扩展功能
文章信息
- 孔逸尘, 田佳伟, 杨字, 殷红敏, 黄皓, 陈利, 张云智
- KONG Yi-chen, TIAN Jia-wei, YANG Zi, YIN Hong-min, HUANG Hao, CHEN Li, ZHANG Yun-zhi
- 云南省大理市黄胸鼠恙虫病东方体的分离、鉴定及56 kDa型特异性抗原基因特征的研究
- Isolation, identification, and 56 kDa type-specific antigen gene characterization of Orientia tsutsugamushi from Rattus tanezumi in Dali, Yunnan province, China
- 中国媒介生物学及控制杂志, 2022, 33(4): 503-509
- Chin J Vector Biol & Control, 2022, 33(4): 503-509
- 10.11853/j.issn.1003.8280.2022.04.012
-
文章历史
- 收稿日期: 2022-03-22
2 昆明医科大学公共卫生学院, 云南 昆明 650000
2 School of Public Health, Kunming Medical University, Kunming, Yunnan 650000, China
恙虫病又称丛林斑疹伤寒,是一种以啮齿动物为主要传染源,恙虫病东方体(Orientia tsutsugamsushi,Ot)为病原体,通过恙螨幼虫叮咬而传播的自然疫源性疾病。Ot为革兰阴性专性胞内寄生的杆菌,属于立克次体目(Rickettsiales)、立克次体科(Rickettsiaceae)、东方体属(Orientia)。目前Ot的分离方法主要是小鼠腹腔接种法,也可通过注射雄性豚鼠睾丸分离。培养方式多采用哺乳动物组织细胞培养[1],如L929、Vero、Hela细胞等,目前Ot也有在人类宿主细胞内的传统血液培养基中存活并生长的证据[2]。Ot也可采用鸡胚卵黄囊培养,鸡胚培养多采用7~9 d的受精卵进行卵黄囊接种。Ot的初始浓度及相关的因素,可能是其分离成功的主要因素[3]。
以往Ot依靠血清学方法进行分型、吉姆萨染色观察、外斐试验以及酶联免疫吸附试验(ELISA)等方式鉴定,随着分子生物学的发展,可以通过基因测序等方式鉴定。Ot的基因分型主要包括Karp、Kato、Gilliam、TA763、TA678、TA716、Kawasaki、Kuroki和Shimoloshi等,这些基因分型主要通过相对分子质量56 000的表面蛋白基因来区分。Ot的56 kDa型特异性抗原(56-kDa type-specific antigen,56 kDa TSA)基因开放阅读框在1 600 bp左右,含有516~541个氨基酸,是PCR检测最常用的扩增靶基因,巢式PCR检测可提高检测灵敏度和特异度。Ot的16S rRNA和groEL等基因序列相对保守,主要用来进行分类,无法对Ot的遗传多样性研究提供有用的数据[4]。本文对云南省大理市捕获的啮齿动物进行Ot分离、鉴定并对56 kDa TSA基因分子特性进行了研究,现报告如下。
1 材料与方法 1.1 样本采集及物种鉴定2020年8月-2021年8月在云南省大理市的银桥、大理、下关和凤仪4个乡(镇),以油炸食物为诱饵,放置鼠夹,采用夹夜法进行啮齿动物调查。捕获的啮齿动物立即带回实验室,进行形态学鉴定,同时利用PCR扩增肝组织DNA的线粒体细胞色素b(mt-Cytb)基因,进行分子生物学鉴定。记录所捕获动物的种类、地理位置、海拔高度及空气湿度。样本进行无菌解剖,分别采集心、肝、脾、肺、肠双份组织样品置于冻存管中,-80 ℃保存,1份用于Ot检测,另1份检测阳性的组织样品用于Ot分离。
1.2 DNA提取Ot检测:无菌剪取用于检测的啮齿动物样品,约0.1 g肝或脾组织放入GeneReady动物PIII粉碎管(杭州遂真生物技术有限公司)中,加入灭菌的500 μl 7.4磷酸盐缓冲溶液(PBS),再置于GeneReady Ultimate生物样本低温快速制备离心系统(杭州遂真生物技术有限公司)中进行研磨。研磨条件根据说明书的标准程序设定。核酸提取采用DNA提取试剂盒(北京天根生化科技有限公司),制备步骤按照说明书进行。Ot的巢氏PCR检测引物按照文献[5]针对Ot的56 kDaTSA基因进行扩增:Ot-Out-F1:5'-TACATTAGCTGCGGGTATGACA-3';Ot-Out-R1:5'-CCAGCATAATTCTTCAACCAAG-3';Ot-In-F2:5'-GAGCAGAGCTAGGTGTTATGTA-3';Ot-In-R2:5'-TAGGCATTATAGTAGGCTGAGG-3'。Ot-Out-F1与Ot-Out-R1配对扩增:306~339 bp;Ot-In-F2与Ot-In-R2配对扩增:150~168 bp。
1.3 Ot分离通过巢氏PCR检测,DNA测序为Ot阳性的标本,取出另1份,将肝、脾各取0.5 g放入研磨管内,加入500 μl的PBS,研磨匀浆。自然沉降匀浆液,腹腔注射ICR(Institute of Cancer Research,ICR,美国肿瘤研究所)小鼠(体质量12~14 g,3周龄),每份样品接种3只,每只200 μl。每日观察小鼠状态,濒死小鼠立即解剖观察其脏器改变,存活小鼠在接种12~14 d后处死。用同样方法盲传2代,健康小鼠腹腔注射等量生理盐水作为实验对照组。
1.4 吉姆萨染色与镜检参考Solarbio吉姆萨原液说明配制吉姆萨工作液,对小鼠的腹膜、脾脏、肝脏和肾脏涂片,甲醇固定后,进行吉姆萨染色,通过光学显微镜观察Ot形态。
1.5 间接免疫荧光试验(IFA)将接种的小鼠脏器组织用冰冻切片机(LEICA CM3050 S)切成10 μm左右薄片,将切片室温晾干后,用冰丙酮固定,4 ℃过夜。加入人抗恙虫病的血清抗体(1∶40)作为一抗,湿盒中37 ℃孵育1 h,7.4 PBS洗涤3次。晾干后再加入荧光标记的兔抗人IgG抗体(1∶100)作为二抗,37 ℃孵育1 h,用PBS再次洗涤3次,晾干封片。荧光显微镜(LEICA 329-2)观察结果。
1.6 56 kDa TSA基因全长的扩增 1.6.1 引物的设计与合成对分离的Ot用引物行走(primer-walking)法进行56 kDa TSA基因全长的扩增。首先根据1.2扩增的部分56 kDa TSA基因序列,通过BLAST比对,下载相似性高的Ot 56 kDa TSA全长序列,再进行ClustalⅩ2比对。用DNAStar 7.1软件设计引物,引物由Invitrogen公司合成(表 1),拼接出Ot 56kDa TSA全长。
1.6.2 PCR扩增根据2×EasyTaq®PCR SuperMix酶的使用说明、引物的选择和扩增序列的长短不同,因而有不同的扩增条件。共使用3对半巢氏PCR进行扩增:①ICR-Ot-F1~29与ICR-Ot-R876~901配对扩增901 bp,ICR-Ot-F1~29与ICR-Ot-R876~901配对扩增739 bp;②ICR-Ot-F265~286与ICR-Ot-R993~1012配对扩增748 bp,ICR-Ot-F351~373与ICR-Ot-R993~1012配对扩增662 bp;③ICR-Ot-F715~737与ICR-Ot-R1546~1566配对扩增852 bp,ICR-Ot-F876~901与ICR-Ot-R1546~1566配对扩增691 bp。PCR循环扩增条件为:95 ℃预变性3 min;95 ℃ 15 s,55~60 ℃ 15 s,72 ℃ 45 s,30次循环;72 ℃延伸10 min。然后将PCR产物进行第2轮PCR,最终扩增出对应的PCR产物为1 566 bp。利用E.Z.N.A® Gel Extraction Kit试剂盒将PCR产物纯化,进行Easy-T载体克隆,每份样品送3个克隆子到生工生物工程(上海)股份有限公司进行DNA测序。
1.6.3 基因序列的拼接序列由SeqMan组装并手动编辑,拼接获得Ot的56 kDa TSA基因组最终序列。
1.6.4 基因同源性分析用BLASTN和BLASTX确定核苷酸序列和推导的氨基酸序列与NCBI/GenBank数据库序列的相似性。并用所分离得到的菌株56 kDa TSA全基因序列及其氨基酸序列使用Megalign程序与Karp、Boryong、Kato、TA763、Kawasaki 5标准株以及9株DALIV8相似株进行同一性比较。
1.7 遗传进化分析将所测得拼接好的序列与GenBank中Ot的核苷酸序列做BLAST分析比较。运用MEGA Ⅹ软件中的邻接法(neighbor-joining method,NJ法)构建系统发育树,自展值取1 000,距离由最大似然数法计算。
2 结果 2.1 样本采集及Ot检测结果在大理市4个乡(镇)共捕获啮齿动物5属6种76只,其中黄胸鼠(Rattus tanezumi)占55.26%(42/76)、褐家鼠(R. norvegicus)占35.53%(27/76)、高山姬鼠(Apodemus chevrieri)占3.95%(3/76)、大绒鼠(Eothenomys miletus)占2.62%(2/76)、针毛鼠(Niviventer fulvescens)占1.32%(1/76)、锡金小鼠(Mus pahari)占1.32%(1/76),黄胸鼠和褐家鼠为优势种。经PCR检测从1只黄胸鼠的肝、脾组织研磨液中扩增出Ot序列,阳性率为2.38%(1/42),其他啮齿动物未扩增出Ot。
2.2 Ot分离与鉴定将检测阳性的黄胸鼠肝、脾样本研磨接种3只ICR小鼠后盲传2代,共计接种12只,有3只接种后第14天死亡,其余小鼠存活,均观察到闭目、耸肩、毛皮发皱、颤抖、呼吸急促和不喜活动等症状。对接种Ot组与接种生理盐水对照组进行比较发现,感染组出现肝脾肿大,少量腹水。感染小鼠的脾脏体积增大3~5倍,肝脏体积增大1.5~3倍,肝脏、脾脏以及肾脏用肉眼观察出现充血红肿的表征(图 1)。感染小鼠组通过PCR检测阳性,将该分离株命名为DALIV8株。经过吉姆萨染色Ot,呈着色深染的紫红色颗粒,通常围绕在细胞核周围的胞质内(图 2),大小为(0.3~0.5)μm×(1.2~3.0)μm,呈短杆状、圆形等形态,偶在镜下可观察到Ot从细胞内释放的过程。
2.3 IFA在脾、肾、肝组织的表现对2只接种感染Ot的ICR小鼠的肝、脾、肾组织进行冷冻切片,结果与健康ICR小鼠比较发现,Ot抗原颗粒在小白鼠动物模型的肝细胞胞浆内呈散在分布的阳性反应,荧光阳性亮度在脾脏组织内最强,在肾脏组织内最弱(图 3)。通过对比结果发现,Ot抗原颗粒在肾脏内的荧光亮度弱,较少出现在细胞胞浆内,与健康肾脏对比特异性并不明显。
2.4 Ot分离株56 kDa TSA基因全长的扩增与相似性比较通过PCR扩增,拼接获得DALIV8株56 kDa TSA基因核苷酸序列全长为1 566 bp,编码521个氨基酸。通过与表 2中从GenBank下载的14株Ot基因序列进行相似性比较,DALIV8株56 kDa TSA在核苷酸水平与Kawasaki、Boryong、Karp、Kato和TA763基因型相似性为82.30%~98.85%;在氨基酸水平相似性为74.04%~98.28%,该Ot分离株为TA763基因型(GenBank:OM914742)。见表 3。
将Ot分离株56 kDa TSA基因全长与TA763基因型最相似的HL03-1、KL0807a、Hualien-14和标准株TA763进行氨基酸比较,结果见图 4。
2.5 Ot分离株遗传进化分析将DALIV8株56 kDa TSA全基因序列与GenBank下载的Karp、Boryong、Kato、TA763和Kawasaki基因型的56 kDa TSA基因序列15株,基于核苷酸水平建立了系统发育树。系统发育树上DALIV8分离株与其他TA763聚集成一簇,在同一分支。见图 5。
3 讨论恙虫病在我国广泛分布,2006年后,云南省成为恙虫病的主要高发区之一[6-7],以黄胸鼠和褐家鼠为主要宿主动物,地理纤恙螨(Leptotrombidium deliense)为主要传播媒介[8]。本研究在大理市捕获的啮齿动物中调查发现,虽然只有1只黄胸鼠为Ot PCR检测阳性,通过ICR小鼠仍分离到1株Ot,提示ICR小鼠用于Ot的分离相对比较敏感。
IFA发现小鼠肝细胞胞浆内呈散在分布的阳性反应,提示Ot感染会导致一定程度的肝损伤[9]。其中脾脏阳性荧光分布最多,脾脏是恙虫病主要的靶器官。有学者研究表明,Ot通过足部感染后,向肺和心脏组织有明显的趋向性[10]。
全世界已分离出40多种Ot血清型或抗原株[11],传统的血清分型是一个复杂的程序,需要参考血清和抗原,也会出现一些非特异性结合干扰结果的判断,因而用血清学方法进行Ot分型受许多因素的影响[12]。ELISA尽管检测Ot特异性IgM抗体具有良好的敏感性和特异性,但对于诊断时间 < 7 d的早期疾病,PCR是实验室诊断确认的首选方法[13]。利用分子生物学方法应用于Ot基因分型,可以揭示Ot菌株之间的遗传多样性。
本研究明确了DALIV8分离株为TA763型,TA763型首先从泰国王鼠(R. rajah)中分离到[14]。我国Ot基因型分布,Karp型和Gilliam型在长江以南地区最为普遍,而Kawasaki型和Gilliam型主要分布在长江以北地区[15],云南省主要存在Karp、Kato和Gilliam型流行[16],本研究首次分离到TA763型,该基因型在云南省的分布有待于进一步研究。
56 kDa TSA是Ot特有的一种免疫显性外膜蛋白,是Ot特异性抗原。DALIV8分离株Ot在多个氨基酸位点发生改变,如在第37位A(丙氨酸)变为G(甘氨酸)、48位G(甘氨酸)变为S(丝氨酸)、52位A(丙氨酸)变为T(苏氨酸)、60位E(谷氨酸)变为D(天冬氨酸)。这4个突变位点是否影响Ot的抗原性或致病性,有待于进一步研究。
恙虫病是抗生素可治愈的疾病,如不加以适当的治疗,病死率可达30%~50%[17]。恙虫病主要影响卫生基础设施较差的农村地区,但随着人员流动、旅游等,恙虫病的发病率逐年上升,广东、海南、广西、福建、浙江、云南、四川、湖南、海南和台湾等省(自治区)存在恙虫病自然疫源地,截至2015年,我国的34个省级行政区中,只有青海省和宁夏回族自治区无恙虫病病例报道[18],恙虫病已成为我国公共卫生关注问题。恙虫病的临床表现多种多样,包括焦痂、斑疹、肺炎、感染性休克和脑膜脑炎等,与疟疾和登革热等相似,虽然存在有效的治疗方案,但是尚无高效率特异性的诊断方法,在临床上诊断困难,加之目前为止还没有有效的疫苗[19],所以研制成功的Ot疫苗是目前急需解决的问题;治疗恙虫病的氯霉素、四环素等抗生素,对孕妇和儿童的副作用大,抗生素已成为一个重大的全球卫生保健问题,持续使用不同的抗生素治疗Ot可能导致多重耐药菌株的产生[20],因而有必要研发治疗恙虫病副作用小而又抗耐药的药物。而Ot的分离是相关问题解决的前提。本研究基于Ot的菌株分离,了解其分子特性,为明确恙虫病发病机制及药物和疫苗研发奠定了基础。
利益冲突 无
[1] |
Giengkam S, Blakes A, Utsahajit P, et al. Improved quantification, propagation, purification and storage of the obligate intracellular human pathogen Orientia tsutsugamushi[J]. PLoS Negl Trop Dis, 2015, 9(8): e0004009. DOI:10.1371/journal.pntd.0004009 |
[2] |
Dittrich S, Card E, Phuklia W, et al. Survival and growth of Orientia tsutsugamushi in conventional hemocultures[J]. Emerg Infect Dis, 2016, 22(8): 1460-1463. DOI:10.3201/eid2208.151259 |
[3] |
Ming DK, Phommadeechack V, Panyanivong P, et al. The isolation of Orientia tsutsugamushi and Rickettsia typhi from human blood through mammalian cell culture: A descriptive series of 3, 227 samples and outcomes in the Lao people's democratic republic[J]. J Clin Microbiol, 2020, 58(12): e01553-20. DOI:10.1128/JCM.01553-20 |
[4] |
Guo WP, Lin XD, Wang W, et al. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents[J]. PLoS Pathog, 2013, 9(2): e1003159. DOI:10.1371/journal.ppat.1003159 |
[5] |
Zhang SY, Song HB, Liu Y, et al. Scrub typhus in previously unrecognized areas of endemicity in China[J]. J Clin Microbiol, 2010, 48(4): 1241-4. DOI:10.1128/JCM.01784-09 |
[6] |
岳玉娟, 王玉姣, 李贵昌, 等. 2006-2018年中国大陆恙虫病高发区流行病学特征分析[J]. 疾病监测, 2020, 35(4): 301-306. Yue YJ, Wang YJ, Li GC, et al. Epidemiological characteristics of scrub typhus in high-incidence areas in the mainland of China, 2006–2018[J]. Dis Surveill, 2020, 35(4): 301-306. DOI:10.3784/j.issn.1003-9961.2020.04.007 |
[7] |
李贵昌, 栗冬梅, 李焱, 等. 2006-2016年我国恙虫病流行特征分析[J]. 疾病监测, 2018, 33(2): 139-143. Li GC, Li DM, Li Y, et al. Epidemiology of scrub typhus in China, 2006-2016[J]. Dis Surveill, 2018, 33(2): 139-143. DOI:10.3784/j.issn.1003-9961.2018.02.007 |
[8] |
罗云燕, 尹家祥. 恙虫病东方体及其宿主和媒介的研究概况[J]. 疾病监测, 2019, 34(10): 920-923. Luo YY, Yin JX. Progress in research of Orientia tsutsugamushi and its host and vector[J]. Dis Surveill, 2019, 34(10): 920-923. DOI:10.3784/j.issn.1003-9961.2019.10.013 |
[9] |
Chung JH, Lim SC, Yun NR, et al. Scrub typhus hepatitis confirmed by immunohistochemical staining[J]. World J Gastroenterol, 2012, 18(36): 5138-5141. DOI:10.3748/wjg.v18.i36.5138 |
[10] |
Keller CA, Hauptmann M, Kolbaum J, et al. Dissemination of Orientia tsutsugamushi and inflammatory responses in a murine model of scrub typhus[J]. PLoS Negl Trop Dis, 2014, 8(8): e3064. DOI:10.1371/journal.pntd.0003064 |
[11] |
Tilak R, Kunte ACR. Scrub typhus strikes back: Are we ready?[J]. Med J Armed Forces India, 2019, 75(1): 8-17. DOI:10.1016/j.mjafi.2018.12.018 |
[12] |
Varghese GM, Janardhanan J, Mahajan SK, et al. Molecular epidemiology and genetic diversity of Orientia tsutsugamushi from patients with scrub typhus in 3 regions of India[J]. Emerg Infect Dis, 2015, 21(1): 64-69. DOI:10.3201/eid2101.140580 |
[13] |
Kannan K, John R, Kundu D, et al. Performance of molecular and serologic tests for the diagnosis of scrub typhus[J]. PLoS Negl Trop Dis, 2020, 14(11): e0008747. DOI:10.1371/journal.pntd.0008747 |
[14] |
Phuklia W, Panyanivong P, Sengdetka D, et al. Novel high-throughput screening method using quantitative PCR to determine the antimicrobial susceptibility of Orientia tsutsugamushi clinical isolates[J]. J Antimicrob Chemother, 2019, 74(1): 74-81. DOI:10.1093/jac/dky402 |
[15] |
Cao M, Guo HB, Tang T, et al. Spring scrub typhus, people's republic of China[J]. Emerg Infect Dis, 2006, 12(9): 1463-1465. DOI:10.3201/eid1209.060257 |
[16] |
胡挺松, 李应, 胡秋凌, 等. 云南省楚雄州恙虫病流行特征及其病原体东方体基因分型研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(3): 282-288. Hu TS, Li Y, Hu QL, et al. Epidemiological characteristics of scrub typhus and genotyping of the pathogen Orientia tsutsugamushi in Chuxiong prefecture, Yunnan province, China[J]. Chin J Vector Biol Control, 2020, 31(3): 282-288. DOI:10.11853/j.issn.1003.8280.2020.03.008 |
[17] |
Xu G, Walker DH, Jupiter D, et al. A review of the global epidemiology of scrub typhus[J]. PLoS Negl Trop Dis, 2017, 11(11): e0006062. DOI:10.1371/journal.pntd.0006062 |
[18] |
龚健仁. 我国恙虫病的分布状况与研究概况[J]. 中华疾病控制杂志, 2016, 20(11): 1176-1181. Gong JR. The distribution and general situation on epidemiology studies of tsutsugamushi disease in China[J]. Chin J Dis Control Prev, 2016, 20(11): 1176-1181. DOI:10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.11.025 |
[19] |
Valbuena G, Walker DH. Approaches to vaccines against Orientia tsutsugamushi[J]. Front Cell Infect Microbiol, 2013, 2: 170. DOI:10.3389/fcimb.2012.00170 |
[20] |
Musa TH, Ahmad T, Wana MN, et al. The epidemiology, diagnosis and management of scrub typhus disease in China[J]. Hum Vaccin Immunother, 2021, 17(10): 3795-3805. DOI:10.1080/21645515.2021.1934355 |