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  波谱学杂志   2018, Vol. 35 Issue (2): 170-177.  DOI: 10.11938/cjmr20172594
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崔妍, 肖亮. 磁共振成像谱仪B0信号的高精度发生与测试[J]. 波谱学杂志, 2018, 35(2): 170-177. DOI: 10.11938/cjmr20172594.
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CUI Yan, XIAO Liang. High Accuracy Generation and Test of B0 Signals on Magnetic Resonance Imaging Spectrometer[J]. Chinese Journal of Magnetic Resonance, 2018, 35(2): 170-177. DOI: 10.11938/cjmr20172594.
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肖亮, Tel:010-64434931, E-mail:xiaoliang@mail.buct.edu.cn

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收稿日期:2017-09-06
在线发表日期:2017-11-28
磁共振成像谱仪B0信号的高精度发生与测试
崔妍, 肖亮     
北京化工大学 信息科学与技术学院, 北京 100029
摘要: 设计了一种基于现场可编程门阵列(FPGA)的磁共振成像(MRI)谱仪B0信号的高精度发生方法,并对产生的B0信号经高速采集卡采集之后进行测试和验证.FPGA从外部读取波形数据和参数,分别存储在双端口随机存取存储器(RAM)和参数寄存器中,根据预补偿算法实现B0信号的发生,并通过对时间参数和幅度参数的控制,产生不同的B0信号,时间分辨率为1 μs.对谱仪的B0输出进行采集,再进行最小二乘拟合,以验证B0信号发生的准确性.经实验证实,该设计可以产生正确、可控的高精度B0信号.
关键词: 磁共振成像(MRI)    谱仪    B0信号    现场可编程门阵列(FPGA)    数据采集卡    
High Accuracy Generation and Test of B0 Signals on Magnetic Resonance Imaging Spectrometer
CUI Yan, XIAO Liang     
College of Information Science and Technology, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China
Abstract: A field programmable gate array (FPGA)-based method is proposed to generate B0 signals, with high accuracy, on magnetic resonance imaging (MRI) spectrometers. The FPGA reads the waveform data and external parameters, and stores them in the dual-port random access memory (RAM) and parameter registers, respectively. The B0 signals are then generated using the pre-emphasis algorithm, and different time or amplitude parameters give different B0 signals. The B0 signals are collected by high speed acquisition card, and the least squares fitting algorithm is used to test the accuracy of the B0 signals generated. The performance of this method was validated by experiments.
Key words: magnetic resonance imaging (MRI)    spectrometer    B0 signals    field programmable gate array (FPGA)    data acquisition card    
引言

磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)能够看到人体内部组织的断层扫描图像,由于该技术具有较高的分辨率、对人体无损伤等优点,因此被广泛的应用到医学检测中,为病变的早期发现和诊断提供了坚实的依据.

谱仪是MRI系统中的核心设备,主要功能是控制系统的时序、发射射频脉冲、产生梯度信号以及接收回波信号等[1-4].其中梯度模块是谱仪的重要组成部分之一,负责发出选层、频率编码以及相位编码三个通道的梯度波形,驱动XYZ三个方向的梯度线圈产生梯度磁场.在梯度磁场的发生过程中,由于涡流效应,它们分别会对主磁场B0产生影响,在B0上叠加指数衰减项.这会使得重建后的图像产生形变、伪影等现象[5],必须在成像系统中对其进行涡流补偿,所以消除涡流是MRI系统保证成像质量的关键之一.

涡流补偿的方法主要有两种:一种是由Mansfield和Chapman共同提出的自屏蔽梯度线圈的方法[5],消除线圈与主磁体之间的相互作用,这种方法需要对梯度线圈进行重新设计,成本较高.另外一种方法就是对梯度电流进行预补偿,以弥补磁场受涡流效应的影响[6-10].现有技术只对梯度在自身方向上产生的涡流效应进行了分析和补偿,而没有考虑梯度对静磁场B0的影响.而事实上,三个方向上的梯度磁场除了会在各种方向上产生涡流,也会共同影响主磁场B0的稳定性,从而影响成像质量[11],因而有必要针对B0场的涡流效应进行预补偿.

本文设计了一种基于现场可编程门阵列(Field Programmable Gate Array, FPGA)的预补偿的方法,以产生B0信号,补偿三个方向的梯度磁场对B0产生的涡流影响.FPGA具有很好的并行性,可以同时计算三个方向的梯度对B0的影响,有较高的运算效率.另外,由于难以通过示波器观测并判断B0信号是否准确,需要再通过高速采集卡采集B0(采样率为2 MHz),对采样结果进行最小二乘拟合以检验结果是否准确.本文设计的B0高精度发生方法,弥补了谱仪在梯度发生上的空缺.

1 B0计算的FPGA实现

谱仪采用FPGA器件实现梯度发生的实时计算.在FPGA中,B0发生的结构框图如图 1所示.根据外部的参数配置,在FPGA上实现数据的读取、缩放、坐标转换和预加重的功能.数字波形的处理结果发送到数模转换器(D/A)的梯度输出模块,经电流/电压转换器(I/V)之后用于采集.

图 1 梯度计算中B0的发生框图 Figure 1 A block diagram of B0 occurrence in gradient computation

B0的计算如(1)~(4)式所示:

$ {B_0}(t) = \sum\limits_{i = 1}^N {p_X^i(t) + } \sum\limits_{i = 1}^N {p_Y^i(t) + } \sum\limits_{i = 1}^N {p_Z^i(t) + OFFSET} $ (1)
$ p_X^i(t) = a_X^i \cdot \frac{{{\rm{d}}{X_0}(t)}}{{{\rm{d}}t}} - b_X^i \cdot \frac{{{\rm{d}}p_X^i(t)}}{{{\rm{d}}t}},\ \ i = 1, 2, 3, 4 $ (2)
$ p_Y^i(t) = a_Y^i \cdot \frac{{{\rm{d}}{Y_0}(t)}}{{{\rm{d}}t}} - b_Y^i \cdot \frac{{{\rm{d}}p_Y^i(t)}}{{{\rm{d}}t}}, \ \ i = 1, 2, 3, 4 $ (3)
$ p_Z^i(t) = a_Z^i \cdot \frac{{{\rm{d}}{Z_0}(t)}}{{{\rm{d}}t}} - b_Z^i \cdot \frac{{{\rm{d}}p_Z^i(t)}}{{{\rm{d}}t}}, \ \ i = 1, 2, 3, 4 $ (4)

其中N代表补偿项的数量,此处最大设为4.aXiaYiaZibXibYibZi分别代表XYZ方向的幅度常数和时间常数,OFFSET为直流偏置.幅度常数aXiaYiaZi为16 bit有符号整数,时间常数bXibYibZi位32 bit有符号整数.X为选层方向,Y为相位编码方向,Z为读方向.XYZ三个方向的预加重补偿是并行运算的.

用FPGA实现上述功能,需要先将微分方程转换成便于程序实现的差分方程形式.以(2)式为例,其差分方程转化过程如(5)~(8)式所示,其中n代表离散时间.

$ p_X^i(n) = a_X^i \cdot [{X_0}(n) - {X_0}(n - 1)] - b_X^i \cdot [p_X^i(n) - p_X^i(n - 1)], \ \ \ i = 1, 2, 3, 4 $ (5)
$ (1 + b_X^i) \cdot p_X^i(n) = a_X^i \cdot [{X_0}(n) - {X_0}(n - 1)] + b_X^i \cdot p_X^i(n - 1), \ \ \ i = 1, 2, 3, 4 $ (6)
$ p_X^i(n) = \frac{{a_X^i}}{{1 + b_X^i}} \cdot [{X_0}(n) - {X_0}(n - 1) + \frac{{b_X^i}}{{a_X^i}} \cdot p_X^i(n - 1)], \ \ \ i = 1, 2, 3, 4 $ (7)

$ PREA_X^i = \frac{{a_X^i}}{{1 + b_X^i}}$$ PREK_X^i = \frac{{b_X^i}}{{a_X^i}}$,得到(8)式

$ p_X^i(n) = PREA_X^i \cdot [{X_0}(n) - {X_0}(n - 1) + PREK_X^i \cdot p_X^i(n - 1)], \ \ \ i = 1, 2, 3, 4 $ (8)

本文设计的选用的FPGA为Altera公司的EP3C55F484,它有55 856个逻辑单元以及156个硬件乘法器.逻辑框图如图 1所示,FPGA完成了梯度数据波形的读取、幅度的缩放、以及预加重的核心功能,并将处理后的结果发送到梯度输出模块的D/A.FPGA的并行架构和高速处理,可以让涡流补偿达到纳秒(ns)级的分辨率.FPGA的编程语言采用硬件描述语言(Hardware Description Language, VHDL),编译环境为Altera公司的Quartus Ⅱ.FPGA操作核心的时钟频率为50 MHz,将从数字信号处理器(Digital Signal Process, DSP)中读取到的波形数据基于变换矩阵进行坐标变换之后得到XYZ方向的梯度数据,分别做预加重运算,得到三个方向对B0磁场的涡流影响B0XB0YB0Z,将这三项与直流偏置项OFFSET叠加,得到B0的预补偿结果,最后经过输出模块的D/A和I/V将结果输出.

FPGA的程序采用三级流水操作.第一级流水实现梯度数据的读取、增益控制和梯度变换,第二级流水完成B0信号的预增强,是程序的核心部分,第三级流水实现波形数据的并串转换.为了达到实时性的要求,需要加快计算速度,本文采取了并行设计模式,对XYZ三路的波形数据进行并行运算,再将三路并行的输出结果进行叠加.该方案依赖于FPGA丰富的硬件资源,包括硬件乘法器和高速时钟等.该方案具有较高的处理速度和较好的设计灵活性,满足B0补偿高速实时的要求.通过精心设计,B0波形的时间分辨率达到1 μs.

2 信号采集

分别从XYZ三个方向同步产生如图 2(a)~(c)所示的矩形信号,将经过补偿的B0信号输出到示波器观察输出波形,如图 2(d)所示.当输入波形的幅度较小,或者设置的幅度参数较小时,输出的B0信号幅度较小,会有较大的噪声,信噪比低,如图 2(e)所示.这种情况下,难以对B0进行观察和测量.为了更好的验证设计,测量B0的输出结果,并且与理论值进行比较,这里用高速采集卡对数据进行采集,以实现进一步的分析和验证.

图 2 (a) X方向的输入梯度;(b) Y方向的输入梯度;(c) Z方向的输入梯度;(d) B0输出结果;(e) 小幅度的B0信号 Figure 2 (a) Input gradient in X; (b) Input gradient in Y; (c) Input gradient in Z; (d) Output of B0; (e) Output of B0 with small amplitude

本文选用ADLINK PCI-9846的高速采集卡,采样率为2 MHz,每个采样点的时间间隔为0.5 μs,经过数据采集卡采样得到的B0信号以双精度浮点格式存储,由谱仪输出的数字门控进行采集的触发.

3 采集结果的测试和分析

涡流对B0的影响是一种近似多时间常数的指数衰减,用Matlab对采集到的信号进行最小二乘拟合,计算确定系数,以验证产生的B0信号的可信度.拟合曲线公式为(9)式,确定系数的计算为(10)式.

$ {B_0}(t) = \sum\limits_{i = 1}^N {{k_i}} \cdot q_i^t + DC $ (9)
$ {R^2} = \frac{{SSR}}{{SST}} = \frac{{{{\sum {({{\hat y}_i} - {{\bar y}_i})} }^2}}}{{{{\sum {({y_i} - {{\bar y}_i})} }^2}}} $ (10)

其中,N为添加的预加重参数的个数,ki为补偿结果的起始幅值,qi为衰减率,DC为直流偏置. $ \mathit{\hat y}$为拟合曲线的估计值,y为波形数据的均值,y为波形数据的实际值,得到的确定系数R2为0~1之间的数值.R2越接近1,说明拟合度越好.

3.1 幅度常数的参数拟合结果分析

输入幅值为2.5 V的矩形波,对一个补偿项进行参数对比,拟合后的参数计算结果应该与设置的幅度常数a呈线性相关.设置的幅度常数a与起始幅值的理论值k的对应关系如(11)式所示,其中amax为幅度常数的最大值,即0x7FFFFFFF,当amax = 0x7FFFFFFF时,对应的起始幅值kmax = -2.5.理论值与实验值的误差δ计算公式如(12)式所示,其中k为拟合得到的起始幅值.

$ \frac{{{k_{\rm{理}}}}}{{{k_{\max }}}} = \frac{a}{{{a_{\max }}}} $ (11)
$ {\delta _k} = \frac{{|k - {k_{\rm{理}}}|}}{{{k_{\rm{理}}}}} $ (12)

将时间常数设为固定值b= 0x7D00FFFF,幅度常数设置为a= 0x5DC0,经过FPGA运算后用示波器观察到的波形如图 3(a)所示,将计算结果经过高速采集卡2 MHz采样采集得到的B0信号如图 3(c)所示,其中纵坐标代表各采样点的幅值,根据(9)、(10)式对B0信号从最低点起的衰减部分进行曲线拟合,结果如图 3(e)所示,纵坐标为对应点的幅值,计算所得的确定系数R2 = 0.999 9,起始幅值k= -1.843 0.根据(11)式和(12)式计算得到k=-1.831 1,误差δk=0.006 5.

图 3 (a)大幅度常数的示波器波形;(b)小幅度常数的示波器波形;(c)大幅度常数采集到的波形;(d)小幅度常数采集到的波形;(e)大幅度常数的曲线拟合结果;(f)小幅度常数的曲线拟合结果 Figure 3 (a) Oscilloscope waveform with a large amplitude constant; (b) Oscilloscope waveform with a small amplitude constant; (c) The waveforms collected by the large amplitude constant; (d) The waveforms collected by the small amplitude constant; (e) Curve fitting results of large amplitude constants; (f) Curve fitting results of small amplitude constants

时间常数不变,将幅度常数减小为原来的1/8,即a= 0xBB8,得到的另外一组示波器波形如图 3(b)所示,经过高速采集卡采集之后的波形如图 3(d)所示,该波形经过曲线拟合的结果如图 3(f)所示,计算所得的确定系数R2 = 0.999 8,起始幅值k= -0.227 6.计算得到k=-0.228 8,误差δk=0.005 2.

对比两组数据经曲线拟合得到起始幅值与计算所得的理论值的误差,在幅度较大和较小时,其误差都在1%以下,该结果很好的反应了输入幅度常数的线性关系.

3.2 时间常数的参数拟合结果分析

时间常数b与理论的衰减率q的关系如(13)式所示,其中≫”为右移符号,即将b(2进制数)右移13位.衰减率的误差计算公式如(14)式所示.

$ q_{\rm{理}}^2 = \frac{{(b > > 13)}}{{{2^{18}}}} $ (13)
$ {\delta _q} = \frac{{|q_{\rm{理}}^2 - {q^2}|}}{{q_{\rm{理}}^2}} $ (14)

幅度常数固定为0x5DC0,时间常数为b= 0x7FF8FFFF,经过FPGA运算后用示波器观察到的波形如图 4(a)所示,其中纵坐标为幅值,将计算结果经过高速采集卡采集得到的B0信号的结果如图 4(c)所示,对B0信号从最低点起的衰减部分进行曲线拟合,结果如图 4(e)所示,计算所得的确定系数R2 = 1.000 0,衰减率q1=0.999 9,则q12=0.999 8.根据(13)式和(14)式计算得到的q2=0.999 7,δq=0.000 1.

图 4 (a)大时间常数的示波器波形;(b)小时间常数的示波器波形;(c)大时间常数采集到的波形;(d)小时间常数采集到的波形;(e)大时间常数的曲线拟合结果;(f)小时间常数的曲线拟合结果 Figure 4 (a) Oscilloscope waveform with a large time constant; (b) Oscilloscope waveform with a small time constant; (c) The waveform collected by large time constant; (d) The waveform collected by small time constant; (e) Curve fitting results of large time constants; (f) Curve fitting results of small time constants

将时间常数减小,设为b= 0x7FBCFFFF,示波器观察到的波形如图 4(b)所示,经过采集卡采集到的波形如图 4(d)所示,该曲线经拟合的结果如图 4(f)所示,计算所得的确定系数R2 = 1.000 0,衰减率q2=0.999 0,则q22=0.998 0.计算得到q2=0.998 0,δq=0.000 0.

对比两组输入的时间常数的比例关系与拟合所得衰减率的关系.(0x7FF8FFFF)/(0x7FBCFFFF) ≈ 0.976 8,q12/q22≈0.976 7.误差为0.000 1.

对比两组数据所得的衰减率与理论值的误差,该结果能够正确反应输入的时间常数的线性关系.

4 结论

本文提出了一种基于FPGA的MRI谱仪B0信号的高精度发生方法,此方法利用FPGA的高速运行及丰富的硬件资源,编程具有灵活性.得到的B0信号经数据采集并用Matlab做曲线拟合进行了测试和分析,结果证实此方法可以达到较高的波形分辨率与较高的运算精度.


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