文章信息
- 马小雯, 范明伟, 杜江
- MA Xiaowen, FAN Mingwei, DU Jiang
- 锌指蛋白502在肺腺癌中的表达及作用机制
- Expression and mechanism of zinc finger protein 502 in lung adenocarcinoma
- 中国医科大学学报, 2023, 52(9): 798-804
- Journal of China Medical University, 2023, 52(9): 798-804
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文章历史
- 收稿日期:2023-03-02
- 网络出版时间:2023-08-31 11:35:13
2. 中国医科大学临床二系106期, 沈阳 110122
2. Department of Pathology, 106K, Second Department of Clinical Medicine, China Medical University, Shenyang 110122, China
肺癌是全球发病率最高的癌症,严重影响人类健康[1]。肺腺癌是肺癌的主要组织学亚型,发病率逐年增加,其5年生存率仅约为15%,绝大多数患者在诊断时已为晚期[2]。因此,寻找肺腺癌的预后标志物和治疗靶点至关重要。
p53是一种经典的抑癌基因,被称为“基因组守护者”,其在保持基因组完整性方面具有关键作用[3-4]。p53在肺癌患者中被认定为早期诊断标志物[5]。当细胞受到外界环境刺激时,p53可以介导细胞周期阻滞,从而导致细胞衰老或细胞凋亡[6]。GADD45是p53的靶基因,已被证明其可以在G2/M细胞周期检查点抑制细胞周期进程。GADD45在G2/M检查点通过抑制细胞周期特异性激酶CyclinB1和CDC2来阻滞细胞周期[7]。锌指蛋白502(zinc finger protein 502,ZNF502)是C2H2型锌指蛋白家族成员,定位于人类染色体3p21.31。LI等[8]研究显示ZNF502可能是抑郁症的易感基因,截至目前,ZNF502在恶性肿瘤组织中的表达模式和生物学功能尚不清楚。
本研究采用生物信息学分析方法和Western blotting实验探讨ZNF502在肺腺癌患者中的表达模式,利用一系列细胞功能实验探究ZNF502对肺腺癌细胞增殖能力的影响,为进一步研究ZNF502在肺腺癌发生发展中的具体作用机制提供线索和依据。
1 材料与方法 1.1 生物信息学分析 1.1.1 TCGA数据库采用仙桃学术在线网站(https://www.xiantao.love/products)对TCGA数据库中肺腺癌数据集进行表达差异和预后相关性分析。
1.1.2 GEPIA数据库采用GEPIA数据库(http://gepia.cancer-pku.cn/detail.php)对ZNF502和TP53mRNA的表达相关性进行预测。设置筛选条件为(1)Gene:ZNF502,TP53;(2)Datasets selection:BRCA;(3)Correlation Coefficient:Person。
1.1.3 Linkedomics在线网站应用Linkedomics(http://www.linkedomics.org/login.php)对ZNF502进行基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)。
1.2 细胞培养永生人支气管上皮细胞系HBE,人类肺腺癌细胞系H1299、LK2,A549购自武汉普诺赛(中国Procell公司)。所有细胞均使用RPMI-1640(美国Invitrogen公司)培养,培养基中添加10% 胎牛血清(美国Invitrogen公司),1%青霉素和链霉素(美国Sigma-Aldrich公司)。所有细胞均置于温度37 ℃,5% CO2的细胞培养箱中。所有细胞系均采用短串联重复序列(short tandem repeat,STR)进行鉴定,无支原体污染。
1.3 质粒构建过表达质粒pCMV6-ZNF502-Myc-DDK和对照质粒PCMV6购自美国Origene公司。敲除序列pLV2-U6-ZNF502-sgRNA-cas9-GFP由吉凯基因(中国吉凯基因公司)设计。转染均使用lipo3000(美国Invitrogen公司)。
1.4 Western blotting采用NP40裂解液(中国碧云天公司)从细胞中提取总蛋白。12 000 r/min,4 ℃离心保留上清液,并使用BCA试剂盒定量(中国碧云天公司)。100 ℃金属浴加热样品5 min,使蛋白质变性。采用10% SDS-PAGE分离40 μg蛋白,100 V,60 min将蛋白转印到PVDF膜(美国Millipore公司)上。5%的脱脂奶粉室温封闭PVDF膜2 h后,在4 ℃与以下抗体孵育过夜:ZNF502、GAPDH、P53、CyclinB1、CDK1、GADD45a和Myc-tag(均以1∶1 000稀释,美国Abcam公司)。24 h后将PVDF膜与以1∶3 000稀释的辣根过氧化物酶偶联抗小鼠IgG和抗兔IgG(中国碧云天公司)室温孵育2 h。增强化学发光法(electrochemiluminescence,ECL)检测蛋白表达,采用ChemiDoc Imaging System进行采集图像。采用GAPDH作为对照来计算相对蛋白表达量。
1.5 免疫荧光实验在细胞传代培养时,将细胞接种到预先放置盖玻片的24孔板中,待细胞融合率接近80%时,磷酸盐缓冲液清洗2次。室温下用4% 多聚甲醛敷育细胞10 min,0.5% Triton X-100通透液室温下敷育细胞10 min,使用含有3% 牛血清白蛋白的磷酸盐缓冲液封闭细胞2 h。将细胞与溶有ZNF502抗体(1∶100)的磷酸盐缓冲液在4℃下孵育过夜。24 h后将细胞使用磷酸盐缓冲液洗涤2次,与荧光二抗Alexa Fluor 488或Alexa Fluor 594(1∶50,中国碧云天公司)在室温下孵育1 h,避光。最后,用含4,6-二氨基-2-苯基吲哚(4,6-diamino-2-phenyl indole,DAPI)的封片剂染色细胞核10 min。将细胞爬片使用共聚焦显微镜获取图像。实验重复3次以上。
1.6 MTS细胞增殖实验培养过表达ZNF502的A549细胞和敲除ZNF502的LK2细胞到对数生长期。取96孔细胞培养板,每孔加入0.1 mL 2 000个上述细胞的RPMI1640培养液,设置5个复孔。在37 ℃ 5%CO2的培养箱中分别培养24、48、72和96 h后,每孔加入20 μL MTS,继续培养1.5 h后进行显色。在酶联检测仪波长490 nm处检测各孔吸光度(optical density,OD)。实验重复3次以上。
1.7 集落形成实验培养过表达ZNF502的A549细胞和敲除ZNF502的LK2细胞到对数生长期。在6孔板每个孔中加入1 000个细胞,放入CO2培养箱培养。1周后,当肉眼可见集落形成时,取出6孔板。每孔加入1 mL冰甲醇固定15 min后,加入结晶紫染色10 min,自来水反蓝。计数集落,实验重复3次以上。
1.8 EdU增殖实验培养过表达ZNF502的A549细胞和敲除ZNF502的LK2细胞至融合率为70%~80%时,用20 μmol/L的EdU溶液(中国雅酶生物公司)在37 ℃ 5% CO2培养箱中孵育细胞1 h后,弃培养基。用磷酸盐缓冲液清洗细胞3次之后,所有步骤按照免疫荧光实验进行。
1.9 统计学分析采用SPSS 22.0软件进行统计分析,组间差异采用t检验。采用Kaplan-Meier法和多因素Cox回归法分析ZNF502与生存预后的关系。P < 0.05为差异有统计学意义。所有实验至少重复3次。
2 结果 2.1 ZNF502在肺腺癌组织和细胞中的表达(图 1)
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A, mRNA expression of ZNF502 in all cancer types; B, expression levels of ZNF502 in lung adenocarcinoma and paired paracancer tissues; C, protein expression of ZNF502 in cell lines; D, subcellular localization of ZNF502 in lung cancer cells×40. * P < 0.05;** P < 0.01;*** P < 0.001. 图 1 ZNF502在肺腺癌组织和细胞中低表达 Fig.1 ZNF502 was low expressed in lung adenocarcinoma tissues and cells |
对TCGA公共数据库中的多种癌和癌旁样本进行差异分析。结果显示,ZNF502在多种肿瘤组织中的mRNA表达水平显著低于癌旁组织(图 1A)。且在配对的肺腺癌组织中表达显著低于癌旁组织(P < 0.01,图 1B)。肺腺癌细胞系A549,H1299和LK2中ZNF502的蛋白水平明显低于正常支气管上皮细胞HBE(图 1C)。本研究选取表达量最低的A549细胞系进行后续的过表达实验,选取表达量相对较高的LK2细胞进行后续的敲除实验。免疫荧光实验结果显示,内源和外源的ZNF502均主要表达于肺腺癌细胞的细胞核中(图 1D)。
2.2 ZNF502过表达与患者预后的相关性对TCGA数据库中的肺腺癌患者临床数据进行Kaplan-Meier生存分析。结果显示,ZNF502高表达的肺腺癌患者总体生存期(overall survival,OS)和疾病特异性生存期(disease specific survival,DSS)显著高于ZNF502低表达的患者,且风险比率(hazard ratio,HR)均 < 1(P = 0.014和P = 0.018,图 2A、2B)。将患者按ZNF502的mRNA表达量分群并绘制风险因子图,发现ZNF502高表达的患者存活更多且有更低的风险评分(图 2C)。接下来对肺腺癌相关的临床病理因素和ZNF502的表达进行多因素Cox分析,结果显示,ZNF502可以作为评价肺腺癌预后的独立保护因素。ZNF502可以联合T分期和N分期作为肺腺癌的预后评价因子(HR=0.738,P < 0.001,图 2D)。
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A, patients with high expression of ZNF502 had a higher overall survival rate; B, patients with high expression of ZNF502 had a higher disease-specific survival rate; C, patients with high expression of ZNF502 had a lower risk score; D, multivariate Cox analysis. 图 2 ZNF502高表达患者预后良好 Fig.2 A high level of ZNF502 expression was associated with a good prognosis |
2.3 ZNF502过表达抑制肺腺癌细胞增殖能力(图 3)
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A, GSEA analysis; B, cell cycle pathway; C, correlation between ZNF502 and G2/M pathway; D, the efficiency of ZNF502 overexpression in A549 cells and knockout in LK2 cells were detected; E, MTT; F, colony formation; G, EdU assay were used to detect the proliferation ability after ZNF502 overexpression or knockout. * P < 0.05;** P < 0.01;*** P < 0.001. 图 3 ZNF502过表达抑制肺腺癌细胞增殖 Fig.3 Overexpression of ZNF502 inhibited the proliferation of lung adenocarcinoma cells |
利用linkedomics网站进行在线GSEA富集分析,结果显示,ZNF502主要与细胞周期、帕金森病和泛素化等通路呈负相关(图 3A、3B)。对TCGA数据库的肺腺癌数据集进行通路相关性分析,ZNF502与G2/M检查点通路显著负相关(P = 0.013,图 3C)。结果显示,ZNF502可能通过调控细胞周期来影响患者的预后。细胞周期主要控制细胞的增殖能力。Western blotting实验结果显示,ZNF502在A549细胞中被成功过表达,在LK2细胞中被成功敲除(图 3D)。MTS、集落形成实验和EdU增殖实验结果显示,过表达ZNF502显著抑制肺腺癌细胞的增殖能力。而敲除ZNF502则显著增强肺腺癌细胞的增殖能力(图 3E~3G)。
利用linkedomics网站进行在线GSEA富集分析,结果显示,ZNF502主要与细胞周期、帕金森病和泛素化等通路呈负相关(图 3A、3B)。对TCGA数据库的肺腺癌数据集进行通路相关性分析,ZNF502与G2/M检查点通路显著负相关(P = 0.013,图 3C)。结果显示,ZNF502可能通过调控细胞周期来影响患者的预后。细胞周期主要控制细胞的增殖能力。Western blotting实验结果显示,ZNF502在A549细胞中被成功过表达,在LK2细胞中被成功敲除(图 3D)。MTS、集落形成实验和EdU增殖实验结果显示,过表达ZNF502显著抑制肺腺癌细胞的增殖能力。而敲除ZNF502则显著增强肺腺癌细胞的增殖能力(图 3E~3G)。
2.4 ZNF502通过激活P53通路抑制细胞周期利用GEPIA网站对ZNF502和下游基因进行相关性分析,结果显示,ZNF502和TP53的表达呈正相关(r = 0.14,P = 0.001 4,图 4A)。接下来在过表达ZNF502的A549细胞中检测p53下游蛋白表达水平。Western blotting实验结果显示,p53,GADD45a表达明显上升,而G2/M检查点关键蛋白CyclinB1和CDK1表达明显下降(图 4B)。在ZNF502敲除的LK2细胞中,上述蛋白表达量的变化恰恰相反(图 4C)。过表达ZNF502可能通过激活p53-GADD45a通路抑制细胞G2/M转化,从而抑制肺腺癌细胞的增殖能力。
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A, correlation between ZNF502 and TP53 mRNA; B, Western blotting was used to detect cell cycle-related proteins after ZNF502 overexpression; C, Western blotting was used to detect cell cycle-related proteins after ZNF502 knockout. 图 4 ZNF502通过激活p53通路抑制细胞周期 Fig.4 ZNF502 inhibited the cell cycle by activating the p53 pathway |
3 讨论
ZNF502是锌指蛋白转录因子家族的成员,其在肺癌中的表达模式和生物学功能仍未有文献报道。此外,ZNF502表达与患者预后之间的相关性也未见文献报道。本研究结果显示,与癌旁组织相比,ZNF502在肺腺癌组织中的表达相对较低。ZNF502主要定位在细胞核中发挥生物学功能。此外,ZNF502的高表达与患者的良好预后呈正相关,ZNF502或许可以作为一个新的评价肺腺癌良好预后的标志物。而且,ZNF502 mRNA的表达可以作为评估为肺腺癌进展的独立保护因素。
GSEA富集分析以及一系列检测细胞增殖能力的功能学实验表明,ZNF502可能通过调节p53信号通路来抑制细胞增殖能力。ZNF502和TP53的表达呈正相关。p53已被证实是调控细胞周期的上游关键因子,发挥抑制肿瘤细胞增殖的作用[9-10]。野生型p53的高表达与肿瘤放化疗敏感性和良好预后密切相关。在基因组受到外界损伤时,p53响应外界刺激,介导细胞周期阻滞,开启DNA损伤修复通路。当基因组损伤不可修复时,p53主要开启细胞凋亡通路,引导细胞程序性死亡[11-12]。
本研究进一步采用Western blotting检测p53通路关键下游蛋白。结果显示,ZNF502通过上调p53的表达水平,激活下游关键因子GADD45a,从而使细胞周期阻滞在G2/M检查点。突变型p53在肿瘤中将发挥与野生型p53截然不同的功能[13]。临床约有50%的肺癌患者存在p53突变。p53蛋白可以发挥转录因子的功能,其突变位点主要位于中央的DNA结合结构域。R175、G245、R248、R249、R273和R282是最常见的6个错义突变位点。突变的p53半衰期明显延长,不再具有野生型p53抑制细胞增殖的能力。突变型p53诱导上皮-间充质转化,放化疗抵抗在肿瘤细胞的侵袭和转移中起关键作用[14]。本研究中使用的A549和LK2细胞都不存在p53突变,仅检测了ZNF502对野生型p53的调控作用,ZNF502对突变型p53的影响将在未来的实验中进一步探究。
综上所述,ZNF502在肺腺癌组织中显著低表达,主要定位于细胞核中且与肺腺癌患者的良好预后呈正相关。ZNF502通过激活p53-GADD45a通路抑制细胞G2/M转化,从而抑制肺腺癌细胞的增殖能力。
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