肿瘤防治研究  2022, Vol. 49 Issue (4): 352-358
本刊由国家卫生和计划生育委员会主管,湖北省卫生厅、中国抗癌协会、湖北省肿瘤医院主办。
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文章信息

长链非编码RNA作为ceRNA在胃癌上皮间质转化中的作用研究进展
Research Progress on Roles of lncRNA as ceRNA in EMT of Gastric Cancer
肿瘤防治研究, 2022, 49(4): 352-358
Cancer Research on Prevention and Treatment, 2022, 49(4): 352-358
http://www.zlfzyj.com/CN/10.3971/j.issn.1000-8578.2022.21.0863
收稿日期: 2021-07-21
修回日期: 2021-12-28
长链非编码RNA作为ceRNA在胃癌上皮间质转化中的作用研究进展
唐银炳1,2 ,    张鹤腾1 ,    张文波1 ,    蒋鹏程1     
1. 212002 镇江,江苏大学附属人民医院普外科;
2. 310000 杭州,浙江大学医学院附属儿童医院肿瘤外科 国家儿童健康与疾病临床医学研究中心
摘要: 胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一。上皮间质转化(EMT)在胃癌的进展和转移中发挥着关键作用。EMT的调控是一个复杂的网络,转录因子SNAIL/SLUG、TWIST1/2、ZEB1/2在肿瘤EMT的过程中发挥着重要诱导作用,此外EMT的调控还与细胞因子、miRNAs(如miR-200家族)等的参与有关。近些年随着非编码RNA研究的深入,ceRNA网络被发现,其涉及lncRNA、circRNA、miRNA和mRNA等多个RNA分子,可广泛调控肿瘤细胞的增殖和转移,与EMT的关系密切。本文综述了lncRNA 作为ceRNA在胃癌EMT中发挥的作用和分子机制,从而加深对胃癌等恶性肿瘤中ceRNA网络的认识。
关键词: 胃癌    长链非编码RNA    ceRNA    上皮间质转化    
Research Progress on Roles of lncRNA as ceRNA in EMT of Gastric Cancer
TANG Yinbing1,2 , ZHANG Heteng1 , ZHANG Wenbo1 , JIANG Pengcheng1     
1. Department of General Surgery, Affiliated People's Hospital of Jiangsu University, Zhenjiang 212002, China;
2. Department of Oncology Surgery, The Children' Hospital, Zhejiang University School of Medicine, National Clinical Research Center for Child Health, Hangzhou 310000, China
Abstract: Gastric cancer is one of the most common malignant tumors in the world, and EMT plays a key role in the development and metastasis of gastric cancer. The regulation of EMT is a complex network. Transcription factors such as SNAIL/SLUG, Twist1/2 and ZEB1/2 play an important induction role in the process of tumor EMT. In addition, the regulation of EMT is related to the participation of cytokines and miRNAs (such as miR-200 family). In recent years, with the deepening studies on non-coding RNAs, researchers discovered that ceRNA networks, involving lncRNA, circRNA, miRNA, mRNA and other RNA molecules, can extensively regulate the proliferation and metastasis of tumor cells, and are closely related to EMT. This paper reviews the role and molecular mechanism of lncRNA as ceRNA in EMT of gastric cancer, to deepen the understanding of ceRNA network in gastric cancer and other malignant tumors.
Key words: Gastric cancer    Long non-coding RNA    ceRNA    Epithelial-mesenchymal transition    
0 引言

胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,是癌症相关死亡的第三大原因,2020年全球新发胃癌病例约占所有癌症的5.6%,死亡病例占7.7%,对全球卫生健康构成了沉重负担[1]。深入探究胃癌的发病机制,尤其是胃癌的转移机制,对于胃癌的诊治具有重要意义。

上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)是细胞从上皮表型转化为间质表型的过程,在肿瘤的进展和转移中发挥着重要作用。众多研究表明EMT与胃癌的预后密切相关,是胃癌晚期转移的关键环节,现阶段关于EMT调控机制的研究和EMT机制在胃癌领域的转化应用研究仍有待突破。近些年随着非编码RNA研究的深入,ceRNA网络被发现,其涉及lncRNA、circRNA、miRNA和mRNA等多个RNA分子,可广泛参与肿瘤细胞的增殖和转移,并与EMT的关系密切。本文综述了lncRNA作为ceRNA在胃癌EMT中发挥的作用和分子机制,从而加深在胃癌等恶性肿瘤中ceRNA网络的认识。

1 胃癌与EMT

EMT是上皮表型细胞向间充质表型细胞转化的过程,与胚胎发育、伤口愈合、纤维化以及癌症转移有关。其与间质上皮转化(mesenchymal-epithelial transition, MET)之间的变换为肿瘤细胞适应微环境提供了基础,是肿瘤发展与转移过程中的重要环节,也是肿瘤免疫逃逸和治疗抵抗的重要因素。在EMT过程中,上皮细胞失去了原本的形态和黏附能力,细胞极性降低,E-cadherin等上皮标志表达下调,而N-cadherin、Vimentin和Fibronectin等间质标志表达上调。上皮表型的丧失与间充质表型的获得,使肿瘤细胞获得转移和侵袭能力,从而发生远处转移。

适当的微环境刺激,如生长因子、细胞因子、缺氧、细胞外基质和免疫反应,或信号通路的突变激活可能诱发EMT,从而影响肿瘤细胞的EMT/MET平衡。EMT的调控是一个复杂的网络,EMT转录因子(如SNAIL/SLUG、TWIST1/2、ZEB1/2)在其中发挥着关键诱导作用[2],此外EMT的调控还与细胞因子、miRNAs(如miR-200家族)等的参与有关,并涉及TGF-β、Wnt/β-catenin和Notch等多个信号通路。

众多研究表明,EMT与胃癌患者的不良预后密切相关,是导致胃癌转移的重要原因。研究胃癌EMT的潜在调控机制,探索新的调控因子,将进一步阐明胃癌的发生发展机理,为胃癌的诊治提供有效手段。

2 LncRNA在胃癌EMT中的作用

LncRNA是一类长度超过200个核苷酸的功能性RNA分子,除部分短肽外,几乎没有编码蛋白的潜能。其广泛参与了人体生物学行为的不同层次,如细胞发育、干细胞分化、细胞稳态和疾病等,特别是在癌症领域,lncRNA发挥着极为关键的作用。研究报道大量lncRNA在肿瘤组织中异常表达,其中多种lncRNA分子与胃癌的发生发展密切相关[3-4]。lncRNA可以通过不同方式调控胃癌的进展,如影响细胞增殖、细胞周期和细胞凋亡等,此外,lncRNA在胃癌细胞的侵袭与转移中也发挥着重要调控作用,而这一过程与EMT的发生极为密切。

lncRNA可发挥信号、诱饵、支架和向导作用,通过与DNA、mRNA、蛋白质、非编码RNA等生物分子进行通信,在基因、转录和转录后等多个水平调控胃癌的EMT过程: (1)染色质修饰:HOTAIR可招募多梳抑制性复合物2(PRC2),使组蛋白H3赖氨酸27(H3K27)在E-cadherin启动子处由乙酰化转为甲基化状态,诱导胃癌EMT[5];(2)转录调控:有研究发现PVT1在胃癌细胞中通过850-1770 nt片段与转录因子STAT3相互作用并将其激活,促进STAT3向SLUG启动子募集并上调SLUG表达,从而触发EMT[6];(3)调控mRNA:研究发现ZEB2-AS1通过阻止其mRNA中包含IRES元件的内含子的剪接促进ZEB2翻译过程,或可在转录后水平诱导胃癌EMT的发生[7-8];(4)调控蛋白质:linc00261可增强GSK3β和SLUG之间的相互作用促进SLUG蛋白的降解,同时linc00261本身也可降低SLUG蛋白的稳定性,从而抑制胃癌EMT进程[9];(5)miRNA海绵:lncRNA可以通过竞争性结合miRNA,改变其下游靶基因的表达,调控肿瘤的EMT,见图 1。近年来,越来越多的研究证实在胃癌EMT过程中存在lncRNA参与的ceRNA网络。

图 1 lncRNA在胃癌EMT中的调控机制 Figure 1 Regulation mechanism of lncRNA in EMT of gastric cancer
3 ceRNA网络

microRNA(miRNA)是一种长度约20~24个核苷酸的内源性小RNA,可与mRNA中的miRNA识别元件(MREs)互补配对。成熟的miRNA将miRNA程序化RNA诱导沉默复合物(miR-RISC)引导到MREs,引起mRNA的稳定性下降或者翻译抑制。与此同时,非编码RNA亦可通过MREs与miRNA竞争性地结合,导致miRNA水平降低和活性减弱。Selmena等在此基础上提出了ceRNA假说[10],这些非编码RNA被称为ceRNA或miRNA海绵,可通过miRNA靶向下游mRNA发挥作用,同时也作为非编码RNAs之间相互“通信”的新语言。

ceRNA机制的发现揭示了更为复杂和精细的转录调控网络,涉及包括lncRNA、circRNA、假基因RNA、mRNA、tRNA和rRNA等多种RNA分子,研究发现一个ceRNA可结合多个miRNA,而每个miRNA又能靶向大量的MREs并抑制多达数百个转录本,预计超过60%的人类蛋白质编码基因是其潜在靶标,提示ceRNA-miRNA-mRNA的相互作用广泛参与人体的生理病理过程。研究表明lncRNA作为ceRNA影响了众多肿瘤的发生、转移和放化疗抗性等[11],与胃癌的恶性进展密切相关[12]

4 LncRNA作为ceRNA在胃癌EMT中的作用

有关EMT的研究对于阐明胃癌的发病机制极为关键,目前已有大量研究证实lncRNA可作为miRNA海绵,与miRNA及下游靶基因共同构成ceRNA网络,调控胃癌的EMT过程,见图 2

图 2 LncRNA作为ceRNA在胃癌EMT中的作用 Figure 2 LncRNA as ceRNA in EMT of gastric cancer
4.1 调控EMT诱导转录因子

在这些ceRNA网络中,最重要的是lncRNA与EMT诱导转录因子之间的关系。ZEB1/2是在ceRNA网络中研究最多的EMT诱导转录因子,Yuan等发现CAT104在胃癌细胞中高表达,并可促进胃癌细胞的迁移和侵袭,这一过程与其竞争性结合miR-381上调ZEB1的表达有关[13],提示CAT104可通过ceRNA机制诱导胃癌EMT。此外HOTAIR、CASC15、MAGI2-AS3、SNHG6、ZEB1-AS1、H19、UCA1等lncRNAs也可作为ceRNA调控ZEB1/2[14-21]。研究发现,EMT诱导转录因子SNAIL和SLUG也可与某些miRNAs(PVT1、SNHG7、GCMA等[22-24])特异性结合,从而受到lncRNA的调控,介导胃癌EMT进程。Wang等[22]发现PVT1作为miRNA海绵可通过miR-30a,上调SNAIL的表达,促进胃癌细胞的迁移,而过表达miR-30a逆转了SNAIL表达水平的变化和胃癌细胞表型的改变。目前尚没有lncRNA通过ceRNA机制调控TWIST的报道。

4.2 调控EMT相关标志物

有研究表明,上皮/间质标志物也可成为miRNA的直接靶点,间接受lncRNA的调控,参与胃癌EMT进程。Chen等[25]在胃癌细胞中通过双荧光素酶报告基因检测发现RP11-789C1.1/miR-5003/E-cadherin轴的存在,沉默RP11-789C1.1可以降低胃癌细胞中E-cadherin的表达,促进EMT的发生,这是目前唯一被证实直接涉及上皮标志物E-cadherin的ceRNA网络。间质标志物Vimentin(VIM)也被发现通过ceRNA机制参与胃癌EMT调控过程,Guo等[26]研究发现lnc01503作为致癌lncRNA,可通过结合miR-133a-5p上调Vimentin的表达,从而促进EMT进程及胃癌进展。

4.3 调控其他转录因子

除此之外,lncRNA也可通过miRNA调控其他肿瘤相关转录因子进而影响胃癌EMT。上游刺激因子1(USF1)是基本螺旋环螺旋亮氨酸拉链(b HLH LZ)家族转录因子的重要组成部分,可以与基因启动子区域的E盒结合,在包括癌症在内的众多疾病中作为重要调控因子发挥作用。Sun等[27]发现LOXL1 AS1和USFI在胃癌中高表达,并通过研究证实LOXL1 AS1可竞争性结合miR-708-5p上调USF1,诱导胃癌细胞增殖、迁移和EMT。在胃癌ceRNA网络中,SOX4、HMGA1、OCT1、EGR2等转录因子也参与了EMT的调控[28-31]

4.4 调节表观调控因子

Zeste基因增强子同源物2(EZH2)是PRC2的催化活性亚单位,可对H3K27进行甲基化修饰,从而介导目的基因沉默和转录抑制。研究发现XIST的高表达与胃癌侵袭性肿瘤表型及不良预后相关,而EZH2是XIST负向调控基因miR-101的直接靶点,EZH2受lncRNA XIST调节,发挥促进EMT等生物学效应[32]

4.5 调控其他肿瘤相关分子

(1)γ微管蛋白环状复合物是微管的一种高效集结结构,其蛋白组分(GCPs)决定了物质在微管中的运输形式和方向,微管蛋白的组装变异与包括癌症在内的多种疾病有关,而关于GCPs如何影响肿瘤发生发展的机制尚未完全阐明。GCP5是γ微管蛋白环状复合物的组分之一,Dong等[33]发现HOTAIR可负向调控miR-217在胃癌中的表达,通过抑制miR-217上调GCP5表达,从而促进胃癌的增殖、凋亡与EMT过程,这为研究GCPs在肿瘤尤其是胃癌EMT中的作用提供了思路;(2)Makorin环指蛋白3(MKRN3)被认为具有泛素-蛋白同肽连接酶(E3)活性,同时也可作为转录调节因子发挥作用,该基因的突变与女性性早熟有关。Xu等[34]发现PCAT6通过miR-30靶向MKRN3,可促进胃癌EMT的发生,一定程度上验证了青春期基因调控与癌症易感性的关系;(3)CLDNs家族是维持细胞间紧密连接结构的关键蛋白,广泛分布于各种上皮组织,参与上皮细胞渗透压的维持、屏障功能和免疫防御过程,同时与肿瘤的发生发展联系紧密。CLDN4是CLDNs家族的重要成员,在胃癌、胰腺癌和卵巢癌等多种恶性肿瘤中存在表达模式的改变,其异常表达可引起细胞间紧密连接的破坏,降低细胞间黏附的稳定性,从而促进肿瘤细胞的分离和转移。研究发现RTAP5-AS1、TUBB2A可通过减少miRNA对CLDN4的抑制,促进胃癌EMT过程[35];(4)DNAJB12是一种内质网相关的Hsp40家族蛋白,在严重的内质网应激下DNAJB12可被降解并促进癌细胞凋亡,同时该基因的缺失可增强促凋亡化疗药物的敏感度。而Ma等发现在胃癌中HCG18通过竞争性结合miR-152-3p上调DNAJB12的表达,引起E-cadherin等上皮标志物表达下调、间质标志物Vimentin表达升高[36],提示HCG18/miR-152-3p/DNAJB12轴可能通过影响凋亡之外的方式调控EMT过程;(5)ADAM9是ADAMs家族的成员,是一种膜锚定蛋白,该家族主要通过崩解素结构域黏附和金属蛋白酶结构域脱落包括E-cadherin在内的多种细胞表面蛋白,促进肿瘤进展、治疗耐药和癌症转移。Yin等[37]发现linc00689通过调控miR-526b3p/ADAM9轴促进了胃癌的EMT过程;(6)血管生成素2(Angiopoietin-2, ANGPT2)是受体酪氨酸激酶Tie-2的配体,主要由内皮细胞产生,是血管成熟的关键因子,ANGPT2的上调与肝癌、神经胶质瘤等多种肿瘤的恶性侵袭有关。Piao等[38]检测发现ANGPT2在胃癌中呈高表达,其表达水平与不良预后相关,进一步研究发现linc00184可以通过阻断miR-145对ANGPT2的抑制作用,促进胃癌细胞的生长、侵袭和EMT。

此外尚有一些ceRNA网络中的miRNA下游靶基因未被发现,仍需要后续的实验研究加以完善,如沉默PCAT6后miR-15a的水平得到上调,从而抑制RB/E2F和Wnt/β-catenin信号通路,最终促进胃癌间质表型的转变[39-40],针对RB/E2F和Wnt/β-catenin信号通路关键分子的研究或可找到miR-15a的直接靶点,在ceRNA机制上解释上述现象。

值得注意的是,lncRNA作为ceRNA可以结合多个miRNA,而同一个miRNA又可结合多个MREs,引起不同信号通路的改变,因此ceRNA网络中单个分子发挥的作用及作用对象并非完全单一,它们之间发生的次级、间接和协同作用共同影响着胃癌的EMT过程。Song等发现KRTAP5-AS1、TUBB2A与miR-3620-3p、miR-596在胃癌细胞中组成EMT调控网络,协同促进CLDN4的表达,从而下调E-cadherin,上调N-cadherin, TWIST1和ZEB2,最终诱导EMT的发生[35]。同时lncRNA和miRNA也可互相调控,并影响对应靶基因的表达。如miR-141与H19特异性结合,前者可调控H19的靶基因(miR-675、Igf1r和Igf2)表达,而H19也调节miR-141靶基因ZEB1的变化[19]。除特异性结合miRNA外,lncRNA也可通过其他方式抑制下游miRNA,Liu等发现HOTAIR通过与PRC2结合表观沉默miR34a基因,下调C-Met(HGF/C-Met/SNAIL通路)和SNAIL的表达,从而促进胃癌细胞的EMT,加速肿瘤的转移[41]。而lincRNA-ATB则在作为ceRNA直接结合miR-141-3p的同时[42],可通过TGF-β间接调控miR-200s(TGF-β/miR-200s/ZEB轴),诱导胃癌EMT[43]。关于这一方面的研究可以进一步完善胃癌EMT中ceRNA网络的构建,见表 1

表 1 胃癌EMT中的lncRNA/miRNA/mRNA网络 Table 1 LncRNA/miRNA/mRNA network in EMT of gastric cancer
5 结论和展望

综上所述,胃癌由于起病隐匿、晚期治疗困难,是困扰公共健康的重大难题。EMT是肿瘤进展过程的重要环节,除了参与肿瘤侵袭,还可维持肿瘤细胞干细胞特性、介导免疫逃逸、拮抗化学免疫疗法等,因此关于胃癌与EMT的研究至关重要。

ceRNA网络在胃癌EMT中具有重要的调控作用,目前利用生物信息学工具,围绕胃癌EMT建立的ceRNA调控网络正被不断拓展和完善。这些新发现的功能网络尚需要可靠的实验去验证,同时以往实验中非编码RNA的浓度常常被人为地放大,导致其研究结果并不能很好地反映真实生理水平中ceRNA网络的功能。此外,目前大部分研究主要集中在单个轴或单个分子上,缺乏对于ceRNA网络复杂性的认识和整体把握。这需要在大量可靠实验的基础上归纳出网络中的共性规律,从而使ceRNA网络作为更加系统的理论依据,为阐明胃癌的进展与转移机制提供思路,并在已有的基础上进行临床转化,以期获得更有前景的胃癌检测与治疗策略。

作者贡献:

唐银炳:选题设计、文章撰写和文章修改;

张鹤腾:文献查阅、文章撰写;

张文波、蒋鹏程:指导选题设计及撰写

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