反应分子动力学（ReaxFF MD） 模拟结果分析工具VARxMD

反应分子动力学（ReaxFF MD）是一种很有潜力 研究较大体系（>1000 个原子）复杂化学反应的方法。 国际上现有的ReaxFF MD 模拟结果分析工具无法让 用户了解所模拟的过程中发生的化学反应细节，对于 规模小或简单的反应体系进行人工分析还可以接受， 但对于原子规模达到~1000 至~10000 的大体系模拟， 反应分析功能的缺乏，将使研究者对反应机理的分析 陷入困境。

中国科学院过程工程研究所刘健等研发的反应分子动力学分析与可视 化工具VARxMD（Visualization and Analysis of ReaxFF Molecular Dy⁃ namics），是国际上第1 个实现对ReaxFF MD 模拟轨迹进行化学反应自动 分析的工具。VARxMD 是基于Qt/VTK 和其他第三方库研发的跨平台图形 用户界面程序，借助化学信息学的化学结构处理方法，对ReaxFF MD 模拟 结果轨迹中的原子、物种、成断键的分析，并结合数据可视化和分子片段结 构可视化，实现对ReaxFF MD 模拟结果的深度分析，可获得模拟过程中完 整的化学反应信息。VARxMD 已应用于煤热解和聚乙烯等复杂分子体系热 解的化学反应机理探索，且VARxMD 具有通用性，有望被应用于更多的体 系。

miR432*调控柯萨奇病毒A16 型 在人横纹肌肉瘤细胞中的复制

中国疾病预防控制中心杨倬和中国科学院微生 物研究所田波通过构建miRNAs 靶基因筛选系统，在 双荧光素酶报告体系的pMIR 载体插入病毒基因，研 究了miRNAs 对柯萨奇病毒A16 型（Coxsackievirus A16，CA16）在宿主细胞内复制的影响。该项研究结 果首次报导miR432*在CA16 病毒复制过程中的调控 作用。通过研究发现CA16 病毒5′-UTR 基因可能是 miRNAs 的作用靶标。

研究结果表明，细胞内miR432*可以调控CA16 在宿主细胞中的复制过程。 miR432*可以促进病毒在RD 细 胞中的复制和表达，反之， miR432*inhibitor 有抑制病毒复 制的作用。研究CA16 病毒与宿 主miRNAs 的相互作用机制为进 一步阐明CA16 病毒感染与复制 机理奠定了基础。

玉米中OsAPO1同源序列克隆 及其与产量相关性状的关系

OsAPO1 是水 稻中一个控制花序 结构的基因，它具有 多种功能，既能提高 抗倒伏能力又能影 响作物的产量。

华中农业大学 生命科学技术学院 宋辉等研究了在玉米中克隆了OsAPO1 的同源序列ZmAPO1- 6 和ZmAPO1- 9。蛋白多序列比对发现，2 个玉米序列 和OsAPO1 相似性均超过了83%而且都 含有F-box 结构域。组织特异性表达分 析表明，ZmAPO1 主要在孕穗期的雌穗 中表达。利用近200 个自交系与S 型细 胞质雄性不育系测交构建了关联分析群 体，在2 个环境下对这2 个基因进行了关 联分析。在ZmAPO1-6 和ZmAPO1-9 上分别检测到14 和8 个与产量相关性状 显著关联的位点，其中前者检测到的显 著位点主要与株高和茎粗有关，而后者 检测到的位点主要与百粒重有关。初步 的研究结果推测，OsAPO1 在玉米中的2 个同源基因可能与产量和产量相关性状 有关，该同源基因的克隆和初步分析可 为进一步功能研究提供参考。

自组装法制备中空二氧化硅 纳米粒子减反射薄膜

浙江工业大学化学工程与材料学院 孙志娟等以正硅酸乙酯（TEOS）为壳层 材料，聚丙烯酸（PAA）为核材料，以传统 的Stober 水解法为基础制备得到结构规 整的中空二氧化硅纳米粒子，并采用自 组装法制备单层减反射薄膜和宽波段双 层减反射薄膜。

研究人员主要研究 中空二氧化硅纳米粒子 的结构调控方法；自组装 次数和中空二氧化硅纳 米粒子分散液的pH 值 对减反射薄膜透光率的 影响规律，以及具有渐变 折射率的双层减反射薄膜的制备。研究 结果表明：通过调节PAA 和TEOS 的用量 可精确调控中空二氧化硅纳米粒子的粒 径和空腔体积分率，进而可精确调控减反 射薄膜的厚度和折射率；通过酸洗工艺，将 自组装次数由10次减少为2次，简化了涂 膜工艺条件，在最佳工艺条件下所制备的 单层减反射薄膜在350~800 nm 波长范 围内可显著提高玻璃的透光率，在最佳波 长（λ=520 nm）处将玻璃的透光率由 91.6%提高至98.1%；双层减反射薄膜可 在更宽的波段范围内提高基材的透光率。

云杉体细胞胚的干化处理 可促进萌发

中国林业科学研究院林业研究所张 建伟等针对云杉体细胞胚萌发率极低和 萌发质量不高的问题，以高同步化体细 胞胚为材料，对干化方式、干化时间和干 化普遍性等影响干化处理的因素进行探 讨，并建立基于形态和颜色识别的云杉 体细胞胚的干化标记。

结果表明：采用“滤纸容器法”的干化 方式更适用于云杉体细胞胚的干化处理； 干化处理2 周后能够获得最高的萌发率； 本试验提供的干化处理 方案对萌发促进作用具 有普遍的适用性；以健壮 的绿色子叶、胚轴及红色 胚根为标记的体细胞胚 能够普遍获得高的萌发 率和较好的萌发质量。

（编辑 祝叶华）