南京农业大学学报  2018, Vol. 41 Issue (5): 925-930   PDF    
http://dx.doi.org/10.7685/jnau.201802012
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金四华, 杨磊, 童雨翠, 范心凤, 何婷婷, 汪加发, 李永胜, 耿照玉
JIN Sihua, YANG Lei, TONG Yucui, FAN Xinfeng, HE Tingting, WANG Jiafa, LI Yongsheng, GENG Zhaoyu
肉鸭PRKAA1PRKAA2基因表达水平及其与剩余采食量性状的相关性分析
Expression levels of PRKAA1 and PRKAA2 and their correlations with residual feed intake in meat-type ducks
南京农业大学学报, 2018, 41(5): 925-930
Journal of Nanjing Agricultural University, 2018, 41(5): 925-930.
http://dx.doi.org/10.7685/jnau.201802012

文章历史

收稿日期: 2018-02-06
肉鸭PRKAA1PRKAA2基因表达水平及其与剩余采食量性状的相关性分析
金四华1 , 杨磊1 , 童雨翠1 , 范心凤1 , 何婷婷1 , 汪加发2 , 李永胜3 , 耿照玉1     
1. 安徽农业大学动物科技学院, 安徽 合肥 230036;
2. 黄山强英鸭业有限公司, 安徽 黄山 245461;
3. 黄山市畜牧兽医技术推广中心, 安徽 黄山 245000
摘要[目的]本试验旨在探讨AMP激活蛋白激酶α1和α2基因(PRKAA1PRKAA2)在高、低饲料效率组肉鸭胸大肌、腿肌和肝脏中表达水平及其与剩余采食量(RFI)性状的相关性。[方法]选取体质量相近的H系肉公鸭1 000只,测定21~42日龄时的采食量和体增重,计算RFI。挑选高、低RFI组肉鸭各8只,采用定量PCR检测PRKAA1PRKAA2在2组肉鸭胸大肌、腿肌和肝脏中表达水平。[结果]PRKAA1 mRNA在低RFI组肉鸭胸大肌中表达量极显著高于高RFI组(P < 0.01),腿肌中表达量显著高于高RFI组(P < 0.05)。低RFI组胸大肌和腿肌中PRKAA2 mRNA表达量显著高于高RFI组(P < 0.05)。相关性分析表明,肉鸭胸大肌中PRKAA1 mRNA相对表达量与日采食量、饲料转化率和RFI显著负相关(P < 0.05),腿肌中相对表达量与日采食量和RFI显著负相关(P < 0.05)。另外,胸大肌中PRKAA2 mRNA相对表达量与日采食量和RFI显著负相关(P < 0.05),腿肌中相对表达量与RFI呈显著负相关关系(P < 0.05)。[结论]PRKAA1PRKAA2基因在高、低RFI组肉鸭胸大肌和腿肌中表达量存在显著差异且与剩余采食量性状显著相关。
关键词   剩余采食量   PRKAA1   PRKAA2   相关性   
Expression levels of PRKAA1 and PRKAA2 and their correlations with residual feed intake in meat-type ducks
JIN Sihua1, YANG Lei1, TONG Yucui1, FAN Xinfeng1, HE Tingting1, WANG Jiafa2, LI Yongsheng3, GENG Zhaoyu1    
1. College of Animal Science and Technology, Anhui Agricultural University, Hefei 230036, China;
2. Huangshan Qiangying Duck Breeding Co., Ltd., Huangshan 245461, China;
3. Extension Center for Animal Husbandry and Veterinary Medicine of Huangshan City, Huangshan 245000, China
Abstract: [Objectives] The objective of this study was to examine expression levels of AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1(PRKAA1) and alpha-2(PRKAA2) mRNA in pectoralis major muscle, leg muscle and liver and their correlations with residual feed intake in meat-type ducks with high and low residual feed intake. [Methods] A total of 1 000 male H-line ducks with similar body weight were chosen to record feed intake and body weight gain from 21 to 42 day old, then calculated residual feed intake(RFI) in the interval. At 42 d, the 8 high RFI(HRFI) and 8 low RFI(LRFI) ranking ducks were selected to detect relative expressions of PRKAA1 and PRKAA2 mRNA in pectoralis major, leg muscle and liver in meat-type ducks between HRFI and LRFI group. [Results] The results showed that expression level of PRKAA1 mRNA in pectoralis major of LRFI group was significantly higher than that of HRFI group(P < 0.01), and its relative expression in leg muscle of LRFI group was significantly higher than that of HRFI group(P < 0.05). Relative expression of PRKAA2 mRNA in pectoralis major and leg muscle of LRFI group was significantly greater than that of HRFI group(P < 0.05). The correlation analysis demonstrated that relative expression of PRKAA1 mRNA in pectoralis major was significantly negatively correlated with average daily feed intake(ADFI), feed conversion ratio(FCR) and RFI(P < 0.05), and its expression level in leg muscle was negatively associated with ADFI and RFI(P < 0.05). Additionally, expression level of PRKAA2 mRNA in pectoralis major was significantly negatively correlated with ADFI and RFI(P < 0.05), and its relative expression in leg muscle was significantly negatively related to RFI(P < 0.05). [Conclusions] The results of this study indicate that the expression levels of PRKAA1 and PRKAA2 in pectoralis major and leg muscle between HRFI and LRFI group are statistically significant and their relative expressions are significantly associated with residual feed intake in meat-type ducks.
Keywords: duck    residual feed intake    AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1(PRKAA1)    AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2(PRKAA2)    correlation   

我国是世界上肉鸭生产和消费量最大的国家,肉鸭生产已成为我国畜牧业重要组成部分。现代肉鸭生产中,饲料成本大约占生产总成本的60%~70%,因此提高饲料效率、降低生产成本是提高肉鸭生产效率和养殖效益的重要手段。近年来,剩余采食量(residual feed intake,RFI)作为重要经济指标首次引入到肉鸭的育种工作中[1]。RFI是指动物实际采食量与用于维持生长的预期采食量之差,RFI反映的是由畜禽本身遗传背景决定的代谢差异[2],与畜禽的体型大小及生产性能等性状相互独立,因此RFI是衡量畜禽饲料效率的有效指标。国内外学者研究表明,影响RFI的因素主要包括机体组成、营养物质的吸收率、新陈代谢能力、免疫反应、能量代谢与利用率等[3-5],其中能量利用率是影响RFI的重要因素[6]

单磷酸腺苷激活蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,是真核生物细胞内一种重要的能量调节器[7]。AMPK是由α、β、γ 3种亚基组成的高度保守的异源三聚体蛋白激酶,α亚基含有激酶活性调控区,具有α1、α2两种异构形式,主要通过N-端Thr172的磷酸化调控AMPK的活性。PRKAA1 (AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1)基因和PRKAA2基因分别编码AMPK α1和α2亚基,在细胞中充当细胞能量感受器,负责调控细胞内AMP/ATP值,在能量平衡的调节过程中起重要作用[8]。Apoorv等[9]在小鼠中研究发现,PRKAA1PRKAA2基因参与机体的能量代谢过程。田万强[10]研究报道,PRKAA1基因多态性与肌内脂肪含量显著相关,PRKAA2基因第4外显子多态性与背膘厚、眼肌面积等生长性状显著关联。Zhong等[11]研究表明,PRKAA1PRKAA2基因可通过磷酸化调控乙酰辅酶A的活性,从而感受机体的能量变化。Jin等[12]在黄羽肉鸡中研究发现,AMPK家族基因的多态性与肉鸡的生长、采食量和饲料效率性状显著相关。因此,PRKAA1PRKAA2是影响饲料效率的重要候选基因。

目前,关于PRKAA1PRKAA2基因的表达水平与肉鸭饲料效率的相关性报道较少。因此,本试验以具有完整系谱记录的H系肉鸭为研究对象,采用荧光定量PCR法(qPCR)检测PRKAA1PRKAA2在高、低饲料效率组间肉鸭胸大肌、腿肌和肝脏中的差异表达水平及其与剩余采食量性状的相关性,为研究PRKAA1PRKAA2基因对饲料效率的调控以及选育高饲料效率肉鸭提供试验依据。

1 材料与方法 1.1 试验材料

供试材料由黄山强英鸭业有限公司提供,试验鸭具有4个世代完整的系谱记录。挑选1日龄体质量相近的H系肉公鸭混合饲养至21日龄,所有试验鸭饲养于同一栋鸭舍,统一饲养管理。试验期间自由采食和饮水,正常免疫。基础日粮参考我国《肉鸭饲养标准:NY/T 2122—2012》,饲料配方由2阶段组成。2阶段日粮营养水平见表 1

表 1 日粮营养水平(风干基础) Table 1 The nutrient levels of the basal diet(air-day basis)
%
日粮营养组成
Ingredients
1~14日龄
1-14 day old
15~42日龄
15-42 day old
代谢能Metabolizable energy 11.82 12.35
粗蛋白Crude protein 19.00 18.00
钙Calcium 0.95 0.80
总磷Total phosphorus 0.62 0.51
非植酸磷Nonphytate phosphorus 0.40 0.30
赖氨酸Lysine 1.28 1.15
蛋氨酸Methionine 0.48 0.40
胱氨酸Cystine 0.30 0.29
注:代谢能单位是MJ · kg-1。The unit of metabolizable energy is MJ · kg-1.
1.2 剩余采食量测定与样品采集

21日龄时全群称体质量,并挑选健康强健、体质量相近的1 000只肉公鸭转至单笼饲喂。试验鸭自由采食和饮水,参照黄山强英鸭业有限公司饲养管理规程和免疫程序,试验至42日龄。记录所有个体21日龄体质量(BW21)、42日龄体质量(BW42)、日采食量(ADFI)和日增重(ADG)。根据采食量和日增重,计算代谢体质量(MBW0.75)、饲料转化率(FCR)和剩余采食量(RFI)。RFI=ADFI-(a0+a1 × MBW0.75+a2 × ADG),其中a0为截距,a1、a2为回归系数。RFI的计算由SAS 9.4线性拟合函数完成。

根据所有个体RFI的排序并综合考虑FCR等性状,筛选出高、低RFI个体各8只,断颈屠宰后采集胸大肌、腿肌和肝脏,将采集的组织样放入1.5 mL装有RNA Later(Ambion,美国)的冻存管中,4 ℃过夜后迅速置于-80 ℃冰箱中保存备用。

1.3 总RNA提取与cDNA第1链合成

采用OMEGA试剂盒(R6834,美国)提取胸大肌、腿肌和肝脏中的总RNA。利用NanoDrop 2000分光光度计(ThermoFisher Scientific,美国)测定总RNA浓度、A230A260A280,用10 g · L-1琼脂糖凝胶电泳检测RNA样品完整性。

以总RNA为模板,按照EasyScript First-Strand cDNA Synthesis Super Mix(TransGen Biotech,北京)合成cDNA第1链。反应体系:总RNA 1.0 μg,Oligo(dT)181.0 μL,2×ES Reaction Mix 10.0 μL,EasyScript RT/RI Enzyme Mix 1.0 μL,加ddH2O至20.0 μL。摇匀后42 ℃孵育15 min;85 ℃5 s,温度降至4 ℃,终止反应,产物置于-20 ℃保存备用。

1.4 引物设计、反转录质量检测及目的基因标准品制备

根据GenBank中PRKAA1PRKAA2β-actin的mRNA序列,按照荧光定量PCR(qPCR)跨内含子引物设计原则,采用在线Primer 3.0软件设计引物,采用NCBI Primer-BLAST进行引物特异性检测。引物序列由上海生工生物科技有限公司合成(表 2)。

表 2 荧光定量PCR(qPCR)中PRKAA1PRKAA2β-actin引物对序列 Table 2 Primer pairs sequences of PRKAA1, PRKAA2 and β-actin for quantitative PCR(qPCR)
基因
Gene
序列号
GenBank sequence
引物对序列(5′→3′)
Primer pairs sequence
产物长度/bp
Products size
退火温度/℃
Annealing temperature
PRKAA1 XM_013105491.1 GAGTGCCATTCTTGGTAGC/CGACACACTTCAGCCATGAT 157 60
PRKAA2 XM_005020808.3 TCGGGAGGTCTGTGAGAAAT/AGGTAGAACTCGCTGGCTTG 147 60
β-actin NM_001310421.1 TTACCAACACCCACACCCTT/TGCTGCTGATACCTTCACCA 13 960

PCR扩增程序:95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,34个循环;72 ℃ 5 min。PCR反应体系:cDNA模板1.5 μL,上、下游引物(10 μmol · L-1)各1.0 μL,PCR Master Mix 12.5 μL,加ddH2O至总体积25.0 μL。PCR反应产物经20 g · L-1琼脂糖凝胶电泳检测,分析内参基因和目的基因反转录质量;采用DNA纯化回收试剂盒切胶回收目的片段,将其用pGM-T载体连接后转化大肠杆菌Top10感受态细胞,挑取转化子接种于含有氨苄青霉素的LB培养基中,连接过夜后,挑选阳性转化子进行测序。用质粒提取试剂盒提取序列比对正确的阳性克隆质粒pGM-T-PRKAA1和pGM-T-PRKAA2,采用NanoDrop 2000分光光度计测其浓度后作为标准品备用。

1.5 荧光定量PCR检测

采用SYBR Green Ⅰ嵌合荧光检测法制作标准曲线。将每个待测样品反转录产物等体积混合,用cDNA混合样优化qPCR反应的退火温度、引物浓度和模板浓度等条件, 最终确定的qPCR引物浓度为0.25 μmol · L-1,退火温度为60 ℃,模板10倍稀释。将构建的标准品质粒进行101、102、103、104、105和106系列稀释,以其作为标准品进行qPCR反应,每个样品3个重复,并设置阴性对照,按照CT及标准品浓度分别对目的基因和内参基因制作标准曲线。利用ABI PRISM 7500荧光定量仪(Applied Biosystem,美国)进行qPCR反应。qPCR反应程序:95 ℃预变性5 min;95 ℃ 10 s,60 ℃ 10 s,共40个循环;95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,95 ℃ 30 s,60 ℃ 15 s。qPCR反应体系(15.0 μL):2 × SYBR Green PCR Mater Mix 7.5 μL, cDNA 1.0 μL, 上、下游引物(10 μmol · L-1)各0.25 μL,RNase-free ddH2O 6.0 μL。每个试验样品3个重复,每组用RNase-free ddH2O代替模板作阴性对照。

1.6 统计分析

所有数据经过Excel 2010预处理,根据目的基因和内参基因的CT值,采用2-ΔΔCT法计算目的基因的相对表达量[13]。采用SAS 9.4软件(SAS Institute Inc.,Cary,NC)中t检验分析基因差异表达规律。用Bivariate Correlation程序分析目的基因表达量与剩余采食量性状的相关性。试验数据以x±SE表示。

2 结果与分析 2.1 总RNA及反转录质量检测

图 1-A可见:提取的总RNA经琼脂糖凝胶电泳检测,分为清晰的18 S和28 S条带,表明提取的总RNA完整性较好。经NanoDrop 2000检测,所有样品A260/A280值为1.8~2.0,A260/A230值大于2.0,表明总RNA纯度较好。以β-actin为内参基因,通过琼脂糖凝胶检测能够看到清晰的139 bp目的条带,表明反转录生成的cDNA完整性好(图 1-B)。

图 1 总RNA(A)和β-actin的PCR产物(B)的电泳检测 Figure 1 The agarose electrophoresis of total RNA(A)and PCR products of β-actin(B) M. DNA标准品DNA marker;1-5.总RNA Total RNA;6-10. β-actin.
2.2 目的片段标准品的制备

图 2可知:目的基因PCR扩增产物条带特异性好,片段大小与预计片段长度157 bp和147 bp相符。PCR鉴定的阳性转化子送公司进行测序,测序结果与GenBank数据库中的PRKAA1PRKAA2序列进行比对,同源性为100%,表明目的片段标准品构建成功,可以满足后续定量PCR试验的需要。

图 2 PRKAA1 (A)和PRKAA2 (B)基因PCR产物的电泳图 Figure 2 PCR products of the PRKAA1 (A)and PRKAA2 (B)gene by agarose electrophoresis M. DNA标准品DNA marker;1-5. PRKAA1基因的PCR产物PCR products of PRKAA1;6-10. PRKAA2基因PCR产物PCR products of PRKAA 2.
2.3 高、低RFI组肉鸭RFI性状的比较

根据RFI排序,选择高、低RFI个体各8只,2组个体日采食量、日增重、代谢体质量、饲料转化率和剩余采食量的描述性统计分析见表 3。结果表明,高RFI组肉鸭日采食量、饲料转化率和剩余采食量极显著高于低RFI组(P < 0.01),日增重显著低于低RFI组(P < 0.05)。

表 3 高、低剩余采食量(RFI)组肉鸭RFI性状的比较 Table 3 Comparison of residual feed intake(RFI)and relevant traits between HRFI and LRFI group in meat-type ducks
性状Trait 高RFI组HRFI group 低RFI组LRFI group
日采食量/(g·d-1) Average daily feed intake(ADFI) 290.67±16.19A 263.91±13.61B
日增重/(g·d-1) Average daily gain(ADG) 128.76±7.25b 139.84±7.28a
代谢体质量/g Metabolic body weight(MBW0.75) 352.69±16.92 351.71±15.75
饲料转化率Feed conversion ratio(FCR) 2.26±0.03A 1.88±0.02B
剩余采食量/(g·d-1) Residual feed intake 21.64±1.18A -19.66±2.12B
注:同一行不同小写和大写字母分别表示差异显著(P < 0.05)和差异极显著(P < 0.01)。
Note:Different lowercase and uppercase letters in the same line indicate significant differences at 0.05 and 0.01 levels,respectively.
2.4 高、低RFI组肉鸭PRKAA1PRKAA2在胸大肌、腿肌和肝脏中表达差异比较

图 3-A可知:PRKAA1 mRNA在高、低RFI组肉鸭胸大肌、腿肌和肝脏中均有表达,在低RFI组肉鸭胸大肌中表达量极显著高于高RFI组(P < 0.01),在腿肌中表达量显著高于高RFI组(P < 0.05)。高、低RFI组肝脏中PRKAA1 mRNA表达水平差异不显著。由图 3-B可见:PRKAA2 mRNA在高、低RFI组胸大肌、腿肌和肝脏中均有表达,低RFI组肉鸭胸大肌和腿肌中相对表达量显著高于高RFI组(P < 0.05),肝脏中两组PRKAA2 mRNA表达量无显著差异。

图 3 高、低RFI组肉鸭胸大肌、腿肌和肝脏中PRKAA1 (A)与PRKAA2 (B)mRNA的差异表达 Figure 3 Differential expression of PRKAA1 (A)and PRKAA2 (B)mRNA in the pectoralis major muscle, leg muscle and liver in meat-type ducks between HRFI and LRFI group ** *表示差异显著(P < 0.05)和差异极显著(P < 0.01)。下同。 *, * * indicate significant differences at 0.05 and 0.01 levels. The same as follows.
2.5 PRKAA1PRKAA2 mRNA表达量与肉鸭RFI性状的相关性分析

表 4可知:PRKAA1 mRNA在胸大肌中表达量与日采食量、饲料转化率和RFI均呈显著负相关(P < 0.05),腿肌中表达量与日采食量和RFI显著负相关(P < 0.05)。PRKAA2 mRNA在胸大肌中表达量与日采食量和RFI显著负相关(P < 0.05),腿肌中表达量与RFI呈显著负相关关系(P < 0.05)。

表 4 PRKAA1PRKAA2 mRNA表达量与肉鸭RFI性状的相关性分析 Table 4 The correlation analysis between expression levels of PRKAA1 and PRKAA2 mRNA in pectoralis major muscle and leg muscle and residual feed intake in meat-type ducks
基因
Gene
组织
Tissue
日采食量
ADFI
日增重
ADG
代谢体质量
MBW0.75
饲料转化率
FCR
剩余采食量
RFI
PRKAA1 胸大肌Pectoralis major muscle -0.52* 0.15 -0.21 -0.41* -0.45*
腿肌Leg muscle -0.41* 0.22 -0.17 -0.53 -0.47*
PRKAA2 胸大肌Pectoralis major muscle -0.44* 0.24 -0.06 -0.57 -0.55*
腿肌Leg muscle -0.26 0.49 0.35 -0.47 -0.62*
3 讨论

饲料效率性状是现代肉鸭育种中重要经济性状,剩余采食量(RFI)作为衡量饲料效率的重要指标被引入到肉鸭育种中。RFI是一个负向选择性状,RFI值越小,则动物饲料利用率越高。RFI的遗传力值为0.25~0.45,是一个中等遗传力性状,因而可以通过遗传选育方法对RFI进行改良[14-15]。近年来,随着测序技术和全基因组关联分析策略的快速发展,国内外学者对影响RFI的基因及其信号通路进行分析,发现调控能量代谢的基因是影响饲料效率的重要候选基因[16-17]

AMPK是机体内能量代谢的重要参与者,其活性主要受细胞内能量状态(AMP/ATP)的调控[7],在机体能量平衡过程中起重要作用。PRKAA1PRKAA2属于AMPK家族的重要成员,其含有AMP和ATP结合位点,并可通过磷酸化过程调控AMPK活性,进而影响细胞的能量平衡[18]。早期研究表明,PRKAA1PRKAA2基因敲除的小鼠通过抑制胰岛素分泌进而调控机体的能量代谢[19]PRKAA2基因单倍型与人的2型糖尿病显著相关[20]。Kelly等[21]在肉牛中研究表明,PRKAA1基因与剩余采食量性状有关,是影响饲料效率的重要候选基因。

目前,关于PRKAA1PRKAA2的研究主要集中在人类疾病、模式生物及大家畜中,在肉鸭中报道较为少见。本试验结果表明,PRKAA1基因在低RFI组(高饲料效率)胸大肌中表达量极显著高于高RFI组,低RFI组腿肌中表达量显著高于高RFI组;PRKAA2基因在低RFI组胸大肌和腿肌中表达量显著高于高RFI组。因PRKAA1PRKAA2基因含有AMP和ATP结合位点,低RFI组PRKAA1PRKAA2基因表达量显著上调,可引起AMP/ATP值上升,进一步激活AMPK活性,使机体能够快速感受细胞的能量变化状态,提高能量利用效率,从而提高饲料利用率[22-23]。Dyck等[24]研究报道,PRKAA2基因可通过磷酸化转录因子来调控机体的能量变化,从而保持机体能量平衡。Young等[25]对猪RFI研究表明,猪饲料利用率与能量代谢密切相关,饲料效率高的猪能量利用率也高。相关性分析表明,胸大肌PRKAA1基因表达量与日采食量、FCR和RFI显著负相关,腿肌中表达量与日采食量和RFI显著负相关;胸大肌RPKAA2基因表达量与日采食量和RFI显著负相关,这与Bottje等[6]研究结果一致。此外,Kelly等[21]研究也表明,ADP控制的氧化磷酸化基因在低RFI组肉牛中表达量显著高于高RFI组。因此,提高能量利用率,减少能量消耗,能够提高肉鸭饲料效率。

参考文献(References)
[1] 侯水生. 2016年水禽产业现状、技术研究进展及展望[J]. 中国畜牧杂志, 2017, 53(6): 143-147.
Hou S S. Current situation, technical progress and prospect of waterfowl industry in 2016[J]. Chinese Journal of Animal Science, 2017, 53(6): 143-147. (in Chinese with English abstract)
[2] Aggrey S E, Karnuah A B, Sebastian B, et al. Genetic properties of feed efficiency parameters in meat-type chickens[J]. Genet Sel Evol, 2010, 42: 25. DOI: 10.1186/1297-9686-42-25
[3] Aggrey S E, Lee J, Karnuah A B, et al. Transcriptomic analysis of genes in the nitrogen recycling pathway of meat-type chickens divergently selected for feed efficiency[J]. Anim Genet, 2014, 45(2): 215-222. DOI: 10.1111/age.2014.45.issue-2
[4] Yi G, Yuan J, Bi H, et al. In-depth duodenal transcriptome survey in chickens with divergent feed efficiency using RNA-Seq[J]. PLoS One, 2015, 10(9): e0136765. DOI: 10.1371/journal.pone.0136765
[5] Lee J, Karnuah A B, Rekaya R, et al. Transcriptomic analysis to elucidate the molecular mechanisms that underlie feed efficiency in meat-type chickens[J]. Mol Genet Genomics, 2015, 290(5): 1673-1682. DOI: 10.1007/s00438-015-1025-7
[6] Bottje W, Kong B W. Cell biology symposium:feed efficiency:mitochondrial function to global gene expression[J]. J Anim Sci, 2013, 91(4): 1582-1593. DOI: 10.2527/jas.2012-5787
[7] Hardie D G, Schaffer B E, Brunet A. AMPK:an energy-sensing pathway with multiple inputs and outputs[J]. Trends Cell Biol, 2016, 26(3): 190-201. DOI: 10.1016/j.tcb.2015.10.013
[8] Dranchak P K, Ekenstedt K J, Valberg S J, et al. Chromosomal assignments for the equine AMPK family genes[J]. Anim Genet, 2006, 37(3): 293-294. DOI: 10.1111/age.2006.37.issue-3
[9] Apoorv T S, Karthik C, Babu P P. AMP-activated protein kinase(AMPK)is decreased in the mouse brain during experimental cerebral malaria[J]. Neurosci Lett, 2018, 662: 290-294. DOI: 10.1016/j.neulet.2017.10.054
[10] 田万强.牛AMPK家族7个基因SNP检测及其与生长和肉质性状的关联分析[D].杨凌: 西北农林科技大学, 2013: 50-59.
Tian W Q. Single nucleotide polymorphism of 7 genes of AMPK family and associations with growth and meat quality traits in cattle[D]. Yangling: Northwest A & F University, 2013: 50-59(in Chinese with English abstract). http://cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-10712-1013347290.htm
[11] Zhong W, Xie Y, Abdallah M, et al. Cellular stress causes reversible, PRKAA1/2-, and proteasome-dependent ID2 protein loss in trophoblast stem cells[J]. Reproduction, 2010, 140(6): 921-930. DOI: 10.1530/REP-10-0268
[12] Jin S, Moujahid M E, Duan Z, et al. Association of AMPK subunit gene polymorphisms with growth, feed intake, and feed efficiency in meat-type chickens[J]. Poult Sci, 2016, 95(7): 1492-1497. DOI: 10.3382/ps/pew081
[13] Livak K J, Schmittgen T D. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2-ΔΔCT method[J]. Methods, 2001, 25(4): 402-408. DOI: 10.1006/meth.2001.1262
[14] Zhang Y, Guo Z B, Xie M, et al. Genetic parameters for residual feed intake in a random population of Pekin duck[J]. Asian-Australas J Anim Sci, 2017, 30(2): 167-170.
[15] Yuan J, Dou T, Ma M, et al. Genetic parameters of feed efficiency traits in laying period of chickens[J]. Poult Sci, 2015, 94(7): 1470-1475. DOI: 10.3382/ps/pev122
[16] Bottje W G, Lassiter K, Piekarski-Welsher A, et al. Proteogenomics reveals enriched ribosome assembly and protein translation in pectoralis major of high feed efficiency pedigree broiler males[J]. Front Physiol, 2017, 8: 306. DOI: 10.3389/fphys.2017.00306
[17] Jing L, Hou Y, Wu H, et al. Transcriptome analysis of mRNA and miRNA in skeletal muscle indicates an important network for differential residual feed intake in pigs[J]. Sci Rep, 2015, 5: 11953. DOI: 10.1038/srep11953
[18] Hardie D G. Sensing of energy and nutrients by AMP-activated protein kinase[J]. Am J Clin Nutr, 2011, 93(Suppl): 891-896.
[19] Sun G, Tarasov A I, McGinty J, et al. Ablation of AMP-activated protein kinase alpha1 and alpha2 from mouse pancreatic beta cells and RIP2.Cre neurons suppresses insulin release in vivo[J]. Diabetologia, 2010, 53(5): 924-936. DOI: 10.1007/s00125-010-1692-1
[20] Sun M W, Lee J Y, de Bakker P I, et al. Haplotype structures and large-scale association testing of the 5'-AMP-activated protein kinase genes PRKAA2, PRKAB1, and PRKAB2 with type 2 diabetes[J]. Diabetes, 2006, 55(3): 849-855. DOI: 10.2337/diabetes.55.03.06.db05-1418
[21] Kelly A K, Waters S M, McGee M, et al. mRNA expression of genes regulating oxidative phosphorylation in the muscle of beef cattle divergently ranked on residual feed intake[J]. Physiol Genomics, 2011, 43(1): 12-23. DOI: 10.1152/physiolgenomics.00213.2009
[22] Hardie D G. AMP-activated/SNF1 protein kinases:conserved guardians of cellular energy[J]. Nat Rev Mol Cell Biol, 2007, 8(10): 774-785. DOI: 10.1038/nrm2249
[23] Canto C, Auwerx J. PGC-1alpha, SIRT1 and AMPK, an energy sensing network that controls energy expenditure[J]. Curr Opin Lipidol, 2009, 20(2): 98-105. DOI: 10.1097/MOL.0b013e328328d0a4
[24] Dyck J R, Kudo N, Barr A J, et al. Phosphorylation control of cardiac acetyl-CoA carboxylase by cAMP-dependent protein kinase and 5'-AMP activated protein kinase[J]. Eur J Biochem, 1999, 262(1): 184-190. DOI: 10.1046/j.1432-1327.1999.00371.x
[25] Young J M, Dekkers J C M. The genetic and biological basis of residual feed intake as a measure of feed efficiency[M]. Wageningen: Wageningen Academic Publishers, 2012: 153-166.