第二军医大学  2014, Vol. 35 Issue (11): 1209-1214   PDF    
肝豆状核变性中ATP7B基因复合突变的研究
徐彬1 , 余元勋1, 鲍远程2, 王迎新1, 李建平1, 刘萍1, 黄迅威1, 朱霖1    
1. 安徽医学高等专科学校, 安徽省遗传医学中心分子室, 合肥 230061;
2. 安徽中医学院第一附院神经内科, 合肥 230031
摘要目的 通过对肝豆状核变性(Wilson's disease,WD)患者 ATP7B基因测序,探讨其突变率及与WD的关系,分析WD中ATP7B基因复合突变的意义。方法 提取67例临床确诊的WD患者口腔黏膜细胞的基因组DNA,应用PCR技术对ATP7B全部外显子 5' 端→ 3' 端扩增,运用DNA直接测序法检测突变。结果 在67例患者中,发现WD中ATP7B基因突变患者52例,检出率为77.61%,其中16例纯合子突变(12例Arg778Leu纯合子突变和4例Arg919Gly纯合子突变),5例复合突变,31例单纯杂合子突变。5种ATP7B基因复合突变国内罕见报道。结论 本研究发现5种ATP7B基因的复合突变,这些复合突变可能与WD的发生发展相关,值得进一步深入研究。
关键词肝豆状核变性     外显子     突变     聚合酶链反应    
Complex mutations of ATP7B gene in Wilson's disease
XU Bin1 , YU Yuan-xun1, BAO Yuan-cheng2, WANG Ying-xin1, LI Jian-ping1, LIU Ping1, HUANG Xun-wei1, ZHU Lin1    
1. Department of Molecule, Medical Genetics Center of Anhui Province, Anhui Medical College, Hefei 230061, Anhui, China;
2. Department of Neurology, the First Affiliated Hospital of Anhui Traditional Chinese Medicine, Hefei 230031, Anhui, China
Abstract: Objective To sequence the ATP7B gene in patients with Wilson's disease (WD) and to analyze the relationship between the mutations and WD. Methods The genomic DNA was obtained from the oral mucosal cells of 67 clinically diagnosed WD patients; PCR was used to amplify all the exons 5' end→ 3' end of ATP7B gene. And the PCR products were subjected to DNA direct sequencing for mutations. Results We found that the ATP7B gene mutation rate was 77.61%(52/67) in WD patients. Of these patients,16 had homozygote mutations (including 12 patients with Arg778Leu and 4 with Arg919Gly), 5 had complex mutations, and 31 had simple hetrozygote mutations. Five types of the ATP7B gene complex mutations were rarely reported in China. Conclusion We have identified 5 complex mutations of ATP7B gene, which might be related to the development and progression of WD and deserves further study.
Key words: Wilson's disease     exons     mutation     polymerase chain reaction    

肝豆状核变性(Wilson’s disease,WD)是常染色体隐性遗传的铜代谢障碍疾病,患病率为1/50 000~1/30 000[1,2,3],好发于儿童、青少年。WD患者由于ATP7B基因发生功能丧失性突变,使铜沉积于肝、脑等处,导致多脏器损害,临床表现多样,以肝、神经系统的损害为主,有不同程度的锥体外系病变、精神障碍、角膜 K-F 环等。1993 年 Bull等克隆了ATP7B 基因,该基因定位于13q14.3,基因全长为78 821 bp,mRNA 长8.5 kb,含21个外显子和20个内含子;编码的ATP7B蛋白含1 465个氨基酸残基,相对分子质量159 000,为 P 型铜离子转运ATP 酶[4,5,6,7]ATP7B突变可导致细胞内铜离子转运、排出功能丧失,迄今已发现 651 种突变,突变形式有错义/无义突变 (占63% )、小片段缺失(占17%)、小片段插入(占8%)、剪接突变(占9%)、大片段缺失(占2%)、同义突变(占2%)[3]等;以往国内鲜有报道复合突变(指有2个或2个以上突变点)。本研究对WD患者ATP7B基因全部外显子5′ 端 → 3′ 端进行测序,发现了一些ATP7B基因错义、插入突变及复合突变,现报告如下。 1 资料和方法 1.1 研究对象

67例中国汉族WD患者均为2009年5月至2013年1月在安徽中医药大学第一附属医院接受治疗的患者,诊断标准参照中华医学会WD诊断指南[8]及美国Roberts 和 Michael 编写的AASLD的WD诊断及治疗指南[9];其中男46例,女21例,年龄6~56岁,平均(21.7±2.6)岁。其中 34例为先证者患者,其余的 33例患者来自于 12 个患者家庭。选取安徽中医药大学第一附属医院中国汉族健康输血员20例,设为正常对照组,其中男14例,女6例,年龄21~32 岁,平均(27.7±2.8岁)。本研究经医院伦理委员会批准,所采集样本对象均有临床数据调查表并签署知情同意书。 1.2 基因组 DNA 抽提

取67例WD患者和20例正常人口腔黏膜细胞,制备细胞悬液,4℃保存。在1.5 mL离心管中,加入200 μL口腔黏膜细胞悬液,再加裂解缓冲液STE 410 μL,10%SDS 90 μL,蛋白酶K液(100 μg/mL)5 μL,65℃消化15 h。加入300 μL饱和NaCl液轻摇3 min。加氯仿340 μL,混匀后高速离心,将上清液吸入另一离心管中,加异丙醇650 μL混匀后高速离心。弃上清液,加500 μL 75%乙醇,高速离心2次,弃上清得DNA 沉淀,室温干燥1.5 min,加30 μL蒸馏水溶解,4℃保存。取3 μL基因组DNA溶液经1.5%琼脂糖凝胶电泳检查质量,为一条带,达电泳纯;基因组DNA溶液经紫外分光光度计检测,D260/D280为1.8,纯度合格;基因组DNA溶液浓度为1 μg/μL。 1.3 PCR引物的设计

PCR引物设计参考美国国立生物技术信息中心(NCBI)的ATP7B基因序列信息,用 Premier 5 软件设计21对外显子+5′ 端和+3′端的PCR扩增引物,由上海生工生物工程技术服务有限公司合成,引物信息见表 1

表 1 ATP7B 基因外显子 PCR 扩增引物及序列 Tab 1 Primers for PCR amplification of ATP7B gene exons
1.4 PCR反应体系和扩增条件

PCR反应总体积 10 μL,含Taq 酶1 U,2 μmol/L 上、 下游引物各 1 μL,基因组DNA液1 μL,10 × buffer 1 μL,50 mmol/L MgCl2 0.3 μL,10 mmol/L dNTPs 0.2 μL,水补齐至10 μL。外显子短片段扩增条件: 95℃预变性5 min,PCR扩增 40个循环 (95℃ 15 s、60℃ 20 s、72℃ 30 s),72℃下延伸15 min,4℃保存。外显子(2、11、12、18、19、21)长片段扩增条件:95℃预变性5 min,PCR扩增 40个循环 (95℃ 15 s、60℃ 20 s、72℃ 2 min),72℃下延伸15 min,4℃ 保存。 1.5 PCR产物测序

PCR反应产物经Qiaquick Spin柱纯化后,由广州华大生物科技有限公司检验中心使用ABI3730型测序仪进行荧光全自动DNA正向测序及反向测序,用SeqMan、BioEdit分析软件分析ATP7B 基因全部外显子5′端 →3′端的突变,对初步发现的突变中有疑问者,均经PCR克隆测序后再确认;分析测序图时,注意使用核苷酸荧光扫描峰较高且噪声线几乎贴近底线的图分析,以免噪声干扰;且测序引物一般距离要分析的外显子若干bp。 1.6 突变分析

扩增67例WD患者和20例正常人ATP7B基因的所有外显子5′ 端 → 3′端,并将其DNA的测序结果与由GenBank中获得的正常人ATP7B基因相应序列进行比对,分析突变情况。 2 结 果

本次研究通过对 67 例WD患者的 ATP7B 基因的全部外显子5′端 → 3′端进行直接扩增测序,发现16例纯合子突变(12例Arg778Leu纯合子突变和4例Arg919Gly纯合子突变),5例复合突变,31例单纯杂合子突变,15例未检出突变,突变总检出率为77.61%(52/67)。5种国内罕见的ATP7B基因复合突变的具体信息见表 2,相应的测序图见图 1。通过PubMed数据库中文献检索,以及在肝豆状核变性突变网站 (http://www.wilsondisease.med.ualberta.Ca/database.asp)和人类突变数据库(http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/validate.phP)进行查询,发现这5种ATP7B基因复合突变在中国汉族人群中罕见报道。正常对照组中未发现ATP7B 基因突变。

表 2 肝豆状核变性患者ATP7B基因的新复合突变 Tab 2 New complex mutations of ATP7B gene in Wilson’disease patients

图 1 5种ATP7B 基因复合突变测序图 Fig 1 Sequences of 5 complex mutations of ATP7B gene A: Patient 7,exon 2,16,and 21 mutation; B: Patient 15,exon 13,20 mutation; C:Patient 26,exon 1,1,and 12 mutation; D:Patient 43,exon 12,16 mutation; E: Patient 51,exon 1,1,2,3,3,and 10 mutation
3 讨 论

铜是维持人正常生理活动必需的微量元素,参与机体氧化还原反应、细胞呼吸、活性氧防御、细胞代谢、生存或凋亡等,常参与形成铜蛋白、铜酶。肠道吸收的Cu2+进入肝门静脉,在血中90%与铜蓝蛋白结合,其余的与白蛋白、组氨酸等结合成三元复合体。细胞摄取 Cu2+ 时主要通过铜蓝蛋白、白蛋白及 组氨酸释放 Cu2+,经细胞表面的还原酶还原为Cu+,通过转运载体摄入细胞,再由还原型谷胱甘肽运输到不同细胞器,细胞内的Cu+ 能通过铜转运蛋白转运给铜蛋白,合成超氧化物歧化酶(SOD)、金属硫蛋白(MT)等;多余的 Cu+主要由ATP7B排出细胞。

一般肝细胞内的ATP7B主要定位于核周高尔基体外侧网络,当细胞质Cu+ 水平升高后,ATP7B移至细胞质,Cu+ 能结合、活化ATP7B,促进后者ATP 结合区结合 ATP、释放能量,使天冬氨酸激酶磷酸化区(P 区)磷酸化[10,11],再将Cu+ 转运至细胞膜,或者形成铜蓝蛋白排入血,或者把Cu+ 排入毛细胆管经肠道排出,从而避免过多Cu+ 积聚于细胞内。细胞质Cu+ 水平过高时,肝细胞也能经溶酶体小泡排出Cu+ [10]

ATP7B分子有7个功能区,有的可发生突变:(1) N端区,有6个Cu+ 结合区(与1~6外显子相关),第1~4 Cu+ 结合区突变时,如已报道的 G85A、G591D等突变,患者可出现症状;(2) TGES 磷酸酶区(与11外显子相关),能使磷酸化的ATP7B第1 027位天冬酰胺去磷酸化,其突变后能使ATP7B过度磷酸化,丧失催化活性,停留在细胞膜,不能转运Cu+,如 G591D;(3) CPC 阳离子跨膜转运区(与7~10/12~13外显子相关)突变,会导致ATP7B一直停留在核周高尔基体、内质网,不能排出Cu+,如Arg778Leu、Gly937Ser等突变;(4) DKTGT天冬氨酸激酶磷酸化区(P区,与14~16外显子相关),ATP7B活化时,DKTGT基序中的D1027(天冬酰胺)磷酸化,使ATP7B能转移位置,如果该天冬酰胺突变,则阻断ATP7B形成ATP7B-酰基磷酸盐,使 ATP不能供应能量,ATP7B不能转移位置,也不能转运Cu+;(5) GDGV ATP结合区(N 区,与17~18 外显子相关),该区H1069等突变,ATP7B不能结合ATP,因而不能被 γ-磷酸化,不能形成ATP7B-酰基磷酸盐,不能转运Cu+,该区目前已发现至少40多种突变;(6) C端磷酸化作用区(DVP,与19~20 外显子相关);(7) C末端区(ACTGT区,与21外显子相关),参与调节ATP7B功能[10,11]

本研究发现WD患者ATP7B基因复合突变的形式有一定异质性,7号患者有exon 2、16、21复合突变,第2外显子突变出现在第2 Cu+ 结合区,使ATP7B不能结合Cu+、排出Cu+ 减少;第16外显子突变出现在天冬氨酸激酶磷酸化区,使该区不能磷酸化,不能到细胞质结合Cu+,不能排Cu+;第21外显子突变在C 末端区,使ATP7B功能不正常,不能排Cu+,导致Cu+ 转运停滞,引起疾病发生。15号患者有exon 13、20复合突变,第13外显子突变出现在CPC 阳离子膜转运区,使ATP7B一直停留在核周高尔基体外侧网络、内质网,不能到细胞膜排出Cu+,第20外显子突变出现在磷酸化作用区,使ATP7B不能完全磷酸化,不能到细胞质结合Cu+,不能排出Cu+。26号患者有 exon 1、12复合突变,第1外显子突变出现在第1 Cu+ 结合区,使ATP7B不能结合Cu+、不能活化,ATP7B由高尔基体转移到细胞质的速度减慢,排出Cu+ 减少;第12外显子突变出现在CPC 阳离子膜转运区,使ATP7B一直停留在核周高尔基体外周网络、内质网,不能到细胞膜排出Cu+。43号患者有exon 12、16复合突变,第12外显子突变,不能排出Cu+;第16外显子突变出现在DKTGT 天冬氨酸激酶磷酸化区,阻断ATP7B形成ATP7B-酰基磷酸盐,ATP不能供应能量,ATP7B不能移位转运Cu+。51号患者有exon 1、2、3、10复合突变,第1、2、3外显子突变出现在第1、2、3 Cu+ 结合区1~3,使ATP7B不能结合Cu+、不能活化,排出Cu+ 减少;第10外显子突变出现在CPC 铜离子跨膜转运区,使ATP7B一直停留在核周高尔基体外周网络、内质网,不能到细胞膜排出Cu+[12,13]

本研究检测的67例WD患者中,ATP7B基因突变率为77.61%,还发现了5种国内罕见的复合突变,显示ATP7B基因突变有较大的异质性。对WD患者ATP7B基因的复合突变,目前还有待进一步深入研究。Maier-Dobersberger等[14]ATP7B基因突变位点研究后认为,复合突变比单一突变者发病常更早。WD为一种常染色体隐性遗传性疾病,因此只有2个突变为直接导致疾病发生的,其余的一般均可视为单核苷酸多态性(SNPs)。SNPs可能在WD发生发展中起着一定的作用。从1995年到目前对WD中ATP7B基因突变的研究中,欧美患者的单突变类型主要是HIS1069Gln(28%)、Gly1266Lys(10%),其他突变各见于3%以下患者。许多国外资料显示,肝豆状核变性基因14号外显子第1 069位密码子突变是一个典型的热点突变,染色体突变频率高达28%~68.3%[15]。国内学者对中国WD患者基因突变研究后发现8号外显子Arg778Leu突变频率为11.4 %~60%[16],此突变公认为中国WD患者ATP7B基因第一突变热点,陆续报道的突变分布在外显子5、7、8、11、12,13、14、18,而对第二突变热点目前存在一定的争议性[17]。2013年复旦大学附属儿科医院报道,53例WD患者ATP7B基因突变频率91.5%,纯合子突变8例,复合杂合突变36例,杂合突变9例;复合杂合突变即有2个或2个以上突变点,因此在ATP7B全基因检测时,要仔细找出全部突变点[18]。复合突变一般分别来自父亲、母亲,2013年Coffey等[19] 也有同样报道,发现复合突变,提示可引发ATP7B多处功能损伤并与患者症状较重可能相关,值得重视,我们也将进一步研究。

4 利益冲突

所有作者声明本文不涉及任何利益冲突。

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