2. 安徽医科大学第一附属医院检验科, 合肥 230002;
3. 安徽中医药大学第一附属医院检验科, 合肥 230006;
4. 安徽医科大学第四附属医院检验科, 合肥 230036;
5. 安徽中医药大学第二附属医院检验科, 合肥 230033;
6. 复旦大学附属华山医院抗生素研究所, 上海 200040
2. Department of Laboratory Medicine, The First Affiliated Hospital of Anhui Medical University, Hefei 230002, Anhui, China;
3. Department of Laboratory Medicine, The First Affiliated Hospital of Anhui University of Chinese Medicine, Hefei 230006, Anhui, China;
4. Department of Laboratory Medicine, The Fourth Affiliated Hospital of Anhui Medical University, Hefei 230036, Anhui, China;
5. Department of Laboratory Medicine, The Second Affiliated Hospital of Anhui University of Chinese Medicine, Hefei 230033, Anhui, China;
6. Institute of Antibiotics, Huashan Hospital, Fudan University, Shanghai 200040, China
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)毒力强、传播快、耐药谱广,已成为全球性的医疗难题[1]。葡萄球菌属的细菌对甲氧西林耐药最主要的机制是获得外源性mecA基因,该基因位于携带mec基因簇的葡萄球菌盒式染色体(staphylococcal chromosome cassette mec,SCCmec)遗传元件上,是导致MRSA播散流行的重要因素[2]。了解本地区MRSA临床分离菌株的SCCmec分型,对于预防并控制MRSA的播散流行具有重要意义。本研究对收集自安徽省合肥地区5家教学医院临床分离的MRSA菌株进行了药物敏感性分析和SCCmec分型,现报告如下。
1 材料和方法 1.1 菌株来源收集2016年1月1日至2021年12月31日安徽省合肥市5所教学医院临床分离的MRSA,随机选取264株(剔除来自同一患者的重复菌株),其中166株来自合肥市第一人民医院,42株来自安徽医科大学第四附属医院,40株来自安徽医科大学第一附属医院,10株来自安徽中医药大学第二附属医院,6株来自安徽中医药大学第一附属医院。随机收集同期临床分离自住院患者的甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(methicillin-sensitive Staphylococcus aureus,MSSA)52株(剔除来自同一患者的重复菌株),其中32株来自合肥市第一人民医院,8株来自安徽中医药大学第二附属医院,6株来自安徽医科大学第一附属医院,4株来自安徽中医药大学第一附属医院,2株来自安徽医科大学第四附属医院。药敏试验质控菌株为金黄色葡萄球菌ATCC25923和金黄色葡萄球菌ATCC43300,由安徽医科大学第一附属医院检验科提供。
1.2 主要试剂与仪器检测mecA基因和SCCmec分型所用的PCR引物参考文献[3-5]进行设计,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。2 000 bp DNA分子量标准和Premix混合物购自宝生物工程(大连)有限公司。
T100TM Thermal Cycler PCR仪(美国Bio-Rad公司),BG-Power 600琼脂糖凝胶电泳仪(上海贝晶生物技术有限公司),Universal Hood Ⅱ琼脂糖凝胶成像仪(美国Bio-Rad公司),VITEK-2 Compact细菌鉴定和药敏测试仪(法国BIOMERIEUX公司)。
1.3 药敏试验应用革兰氏阳性菌鉴定板卡GP和革兰氏阳性菌药敏卡GP67分别进行细菌鉴定和药敏试验。采用自动化仪器方法测定金黄色葡萄球菌对抗菌药物的敏感性,利用头孢西丁纸片扩散法筛选MRSA菌株,判断标准参考2020年版美国临床和实验室标准化协会(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)M100-S30文件标准[6]。
1.4 mecA基因检测及细菌DNA制备挑取血平板培养基上生长了16~18 h的单菌落,放入加有0.5 mL Tris-EDTA缓冲液的微量离心管中,100 ℃煮沸10 min,12 000×g离心5 min,取上清保存备用。按文献[3]描述,用PCR法检测MRSA菌株中的mecA基因,引物序列见表 1,反应体系25 µL:Premix混合物12.5 µL,模板1 µL,正、反向引物各1 µL,加ddH2O补足至25 µL。
1.5 SCCmec分型
利用多重PCR对所有MRSA菌株进行SCCmec分型,反应体系50 µL:Premix混合物25 μL,模板2 μL,正、反向引物各1 μL,加ddH2O补足至50 µL。反应条件:94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共35个循环;72 ℃继续延伸10 min。PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳后在紫外凝胶成像仪下成像。SCCmec分型所用引物序列见表 1。
1.6 统计学处理应用WHONET 5.6软件进行药物敏感性统计分析。计数资料以株数和百分数表示,两组间比较采用χ2检验。检验水准(α)为0.05。
2 结果 2.1 金黄色葡萄球菌药敏结果264株菌株经头孢西丁筛选和mecA基因PCR检测后确认均为MRSA菌株,未发现特殊基因型和特殊表型菌株。MRSA和MSSA对抗菌药物的敏感性对比结果见表 2,MRSA和MSSA对达托霉素、替加环素、利奈唑胺和万古霉素的敏感率均为100.0%;MRSA对红霉素、克林霉素、四环素、莫西沙星和庆大霉素的耐药率高于MSSA,差异均有统计学意义(P均<0.05);MRSA和MSSA对环丙沙星、左氧氟沙星、复方磺胺甲
2.2 SCCmec分型
分型结果显示,SCCmec Ⅱ型和Ⅳa型为最主要的流行株,分别占59.1%(156/264)和34.8%(92/264),Ⅲ型菌株占1.5%(4/264),未分型菌株占4.5%(12/264)。
2.3 不同SCCmec分型菌株的药敏结果SCCmecⅡ型和Ⅳa型MRSA菌株药敏结果见表 3,SCCmec Ⅱ型和Ⅳa型菌株对达托霉素、替加环素、利奈唑胺和万古霉素的敏感率均为100.0%;Ⅱ型对环丙沙星、左氧氟沙星、莫西沙星和庆大霉素的耐药率分别为28.2%(44/156)、21.8%(34/156)、21.2%(33/156)和12.8%(20/156),高于Ⅳa型的17.4%(16/92)、9.8%(9/92)、7.6%(7/92)和8.7%(8/92),差异均有统计学意义(P均<0.05)。SCCmec Ⅱ型和Ⅳa型对红霉素、克林霉素、四环素、复方磺胺甲
2.4 不同SCCmec分型菌株的来源分布特征
从送检标本类型看,SCCmec Ⅱ型MRSA菌株来源排名前3的分别是痰57.1%(89/156)、分泌物28.2%(44/156)和脓肿14.7%(23/156),Ⅳa型排名前3的分别是痰67.4%(62/92)、分泌物30.4%(28/92)和血液6.5%(6/92)。送检科室中,SCCmec Ⅱ型和Ⅳa型送检科室标本量排名前3依次为骨科34.7%(86/248)、神经内科33.1%(82/248)和脑外科32.3%(80/248)。
3 讨论欧洲的一项耐药菌感染所致死亡的调查发现,在感染所致死亡率排名中,MRSA所致的死亡率高居第2位[7]。虽然2019年CHINET中国细菌耐药监测网数据显示,金黄色葡萄球菌在所有分离菌中分离率仅占9.34%,但其是革兰氏阳性菌中分离率第一的细菌,在革兰氏阳性菌中的分离率为32.2%[8]。因此,对于金黄色葡萄球菌尤其是MRSA感染的预防、治疗和监测是一项长期任务。
MRSA耐药是由于mecA基因编码的青霉素结合蛋白2a对β-内酰胺类抗菌药物亲和力较低,使得大部分该类抗菌药物无法作用于MRSA。本研究收集的264株MRSA的药敏分析结果显示,除β-内酰胺类抗菌药物外,MRSA对红霉素、克林霉素、四环素的耐药率分别为75.4%、49.2%、37.9%,对环丙沙星、左氧氟沙星、莫西沙星、庆大霉素、复方磺胺甲
编码金黄色葡萄球菌对甲氧西林耐药的mec基因位于可移动遗传元件SCCmec上,具有以下特点:一是可以运载mec基因在不同菌株之间进行传播;二是可以整合许多耐药基因至金黄色葡萄球菌的基因盒上,使MRSA菌株呈多重耐药。因此,SCCmec分型与流行病学密切相关,且很多文献报道同一型别的MRSA菌株耐药表型在不同地区之间差别较大[10-11],这也是区别社区获得性感染和医院感染的一个重要指标。文献指出医院获得性MRSA常常携带SCCmec Ⅰ、Ⅱ或Ⅲ型,社区获得性MRSA感染携带的是SCCmec Ⅳ或Ⅴ型基因[12]。本研究收集的合肥地区264株MRSA的SCCmec分型结果和国内其他地区报道的分型不完全相同[13]。
主要型别SCCmec Ⅱ和Ⅳa型的药敏分析结果显示,达托霉素、替加环素、利奈唑胺和万古霉素在不同型别中的敏感率均为100.0%,SCCmec Ⅱ和Ⅳa型对红霉素、克林霉素、四环素、复方磺胺甲
随着时间的推移,合肥地区MRSA的SCCmec分型已发生明显变化。本研究中,合肥地区MRSA的SCCmec分型主要以Ⅱ型和Ⅳa型为主,而既往文献报道MRSA的SCCmec分型以Ⅱ型和Ⅲ型为主[15]。
从药敏分析来看,本研究中MRSA对红霉素、克林霉素、四环素、左氧氟沙星、庆大霉素和利福平的耐药率均低于文献报道[15],原因可能是随着新型抗菌药物如达托霉素、替加环素、万古霉素和利奈唑胺的研发上市,原有的抗菌药物使用率下降,使得这些抗菌药物的敏感性提高;另一个原因可能与国家规范抗菌药物使用有关。
金黄色葡萄球菌可侵犯人体多种器官和组织,引起化脓性感染,尤其易在人类皮肤软组织中引起化脓性感染。从本研究送检标本科室分布看,送检排名第一的是骨科,多来自术后切口的化脓性感染。
综上所述,不同地区甚至同一地区不同时期MRSA的SCCmec分型和药物敏感性均存在差异,因此动态监测MRSA的SCCmec分型和药敏结果对了解、监控这类菌株的流行病学特征有一定的临床意义。
[1] |
LAKHUNDI S, ZHANG K. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: molecular characterization, evolution, and epidemiology[J]. Clin Microbiol Rev, 2018, 31(4): e00020-18. DOI:10.1128/CMR.00020-18 |
[2] |
CHALMERS S J, WYLAM M E. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus infection and treatment options[J]. Methods Mol Biol, 2020, 2069: 229-251. DOI:10.1007/978-1-4939-9849-4_16 |
[3] |
赵焕强, 邹玉涵, 金姝, 等. tst和pvl基因阳性金黄色葡萄球菌流行情况及分子特征[J]. 中国感染与化疗杂志, 2016, 16(3): 353-358. DOI:10.16718/j.1009-7708.2016.03.018 |
[4] |
纪风兵, 邹自英, 胡章勇, 等. 成都地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌SCCmec基因分型的研究[J]. 四川医学, 2016, 37(4): 364-368. DOI:10.16252/j.cnki.issn1004-0501-2016.04.002 |
[5] |
CAVALCANTE F S, SAINTIVE S, CARVALHO FERREIRA D, et al. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus from infected skin lesions present several virulence genes and are associated with the CC30 in Brazilian children with atopic dermatitis[J]. Virulence, 2021, 12(1): 260-269. DOI:10.1080/21505594.2020 |
[6] |
Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing[S]. M100-S30. Wayne, PA: CLSI, 2020.
|
[7] |
CASSINI A, HÖGBERG L D, PLACHOURAS D, et al. Attributable deaths and disability-adjusted life-years caused by infections with antibiotic-resistant bacteria in the EU and the European Economic Area in 2015: a population-level modelling analysis[J]. Lancet Infect Dis, 2019, 19: 56-66. DOI:10.1016/S1473-3099(18)30605-4 |
[8] |
胡付品, 郭燕, 朱德妹, 等. 2019年CHINET三级医院细菌耐药监测[J]. 中国感染与化疗杂志, 2020, 20(3): 233-243. DOI:10.16718/j.1009-7708.2020.03.001 |
[9] |
邹玉涵, 刘庆中, 张骥, 等. 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药性分析及SCCmec分型[J]. 国际检验医学杂志, 2018, 39(2): 159-162. DOI:10.3969/j.issn.1673-4130.2018.02.010 |
[10] |
胡庆花, 朱德全, 刘卫东, 等. 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药性及SCCmec基因分型研究[J]. 中国现代医学杂志, 2020, 30(2): 34-38. DOI:10.3969/j.issn.1005-8982.2020.02.006 |
[11] |
ALFOUZAN W, UDO E E, MODHAFFER A, et al. Molecular characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in a tertiary care hospital in Kuwait[J]. Sci Rep, 2019, 9(1): 18527. DOI:10.1038/s41598-019-54794-8 |
[12] |
林娅, 叶永志, 屠雷钧, 等. 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌SCCmec基因分型及耐药性分析[J]. 中国现代应用药学, 2021, 38(2): 184-188. DOI:10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2021.02.010 |
[13] |
叶千红, 吴许文, 李沛樟, 等. 澳门特别行政区医院耐甲氧西林金黄色葡萄球菌SCCmec基因分型及相关基因检测[J]. 中华医院感染学杂志, 2021, 31(22): 3366-3370. |
[14] |
LI X, HUANG T, XU K, et al. Molecular characteristics and virulence gene profiles of Staphylococcus aureus isolates in Hainan, China[J]. BMC Infect Dis, 2019, 19(1): 873. DOI:10.1186/s12879-019-4547-5 |
[15] |
纪冰, 马筱玲, 蔡朝阳, 等. 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌SCCmec基因分型与耐药性分析[J]. 临床检验杂志, 2007, 25(3): 204-206. DOI:10.3969/j.issn.1001-764X.2007.03.017 |