文章信息
- YTHDF1与肿瘤关系的研究进展
- Research Progress on Relation Between YTHDF1 and Tumors
- 肿瘤防治研究, 2020, 47(9): 712-715
- Cancer Research on Prevention and Treatment, 2020, 47(9): 712-715
- http://www.zlfzyj.com/CN/10.3971/j.issn.1000-8578.2020.19.1608
- 收稿日期: 2019-12-24
- 修回日期: 2020-05-22
2. 550002 贵阳,贵州省人民医院泌尿外科
2. Department of Urology, Guizhou Provincial People's Hospital, Guiyang 550002, China
Competing interests: The authors declare that they have no competing interests.
N6甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)修饰是真核细胞转录后细胞内修饰最常见、最丰富、最保守的形式,广泛存在于真核生物的mRNA和lncRNA中,参与细胞发育、干细胞特征维持、肿瘤的进展、受精能力和T细胞的稳态等过程[1-4]。m6A修饰的功能受甲基转移酶催化、去甲基化酶和结合蛋白的调控。越来越多的证据提示[5-8],m6A修饰通过各种机制对肝癌、胃癌、肺癌、膀胱癌和黑色瘤等肿瘤产生一定的影响,YT521-B同源结构域家族蛋白1(YT521-B homology domain family protein 1, YTHDF1)作为m6A的结合蛋白在肿瘤中发挥重要作用。弄清YTHDF1的作用机制,有望找到癌症诊治新的方法。本文就YTHDF1与肿瘤关系的研究进展进行综述。
1 YTHDF1与m6A修饰m6A修饰是一个动态的过程,由甲基转移酶催化RNA发生m6A修饰,通过去甲基化酶介导m6A去甲基化修饰[5, 9-10]。读码器即结合蛋白可以识别、结合RNA甲基化修饰的信息,并介导下游RNA的翻译和降解过程[11],包括YT521-B同源(YT521-B homology, YTH)结构域蛋白家族、真核启动因子、胰岛素样生长因子2结合蛋白2家族和异质细胞核核糖核蛋白家族[12]。YTH结构域蛋白家族作为m6A修饰发现最早、最主要的识别蛋白,主要包括YTHDF和YTHDC两个亚型[13]。该蛋白家族均有保守的m6A结合结构域,通过一个保守的芳香族笼和两个蛋白FMR1、LRPPRC识别m6A修饰,并优先与RRm6ACH共有基序处的m6A修饰的RNA结合[14]。YTHDF主要包括YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3,主要定位在细胞质。不同的结合蛋白选择性地识别m6A修饰的RNA,在调节靶基因表达中发挥重要作用。YTHDF1通过与终止密码子周围的m6A位点结合,增加mRNA转录复合体的传递,联合翻译启动机制,从而促进翻译起始和蛋白质合成[15]。YTHDF2是第一个被认识的结合蛋白,通过m6A修饰调节mRNA的稳定性和RNA结构的重塑[16]。YTHDF3既可以协同YTHDF1促进甲基化RNA的翻译,也能够直接与YTHDF2作用加速mRNA的衰减[17]。虽然,多项研究已经解释m6A识别蛋白在多个生理病理过程中的重要性,但仍需要进一步的研究来充分阐明其在mRNA生物学中的作用。
2 YTHDF1与肿瘤发展的关系早在1974年,m6A就在肝癌细胞的mRNA中被发现,但是由于当时检测技术不成熟,m6A相关研究进展十分缓慢[18]。随着高通量测序技术和RNA修饰鉴定方法的不断发展,人们对m6A的认识逐渐加深[19]。相关研究显示,YTHDF1在肝癌组织、癌旁组织中呈下降趋势,与肝癌患者总生存率呈负相关[20];YTHDF2可以引起SOCS2转录后的抑制,利于肝癌细胞的增殖[21]。一项癌症基因组图谱数据库分析发现[22],与正常结肠组织相比,YTHDF1在结肠癌中表达存在显著差异,主要集中的功能和通路分别是DNA的催化活性、RNA的催化活性、AMPK信号通路和p53信号通路等。张杰等[23]的研究同样发现,沉默胃癌MGC-803和HGC-27细胞中YTHDF1的表达后,大量转录组水平基因发生变化,且与之对应的靶标mRNA数量减少,翻译水平降低,可以抑制胃癌细胞增殖、迁移和侵袭能力。在结肠直肠癌中c-myc可以启动YTHDF1表达,其高表达与较差的总体生存率相关[24]。Shi等[25]研究发现,YTHDF1在高原家养哺乳动物中低表达,但在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)的组织和细胞系中均高表达,抑制其在正常肺上皮细胞中表达,可以抵抗低氧诱导的细胞凋亡; YTHDF1在常氧状态下可以介导加速CDK2和CDK4的表达,进而促进癌细胞的增殖; YTHDF1缺陷可以降低CDK2、CDK4和细胞周期蛋白D1的翻译效率,减少NSCLC细胞的增殖、异种移植瘤的形成和新发肺腺癌的进展。此外,相关研究发现,m6A在ITGA6转录本中高度富集,且METTL3通过介导m6A修饰促进了YTHDF1/YTHDF3与ITGA6 mRNA 3’UTR端的结合,提高了ITGA6 mRNA的翻译水平,进而改变膀胱癌细胞的黏附能力。ITGA6的上调与METTL3在组织中的表达增加相关,其高表达预示较低的生存率[26-27]。由此可见,YTHDF1在大多数肿瘤中发挥促癌作用。
值得注意的是,最近研究发现YTHDF1可以抑制肿瘤进展。有证据表明,在小鼠黑色素瘤模型中敲除YTHDF1,可以提高树突细胞的交叉递呈能力,联合PD-L1的检查点抑制剂,几乎可以完全地控制肿瘤[28]。除此之外,另一项研究表明,m6A修饰明显抑制了眼黑色素瘤细胞的进展,其水平降低提示较差的预后,考虑这是由于YTHDF1识别m6A修饰的RNA,进而促进组氨酸三核苷酸结合蛋白2的翻译,并认为YTHDF1是眼部黑色素瘤的一种抑癌基因[29]。
由此可见,YTHDF1作为m6A修饰的识别蛋白,可以通过作用不同的途径,导致肿瘤特异性癌基因表达和生物学功能的改变,调控YDHDF1有望成为癌症治疗的一种新策略。
3 YTHDF1与肿瘤细胞免疫应答T细胞免疫应答在肿瘤免疫治疗中发挥至关重要的作用,虽然患者体内存在丰富的新抗原,但由于未能得到充足和长期的抗肿瘤免疫反应,因而不能完全消除肿瘤[30]。Han等[28]研究发现,YTHDF1能够通过识别带有m6A修饰的RNA影响靶基因的翻译; YTHDF1的缺失可以增强经典树突状细胞中肿瘤抗原的相互表达和CD8+T细胞的交叉启动; 编码溶酶体蛋白酶的转录本被m6A标记,并被YTHDF1识别、结合,从而促进了树突细胞中溶酶体组织蛋白酶的翻译,显著抑制野生型树突细胞的交叉递呈的作用。该研究还发现YTHDF1缺陷小鼠的T细胞可以产生更加丰富的γ干扰素,说明宿主细胞中YTHDF1的敲除在初期就可以促进T细胞的活化。此外,PD-L1检查点抑制剂的治疗作用在YTHDF1-/-小鼠中得到加强,达到几乎完全抑制肿瘤的效果,这提示YTHDF1可能成为抗肿瘤治疗新的免疫靶点。此外,该研究还指出,在结直肠癌患者中YTHDF1表达与CD8+T细胞数量呈负相关。以上研究提示,YTHDF1可以抑制机体细胞抗肿瘤的免疫反应,发挥促癌作用。
4 YTHDF1与肿瘤上皮间充质转化上皮间充质转化(EMT)是肿瘤细胞转移的一个重要步骤,E-钙黏蛋白的丢失被认为是EMT程序中最基本的事件。一些研究发现,YTHDF1可以通过调节EMT产生促癌效应。EMT诱导转录因子Snail可以降低E-钙黏蛋白的表达,从而促进肿瘤复发、转移和耐药[31]。Lin等[32]研究发现,EMT关键的转录因子Snail在3'UTR和CDS区被甲基化,YTHDF1在Snail mRNA中显著富集,且更易与Snail mRNA的CDS区相互作用; si-YTHDF1减弱了HeLa细胞中转化生长因子-β诱导Snail的表达; 功能损益分析研究表明,Snail转录因子CDS区的m6A能够通过YTHDF1与eEF-2的相互作用来启动其翻译延伸; YTHDF1与eIF3相互作用,可以增加m6A修饰的mRNA与多聚体结合,这是提高m6A修饰的mRNA翻译的限速步骤。
5 YTHDF1与耐药肿瘤相关研究发现,Keap1和Nrf2在YTHDF1蛋白敲除后被反向调节,表现为Keap1降低,Nrf2及其下游因子AKR1C1蛋白表达上升[25]。AKR1C1属于人AKR还原酶家族,已证明其异常表达可以诱导多种化疗的耐药性发展,包括NSCLC、乳腺癌和卵巢癌[33]。研究表明[25],在顺铂诱导的氧化应激状态下,YTHDF1的敲除降低了m6A修饰的Keap1转录物的翻译效率,进而激活了抗氧化氧自由基清除系统(Nrf2-AKR1C1),导致NSCLC对铂基化疗的耐药和更差的临床预后。该研究提示Keap1-Nrf2-AKR1C1轴是YTHDF1的下游调节靶点,强调了YTHDF1对低氧适应和NSCLC进展的重要作用。此外,在化学致癌物质诱导的恶性转化中研究发现[34],METTL3和CDCP1在膀胱癌患者标本中上调,两者的高表达与膀胱癌的进展相关,抑制METTL3-m6A-CDCP1轴可以延缓化学转化细胞与膀胱尿路上皮癌细胞的生长和进展; 体外和体内研究证明METTL3-m6A-CDCP1轴与化学致癌物协同作用,促进尿路上皮细胞恶性转化和膀胱癌的发生。由此可见,m6A修饰可以对肿瘤的化疗药物发挥调控作用,深入研究YTHDF1有助于解决这一难题。
6 小结与展望m6A修饰作为关键的、广泛存在的转录后修饰,通过多种机制在肿瘤中发挥重要作用。YTHDF1可以识别并结合m6A修饰,增加mRNA转录复合体的传递,促进翻译、蛋白质合成和EMT,利于肿瘤细胞免疫逃逸,因而在大多数肿瘤中扮演促进肿瘤增殖、侵袭和转移的角色。然而,YTHDF1在少数肿瘤中也可以发挥抑制肿瘤进展的作用,尤其在铂类为基础的化疗方案中,高水平的YTHDF1可以减少患者对化疗的耐药概率,提高临床预后。此外,YTHDF1在不同的细胞和不同的靶点发挥的作用也不尽相同。目前为止,我们对YTHDF1的了解还不足,仍需要大量的基础实验和临床试验来更加深入地认识YTHDF1,从而为癌症诊治提供新的希望。
作者贡献
肖世伟:检索文献和撰写论文
王海峰:查阅文献,提出修改建议
王剑松、丁明霞:提出建议并对文章进行最终修定
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