPR139) Gene
- 四川动物, 2015, 34(6): 869-874
- Sichuan Journal of Zoology, 2015, 34(6): 869-874
- 10.11984/j.issn.1000-7083.20150177
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文章历史
- 收稿日期: 2015-04-12
- 接受日期: 2015-09-14
G蛋白偶联受体(GPCRs)家族是最大的细胞表面受体家族,广泛表达于各种组织中,将细胞外环境中的胺类、多肽类、脂质、光子、离子等信号转换并传递至细胞内(Melvin et al.,1991;Joel & Jean,1999;David et al.,2005;Ute et al.,2006),从而参与众多生理过程调节(Kristen et al.,2002;Kavita & Kaiser,2014;Raise et al.,2015),如有丝分裂的发生、肌肉收缩、离子通道调控、基因转录等(Ayako et al.,2005)。
G蛋白偶联受体都具有7次跨膜结构(Joel & Jean,1999)。G蛋白偶联受体具有α、β和γ 3个亚基,其中,Gα亚基有4种类型:Gαs、Gαi/o、Gαq和Gα12/13(Ayako et al.,2005;Liaoyuan et al.,2009)。Gαs刺激腺苷酸环化酶的活性,增加胞内cAMP的含量;而Gαi则抑制cAMP的产生;Gαq刺激甘油二酯和磷酸肌醇的生成,进而促进胞内Ca2+的释放;Gα12/13调控小G蛋白RhoA的活性(Kristen et al.,2002; Kavita &Kaiser,2014)。根据G蛋白偶联受体初级结构,以及它们与配体的相互作用的不同,G蛋白偶联受体被分成不同的亚家族,其中包括A类(视紫红质样家族)、B类(分泌素样家族)和C类(代谢型谷氨酸样家族)3个主要亚家族(Ulrik,2000;Robert et al.,2003a,2003b;Kavita & Kaiser,2014;Raise et al.,2015)。
G蛋白偶联受体虽然仅构成人类基因组的小部分,但其可作为近半数市场现有药物的靶点(Jurgen,2000;Robert et al.,2003a;Thóra et al.,2006;Davide & Maria,2008;Liaoyuan et al.,2009)。人类基因组计划显示人体内含有超过800个G蛋白偶联受体,仍有大约140个G蛋白偶联受体为孤儿受体(Robert et al.,2003a;David et al.,2005;Chung et al.,2008)。截止目前,研究人员已为超过100个受体寻找到其对应的内源性配体,并且证实这些受体可以作为许多人类疾病治疗的药物靶点(Olivier et al.,2006;Davide & Maria,2008;Kavita & Kaiser,2014)。因此,寻找新的G蛋白偶联受体及其对应配体仍是研究的热点。研究人员在人和小鼠的基因组数据库中发现了新型的G蛋白偶联受体,并将其命名为GPR139(又名GPRg1)(Robert et al.,2003b;Ayako et al.,2005;David et al.,2005;Feng et al.,2011;Vignir et al.,2014)。人的GPR139与小鼠的GPR139具有94%的相似度(Ayako et al.,2005;Ute et al.,2006),说明了GPR139在进化过程中高度保守(Ute et al.,2006)。GPR139第三跨膜区域末端包含一个天冬氨酸-精氨酸-酪氨酸(D-R-Y)基序,属于G蛋白偶联受体家族视紫红质亚家族(Andrew & Colin,2002;Robert et al.,2003a;Ayako et al.,2005;Ute et al.,2006)。然而,GPR139与G蛋白偶联受体家族视紫红质亚家族的其他成员仅有20%左右的相似度,却与另一孤儿受体GPR142具有较高的相似度(50%)(Ayako et al.,2005;Liaoyuan et al.,2009),因此,GPR139与GPR142形成视紫红质亚家族的一个新分支(Ayako et al.,2005)。
组织表达图谱研究发现,小鼠GPR139几乎全部分布在小鼠的中枢神经系统中,主要分布在纹状体腹侧外部和缰核中央,说明GPR139参与调节大脑功能(Andrew & Colin,2002;Ayako et al.,2005;Ute et al.,2006;Liaoyuan et al.,2009;Feng et al.,2011)。然而,小鼠GPR139在胚胎时期脑组织中的分布较成熟中枢神经系统更为广泛,预示着GPR139可能在大脑不同区域的发育中发挥重要功能(Ute et al.,2006)。人GPR139具有2种不同大小的剪接变体,hGPR139和hGPR139b。人GPR139主要分布在中枢神经系统中,在尾状壳核及下丘脑中具有极高表达量;而人GPR139b广泛分布于不同组织中,在甲状腺、胼胝体、小脑、脾、小肠、胰腺等组织中均有表达(Ayako et al.,2005;Ute et al.,2006)。目前,已有研究结果显示GPR139在调控个体自主活动和情感行为方面具有重要作用(Ayako et al.,2005;Ute et al.,2006)。
黄思邈等:家鸡G蛋白偶联受体139基因的结构、序列及表达特征分析进一步研究发现,在表达GPR139的细胞中,小鼠脑组织提取物可以剂量依赖性地提升胞内钙离子水平,说明在小鼠脑组织中可能存在GPR139的内源性配体(Ute et al.,2006)。在CHO细胞中,报告基因转录分析结果首次证实GPR139可偶联Gq发挥其生理功能(Ayako et al.,2005;Feng et al.,2011;Vignir et al.,2014;Raise et al.,2015);随后有研究发现GPR139可偶联Gi亚基(Ute et al.,2006;Raise et al.,2015);此外也有研究发现过表达GPR139的HEK293F细胞内cAMP含量增加,表明GPR139可以偶联Gαs亚基激活下游信号通路(Liaoyuan et al.,2009)。
家鸡是重要的经济动物,也是重要的模式生物。本次研究以家鸡为对象,从其脑组织中克隆得到家鸡GPR 139基因的cDNA序列,并探究了GPR139 在家鸡组织及脑中的表达情况,为寻找家鸡GPR139的内源性配体、胞内信号通路,及其在家鸡组织中的生理作用奠定基础。
1 材料与方法 1.1 材料感受态大肠杆菌Eschericha coli菌株DH5α由本实验室制备保存;pTA2载体、聚合酶链式反应(PCR)中所使用KOD-Fx高保真聚合酶均购自TOYOBO公司;总RNA提取所用RNAzol购自Molecular Research Center公司;限制性内切酶、逆转录酶MMLV、T4连接酶、dNTP均购自TaKaRa公司;引物合成由Invitrogen公司完成,测序由北京华大六和股份公司完成。
1.2 方法 1.2.1 家鸡总RNA提取取家鸡心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏、小肠、肌肉、胰腺、精巢、卵巢、垂体,以及脑各功能区域(大脑、中脑、小脑、后脑、下丘脑)约600 mg,于液氮中充分研磨,并与600 μL RNAzol混合均匀,加入240 μL DEPC-H2O混匀,4 ℃12 000 r/min冷冻离心15 min;取上清,加入3 μL的阿司咪唑(BAN),漩涡后于4 ℃ 12 000 r/min离心 10 min;取上清,加入等体积异丙醇,4 ℃12 000 r/min冷冻离心15 min;弃上清,加入70%的乙醇漂洗2次,4 ℃ 12 000 r/min冷冻离心3 min;弃上清,用DEPC-H2O溶解沉淀,-80 ℃保存。
1.2.2 反转录以各组织总RNA为模板,反转录合成cDNA序列。反转录体系:1 μL Oligo-dT,2 μg RNA,加入DEPC-H2O补足5 μL,70 ℃反应10 min后冰上放置2 min;再加入2 μL 5×Buffer(+DTT),0.5 μL dNTP,0.5 μL MMLV-RT,2 μL DEPC-H2O混合均匀,42 ℃反应1.5 h,70 ℃反应10 min。将反转录产物加入50 μL MiliQ-H2O稀释作为cDNA模板,-20 ℃保存。
1.2.3 引物设计根据NCBI中家鸡GPR 139 预测序列(Accession No:XM_428970),设计了家鸡GPR 139 基因cDNA全长的扩增引物(rU1+rL1)及组织表达检测引物(rU2+rL2)(表 1)。
基因 | 引物序列 | 片段大小/bp |
基因克隆引物 | ||
GPR139 | rU1: 5’-CCCAAGCTTAGAGCAGGTCCATGGAGCACAA-3’
rL1: 5’-CCGGAATTCAGAACTTTCACCCACCAACTCCA-3’ | 1121 |
组织表达引物 | ||
GPR139 | rU2: 5’-ATCGCTATGGCTGTGGCTTG-3’
rL2: 5’-CGAGCAGGGTAGGAGACTGTAT-3’ | 376 |
β-actin | U1: 5’-TGTGCTACGTCGCACTGGAT-3’
L1: 5’-GCTGATCCACATCTGCTGGA-3’ | 401 |
以大脑cDNA为模板,采用PCR方法对家鸡GPR 139 基因的开放阅读框(open reading frame,ORF)区域进行扩增。PCR体系:5 μL 2×KOD Buffer,2 μL cDNA模板,2 μL 2 mM dNTP,0.1 μL rU1引物,0.1 μL rL1引物,0.2 μL KOD-Fx,加水补足10 μL。将PCR体系混合均匀后,94 ℃预变性2 min;98 ℃变性10 s,60 ℃退火30 s,68 ℃延伸90 s,变性-退火-延伸35个循环;68 ℃最终延伸20 min。反应完成后,取3 μL PCR产物用1%的琼脂糖凝胶进行电泳检测。
取4.5 μL PCR产物与0.5 μL 10×A-attachment Mix混合,60 ℃反应30 min,产物3’-末端加A;取1.5 μL加A产物,2.5 μL 2×Ligation Buffer,0.5 μL pTA2载体,0.5 μL T4 DNA连接酶,混匀后4 ℃过夜连接;转化后用通用引物进行菌落PCR筛选,提取重组质粒并进行酶切检测,将选取的质粒进行测序。
1.2.5 家鸡GPR 139 基因组织表达图谱研究以家鸡各组织cDNA为模板,根据表 1中引物rU2+rL2进行PCR扩增,检测家鸡GPR 139 基因在不同组织中的表达情况。PCR体系:1 μL 10×Taq Buffer,2 μL cDNA模板,0.2 μL dNTP,0.1 μL rU2引物,0.1 μL rL2引物,0.1 μL Taq酶,加水补足10 μL。将PCR体系混合均匀后,于94 ℃预变性2 min,94 ℃变性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸40 s,变性-退火-延伸共29个循环,72 ℃最终延伸5 min。反应完成后,取3 μL PCR产物用2%的琼脂糖凝胶进行电泳检测。
2 结果 2.1 家鸡GPR 139 基因cDNA ORF区域克隆及序列分析以家鸡大脑cDNA为模板,进行PCR扩增,得到GPR 139 基因cDNA ORF区域全长,与预测基因片段大小相同(图 1)。测序结果显示,家鸡GPR 139 基因ORF区域全长1056 bp,编码351个氨基酸的前体蛋白。GPR 139 的第三跨膜区末端有1个D-R-Y基序,属于G蛋白偶联受体家族视紫红质亚家族。我们将家鸡GPR 139 基因ORF区域序列进行基因组序列比对,显示该基因位于家鸡第14号染色体上,由2个外显子组成。家鸡GPR139前体蛋白与人(91.78%)、大鼠(89.17%)、小鼠(89.17%)的GPR139前体蛋白具有较高的同源性(图 2,图 3)。
2.2 家鸡GPR 139 基因组织表达图谱分析
采用RT-PCR方法对GPR 139 在成体家鸡组织和脑各功能区的表达情况进行检测。结果显示:家鸡GPR 139在大脑、中脑、小脑、后脑、下丘脑、垂体、肺、卵巢、精巢、肌肉和肾脏等组织中有表达。其中,GPR139在脑各功能区域和垂体中的表达量最高;在肺、卵巢、精巢、肌肉和肾脏组织中仅有微弱表达。而在其余多种外周组织中,基本检测不到GPR139 的表达(图 4)。
3 讨论GPR139属于G蛋白偶联受体家族视紫红质亚家族,目前仍未发现其内源性配体。孤儿受体被证实可作为药物靶点,因此,GPR139也一直是研究热点,但其在非哺乳类脊椎动物中的信息尚属空白。本次实验首次以家鸡为研究对象,成功从家鸡大脑中克隆得到了 GPR139基因的完整ORF区域。基因序列比对结果显示,GPR139 基因位于家鸡第14条染色体上,由2个外显子组成,在其第三跨膜区域末端含有1个D-R-Y基序(图 3)。其中,ORF区长1056 bp,编码351个氨基酸(图 1~图 3)。不同物种间氨基酸序列比对显示,GPR 139 基因编码的前体蛋白与人、大鼠、小鼠GPR139前体蛋白具有较高的同源性(图 3),说明GPR 139 在进化过程中十分保守,也表明GPR 139 可能具有重要生理学功能,而该功能在脊椎动物进化过程中高度保守。
通过对家鸡GPR 139基因组织表达图谱研究表明,GPR139基因的高表达主要局限于家鸡中枢神经系统及垂体中,暗示GPR 139 主要在家鸡脑组织及垂体中发挥作用。家鸡GPR139基因表达模式与小鼠GPR139基因和人GPR139 基因的表达模式一样,主要在中枢神经系统中表达(Andrew & Colin,2002;Ayako et al.,2005;Ute et al.,2006;Liaoyuan et al.,2009;Feng et al.,2011),也暗示GPR 139 在物种进化过程中发挥相同或相似的生理学作用,包括参与动物自主活动、行为的调控(Ute et al.,2006)。此外,与小鼠GPR 139基因和人GPR139基因不同的是,家鸡GPR139基因高表达于垂体,还被检测到在肺、卵巢、精巢、肌肉中有微弱表达。GPR139基因在家鸡组织中的表达图谱结果,表明GPR139在下丘脑-垂体轴及少数外周组织中发挥作用。本研究为探讨GPR139基因在家鸡中的生理功能奠定了一些基础。
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