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文章信息
- 许秀燕, 阎婷, 李静, 朱思捷, 张洪江, 周小洁, 佟颖, 张勇
- XU Xiu-yan, YAN Ting, LI Jing, ZHU Si-jie, ZHANG Hong-jiang, ZHOU Xiao-jie, TONG Ying, ZHANG Yong
- 北京市顺义区白纹伊蚊Brevihamaparvovirus属病毒的分离与鉴定
- Isolation and identification of Aedes albopictus Densovirus (Brevihamaparvovirus) in Shunyi District, Beijing, China
- 中国媒介生物学及控制杂志, 2025, 36(1): 4-10
- Chin J Vector Biol & Control, 2025, 36(1): 4-10
- 10.11853/j.issn.1003.8280.2025.01.002
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文章历史
- 收稿日期: 2024-03-26
2 北京市顺义区疾病预防控制中心, 北京 101300
2 Beijing Shunyi District Center for Disease Prevention and Control, Beijing 101300, China
细小病毒是一种无包膜、二十面体形状的单链线性DNA病毒,基因组全长约4~6 kb核苷酸[1]。依据国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)2019年发布的最新病毒学分类报告,细小病毒科(Parvoviridae)分为浓核病毒亚科(Densovirinae)、Hamaparvovirinae亚科和细小病毒亚科(Parvovirinae)3个亚科。新建立的Hamaparvovirinae亚科病毒可以感染脊椎动物和无脊椎动物,包含5个病毒属,分别为Brevihamaparvovirus、Hepanhamaparvovirus、Penstylhamaparvovirus、Ichthamaparvovirus和Chaphamaparvovirus 5个属,其中Brevihamaparvovirus、Hepanhamaparvovirus和Penstylhamaparvovirus病毒属分别包含原浓核病毒亚科中的Brevidensovirus、Hepandensovirus、Penstyldensovirus病毒属[2]。
Brevihamaparvovirus属细小病毒包括3个成员,分别是Brevihamaparvovirus dipteran1、Brevihamaparvovirus dipteran2和Brevihamaparvovirus orthopteran1。Brevihamaparvovirus属病毒具有3个开放阅读框,编码两种非结构蛋白(NS1,NS2)和衣壳蛋白(VP)[3]。目前,Brevihamaparvovirus属病毒仅从蚊虫细胞系和野生蚊虫中分离得到,其宿主特异性强,仅感染蚊类,实验证实其不能感染其他种类昆虫、鱼类、鸟类和包括人类在内的哺乳动物[4-5]。Brevihamaparvovirus属病毒分布广泛,主要来自亚洲[6]、美洲[7]、欧洲[8]和非洲[9]不同种类的伊蚊(Aedes)和库蚊(Culex)。
我国辽宁、云南、贵州、陕西、广东省和新疆维吾尔自治区不同种类的库蚊和伊蚊中均分离出Brevihamaparvovirus属病毒[10]。本研究于2021年6-9月在北京市采集的白纹伊蚊(Ae. albopictus)标本中鉴定出1株Brevihamaparvovirus属病毒。该病毒是全世界范围内在白纹伊蚊的体内或者白纹伊蚊卵细胞(C6/36细胞)系内分离得到的第8株Brevihamaparvovirus属病毒,根据ICTV颁布的病毒分类命名规则将该株病毒命名为Ae. albopictus Densovirus 8(AalDV-8),也是北京市首次从蚊虫野外种群中分离出的Brevihamaparvovirus属病毒。
1 材料与方法 1.1 标本采集2021年6-9月在北京市顺义区的居民区、公园和机场周边采用二氧化碳诱蚊灯法采集蚊虫标本,每月采集1次,共采集4次,采集时间为日落前1 h至次日日出后1 h。将采集的蚊虫活标本放入-20 ℃冰箱中30 min后取出,在冰浴条件下进行标本分类鉴定,并根据采集时间、采集环境等信息进行分装和编号登记。标本放入液氮中保存直至实验室检测[11-12]。
1.2 细胞叙利亚仓鼠肾细胞(BHK-21细胞)和C6/36细胞为本实验室保存。BHK-21细胞培养条件:92%最低必须培养基(minimum essential medium,MEM)(Corning-cellgro,默克生命科学)、7%胎牛血清(Gibco,赛默飞世尔科技公司)、1%青霉素和链霉素(北京雷根生物技术有限公司);C6/36细胞培养条件:89% RPMI 1640培养基(Gibco,赛默飞世尔科技公司)、10%胎牛血清(Gibco,赛默飞世尔科技公司)、1%的青霉素和链霉素(北京雷根生物技术有限公司)。BHK-21和C6/36细胞分别置于含5% CO2的37 ℃培养箱、28 ℃培养箱中培养[13]。
1.3 病毒分离每30只蚊虫为1批,加入1.5 ml研磨液(99%MEM、1%青霉素和链霉素),使用研磨器研磨至标本完全破碎。研磨后离心(4 ℃,13 200 g,30 min),离心后取上清100 µl分别接种到生长至80%的单层BHK-21细胞和C6/36细胞24孔培养板中。接种后的BHK-21细胞和C6/36细胞分别置于含5% CO2的37 ℃和28 ℃条件下连续培养。每12 h在显微镜下观察细胞病变(CPE),细胞出现CPE时收取病毒液保存于-80 ℃超低温冰箱直至进一步鉴定[14]。
1.4 DNA提取按照DNeasy® Blood & Tissue Kit试剂盒(Qiagen)说明书操作步骤提取标本研磨上清的DNA。提取的DNA可立即使用或置于-40 ℃保存备用,并用于后续DNA病毒的检测。
1.5 病毒RNA提取及cDNA文库制备按照Viral RNA Mini Kit试剂盒(Qiagen)的说明书操作步骤提取标本研磨上清的总RNA。提取的总RNA放入65 ℃水浴10 min,然后立即冰浴2 min,取32 μl RNA加入到Ready-To-Go kit试剂盒(GE Healthcare)中的第一链反应管,室温静置1 min,加入1 µl随机引物[pd(N)6]后瞬时离心,37 ℃水浴60 min。如此制备的病毒RNA的cDNA文库总体积为33 µl,可立即使用或置于-40 ℃保存备用,并可用于后续RNA病毒的检测。
1.6 病毒基因扩增与核苷酸序列测定病毒基因扩增体系为25 µl,包括:cDNA模板、GoTaq® Green Master Mix,2×(Promega,Madison,WI)、10 μmol/L的正、反向引物。使用黄病毒属(Flavivirus)引物和甲病毒属(Alphavirus)引物进行半巢式PCR扩增,使用西藏环状病毒(Tibet orbivirus)、盖塔病毒(Getah virus)、辽宁病毒(Liaoning virus)、版纳病毒(Banna virus)、OYA病毒(Oya virus)、Brevihamaparvovirus属病毒特异性引物进行PCR扩增,引物序列见表 1,Brevihamaparvovirus属病毒全基因组编码区序列扩增引物序列见表 2。PCR反应结束后,取5 µl基因扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳检测。基因扩增阳性产物开展核苷酸序列测定[15]。
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将获得的核苷酸序列在美国国立生物技术信息中心(NCBI)网站使用基于局部比对算法的搜索工具(BLAST)进行序列比对。使用SeqMan软件进行核苷酸序列拼接与质量分析;使用BioEdit 7.0.5.3软件进行核苷酸多序列比对;使用MEGA 6.0软件完成基于邻接(neighbour-joining,NJ)法的系统进化分析,bootstrap值设定为1 000[16-17]。
2 结果 2.1 标本采集共采集到白纹伊蚊1 950只,其中在居民区、公园和机场周边分别采集390、330和1 230只。
2.2 病毒初步鉴定将采集的1 950只白纹伊蚊标本分65批研磨处理,每批次30只蚊虫。PCR扩增结果显示,65批白纹伊蚊标本中仅有1批标本(B44株)Brevihamaparvovirus属病毒基因扩增阳性,命名为AalDV-8病毒。B44株的采集地点为机场周边,其他白纹伊蚊标本中均未发现病毒阳性扩增条带。
2.3 病毒分离将Brevihamaparvovirus属病毒基因扩增阳性株B44的研磨上清接种C6/36细胞和BHK-21细胞连续培养,每12 h在光学显微镜下观察细胞是否发生病变。结果表明B44株仅在C6/36细胞发生病变,在接种C6/36细胞第4天出现细胞病变,表现为细胞聚集、脱落等,并可在C6/36细胞中稳定传代,见图 1。
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图 1 AalDV-8病毒分离物接种白纹伊蚊C6/36细胞病变图 Figure 1 Lesions of Aedes albopictus C6/36 cells inoculated with the virus isolate AalDV-8 |
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AalDV-8病毒使用Brevihamaparvovirus属病毒特异性引物进行PCR基因扩增获得约593 bp的特异性扩增产物,序列测定后,通过BLAST比对,与Ae. albopictus Densovirus 7(MK182384.1)同源性 > 98%,提示AalDV-8病毒为Brevihamaparvovirus属病毒。
根据Ae. albopictus Densovirus 7的病毒基因组序列信息,通过Primer-BLAST(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast)设计出可以覆盖全基因组编码区核苷酸序列的扩增引物,见表 2。以B44株的研磨上清所提取的DNA为模板,使用所设计的引物对AalDV-8病毒基因组编码区序列进行PCR扩增与核苷酸序列测定,并对获得的核苷酸序列进行拼接,最终获得基因组编码区全序列信息。AalDV-8病毒的基因组编码区核苷酸和氨基酸序列已上传至GenBank,登录号为OQ878960。
对AalDV-8病毒基因组编码区核苷酸序列的分析结果显示,AalDV-8病毒为单链DNA病毒,该病毒基因组编码区全长为3 335 nt,共编码2个非结构蛋白(NS1、NS2)和1个衣壳蛋白(VP),3种蛋白的核苷酸(氨基酸)序列长度分别为2 376 nt(791 aa)、1 092 nt(363 aa)、1 071 nt(356 aa)。AalDV-8病毒基因组结构见图 2。
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注:AalDV-8按照5′-3′编码NS1、NS2、VP蛋白。 图 2 AalDV-8病毒基因组结构图 Figure 2 Genome structure of AalDV-8 virus |
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制备系统进化分析数据集,使用NJ法构建系统进化树进行系统进化分析,结果显示,Brevihamaparvovirus属病毒可分为2个进化支,第1个进化分支由Ae. albopictus Densovirus 2、Ae. albopictus Densovirus 5、Ae. albopictus Densovirus 7、AalDV-8、Ae. aegypti Densovirus 1、Ae. aegypti Densovirus 2、Cx. pipiens pallens Densovirus、Anopheles gambiae Densovirus组成,大多数从蚊虫中分离而来;第2个进化分支由Ae. albopictus Densovirus 1、Ae. albopictus Densovirus 3、Haemagogus equinus Densovirus组成,主要从实验室细胞系中分离出,AalDV-8病毒位于Brevihamaparvovirus属病毒进化组中的第1个进化分支,并与中国广州市白纹伊蚊中分离的Ae. albopictus Densovirus 7病毒亲缘关系最近。见图 3~6。
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注:图为Hamaparvovirinae亚科病毒全基因的完整核苷酸序列构建的系统进化树,所用数据集为Brevihamaparvovirus属所有病毒及Hamaparvovirinae亚科其他4个属代表株病毒的全基因完整核苷酸序列;各分支基因序列信息排列方式为“检索号/病毒名称/分离株/分离地/分离时间/宿主”;▲表示本研究所获北京市白纹伊蚊分离株AalDV-8。 图 3 AalDV-8病毒的全基因系统进化分析 Figure 3 Phylogenetic analysis of the whole genome of AalDV-8 virus |
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注:图为Brevihamaparvovirus属病毒的非结构蛋白NS1基因的完整核苷酸序列构建的系统进化树;各分支基因序列信息排列方式为“检索号/病毒名称/分离株/分离地/分离时间/宿主”;▲表示本研究所获北京市白纹伊蚊分离株AalDV-8。 图 4 AalDV-8病毒的非结构蛋白NS1基因系统进化分析 Figure 4 Phylogenetic analysis of non-structural protein NS1 gene AalDV-8 virus |
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注:图为Brevihamaparvovirus属病毒的非结构蛋白NS2基因的完整核苷酸序列构建的系统进化树;各分支基因序列信息排列方式为“检索号/病毒名称/分离株/分离地/分离时间/宿主”;▲表示本研究所获北京市白纹伊蚊分离株AalDV-8。 图 5 AalDV-8病毒的非结构蛋白NS2基因系统进化分析 Figure 5 Phylogenetic analysis of non-structural protein NS2 gene of AalDV-8 virus |
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注:图为Brevihamaparvovirus属病毒衣壳蛋白(VP)基因的完整核苷酸序列构建的系统进化树;各分支基因序列信息排方式为“检索号/病毒名称/分离株/分离地/分离时间/宿主”;▲表示本研究所获北京市白纹伊蚊分离株AalDV-8。 图 6 AalDV-8病毒的衣壳蛋白(VP)基因系统进化分析 Figure 6 Phylogenetic analysis of capsid protein (VP) gene of AalDV-8 virus |
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在过去10年中,除了发现许多与嗜血节肢动物相关的致病病毒外,许多研究还揭示了大量所谓的昆虫特异性病毒(insect-specific viruses,ISV),这些病毒在脊椎动物细胞中都具有受限/零复制能力[18],其中就包括Brevihamaparvovirus属的病毒[19]。
在白纹伊蚊体内或者白纹伊蚊C6/36细胞系内已分离到7株Brevihamaparvovirus属病毒,AalDV-1~AalDV-4分别分离自美国[20]、广州[21]、秘鲁[22]和泰国[23]的C6/36细胞系,AalDV-5[22]、AalDV-6[24]和AalDV-7[22]分离自广州市白纹伊蚊野外种群,本研究于2021年6-9月在北京市采集的白纹伊蚊标本中分离获得的AalDV-8病毒是由白纹伊蚊分离得到的第8株病毒,这是首次从北京市蚊虫野外种群中分离出Brevihamaparvovirus属病毒。
截止目前,Brevihamaparvovirus病毒属病毒仅从蚊虫细胞系和野生蚊虫中分离得到,属于蚊虫特异性病毒[4-5],特异性感染蚊类,可以在自然界中垂直和水平传播,高滴度病毒可以直接杀伤蚊类,低滴度可以影响蚊类寿命、产卵量、孵化率等,从而降低蚊虫种群数量[22]。目前多种Brevihamaparvovirus属病毒的全基因组已经成功构建为感染性克隆质粒载体,便于进行基因改造使其成为优良的基因转移载体和基因表达载体[22]。有研究以Ae. aegypti Densovirus为载体,表达东亚钳蝎(Buthus martensii)特异性神经毒素Bm KIT,增强病毒的杀伤效果,因而可通过基因工程方法有效增加野生型Ae. aegypti Densovirus的毒性,成为生物杀虫剂或者基因表达载体[25]。有研究表明,广州白纹伊蚊分离的Ae. albopictus Densovirus 7病毒有望成为生物杀虫剂或者基因表达载体,本研究分离的AalDV-8病毒与Ae. albopictus Densovirus 7病毒具有相同的病毒基因组结构和基因组长度。系统进化分析结果显示,无论病毒全基因组序列,还是NS1、NS2和VP基因,AalDV-8病毒与此前分离的Ae. albopictus Densovirus 7病毒亲缘关系最近,均处在共同的进化分支。因此,对AalDV-8病毒进行分离和鉴定,分析其分子生物学和病原性特点,探索AalDV-8病毒作为生物杀虫剂和基因表达载体的可能性,可为发展生物杀虫剂提供更多可替代的选择。
利益冲突 无
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