南京农业大学学报  2020, Vol. 43 Issue (5): 903-909   PDF    
http://dx.doi.org/10.7685/jnau.201910013
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文章信息

荆雅玮, 左佳坤, 王志豪, 胡剑刚, 黄燕, 米荣升, 苗晋锋, PHOUTHAPANE Vanhnaseng, 陈兆国, 韩先干
JING Yawei, ZUO Jiakun, WANG Zhihao, HU Jiangang, HUANG Yan, MI Rongsheng, MIAO Jinfeng, PHOUTHAPANE Vanhnaseng, CHEN Zhaoguo, HAN Xiangan
氧化型辅酶NAD+及布氏杆菌SahH活性位点对SahH催化活性的影响
Effects of oxidized coenzyme NAD+ and SahH active site on catalytic activity of Brucella SahH
南京农业大学学报, 2020, 43(5): 903-909
Journal of Nanjing Agricultural University, 2020, 43(5): 903-909.
http://dx.doi.org/10.7685/jnau.201910013

文章历史

收稿日期: 2019-10-14
氧化型辅酶NAD+及布氏杆菌SahH活性位点对SahH催化活性的影响
荆雅玮1 , 左佳坤1,2 , 王志豪1 , 胡剑刚1 , 黄燕1 , 米荣升1 , 苗晋锋2 , PHOUTHAPANE Vanhnaseng3 , 陈兆国1 , 韩先干1     
1. 中国农业科学院上海兽医研究所, 上海 200241;
2. 南京农业大学动物医学院, 江苏 南京 210095;
3. 老挝科技部生态与生物技术研究所, 万象 22797
摘要[目的]本文旨在鉴定影响布氏杆菌S-腺苷同型半胱氨酸水解酶(S-adenosylhomocysteine hydrolase,SahH)催化S-腺苷同型半胱氨酸(S-adenosylhomocysteine,SAH)产生同型半胱氨酸(homocysteine,HCY)的催化活性位点。[方法]将表达载体pET28a-Bru-sahH转化大肠杆菌BL21中,表达、纯化布氏杆菌SahH(Bru-SahH)蛋白,分析辅酶NAD+、磷酸化修饰及活性位点对Bru-SahH催化活性的影响。[结果]添加NAD+后,Bru-SahH的催化活性降低85.6%;对Bru-SahH质谱分析表明,其444位丝氨酸为可能的磷酸化位点,对该位点突变后Bru-SahH催化SAH形成HCY的活性降低85.5%;生物信息学分析表明,Bru-SahH的337位和338位氨基酸为其活性位点,分别对上述2个位点进行单突变和双突变,突变后的Bru-SahH催化活性降低90.8%以上。[结论]Bru-SahH的337、338和444位氨基酸是其催化活性位点,添加外源性NAD+可抑制其催化活性。
关键词布氏杆菌   S-腺苷同型半胱氨酸水解酶   酶活性   活性位点   
Effects of oxidized coenzyme NAD+ and SahH active site on catalytic activity of Brucella SahH
JING Yawei1, ZUO Jiakun1,2, WANG Zhihao1, HU Jiangang1, HUANG Yan1, MI Rongsheng1, MIAO Jinfeng2, PHOUTHAPANE Vanhnaseng3, CHEN Zhaoguo1, HAN Xiangan1    
1. Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 200241, China;
2. College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China;
3. Animal Science Center at Biotechnology and Ecology Institute, Ministry of Science and Technology of Laos, Vientiane 22797, Laos
Abstract: [Objectives] The objective of this paper is to investigate the influencing factors of catalytic activity and identification of active catalytic site of Brucella S-adenosylhomocysteine hydrolase (SahH). [Methods] The expression vector pET28a-Bru-sahH was transformed into Escherich coli BL21, the influencing factors of catalytic activity of SahH in vitro were analyzed by addition of exogenous coenzyme NAD+, analysis of modification and identification of catalytic activity sites of SahH, respectively. [Results] The results showed that the catalytic activity of recombinant Brucella protein SahH (Bru-SahH) was decreased by 85.6% by addition of exogenous NAD+. Furthermore, the catalytic activity of Bru-SahH was decreased by 85.5% by mutation of 444th amino acid, which was a possible phosphorylation modification by mass spectrum analysis of Bru-SahH. In addition, the catalytic activity of Bru-SahH was decreased more than 90.8% by single or double site mutation at 337th and/or 338th amino acids of Bru-SahH, which was predicted to the key activity sites of Bru-SahH by bioinformatics analysis. [Conclusions] The results indicated that the key catalytic sites of Bru-SahH were 337th, 338th and 444th amino acids. Exogenous NAD+ could inhibit catalytic activity of Bru-SahH.
Keywords: Brucella    S-adenosylhomocysteine hydrolase(SahH)    enzyme activity    active site   

布氏杆菌病是一种重要的人畜共患传染病, 由布氏杆菌(Brucella)入侵机体引起, 世界动物卫生组织(World Organization for Animal Health, OIE)将该病列为必须通报的疫病, 我国将其列为二类动物疫病。人感染该病后主要表现为发热、关节痛、全身乏力和多汗等症状, 动物感染该病后主要表现为母畜流产、子宫炎、关节炎和睾丸炎等症状。全世界每年布氏杆菌发病人数超过50万例, 170多个国家有该病发生[1]。该病不但对养殖业造成重大经济损失, 同时也严重威胁食品安全和公共卫生, 开展布氏杆菌致病机制研究, 可为该病的有效防控提供理论支撑。

sahH基因编码的S-腺苷同型半胱氨酸水解酶(S-adenosylhomocysteine hydrolase, SahH)广泛存在于细胞中, 并在新陈代谢过程中起重要作用[2-3]。对SahH在人及其他真核细胞中的研究表明, SahH可引起包括肿瘤、神经系统、心血管系统及肌肉病变等在内的多种疾病[4-6]。而SahH在细菌中的研究较少, SahH参与细菌的甲硫氨酸循环, 甲硫氨酸通过ATP活化和去甲基化后形成S-腺苷同型半胱氨酸(S-adenosylhomocysteine, SAH), SAH在SahH的催化作用下生成同型半胱氨酸(homocysteine, HCY), HCY再重新生成甲硫氨酸的过程, 称为甲硫氨酸循环[7-8]。甲硫氨酸循环在细菌的DNA合成、蛋白质翻译和甲基化等过程中发挥重要作用。

对埃氏慢生根瘤菌SahH的晶体结构研究表明, SahH由4个亚基组成, 每个亚基由底物结合位点、辅因子结合位点和羧基端二聚体组成, 并由于辅因子的结合, 通过形成开放和闭合两种构象, 影响其催化活性[9]。在影响SahH催化活性的众多因素中, NAD+作为辅因子, 参与调控包括结核杆菌、海洋热菌等在内的多种细菌的SahH催化活性[10]。研究表明, 维持细胞的SAH/SAM平衡, 对其发挥生理功能具有重要的调节作用, 而SahH的活性是维持SAH/SAM平衡的关键。因此, 通过调控布氏杆菌SahH的催化活性, 实现对其胞内SAM/SAH平衡的调控, 可为布氏杆菌病的防控提供新思路。

目前关于布氏杆菌SahH的研究较少, 仅有对其免疫原性和催化活性研究, 尚未见影响其催化活性的研究, 因此本试验在本课题组前期研究基础上, 进一步研究影响其催化活性的因素并鉴定可能的催化活性位点, 为后续开展SahH对布氏杆菌的调控作用提供参考。

1 材料与方法 1.1 菌株和质粒以及试剂

大肠杆菌DH5α和BL21(DE3)感受态细胞、质粒小提试剂盒购自北京天根生化科技有限公司; 表达布氏杆菌SahH(Bru-SahH)的表达载体pET28a-Bru-sahH由本课题组前期构建[11]。限制性内切酶、DNA Marker以及高保真酶购自大连TaKaRa公司; BCA蛋白浓度测定试剂盒购自碧云天生物技术公司。

1.2 NAD+对SahH催化活性的影响

将表达质粒pET28a-Bru-sahH转化大肠杆菌BL21, 用终浓度为1 mmol·L-1 IPTG诱导表达重组蛋白Bru-SahH, 纯化后备用[11-12]

重组蛋白Bru-SahH体外催化活性分析方法参照文献[11-12], 采用BCA蛋白浓度测定试剂盒对纯化的各梯度蛋白进行浓度测定, 并取纯化后终浓度为1 mg·mL-1 Bru-SahH重组蛋白200 μL与终浓度为1 mmol·L-1底物SAH作用, 同时添加终浓度为100 μmol·L-1外源性NAD+, 37 ℃孵育1 h。反应结束后反应液用蛋白超滤管进行离心、超滤, 去除反应液中的蛋白后, 收集滤液, 检测催化产物HCY的生成量, 同时以PBS缓冲液作为阴性对照。重复3次。

催化产物HCY的浓度检测方法参照文献[13], DTNB[5, 5′-二硫代双(2-硝基苯甲酸)]是一种Ellman ’ s试剂, 可以通过与HCY中的巯基反应, 转化成为黄色的5-巯基-2-硝基苯甲酸, 测定412 nm处吸收峰值可确定底物反应液中的HCY含量。将200 μL重组蛋白滤液与100 μL 5 mmol·L-1 Ellman ’ s试剂充分混匀, 37 ℃培养箱静置避光孵育30 min, 检测反应液的吸光值(A412), 根据HCY标准曲线测定重组蛋白SahH的催化活性(HCY的产量)。

1.3 SahH理化特性分析、磷酸化及活性位点鉴定

通过蛋白质理化特性预测网站(https://web.expasy.org/protparam/)分析SahH的理化特性。为了进行SahH的磷酸化位点检测, 将重组表达的Bru-SahH经SDS-PAGE凝胶电泳后, 切胶送至上海厚基生物科技有限公司进行磷酸化质谱分析。

分别选取流产布氏杆菌(Brucella abortus, EEP62727.1)、结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, NC_000962.3)、铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa, JQ894861.1)、类鼻疽伯克氏菌(Burkholderia pseudomallei, CAH37303.1)、大豆根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum, BAL09033.1)、黄杆菌(Flavobacteria bacterium, EAZ95386.1)和哈维弧菌(Vibrio harveyi CAIM, EMR35983.1)的SahH氨基酸序列, 运用DNAStar等软件, 对SahH可能的活性位点进行预测。

1.4 sahH突变表达质粒的构建、表达

通过点突变引物(表 1), 利用重叠引物延伸PCR(overlap PCR)对表达载体pET28a-sahH的第337位(His)、338位(Phe)和第444位(Ser)氨基酸分别进行单点突变, 对337和338位氨基酸进行双突变, 构建sahH点突变质粒(表 2)。将突变后的重组表达质粒转化BL21(DE3)菌株, IPTG诱导表达突变的SahH, 纯化后备用。

表 1 本研究所用引物 Table 1 Primers in this study
引物Primers 序列Sequence(5′→3′) 突变位点Mutant site 产物大小/bpProduct size
Fa337 CGCGGATCCATGACCGCAAGCCAAGa 337 1 010
Ra337 TTGTCGAAGGGGCCGATATTGCCGAC
Fb337 ATATCGGCCCCTTCGACAATGAAAT 388
Rb337 CCGGTCGACATACCTGTAGTGTTCCb
Fa338 CGCGGATCCATGACCGCAAGCCAAGa 338 1 013
Ra338 TTCATTGTCGTAGTGGCCGATATTGC
Fb338 TCGGCCACTACGACAATGAAATTCAG 385
Rb338 CCGGTCGACATACCTGTAGTGTTCCb
Fa337-338 CGCGGATCCATGACCGCAAGCCAAGa 337-338 1 013
Ra337-338 TTCATTGTCGTAGGGGCCGATATTGCCGAC
Fb337-338 TCGGCCCCTACGACAATGAAATTCAG 385
Rb337-338 CCGGTCGACATACCTGTAGTGTTCCb
Fa444 CGCGGATCCATGACCGCAAGCCAAGa 444 1 340
Ra444 TGTTCCTCGCAAAGTACCGTC
Fb444 GACGGTACTTTGCGAGGAACA 58
Rb444 CCGGTCGACATACCTGTAGTGTTCCb
注:下划线表示内切酶位点(a:BamHⅠ; b:SalⅠ)。The restriction sites were underlined(a:BamHⅠ; b:SalⅠ).
表 2 SahH定点突变 Table 2 Site-directed mutagenesis of SahH
突变位点Mutation site 原始氨基酸Original amino acid 突变后氨基酸Post-mutation amino acid 突变质粒Mutant plasmid
337 His(CAC) Pro(CCC) pET28a-sahH-M337
338 Phe(TTC) Tyr(TAC) pET28a-sahH-M338
337-338 His Phe(CACTTC) Pro Tyr(CCCTAC) pET28a-sahH-M337-338
444 Ser(TCC) Cys(TGC) pET28a-sahH-M444
注:His:组氨酸Histidine; Pro:脯氨酸Proline; Phe:苯丙氨酸Phenylalanine; Tyr:苏氨酸Threonine; Ser:丝氨酸Serine; Cys:半胱氨酸Cysteine.
1.5 SahH突变株的体外催化活性分析

纯化表达的4种SahH突变重组蛋白, 采用BCA法测定其浓度。将终质量浓度为4 mg·mL-1的4种SahH突变重组蛋白分别与终浓度为1 mmol·L-1 SAH混匀, 置于37 ℃培养箱静置孵育1 h, 以未突变的SahH作为催化反应的阳性对照, 以PBS缓冲液作为阴性对照, 评价SahH突变重组蛋白的体外催化活性。

2 结果与分析 2.1 NAD+抑制SahH的体外催化活性

对SahH的催化活性检测结果表明, 添加终浓度为100 μmol·L-1的NAD+后, SahH对底物的催化活性降低85.6%, 表明NAD+对SahH的催化活性具有抑制作用(表 3)。

表 3 NAD+对SahH催化活性的影响 Table 3 Effects of NAD+on the catalytic activity of SahH
底物
Substrate

Enzyme
催化生成HCY的浓度/(μmol·L-1)
Concentration of homocysteine
活性降低/%
Activity decreased
SAH SahH 100.2 0
SAH SahH+NAD+ 14.4 85.6
SAH PBS(-) 0
2.2 Bru-SahH理化特性与活性位点分析

对Bru-SahH的理化特性分析表明, 该蛋白含有466个氨基酸(相对分子质量50.79×103), 理论等电点5.30, 带负电荷残基数(天冬氨酸+谷氨酸)为61, 带正电荷残基数(精氨酸+赖氨酸)为49, 不稳定指数(instability index)为32.40, 表明该蛋白属于稳定蛋白。脂溶指数(aliphatic index)为88.13, 总平均亲水性(grand average of hydropathicity, GRAVY)为-0.148。

质谱分析结果表明, Bru-SahH的第444位丝氨酸为预测的磷酸化修饰位点(图 1)。

图 1 Bru-SahH的第444位丝氨酸为预测的磷酸化修饰位点 Fig. 1 The prediction phosphorylation site of Bru-SahH by Mass spectrum

对流产布氏杆菌、结核分枝杆菌、类鼻疽伯克氏菌、铜绿假单胞菌、黄杆菌、哈维弧菌和大豆根瘤菌的SahH氨基酸活性位点分析表明, 布氏杆菌SahH的第337和338位存在组氨酸(H)和苯丙氨酸(F)活性位点(图 2)。

图 2 Bru-SahH活性位点分析 Fig. 2 Analysis of Bru-SahH active sites Ba:流产布氏杆菌Brucella abortus; Mt:结核分枝杆菌Mycobacterium tuberculosis; Bp:类鼻疽伯克氏菌Burkholderia pseudomallei; Pa:铜绿假单胞菌Pseudomonas aeruginosa; Fb:黄杆菌Flavobacteria bacterium; Vh:哈维弧菌Vibrio harveyi; Bj:大豆根瘤菌Bradyrhizobium japonicum.
2.3 sahH突变表达载体的鉴定

测序结果表明, 成功构建布氏杆菌sahH的第337、338、444位单突变和337-338位点双突变的4种表达质粒, 分别为pET28a-sahH-M337、pET28a-sahH-M338、pET28a-sahH-M444和pET28a-sahH-M337-338(表 2, 图 3)。

图 3 sahH突变位点的反向互补序列测序结果 Fig. 3 The reverse complementary sequences of the 337th, 338th, 337-338th and 444th amino acids of the mutant strains A-D分别显示第337、338、337-338和444位氨基酸突变为GGG、GTA、GTAGGG和GCA。 A-D:The base of 337th, 338th, 337-338th and 444th amino acids had been mutated to GGG, GTA, GTAGGG and GCA by sequencing, respectively.
2.4 Bru-SahH重组突变蛋白的表达、纯化

将构建的4种sahH突变表达质粒分别转化BL21(DE3), 用T7通用引物对重组菌进行PCR鉴定, 结果表明成功获得含sahH突变质粒的BL21重组菌(图 4)。

图 4 T7引物鉴定含有sahH点突变质粒的重组菌 Fig. 4 Identification of recombinant strains contained different mutation plasmid of sahH by T7 primer M. DNA标准品DNA maker DL2000;1. BL21(pET28a-sahH-M337);2. BL21(pET28a-sahH-M338);3. BL21(pET28a-sahH-M337-338);4. BL21(pET28a-sahH-M444);5.阴性对照Negative control.

含有不同sahH突变质粒的BL21重组菌, 均可表达相对分子质量为55×103的Bru-SahH突变蛋白, 与预期结果相符。对突变的Bru-SahH蛋白进行纯化, 结果表明当咪唑浓度为100和150 mmol·L-1时, Bru-SahH蛋白的洗脱效率较高(图 5)。

图 5 点突变Bru-SahH蛋白表达与纯化的SDS-PAGE分析 Fig. 5 Expression and purification of site mutation Bru-SahH by SDS-PAGE A-D.分别显示第337、338、337-338和444位突变的Bru-SahH蛋白; M.蛋白标准品; 1.全菌蛋白; 2~3.分析分别用10和20 mmol·L-1咪唑纯化的Bru-SahH突变蛋白; 4~6.分别用100、150和200 mmol·L-1咪唑纯化的Bru-SahH突变蛋白; 7.空白对照。 A-D. Purification of mutantion Bru-SahH with site 337th, 338th, 337-338th and 444th mutation, respectively. M. Protein marker; 1. Whole bacterial protein; 2-3. Site mutation Bru-SahH purification with 10 and 20 mmol·L-1 imidazole, respectively; 4-6. Site mutation Bru-SahH purification with 100, 150 and 200 mmol·L-1 imidazole, respectively; 7. Blank control.
2.5 Bru-SahH重组突变蛋白的体外催化活性分析

对突变的Bru-SahH催化活性检测结果(表 4)表明, Bru-SahH的第337位和338位氨基酸突变后, 其催化活性降低90.8%以上; Bru-SahH的第444位丝氨酸为磷酸化位点, 对该位点突变后, 其催化活性降低85.5%。

表 4 Bru-SahH重组突变蛋白的催化活性 Table 4 Catalytic activity of mutant recombinant Bru-SahH protein
底物
Substrate

Enzyme
催化生成HCY浓度/(μmol·L-1)
Concentration of homocysteine
活性下降/%
Activity decreased
SAH SahH(+) 150.3 0
SAH SahH-M337 1.6 98.9
SAH SahH-M338 13.8 90.8
SAH SahH-M337-338 4.5 97.0
SAH SahH-M444 21.8 85.5
SAH PBS(-) 0
3 讨论

甲硫氨酸代谢对细菌具有重要的调控作用, 参与包括DNA复制与修复[14]、磷脂合成和群体感应等过程。SahH是甲硫氨酸循环过程中的关键酶[15-16], 在多种疾病(包括癌症、高胆固醇血症、寄生虫及病毒性传染病)中被作为潜在的药物靶标。如在结核病防治中, SahH被提出可作为一种具有前景的药物靶标[17-19]。在人体细胞中SahH功能障碍可引起包括肿瘤、神经系统、心血管系统及肌肉病变在内的多种疾病。在布氏杆菌中, SahH参与甲硫氨酸循环, 但对其催化活性的分子机制尚不清楚。

为了探讨影响布氏杆菌SahH催化活性的因素, 本研究开展了NAD+对SahH催化活性的影响, 结果表明NAD+对SahH的催化活性具有抑制作用。这可能是由于辅因子NAD+可通过氢键和疏水作用与SahH上特定的氨基酸残基相互作用所致。例如在人的SahH中, 由于NAD+与SahH的氨基酸残基Asn191、Val224、Ile244和Thr276形成疏水作用和相互作用, 从而影响其催化活性[20]。而与NAD+具有相互作用的氨基酸残基可用于作为抑制剂设计的靶位点, 同时NAD+的类似物也可作为SahH的抑制剂。

为了进一步分析影响SahH活性的位点, 对埃氏慢生根瘤菌的SahH晶体结构研究表明, SahH由4个亚基组成, 每个亚基由底物结合位点(substrate-binding domain)、辅因子结合位点(cofactor-binding domain)和羧基端二聚体(C-terminal dimerization domain)组成, 并具有开放和闭合2种构象, 而调节这种构象的关键是2个相连的氨基酸-组氨酸和苯丙氨酸(HF)[9]。本试验通过对布氏杆菌和其他细菌的SahH进行序列比对, 结果发现布氏杆菌SahH也存在第337位组氨酸和第338位苯丙氨酸, 通过对SahH上述2个位点的突变, 证明第337位组氨酸和第338位苯丙氨酸参与调控SahH的催化活性。突变337位和/或338位氨基酸后, 可能破坏了控制布氏杆菌SahH的开放与闭合构象的分子闸门, 无法暴露出底物结合位点与辅因子结合位点, 进而使布氏杆菌SahH无法结合底物SAH, 而使其催化活性大大降低, 具体机制仍有待进一步研究。

磷酸化是影响蛋白质活性的重要方式, 为了分析SahH可能的磷酸化位点, 本试验通过质谱分析, 预测布氏杆菌SahH的第444位丝氨酸是潜在的磷酸化修饰位点, 突变后其催化活性显著降低, 表明该位点在SahH催化活性中具有重要作用。有研究表明, 在结核分枝杆菌中, SahH通过被细菌的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶磷酸化, 实现其对酶活的调控[21]。因此, 在本试验中, 推测当布氏杆菌SahH的第444位丝氨酸突变为半胱氨酸后, 布氏杆菌SahH无法被磷酸激酶磷酸化, 进而使酶催化活性显著下降。

本试验采用测定SahH催化产物HCY的浓度评价SahH活性位点和氧化型辅酶NAD+对其催化活性的影响, 在后续的研究中, 将通过开展对布氏杆菌SahH酶活单位、催化反应速度和米氏常数等参数的研究, 进一步研究SahH催化活性及其影响因素, 为开展布氏杆菌SahH功能研究和基于SahH开展布氏杆菌防控提供新思路。

参考文献(References)
[1]
Atluri V L, Xavier M N, de Jong M F, et al. Interactions of the human pathogenic Brucella species with their hosts[J]. Annual Review of Microbiology, 2011, 65: 523-541. DOI:10.1146/annurev-micro-090110-102905
[2]
Shao H, Lamont R J, Demuth D R. Autoinducer 2 is required for biofilm growth of Aggregatibacter(Actinobacillus)actinomycetemcomitans[J]. Infection and Immunity, 2007, 75(9): 4211-4218. DOI:10.1128/IAI.00402-07
[3]
Walters M, Sircili M P, Sperandio V. AI-3 synthesis is not dependent on luxS in Escherichia coli[J]. Journal of Bacteriology, 2006, 188(16): 5668-5681. DOI:10.1128/JB.00648-06
[4]
Leal J F, Ferrer I, Blanco-Aparicio C, et al. S-adenosylhomocysteine hydrolase downregulation contributes to tumorigenesis[J]. Carcinogenesis, 2008, 29(11): 2089-2095. DOI:10.1093/carcin/bgn198
[5]
Baric I. Inherited disorders in the conversion of methionine to homocysteine[J]. Journal of Inherited Metabolic Disease, 2009, 32(4): 459-471. DOI:10.1007/s10545-009-1146-4
[6]
de Clercq E. John Montgomery's legacy:carbocyclic adenosine analogues as SAH hydrolase inhibitors with broad-spectrum antiviral activity[J]. Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, 2005, 24(10/11/12): 1395-1415.
[7]
Redanz S, Standar K, Podbielski A, et al. Heterologous expression of sahH reveals that biofilm formation is autoinducer-2-independent in Streptococcus sanguinis but is associated with an intact activated methionine cycle[J]. The Journal of Biological Chemistry, 2012, 287(43): 36111-36122. DOI:10.1074/jbc.M112.379230
[8]
Han T, Li Y, Shan Q, et al. Characterization of S-adenosylhomocysteine/methylthioadenosine nucleosidase on secretion of AI-2 and biofilm formation of Escherichia coli[J]. Microbial Pathogenesis, 2017, 108: 78-84. DOI:10.1016/j.micpath.2017.05.015
[9]
Manszewski T, Singh K, Imiolczyk B, et al. An enzyme captured in two conformational states:crystal structure of S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase from Bradyrhizobium elkanii[J]. Acta crystallographica section D:Biological Crystallography, 2015, 71: 2422-2432. DOI:10.1107/S1399004715018659
[10]
Brzezinski K, Czyrko J, Sliwiak J, et al. S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase from a hyperthermophile(Thermotoga maritima)is expressed in Escherichia coli in inactive form:Biochemical and structural studies[J]. International Journal of Biological Macromolecules, 2017, 104: 584-596. DOI:10.1016/j.ijbiomac.2017.06.065
[11]
徐达, 吴小卡, 荆雅玮, 等. 布氏杆菌半胱氨酸水解酶在甲硫氨酸循环中的催化活性研究[J]. 南京农业大学学报, 2017, 40(4): 697-702.
Xu D, Wu X K, Jing Y W, et al. Catalytic activity of Brucella abortus SahH in activated methionine cycle[J]. Journal of Nanjing Agricultural University, 2017, 40(4): 697-702 (in Chinese with English abstract). DOI:10.7685/jnau.201608021
[12]
Xu D, Zuo J, Chen Z, et al. Different activated methyl cycle pathways affect the pathogenicity of avian pathogenic Escherichia coli[J]. Veterinary Microbiology, 2017, 211: 160-168. DOI:10.1016/j.vetmic.2017.10.017
[13]
Han X, Lu C. Biological activity and identification of a peptide inhibitor of LuxS from Streptococcus suis serotype 2[J]. FEMS Microbiol Lett, 2009, 294: 16-23. DOI:10.1111/j.1574-6968.2009.01534.x
[14]
Chiang P K, Gordon R K, Tal J, et al. S-adenosylmethionine and methylation[J]. FASEB Journal:Official Publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology, 1996, 10(4): 471-480. DOI:10.1096/fasebj.10.4.8647346
[15]
Kitade Y, Kozaki A, Gotoh T, et al. Synthesis of S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase inhibitors and their biological activities[J]. Nucleic Acids Symposium Series, 1999, 42: 25-26. DOI:10.1093/nass/42.1.25
[16]
Vandenplas C, Guillerm D, Guillerm G. A new series of mechanism-based inhibitors of S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase from beef liver[J]. Nucleosides & Nucleotides, 1999, 18(4/5): 569-570.
[17]
Yamada T, Komoto J, Lou K, et al. Structure and function of eritadenine and its 3-deaza analogues:potent inhibitors of S-adenosylhomocysteine hydrolase and hypocholesterolemic agents[J]. Biochemical Pharmacology, 2007, 73(7): 981-989. DOI:10.1016/j.bcp.2006.12.014
[18]
Bujnicki J M, Prigge S T, Caridha D, et al. Structure, evolution, and inhibitor interaction of S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase from plasmodium falciparum[J]. Proteins, 2003, 52(4): 624-632. DOI:10.1002/prot.10446
[19]
Cai S, Li Q S, Fang J, et al. The rationale for targeting the NAD/NADH cofactor binding site of parasitic S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase for the design of anti-parasitic drugs[J]. Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, 2009, 28(5): 485-503.
[20]
Singh D B, Dwivedi S. Structural insight into binding mode of inhibitor with SAHH of Plasmodium and human:interaction of curcumin with anti-malarial drug targets[J]. Journal of Chemical Biology, 2016, 9(4): 107-120. DOI:10.1007/s12154-016-0155-7
[21]
Corrales R M, Leiba J, Cohen-Gonsaud M, et al. Mycobacterium tuberculosis S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase is negatively regulated by Ser/Thr phosphorylation[J]. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2013, 430(2): 858-864. DOI:10.1016/j.bbrc.2012.11.038