中国媒介生物学及控制杂志  2022, Vol. 33 Issue (4): 503-509

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孔逸尘, 田佳伟, 杨字, 殷红敏, 黄皓, 陈利, 张云智
KONG Yi-chen, TIAN Jia-wei, YANG Zi, YIN Hong-min, HUANG Hao, CHEN Li, ZHANG Yun-zhi
云南省大理市黄胸鼠恙虫病东方体的分离、鉴定及56 kDa型特异性抗原基因特征的研究
Isolation, identification, and 56 kDa type-specific antigen gene characterization of Orientia tsutsugamushi from Rattus tanezumi in Dali, Yunnan province, China
中国媒介生物学及控制杂志, 2022, 33(4): 503-509
Chin J Vector Biol & Control, 2022, 33(4): 503-509
10.11853/j.issn.1003.8280.2022.04.012

文章历史

收稿日期: 2022-03-22
云南省大理市黄胸鼠恙虫病东方体的分离、鉴定及56 kDa型特异性抗原基因特征的研究
孔逸尘1 , 田佳伟1 , 杨字1 , 殷红敏1 , 黄皓1 , 陈利2 , 张云智1     
1 大理大学公共卫生学院, 大理大学预防医学研究所, 云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室(培育), 云南省高校人兽共患病跨境防控与检疫重点实验室, 云南 大理 671000;
2 昆明医科大学公共卫生学院, 云南 昆明 650000
摘要: 目的 从云南省大理市啮齿动物中分离和鉴定恙虫病东方体(Orientia tsutsugamsushi,Ot),并对分离到的Ot 56 kDa型特异性抗原(56 kDa TSA)基因全长进行扩增分析。方法 2020年8月-2021年8月采用夹夜法,在大理市4个乡(镇)采集啮齿动物样本,巢氏PCR扩增Ot保守基因,阳性样品采用小鼠腹腔接种法分离Ot。分离到的Ot用吉姆萨染色观察和间接免疫荧光试验进行鉴定,设计引物扩增Ot的56 kDa TSA全长,用MEGA Ⅹ、DNAStar 7.1、SeqMan等生物信息学软件进行同源性与遗传进化分析。结果 共捕获啮齿动物5属6种76只,从1只黄胸鼠肝、脾组织研磨液中扩增出了Ot序列,阳性率为2.38%(1/42)。分离和鉴定了1株Ot,命名为DALIV8。该分离株56 kDa TSA基因全长1 566 bp,编码521个氨基酸(GenBank:OM914742)。DALIV8株56 kDa TSA基因在核苷酸水平与Kawasaki、Boryong、Karp、Kato、TA763基因型相似性为82.30%~98.85%,在氨基酸水平相似性为74.04%~98.28%。该Ot分离株为TA763基因型。结论 云南省大理市黄胸鼠Ot分离株DALIV8,经对其56 kDa TSA基因的分子鉴定,确定为云南省首次分离获得Ot TA763基因型。
关键词: 恙虫病东方体    分离    鉴定    基因特征    大理    
Isolation, identification, and 56 kDa type-specific antigen gene characterization of Orientia tsutsugamushi from Rattus tanezumi in Dali, Yunnan province, China
KONG Yi-chen1 , TIAN Jia-wei1 , YANG Zi1 , YIN Hong-min1 , HUANG Hao1 , CHEN Li2 , ZHANG Yun-zhi1     
1 Institute of Preventive Medicine, School of Public Health, Dali University, Yunnan Key Laboratory of Screening and Research on Anti-pathogenic Plant Resources from Western Yunnan (Cultivation), Yunnan Key Laboratory of Zoonotic Disease Cross-border Prevention and Quarantine, Dali, Yunnan 671000, China;
2 School of Public Health, Kunming Medical University, Kunming, Yunnan 650000, China
Abstract: Objective To isolate and identify Orientia tsutsugamushi from rodents in Dali city, Yunnan province, China, and to amplify and analyze its full-length 56 kDa type-specific antigen (TSA) gene. Methods From August 2020 to August 2021, rodents were collected from four townships in Dali city using the night trapping method. Nested polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify the conserved sequence of O. tsutsugamushi. PCR-positive samples were taken to intraperitoneally inoculate mice to isolate O. tsutsugamushi. The isolated O. tsutsugamushi was identified by observation with Giemsa staining and indirect immunoassay. Primers were designed to amplify the full-length 56 kDa TSA gene of O. tsutsugamushi. Bioinformatics software (MEGA Ⅹ, DNAStar 7.1, and SeqMan) was used for homology and phylogenetic analyses. Results A total of 76 rodents were captured, including 6 species under 5 genera. PCR detected the sequence of O. tsutsugamushi from the liver and spleen tissue homogenate of a Rattus tanezumi, with a positive rate of 2.38% (1/42). One strain named DALIV8 was isolated and identified as O. tsutsugamushi. The full-length 56 kDa TSA gene of this isolate was 1 566 bp, encoding 521 amino acids (GenBank: OM914742). The 56 kDa TSA gene of the DALIV8 strain showed similarities of 82.30%-98.85% at the nucleotide level and 74.04%-98.28% at the amino acid level to the Kawasaki, Boryong, Karp, Kato, and TA763 genotypes. So, the isolate was identified as the TA763 genotype. Conclusion The DALIV8 strain isolated from R. tanezumi in Dali city is firstly recorded as the TA763 genotype of O. tsutsugamushi in Yunnan province, China.
Key words: Orientia tsutsugamushi    Isolation    Identification    Molecular characteristic    Dali    

恙虫病又称丛林斑疹伤寒,是一种以啮齿动物为主要传染源,恙虫病东方体(Orientia tsutsugamsushi,Ot)为病原体,通过恙螨幼虫叮咬而传播的自然疫源性疾病。Ot为革兰阴性专性胞内寄生的杆菌,属于立克次体目(Rickettsiales)、立克次体科(Rickettsiaceae)、东方体属(Orientia)。目前Ot的分离方法主要是小鼠腹腔接种法,也可通过注射雄性豚鼠睾丸分离。培养方式多采用哺乳动物组织细胞培养[1],如L929、Vero、Hela细胞等,目前Ot也有在人类宿主细胞内的传统血液培养基中存活并生长的证据[2]。Ot也可采用鸡胚卵黄囊培养,鸡胚培养多采用7~9 d的受精卵进行卵黄囊接种。Ot的初始浓度及相关的因素,可能是其分离成功的主要因素[3]

以往Ot依靠血清学方法进行分型、吉姆萨染色观察、外斐试验以及酶联免疫吸附试验(ELISA)等方式鉴定,随着分子生物学的发展,可以通过基因测序等方式鉴定。Ot的基因分型主要包括Karp、Kato、Gilliam、TA763、TA678、TA716、Kawasaki、Kuroki和Shimoloshi等,这些基因分型主要通过相对分子质量56 000的表面蛋白基因来区分。Ot的56 kDa型特异性抗原(56-kDa type-specific antigen,56 kDa TSA)基因开放阅读框在1 600 bp左右,含有516~541个氨基酸,是PCR检测最常用的扩增靶基因,巢式PCR检测可提高检测灵敏度和特异度。Ot的16S rRNA和groEL等基因序列相对保守,主要用来进行分类,无法对Ot的遗传多样性研究提供有用的数据[4]。本文对云南省大理市捕获的啮齿动物进行Ot分离、鉴定并对56 kDa TSA基因分子特性进行了研究,现报告如下。

1 材料与方法 1.1 样本采集及物种鉴定

2020年8月-2021年8月在云南省大理市的银桥、大理、下关和凤仪4个乡(镇),以油炸食物为诱饵,放置鼠夹,采用夹夜法进行啮齿动物调查。捕获的啮齿动物立即带回实验室,进行形态学鉴定,同时利用PCR扩增肝组织DNA的线粒体细胞色素b(mt-Cytb)基因,进行分子生物学鉴定。记录所捕获动物的种类、地理位置、海拔高度及空气湿度。样本进行无菌解剖,分别采集心、肝、脾、肺、肠双份组织样品置于冻存管中,-80 ℃保存,1份用于Ot检测,另1份检测阳性的组织样品用于Ot分离。

1.2 DNA提取

Ot检测:无菌剪取用于检测的啮齿动物样品,约0.1 g肝或脾组织放入GeneReady动物PIII粉碎管(杭州遂真生物技术有限公司)中,加入灭菌的500 μl 7.4磷酸盐缓冲溶液(PBS),再置于GeneReady Ultimate生物样本低温快速制备离心系统(杭州遂真生物技术有限公司)中进行研磨。研磨条件根据说明书的标准程序设定。核酸提取采用DNA提取试剂盒(北京天根生化科技有限公司),制备步骤按照说明书进行。Ot的巢氏PCR检测引物按照文献[5]针对Ot的56 kDaTSA基因进行扩增:Ot-Out-F1:5'-TACATTAGCTGCGGGTATGACA-3';Ot-Out-R1:5'-CCAGCATAATTCTTCAACCAAG-3';Ot-In-F2:5'-GAGCAGAGCTAGGTGTTATGTA-3';Ot-In-R2:5'-TAGGCATTATAGTAGGCTGAGG-3'。Ot-Out-F1与Ot-Out-R1配对扩增:306~339 bp;Ot-In-F2与Ot-In-R2配对扩增:150~168 bp。

1.3 Ot分离

通过巢氏PCR检测,DNA测序为Ot阳性的标本,取出另1份,将肝、脾各取0.5 g放入研磨管内,加入500 μl的PBS,研磨匀浆。自然沉降匀浆液,腹腔注射ICR(Institute of Cancer Research,ICR,美国肿瘤研究所)小鼠(体质量12~14 g,3周龄),每份样品接种3只,每只200 μl。每日观察小鼠状态,濒死小鼠立即解剖观察其脏器改变,存活小鼠在接种12~14 d后处死。用同样方法盲传2代,健康小鼠腹腔注射等量生理盐水作为实验对照组。

1.4 吉姆萨染色与镜检

参考Solarbio吉姆萨原液说明配制吉姆萨工作液,对小鼠的腹膜、脾脏、肝脏和肾脏涂片,甲醇固定后,进行吉姆萨染色,通过光学显微镜观察Ot形态。

1.5 间接免疫荧光试验(IFA)

将接种的小鼠脏器组织用冰冻切片机(LEICA CM3050 S)切成10 μm左右薄片,将切片室温晾干后,用冰丙酮固定,4 ℃过夜。加入人抗恙虫病的血清抗体(1∶40)作为一抗,湿盒中37 ℃孵育1 h,7.4 PBS洗涤3次。晾干后再加入荧光标记的兔抗人IgG抗体(1∶100)作为二抗,37 ℃孵育1 h,用PBS再次洗涤3次,晾干封片。荧光显微镜(LEICA 329-2)观察结果。

1.6 56 kDa TSA基因全长的扩增 1.6.1 引物的设计与合成

对分离的Ot用引物行走(primer-walking)法进行56 kDa TSA基因全长的扩增。首先根据1.2扩增的部分56 kDa TSA基因序列,通过BLAST比对,下载相似性高的Ot 56 kDa TSA全长序列,再进行ClustalⅩ2比对。用DNAStar 7.1软件设计引物,引物由Invitrogen公司合成(表 1),拼接出Ot 56kDa TSA全长。

表 1 本研究扩增恙虫病东方体56 kDa TSA基因全长所设计的引物 Table 1 Primers designed to amplify full-length 56 kDa type-specific antigen gene of Orientia tsutsugamushi in this study
1.6.2 PCR扩增

根据2×EasyTaq®PCR SuperMix酶的使用说明、引物的选择和扩增序列的长短不同,因而有不同的扩增条件。共使用3对半巢氏PCR进行扩增:①ICR-Ot-F1~29与ICR-Ot-R876~901配对扩增901 bp,ICR-Ot-F1~29与ICR-Ot-R876~901配对扩增739 bp;②ICR-Ot-F265~286与ICR-Ot-R993~1012配对扩增748 bp,ICR-Ot-F351~373与ICR-Ot-R993~1012配对扩增662 bp;③ICR-Ot-F715~737与ICR-Ot-R1546~1566配对扩增852 bp,ICR-Ot-F876~901与ICR-Ot-R1546~1566配对扩增691 bp。PCR循环扩增条件为:95 ℃预变性3 min;95 ℃ 15 s,55~60 ℃ 15 s,72 ℃ 45 s,30次循环;72 ℃延伸10 min。然后将PCR产物进行第2轮PCR,最终扩增出对应的PCR产物为1 566 bp。利用E.Z.N.A® Gel Extraction Kit试剂盒将PCR产物纯化,进行Easy-T载体克隆,每份样品送3个克隆子到生工生物工程(上海)股份有限公司进行DNA测序。

1.6.3 基因序列的拼接

序列由SeqMan组装并手动编辑,拼接获得Ot的56 kDa TSA基因组最终序列。

1.6.4 基因同源性分析

用BLASTN和BLASTX确定核苷酸序列和推导的氨基酸序列与NCBI/GenBank数据库序列的相似性。并用所分离得到的菌株56 kDa TSA全基因序列及其氨基酸序列使用Megalign程序与Karp、Boryong、Kato、TA763、Kawasaki 5标准株以及9株DALIV8相似株进行同一性比较。

1.7 遗传进化分析

将所测得拼接好的序列与GenBank中Ot的核苷酸序列做BLAST分析比较。运用MEGA Ⅹ软件中的邻接法(neighbor-joining method,NJ法)构建系统发育树,自展值取1 000,距离由最大似然数法计算。

2 结果 2.1 样本采集及Ot检测结果

在大理市4个乡(镇)共捕获啮齿动物5属6种76只,其中黄胸鼠(Rattus tanezumi)占55.26%(42/76)、褐家鼠(R. norvegicus)占35.53%(27/76)、高山姬鼠(Apodemus chevrieri)占3.95%(3/76)、大绒鼠(Eothenomys miletus)占2.62%(2/76)、针毛鼠(Niviventer fulvescens)占1.32%(1/76)、锡金小鼠(Mus pahari)占1.32%(1/76),黄胸鼠和褐家鼠为优势种。经PCR检测从1只黄胸鼠的肝、脾组织研磨液中扩增出Ot序列,阳性率为2.38%(1/42),其他啮齿动物未扩增出Ot。

2.2 Ot分离与鉴定

将检测阳性的黄胸鼠肝、脾样本研磨接种3只ICR小鼠后盲传2代,共计接种12只,有3只接种后第14天死亡,其余小鼠存活,均观察到闭目、耸肩、毛皮发皱、颤抖、呼吸急促和不喜活动等症状。对接种Ot组与接种生理盐水对照组进行比较发现,感染组出现肝脾肿大,少量腹水。感染小鼠的脾脏体积增大3~5倍,肝脏体积增大1.5~3倍,肝脏、脾脏以及肾脏用肉眼观察出现充血红肿的表征(图 1)。感染小鼠组通过PCR检测阳性,将该分离株命名为DALIV8株。经过吉姆萨染色Ot,呈着色深染的紫红色颗粒,通常围绕在细胞核周围的胞质内(图 2),大小为(0.3~0.5)μm×(1.2~3.0)μm,呈短杆状、圆形等形态,偶在镜下可观察到Ot从细胞内释放的过程。

注:A对照组,未感染恙虫病东方体(Ot)小鼠脾脏;B实验组,感染Ot小鼠的脾脏。 图 1 恙虫病东方体感染ICR小鼠脾脏的比较 Figure 1 Appearances of spleen from ICR mice with and without Orientia tsutsugamushi infection
注:箭头所示为恙虫病东方体 图 2 恙虫病东方体感染ICR小鼠的肾脏组织涂片镜检结果(吉姆萨染色,×1 000) Figure 2 Microscopic findings of renal smear from ICR mice infected with Orientia tsutsugamushi (Giemsa-stained, ×1 000)
2.3 IFA在脾、肾、肝组织的表现

对2只接种感染Ot的ICR小鼠的肝、脾、肾组织进行冷冻切片,结果与健康ICR小鼠比较发现,Ot抗原颗粒在小白鼠动物模型的肝细胞胞浆内呈散在分布的阳性反应,荧光阳性亮度在脾脏组织内最强,在肾脏组织内最弱(图 3)。通过对比结果发现,Ot抗原颗粒在肾脏内的荧光亮度弱,较少出现在细胞胞浆内,与健康肾脏对比特异性并不明显。

注:A感染恙虫病东方体(Ot)小鼠脾脏组织;B感染Ot小鼠肝脏组织;C感染Ot小鼠肾脏组织;D未感染Ot小鼠脾脏组织;E未感染Ot小鼠肝脏组织;F未感染Ot小鼠肾脏组织。 图 3 ICR小鼠不同组织的间接免疫荧光试验结果(×400) Figure 3 Indirect immunofluorescence results of different tissues of ICR mice (×400)
2.4 Ot分离株56 kDa TSA基因全长的扩增与相似性比较

通过PCR扩增,拼接获得DALIV8株56 kDa TSA基因核苷酸序列全长为1 566 bp,编码521个氨基酸。通过与表 2中从GenBank下载的14株Ot基因序列进行相似性比较,DALIV8株56 kDa TSA在核苷酸水平与Kawasaki、Boryong、Karp、Kato和TA763基因型相似性为82.30%~98.85%;在氨基酸水平相似性为74.04%~98.28%,该Ot分离株为TA763基因型(GenBank:OM914742)。见表 3

表 2 本实验中使用的恙虫病东方体菌株背景信息 Table 2 Background information of Orientia tsutsugamushi strains used in this study
表 3 DALIV8分离株与其他Ot菌株56 kDa TSA全长核苷酸序列和氨基酸序列同源性比对 Table 3 Nucleotide and amino acid sequence alignment results of full-length 56 kDa type-specific antigen gene of DALIV8 strain with other reference Ot strains

将Ot分离株56 kDa TSA基因全长与TA763基因型最相似的HL03-1、KL0807a、Hualien-14和标准株TA763进行氨基酸比较,结果见图 4

注:根据同源序列相似性进行上色,黑色为高度相似区域(保守性100%),灰色为相似区域(保守性60%~80%)。 图 4 DALIV8与4株TA763型56 kDa TSA基因氨基酸序列比较 Figure 4 Similarities in amino acid sequence of 56 kDa type-specific antigen gene between DALIV8 strain and four TA763 stains
2.5 Ot分离株遗传进化分析

将DALIV8株56 kDa TSA全基因序列与GenBank下载的Karp、Boryong、Kato、TA763和Kawasaki基因型的56 kDa TSA基因序列15株,基于核苷酸水平建立了系统发育树。系统发育树上DALIV8分离株与其他TA763聚集成一簇,在同一分支。见图 5

注:●为本次实验的恙虫病东方体分离株(DALIV8)。 图 5 DALIV8分离株基于56 kDa TSA基因全长的核苷酸水平系统发育树 Figure 5 Phylogenetic tree of DALIV8 isolate based on full-length 56 kDa type-specific antigen gene at nucleotide level
3 讨论

恙虫病在我国广泛分布,2006年后,云南省成为恙虫病的主要高发区之一[6-7],以黄胸鼠和褐家鼠为主要宿主动物,地理纤恙螨(Leptotrombidium deliense)为主要传播媒介[8]。本研究在大理市捕获的啮齿动物中调查发现,虽然只有1只黄胸鼠为Ot PCR检测阳性,通过ICR小鼠仍分离到1株Ot,提示ICR小鼠用于Ot的分离相对比较敏感。

IFA发现小鼠肝细胞胞浆内呈散在分布的阳性反应,提示Ot感染会导致一定程度的肝损伤[9]。其中脾脏阳性荧光分布最多,脾脏是恙虫病主要的靶器官。有学者研究表明,Ot通过足部感染后,向肺和心脏组织有明显的趋向性[10]

全世界已分离出40多种Ot血清型或抗原株[11],传统的血清分型是一个复杂的程序,需要参考血清和抗原,也会出现一些非特异性结合干扰结果的判断,因而用血清学方法进行Ot分型受许多因素的影响[12]。ELISA尽管检测Ot特异性IgM抗体具有良好的敏感性和特异性,但对于诊断时间 < 7 d的早期疾病,PCR是实验室诊断确认的首选方法[13]。利用分子生物学方法应用于Ot基因分型,可以揭示Ot菌株之间的遗传多样性。

本研究明确了DALIV8分离株为TA763型,TA763型首先从泰国王鼠(R. rajah)中分离到[14]。我国Ot基因型分布,Karp型和Gilliam型在长江以南地区最为普遍,而Kawasaki型和Gilliam型主要分布在长江以北地区[15],云南省主要存在Karp、Kato和Gilliam型流行[16],本研究首次分离到TA763型,该基因型在云南省的分布有待于进一步研究。

56 kDa TSA是Ot特有的一种免疫显性外膜蛋白,是Ot特异性抗原。DALIV8分离株Ot在多个氨基酸位点发生改变,如在第37位A(丙氨酸)变为G(甘氨酸)、48位G(甘氨酸)变为S(丝氨酸)、52位A(丙氨酸)变为T(苏氨酸)、60位E(谷氨酸)变为D(天冬氨酸)。这4个突变位点是否影响Ot的抗原性或致病性,有待于进一步研究。

恙虫病是抗生素可治愈的疾病,如不加以适当的治疗,病死率可达30%~50%[17]。恙虫病主要影响卫生基础设施较差的农村地区,但随着人员流动、旅游等,恙虫病的发病率逐年上升,广东、海南、广西、福建、浙江、云南、四川、湖南、海南和台湾等省(自治区)存在恙虫病自然疫源地,截至2015年,我国的34个省级行政区中,只有青海省和宁夏回族自治区无恙虫病病例报道[18],恙虫病已成为我国公共卫生关注问题。恙虫病的临床表现多种多样,包括焦痂、斑疹、肺炎、感染性休克和脑膜脑炎等,与疟疾和登革热等相似,虽然存在有效的治疗方案,但是尚无高效率特异性的诊断方法,在临床上诊断困难,加之目前为止还没有有效的疫苗[19],所以研制成功的Ot疫苗是目前急需解决的问题;治疗恙虫病的氯霉素、四环素等抗生素,对孕妇和儿童的副作用大,抗生素已成为一个重大的全球卫生保健问题,持续使用不同的抗生素治疗Ot可能导致多重耐药菌株的产生[20],因而有必要研发治疗恙虫病副作用小而又抗耐药的药物。而Ot的分离是相关问题解决的前提。本研究基于Ot的菌株分离,了解其分子特性,为明确恙虫病发病机制及药物和疫苗研发奠定了基础。

利益冲突  无

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