中国医科大学学报  2023, Vol. 52 Issue (9): 798-804

文章信息

马小雯, 范明伟, 杜江
MA Xiaowen, FAN Mingwei, DU Jiang
锌指蛋白502在肺腺癌中的表达及作用机制
Expression and mechanism of zinc finger protein 502 in lung adenocarcinoma
中国医科大学学报, 2023, 52(9): 798-804
Journal of China Medical University, 2023, 52(9): 798-804

文章历史

收稿日期:2023-03-02
网络出版时间:2023-08-31 11:35:13
锌指蛋白502在肺腺癌中的表达及作用机制
马小雯1,2 , 范明伟1 , 杜江1     
1. 中国医科大学基础医学院病理学教研室, 沈阳 110122;
2. 中国医科大学临床二系106期, 沈阳 110122
摘要目的 探讨锌指蛋白502(ZNF502)在肺腺癌中的表达情况、临床意义及分子机制。方法 通过肿瘤基因组图谱(TCGA)分析ZNF502在肺腺癌中的mRNA表达,以及与生存危险因素的相关性。采用Kaplan-Meier法分析ZNF502与患者预后的关系。通过linkedomics网站对ZNF502的下游差异基因进行基因集富集分析(GSEA),并采用Western blotting对下游关键分子进行验证。运用免疫荧光实验确定ZNF502蛋白在肺腺癌细胞株的定位。MTS细胞增殖实验、克隆形成实验和EdU实验检测ZNF502过表达对肿瘤细胞增殖能力的影响。结果 ZNF502在肺腺癌组织中呈显著低表达(P < 0.05),主要定位于细胞核,且与肺腺癌患者的良好预后呈正相关。富集分析结果显示,ZNF502负调控细胞增殖和G2/M检查点相关通路,导致细胞周期阻滞。ZNF502过表达显著抑制肺腺癌细胞增殖能力,并下调G2/M检查点关键蛋白的表达。结论 ZNF502在肺腺癌中低表达,其通过调控细胞周期抑制肺腺癌细胞的增殖,延缓肿瘤发生发展。
关键词肺腺癌    锌指蛋白502    细胞增殖    
Expression and mechanism of zinc finger protein 502 in lung adenocarcinoma
MA Xiaowen1,2 , FAN Mingwei1 , DU Jiang1     
1. Department of Pathology, College of Basic Medical Sciences, China Medical University, Shenyang 110122, China;
2. Department of Pathology, 106K, Second Department of Clinical Medicine, China Medical University, Shenyang 110122, China
Abstract: Objective To investigate the expression of zinc finger protein 502 (ZNF502) in lung adenocarcinoma and its clinical signifi-cance and molecular mechanism. Methods The mRNA expression of ZNF502 in lung adenocarcinoma and its correlation with survival risk factors were analyzed by the TCGA database. Kaplan-Meier method was used to analyze the relationship between ZNF502 and the prognosis of the patients. The downstream differential genes of ZNF502 were subjected to GSEA enrichment analysis by the Linkedomics website, and the downstream key molecules were detected by Western blotting. The localization of the ZNF502 protein in the lung adenocarcinoma cell line was determined by immunofluorescence assay. MTS, colony formation assay, and EdU assay were used to detect the effect of ZNF502 overexpression on the proliferation of tumor cells. Results The expression of ZNF502 was significantly lower in lung adenocarcinoma (P < 0.05). ZNF502 was mainly localized in the nucleus and positively correlated with the good prognosis of lung adenocarcinoma. Furthermore, enrichment analysis showed that ZNF502 negatively regulated cell proliferation and G2/M checkpoint-related pathways, resulting in cell cycle arrest. Overexpression of ZNF502 significantly inhibited the proliferation of lung adenocarcinoma cells and down-regulated the expression of key proteins at the G2/M checkpoint. Conclusion The expression of ZNF502 was low in lung adenocarcinoma. ZNF502 inhibited the proliferation of lung adenocarcinoma cells by regulating the cell cycle, then decreased tumor development.

肺癌是全球发病率最高的癌症,严重影响人类健康[1]。肺腺癌是肺癌的主要组织学亚型,发病率逐年增加,其5年生存率仅约为15%,绝大多数患者在诊断时已为晚期[2]。因此,寻找肺腺癌的预后标志物和治疗靶点至关重要。

p53是一种经典的抑癌基因,被称为“基因组守护者”,其在保持基因组完整性方面具有关键作用[3-4]p53在肺癌患者中被认定为早期诊断标志物[5]。当细胞受到外界环境刺激时,p53可以介导细胞周期阻滞,从而导致细胞衰老或细胞凋亡[6]GADD45p53的靶基因,已被证明其可以在G2/M细胞周期检查点抑制细胞周期进程。GADD45在G2/M检查点通过抑制细胞周期特异性激酶CyclinB1和CDC2来阻滞细胞周期[7]。锌指蛋白502(zinc finger protein 502,ZNF502)是C2H2型锌指蛋白家族成员,定位于人类染色体3p21.31。LI等[8]研究显示ZNF502可能是抑郁症的易感基因,截至目前,ZNF502在恶性肿瘤组织中的表达模式和生物学功能尚不清楚。

本研究采用生物信息学分析方法和Western blotting实验探讨ZNF502在肺腺癌患者中的表达模式,利用一系列细胞功能实验探究ZNF502对肺腺癌细胞增殖能力的影响,为进一步研究ZNF502在肺腺癌发生发展中的具体作用机制提供线索和依据。

1 材料与方法 1.1 生物信息学分析

1.1.1 TCGA数据库

采用仙桃学术在线网站(https://www.xiantao.love/products)对TCGA数据库中肺腺癌数据集进行表达差异和预后相关性分析。

1.1.2 GEPIA数据库

采用GEPIA数据库(http://gepia.cancer-pku.cn/detail.php)对ZNF502TP53mRNA的表达相关性进行预测。设置筛选条件为(1)Gene:ZNF502TP53;(2)Datasets selection:BRCA;(3)Correlation Coefficient:Person。

1.1.3 Linkedomics在线网站

应用Linkedomics(http://www.linkedomics.org/login.php)对ZNF502进行基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)。

1.2 细胞培养

永生人支气管上皮细胞系HBE,人类肺腺癌细胞系H1299、LK2,A549购自武汉普诺赛(中国Procell公司)。所有细胞均使用RPMI-1640(美国Invitrogen公司)培养,培养基中添加10% 胎牛血清(美国Invitrogen公司),1%青霉素和链霉素(美国Sigma-Aldrich公司)。所有细胞均置于温度37 ℃,5% CO2的细胞培养箱中。所有细胞系均采用短串联重复序列(short tandem repeat,STR)进行鉴定,无支原体污染。

1.3 质粒构建

过表达质粒pCMV6-ZNF502-Myc-DDK和对照质粒PCMV6购自美国Origene公司。敲除序列pLV2-U6-ZNF502-sgRNA-cas9-GFP由吉凯基因(中国吉凯基因公司)设计。转染均使用lipo3000(美国Invitrogen公司)。

1.4 Western blotting

采用NP40裂解液(中国碧云天公司)从细胞中提取总蛋白。12 000 r/min,4 ℃离心保留上清液,并使用BCA试剂盒定量(中国碧云天公司)。100 ℃金属浴加热样品5 min,使蛋白质变性。采用10% SDS-PAGE分离40 μg蛋白,100 V,60 min将蛋白转印到PVDF膜(美国Millipore公司)上。5%的脱脂奶粉室温封闭PVDF膜2 h后,在4 ℃与以下抗体孵育过夜:ZNF502、GAPDH、P53、CyclinB1、CDK1、GADD45a和Myc-tag(均以1∶1 000稀释,美国Abcam公司)。24 h后将PVDF膜与以1∶3 000稀释的辣根过氧化物酶偶联抗小鼠IgG和抗兔IgG(中国碧云天公司)室温孵育2 h。增强化学发光法(electrochemiluminescence,ECL)检测蛋白表达,采用ChemiDoc Imaging System进行采集图像。采用GAPDH作为对照来计算相对蛋白表达量。

1.5 免疫荧光实验

在细胞传代培养时,将细胞接种到预先放置盖玻片的24孔板中,待细胞融合率接近80%时,磷酸盐缓冲液清洗2次。室温下用4% 多聚甲醛敷育细胞10 min,0.5% Triton X-100通透液室温下敷育细胞10 min,使用含有3% 牛血清白蛋白的磷酸盐缓冲液封闭细胞2 h。将细胞与溶有ZNF502抗体(1∶100)的磷酸盐缓冲液在4℃下孵育过夜。24 h后将细胞使用磷酸盐缓冲液洗涤2次,与荧光二抗Alexa Fluor 488或Alexa Fluor 594(1∶50,中国碧云天公司)在室温下孵育1 h,避光。最后,用含4,6-二氨基-2-苯基吲哚(4,6-diamino-2-phenyl indole,DAPI)的封片剂染色细胞核10 min。将细胞爬片使用共聚焦显微镜获取图像。实验重复3次以上。

1.6 MTS细胞增殖实验

培养过表达ZNF502的A549细胞和敲除ZNF502的LK2细胞到对数生长期。取96孔细胞培养板,每孔加入0.1 mL 2 000个上述细胞的RPMI1640培养液,设置5个复孔。在37 ℃ 5%CO2的培养箱中分别培养24、48、72和96 h后,每孔加入20 μL MTS,继续培养1.5 h后进行显色。在酶联检测仪波长490 nm处检测各孔吸光度(optical density,OD)。实验重复3次以上。

1.7 集落形成实验

培养过表达ZNF502的A549细胞和敲除ZNF502的LK2细胞到对数生长期。在6孔板每个孔中加入1 000个细胞,放入CO2培养箱培养。1周后,当肉眼可见集落形成时,取出6孔板。每孔加入1 mL冰甲醇固定15 min后,加入结晶紫染色10 min,自来水反蓝。计数集落,实验重复3次以上。

1.8 EdU增殖实验

培养过表达ZNF502的A549细胞和敲除ZNF502的LK2细胞至融合率为70%~80%时,用20 μmol/L的EdU溶液(中国雅酶生物公司)在37 ℃ 5% CO2培养箱中孵育细胞1 h后,弃培养基。用磷酸盐缓冲液清洗细胞3次之后,所有步骤按照免疫荧光实验进行。

1.9 统计学分析

采用SPSS 22.0软件进行统计分析,组间差异采用t检验。采用Kaplan-Meier法和多因素Cox回归法分析ZNF502与生存预后的关系。P < 0.05为差异有统计学意义。所有实验至少重复3次。

2 结果 2.1 ZNF502在肺腺癌组织和细胞中的表达(图 1
A, mRNA expression of ZNF502 in all cancer types; B, expression levels of ZNF502 in lung adenocarcinoma and paired paracancer tissues; C, protein expression of ZNF502 in cell lines; D, subcellular localization of ZNF502 in lung cancer cells×40. * P < 0.05;** P < 0.01;*** P < 0.001. 图 1 ZNF502在肺腺癌组织和细胞中低表达 Fig.1 ZNF502 was low expressed in lung adenocarcinoma tissues and cells

对TCGA公共数据库中的多种癌和癌旁样本进行差异分析。结果显示,ZNF502在多种肿瘤组织中的mRNA表达水平显著低于癌旁组织(图 1A)。且在配对的肺腺癌组织中表达显著低于癌旁组织(P < 0.01,图 1B)。肺腺癌细胞系A549,H1299和LK2中ZNF502的蛋白水平明显低于正常支气管上皮细胞HBE(图 1C)。本研究选取表达量最低的A549细胞系进行后续的过表达实验,选取表达量相对较高的LK2细胞进行后续的敲除实验。免疫荧光实验结果显示,内源和外源的ZNF502均主要表达于肺腺癌细胞的细胞核中(图 1D)。

2.2 ZNF502过表达与患者预后的相关性

对TCGA数据库中的肺腺癌患者临床数据进行Kaplan-Meier生存分析。结果显示,ZNF502高表达的肺腺癌患者总体生存期(overall survival,OS)和疾病特异性生存期(disease specific survival,DSS)显著高于ZNF502低表达的患者,且风险比率(hazard ratio,HR)均 < 1(P = 0.014和P = 0.018,图 2A2B)。将患者按ZNF502的mRNA表达量分群并绘制风险因子图,发现ZNF502高表达的患者存活更多且有更低的风险评分(图 2C)。接下来对肺腺癌相关的临床病理因素和ZNF502的表达进行多因素Cox分析,结果显示,ZNF502可以作为评价肺腺癌预后的独立保护因素。ZNF502可以联合T分期和N分期作为肺腺癌的预后评价因子(HR=0.738,P < 0.001,图 2D)。

A, patients with high expression of ZNF502 had a higher overall survival rate; B, patients with high expression of ZNF502 had a higher disease-specific survival rate; C, patients with high expression of ZNF502 had a lower risk score; D, multivariate Cox analysis. 图 2 ZNF502高表达患者预后良好 Fig.2 A high level of ZNF502 expression was associated with a good prognosis

2.3 ZNF502过表达抑制肺腺癌细胞增殖能力(图 3
A, GSEA analysis; B, cell cycle pathway; C, correlation between ZNF502 and G2/M pathway; D, the efficiency of ZNF502 overexpression in A549 cells and knockout in LK2 cells were detected; E, MTT; F, colony formation; G, EdU assay were used to detect the proliferation ability after ZNF502 overexpression or knockout. * P < 0.05;** P < 0.01;*** P < 0.001. 图 3 ZNF502过表达抑制肺腺癌细胞增殖 Fig.3 Overexpression of ZNF502 inhibited the proliferation of lung adenocarcinoma cells

利用linkedomics网站进行在线GSEA富集分析,结果显示,ZNF502主要与细胞周期、帕金森病和泛素化等通路呈负相关(图 3A3B)。对TCGA数据库的肺腺癌数据集进行通路相关性分析,ZNF502与G2/M检查点通路显著负相关(P = 0.013,图 3C)。结果显示,ZNF502可能通过调控细胞周期来影响患者的预后。细胞周期主要控制细胞的增殖能力。Western blotting实验结果显示,ZNF502在A549细胞中被成功过表达,在LK2细胞中被成功敲除(图 3D)。MTS、集落形成实验和EdU增殖实验结果显示,过表达ZNF502显著抑制肺腺癌细胞的增殖能力。而敲除ZNF502则显著增强肺腺癌细胞的增殖能力(图 3E~3G)。

利用linkedomics网站进行在线GSEA富集分析,结果显示,ZNF502主要与细胞周期、帕金森病和泛素化等通路呈负相关(图 3A3B)。对TCGA数据库的肺腺癌数据集进行通路相关性分析,ZNF502与G2/M检查点通路显著负相关(P = 0.013,图 3C)。结果显示,ZNF502可能通过调控细胞周期来影响患者的预后。细胞周期主要控制细胞的增殖能力。Western blotting实验结果显示,ZNF502在A549细胞中被成功过表达,在LK2细胞中被成功敲除(图 3D)。MTS、集落形成实验和EdU增殖实验结果显示,过表达ZNF502显著抑制肺腺癌细胞的增殖能力。而敲除ZNF502则显著增强肺腺癌细胞的增殖能力(图 3E~3G)。

2.4 ZNF502通过激活P53通路抑制细胞周期

利用GEPIA网站对ZNF502和下游基因进行相关性分析,结果显示,ZNF502TP53的表达呈正相关(r = 0.14,P = 0.001 4,图 4A)。接下来在过表达ZNF502的A549细胞中检测p53下游蛋白表达水平。Western blotting实验结果显示,p53,GADD45a表达明显上升,而G2/M检查点关键蛋白CyclinB1和CDK1表达明显下降(图 4B)。在ZNF502敲除的LK2细胞中,上述蛋白表达量的变化恰恰相反(图 4C)。过表达ZNF502可能通过激活p53-GADD45a通路抑制细胞G2/M转化,从而抑制肺腺癌细胞的增殖能力。

A, correlation between ZNF502 and TP53 mRNA; B, Western blotting was used to detect cell cycle-related proteins after ZNF502 overexpression; C, Western blotting was used to detect cell cycle-related proteins after ZNF502 knockout. 图 4 ZNF502通过激活p53通路抑制细胞周期 Fig.4 ZNF502 inhibited the cell cycle by activating the p53 pathway

3 讨论

ZNF502是锌指蛋白转录因子家族的成员,其在肺癌中的表达模式和生物学功能仍未有文献报道。此外,ZNF502表达与患者预后之间的相关性也未见文献报道。本研究结果显示,与癌旁组织相比,ZNF502在肺腺癌组织中的表达相对较低。ZNF502主要定位在细胞核中发挥生物学功能。此外,ZNF502的高表达与患者的良好预后呈正相关,ZNF502或许可以作为一个新的评价肺腺癌良好预后的标志物。而且,ZNF502 mRNA的表达可以作为评估为肺腺癌进展的独立保护因素。

GSEA富集分析以及一系列检测细胞增殖能力的功能学实验表明,ZNF502可能通过调节p53信号通路来抑制细胞增殖能力。ZNF502TP53的表达呈正相关。p53已被证实是调控细胞周期的上游关键因子,发挥抑制肿瘤细胞增殖的作用[9-10]。野生型p53的高表达与肿瘤放化疗敏感性和良好预后密切相关。在基因组受到外界损伤时,p53响应外界刺激,介导细胞周期阻滞,开启DNA损伤修复通路。当基因组损伤不可修复时,p53主要开启细胞凋亡通路,引导细胞程序性死亡[11-12]

本研究进一步采用Western blotting检测p53通路关键下游蛋白。结果显示,ZNF502通过上调p53的表达水平,激活下游关键因子GADD45a,从而使细胞周期阻滞在G2/M检查点。突变型p53在肿瘤中将发挥与野生型p53截然不同的功能[13]。临床约有50%的肺癌患者存在p53突变。p53蛋白可以发挥转录因子的功能,其突变位点主要位于中央的DNA结合结构域。R175、G245、R248、R249、R273和R282是最常见的6个错义突变位点。突变的p53半衰期明显延长,不再具有野生型p53抑制细胞增殖的能力。突变型p53诱导上皮-间充质转化,放化疗抵抗在肿瘤细胞的侵袭和转移中起关键作用[14]。本研究中使用的A549和LK2细胞都不存在p53突变,仅检测了ZNF502对野生型p53的调控作用,ZNF502对突变型p53的影响将在未来的实验中进一步探究。

综上所述,ZNF502在肺腺癌组织中显著低表达,主要定位于细胞核中且与肺腺癌患者的良好预后呈正相关。ZNF502通过激活p53-GADD45a通路抑制细胞G2/M转化,从而抑制肺腺癌细胞的增殖能力。

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