第二军医大学  2014, Vol. 35 Issue (6): 616-620   PDF    
转化生长因子β调控miR-200b-200a-429启动子活性
韩敬明, 白久旭, 张晓玲, 崔汉民, 李旭, 曹宁    
沈阳军区总医院血液净化科, 沈阳 110015
摘要目的 探讨转化生长因子β(TGF-β)对miR-200b-200a-429簇表达的影响,对其调控机制作初步研究。 方法 使用RT-PCR方法检测TGF-β对人肾小管上皮细胞HK-2 miR-200a、miR-200b和miR-429表达的影响。PCR方法扩增出miR-200b-200a-429簇启动子序列,构建miR-200b-200a-429启动子荧光素酶报告基因表达载体,转染至HK-2细胞,检测其荧光素酶活性。观察TGF-β对miR-200b-200a-429转录的表达调控。 结果 实时定量PCR检测结果显示TGF-β作用细胞24 h后下调了miR-200a、miR-200b和miR-429的表达。成功构建miR-200b-200a-429启动子荧光素酶表达载体,测序正确,然后利用双荧光素酶报告基因系统证实构建的报告基因载体启动子具有活性,发现TGF-β可以抑制miR-200b-200a-429启动子活性(P<0.05)。 结论 TGF-β可以调控miR-200b-200a-429启动子的活性。
关键词miR-200b-200a-429     转化生长因子β     转录调控     启动子    
Transforming growth factor-β regulates activity of miR-200b-200a-429 promoter
HAN Jing-ming, BAI Jiu-xu, ZHANG Xiao-ling, CUI Han-min, LI Xu, CAO Ning    
Department of Blood Purification, General Hospital of Shenyang Military Area Command, Shenyang 110015, Liaoning, China
Abstract: Objective To investigate the regulatory effect of transforming growth factor-β (TGF-β) on miR-200b-200a-429 expression and the related mechanism. Methods RT-PCR was used to examine the expression of miR-200a, miR-200b and miR-429 in HK-2 cells treated with TGF-β. The miR-200b-200a-429 promoter was amplified by PCR and was cloned into pGL3 basic vector, which was then transfected into HK-2 cells and the luciferase activity of miR-200b-200a-429 gene promoter was detected by luminometer. Results Results of RT-PCR showed that TGF-β down-regulated miR-200a, miR-200b and miR-429 in HK-2 cells 24 h after TGF-β treatment. Vector of pGL3- miR-200b-200a-429-promoter was constructed successfully and was confirmed by sequencing. Dual-Luciferase reporter gene system was used to verify the promoter activity of the constructed reporter gene vector. TGF-β was found to significantly inhibit the activities of miR-200b-200a-429 promoter in HK-2 cells (P<0.05). Conclusion TGF-β may regulate the activity of miR-200b-200a-429 promoter.
Key words: miR-200b-200a-429     transforming growth factor beta     transcriptional regulation     promoter    

肾小管上皮细胞失去自身的细胞特性而获得肌成纤维细胞的特性,属于上皮-间质细胞转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)。EMT在肾脏纤维化的发生和发展中起重要作用,抑制或逆转EMT的发生和发展,已成为控制肾脏纤维化的重要途径之一[1]。转化生长因子β(TGF-β)通过结合上皮细胞表面的受体,经过Notch、β-catenin等信号途径活化EMT相关转录因子,导致EMT的发生[2,3]。研究发现多种miRNA参与EMT的调控,可能在EMT的发展进程中发挥重要作用[4]。证据表明miR-200家族通过下调ZEB基因调控EMT,随着对miRNA参与细胞表型转化中研究的不断深入,逐渐发现miR-200家族在EMT过程中起着关键性的作用[5,6]。研究报道TGF-β诱导人角质化细胞EMT过程中一些miRNA表达谱发生变化,提示TGF-β可能通过调控miRNA表达参与EMT[7]。但是目前关于TGF-β调节的miR-200家族表达机制研究鲜有报道。本研究通过在基因转录水平探讨TGF-β和miR-200家族的关系,为miR-200家族转录调控机制研究奠定初步理论基础。
1 材料和方法 1.1 材料及仪器

TRIzol(Invitrogen公司),miScript Reverse Transcription Kit(Qiagen公司),SYBR® Premix Ex TaqTM Ⅱ、 T4 DNA连接酶、高保真酶PRIME STAR、限制性内切酶XhoⅠ、NcoⅠ、NheⅠ和HindⅢ(TaKaRa公司),E.coli DH5α(本实验室保存),柱式DNA胶回收试剂盒、柱式小量质粒DNA纯化试剂盒(Axygen公司),基因组DNA提取试剂盒(Omega公司),pGL3-Basic载体、Dual-Luciferase Reporter1000 Assay System (Promega公司),脂质体Lipofectamine 2000(Invitrogen公司),人胚胎肾(human embryonic kidney,HEK)293细胞系、人肾小管上皮细胞(HK-2,本实验室保存),胎牛血清(FBS,杭州四季青生物工程材料有限公司),DMEM培养基、RPMI 1640培养基(Gibco公司),TGF-β(R&D公司)。Synergy 2 多功能酶标仪(Biotek公司)。 1.2 基因组DNA的提取 按照基因组DNA提取试剂盒说明书的具体步骤提取HK-2细胞基因组DNA。 1.3 引物设计和PCR扩增miR-200b-200a-429基因

依据文献[16]报道设计miR-200b-200a-429启动子及截短体的引物,由上海生工生物工程技术服务有限公司合成,见表 1

表 1 产生合成记录所用参数 Table 1 Parameters used to synthesize the seismic record

扩增1 600 bp左右片段引物为:上游-1 574/+120F,下游-1 574/+120R;扩增片段400 bp:上游-321/+120F,下游-1 574/+120R;扩增片段300 bp:上游-321/+120F,下游-158/+19R;扩增片段200 bp:上游-158/+19F,下游-158/+19R;扩增片段100 bp:上游-110/+19F,下游-158/+19R。其酶切位点分别为NheⅠ、BglⅡ。以从HK-2细胞提取的基因组DNA为模板,PCR进行扩增miR-200b-200a-429启动子及其截短体。反应条件:95℃ 5 min;95℃ 30 s,58℃ 30 s,72℃ 90 s,共25个循环;72℃10 min。1%琼脂糖凝胶电泳检测并回收纯化PCR产物。 1.4 miR-200b-200a-429启动子报告基因载体的构建

将纯化后的PCR产物经NheⅠ、HindⅢ双酶切,回收酶切产物,利用T4 DNA连接酶将回收产物与双酶切后的pGL3-Basic载体连接,转化至E.coli DH5α扩增,提取质粒后双酶切鉴定,将鉴定正确的质粒送上海生工生物工程技术服务有限公司进行DNA测序。 1.5 检测报告基因荧光素酶表达活性

将HK-2和HEK293细胞分别接种到48孔板,培养24 h后待细胞生长至融合度大于80%时进行转染。将重组的荧光素酶报告基因载体pGL3-miR-200-promoter、pGL3-Basic、内参质粒pRL-TK共转染HK-2细胞,每种载体平行做3复孔,报告基因载体每孔100 ng,pRL-TK每孔5 ng,具体步骤见Lipofectamine 2000说明书。24 h后加入工作液浓度为5 ng/mL TGF-β的培养液刺激,以正常培养液培养的细胞作为对照。转染48 h后裂解细胞并收取细胞裂解液,利用 Dual-Luciferasev Reporter 1000 Assay System检测荧光素酶活性值。 1.6 TGF-β刺激HK-2细胞

将用RPMI 1640(10% FBS)培养液培养的HK-2细胞,传代到T25细胞培养瓶中,细胞融合率达到70%时,取指数生长期的细胞弃去培养液,加入工作液浓度为5 ng/mL TGF-β的培养液,以正常培养液培养的细胞作为对照,放入37℃、5% CO2 细胞培养箱中培养24 h后提取细胞总RNA。 1.7 实时定量PCR

按照Qiagen公司的试剂盒说明书步骤提取细胞总RNA并进行miRNA的反转录。配制PCR反应液后上荧光实时定量PCR仪(ABI 7500)进行反应。PCR条件:95℃10 s;95℃ 5 s,60℃ 34 s,45个循环。PCR反应体系:SYBRR Premix Ex TaqTMⅡ(2×)10 μL、miRNA Primer(10 μmol/L)0.4 μL、Universal adaptor PCR Primer 0.4 μL、DNA模板1 μL、ROX Reference Dye Ⅱ(50×)0.4 μL、dH2O(灭菌蒸馏水) 8.8 μL,共计20 μL。

实时定量PCR中所用的引物序列hsa-miR-200a primer引物5′-TAA CAC TGT CTG GTA ACG ATG T-3′;has-miR-200b primer引物5′-TAA TAC TGC CTG GTA ATG ATG A-3′;hsa-miR-429 primer引物5′-TAA TAC TGT CTG GTA AAA CCG T-3′;内参U6 forword 5′-CTC GCT TCG GCA GCA CA-3′,reverse 5′-AAC GCT TCA CGA ATT TGC GT-3′。 1.8 TFSEARCH软件分析miR-200b-200a-429启动子-110/19区域序列

登录http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html,在线输入miR-200b-200a-429启动子-110/19区域序列,分析启动子-110/19区域序列的转录因子结合位点。 1.9 统计学处理

使用SPSS 15.0统计学软件分析数据。采用t检验或方差分析进行组间比较,检验水准(α)为0.05。 2 结 果 2.1 TGF-β对HK-2细胞miR-200a、miR-200b和miR-429表达的影响

TGF-β(5 ng/mL)刺激HK-2细胞,24 h后收集细胞总RNA,用实时定量PCR检测miR-200a、miR-200b和miR-429表达。结果显示TGF-β作用细胞24 h后下调miR-200a、miR-200b和miR-429的表达,与对照组相比分别下调了51%、62%和42%。 2.2 miR-200b-200a-429启动子报告基因表达载体的构建和鉴定

根据miR-200b-200a-429启动子序列设计截短体引物,利用PCR扩增出1 600、400、300、200、100 bp左右的目的片段(图1)。其中pGL3 -321/+19为2个条带,对2个条带分别测序鉴定,测序结果显示上面条带为目的片段,将测序正确的PCR产物克隆到质粒载体。 2.3 miR-200b-200a-429启动子报告基因荧光素酶活性的检测

将构建好的pGL3-1 574/+120、截短报告基因载体、pGL3-basic(阴性对照)与内参质粒pRL-TK共转染至HEK293和HK-2细胞,48 h后利用双荧光素酶报告系统检测启动子活性,结果显示miR-200b-200a-429启动子载体在HK-2细胞中能够检测出荧光素酶活性,在HEK293细胞中几乎不能检测出荧光素酶活性,两者间差异有统计学意义(P<0.05)。pGL3-1 574/+120载体逐渐截短后,检测显示荧光素酶活性也依次递减(图 2)。

图 1 miR-200b-200a-429启动子及截短体PCR Figure 1 Agarose gel electrophoresis of miR-200b-200a-429 promoter and PCR products of truncated product 1,3: DL2000; 2: pGL3 -1 574/+120; 4: pGL3 -321/+120; 5: pGL3 -321/+19; 6: pGL3 -158/+19; 7: pGL3 -110/+19
2.4 TGF- β对miR-200b-200a-429启动子活性的影响及启动子序列分析

pGL3 -1 574/+120、截短报告基因载体、pGL3-basic(阴性对照)与内参质粒pRL-TK共转染至HK-2细胞,24 h后加入TGF-β(5 ng/mL),刺激24 h后检测启动子荧光素酶活性,结果显示TGF-β能够抑制启动子和各截短体的报告基因活性(P<0.05,图 3)。提示miR-200b-200a-429 启动子区域的-110/+19区间有可能存在被TGF-β调控的作用元件。

图 2 miR-200b-200a-429启动子报告基因及截短体在HK-2和HEK 293细胞中的活性 Figure 2 Luciferase activity of miR-200b-200a-429 promoter reporter gene and truncated product in HK-2 and HEK 293 cells *P<0.05 vs HK-2 cells. n=3,x±s

图 3 TGF-β抑制HK-2细胞miR-200b-200a-429启动子报告基因及截短体的活性 Figure 3 TGF-β inhibited activity of miR-200b-200a-429 promoter reporter gene and truncated product in HK-2 cells *P<0.05 vs negative control. n=3,x±s

TFSEARCH软件分析miR-200b-200a-429启动子-110/+19区域序列,发现该启动子区域存在Smad、c-Myc、c-Myb、Sp1等重要转录因子的结合位点。 3 讨 论

miRNA是内源性小分子非编码单链RNA,它通过与靶mRNA 3′末端非编码区 (3′untranslational region,3′-UTR)序列特异性的互补配对发挥抑制或降解靶mRNA的作用。研究表明miRNAs参与细胞的增殖和凋亡、胚胎发育、组织器官的形成和多种疾病的发生等生理病理活动重要过程[8]。同时研究发现miRNAs参与人类的疾病发生,探讨miRNAs与疾病之间的关系成为当前研究的热点[9]。miRNAs在EMT的进程中起到重要的作用,通过刺激诱导处于上皮向间充质转化的细胞和间充质细胞能够下调miR-200的表达,miR-200丢失与E-钙黏连蛋白下调相关[10]。miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-141和miR-429是miR-200家族成员,miR-200a、miR-200b和miR-429位于人类基因组1号染色体,miR-200c和miR-141位于人类基因组的12号染色体[11]。TGF-β在EMT过程中可以下调miR-200家族和miR-205的表达[12]。我们构建了miR-200b-200a-429的启动子报告基因载体和截短体。结果显示miR-200b-200a-429启动子报告基因载体及其截短体在HK-2细胞中活性明显的升高,说明这一片段具有启动子的活性。而在HEK293细胞中不能检测出miR-200b-200a-429启动子的活性,可能由于HK-2细胞为上皮细胞,miR-200家族在上皮细胞内高表达,而HEK293细胞属于间充质细胞,miR- 200家族在间充质细胞表达水平低[13]。我们推测在上皮细胞中miR-200启动子区域存在特异表达表达的调控元件。我们发现TGF-β能有抑制miR-200b-200a-429启动子和其截短体的活性,提示启动子-110/+19区间可能存在被TGF-β调控的作用元件。

Smad家族是TGF-β信号转导通路中关键的下游因子,在TGF-β诱导EMT过程中发挥了重要作用[6]。研究发现miR-200家族与Smad家族相互作用参与EMT的调控,Smad能够将 TGF-β的信号从胞膜受体转导入胞核内,通过调节核内靶基因转录发挥TGF-β的生物学效应[14]。研究发现通过TGF-β可以使Smad3与miR-200b-200a-429启动子区结合位点结合,活化Smad蛋白,参与调控miR-200家族,最后调控E-钙黏连蛋白的转录抑制因子Zeb1和Zeb2表达[15]。Smad7分子也参与miR-200家族的调节,其在NRK-52E细胞中过表达能够阻断TGF-β引起的miR-200家族的下调[6]。因此,TGF-β可能是依赖细胞内的Smad信号途径引起miR-200家族下调。

多种细胞和分子参与了肾脏纤维化过程,各种因素相互作用,机制十分复杂。肾小管上皮细胞EMT及其分子机制的研究为病理-临床联系提供了新的线索。本研究发现在肾小管上皮细胞中,TGF-β能够增强miR-200b-200a-429启动子活性,TGF-β可能通过调控miR-200b-200a-429启动子的活性而调节miR-200家族的表达。本研究为miR-200家族转录调控机制的研究奠定了基础。 4 利益冲突

所有作者声明本文不涉及任何利益冲突。

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