尿酸是人体内嘌呤分解代谢的最终氧化产物, 体内尿酸水平过高会导致高尿酸血症(hyperuricemia, HUA)[1]。HUA引起尿酸盐晶体在关节处的沉积, 进而会导致痛风[2, 3]。目前, 用于治疗HUA和痛风的药物主要分为两类: 一是促进尿酸排泄类药物, 如苯溴马隆和丙磺舒等; 另一是抑制尿酸形成类药物, 如别嘌呤醇和非布司他等, 属于黄嘌呤氧化酶(xanthine oxidase, XO) 抑制剂(XO inhibitors, XOIs)[4, 5]。临床上也常用秋水仙碱、非甾体类抗炎药和糖皮质激素等镇痛消炎类药物结合使用[6]。
XO是一种有效的治疗痛风及HUA相关疾病的重要靶点, 是催化嘌呤在体内分解代谢的关键酶。XO主要催化尿酸生成的最后两个步骤, 即次黄嘌呤氧化分解为黄嘌呤和黄嘌呤氧化分解为尿酸的过程[2], 同时还能催化电子转移到氧分子上形成过氧化氢或超氧阴离子[7], 参与炎症、代谢紊乱、动脉粥样硬化和癌症等疾病的形成和发展[8, 9]。XO一般由两个相同的亚基组成, 每个亚基包括1个钼蝶呤中心(C端)、1个黄素腺嘌呤二核苷酸中心(中间域) 和2个铁硫中心(N端), 4个中心呈线性排列[10, 11]。其中, 钼蝶呤中心是XO催化生成尿酸的关键位点[12, 13], 通过与钼蝶呤中心的相互作用, XOI可干扰次黄嘌呤和黄嘌呤的分解代谢, 抑制尿酸的形成, 治疗痛风及由活性氧带来的相关疾病[14, 15]。
临床上常用的XOI有别嘌呤醇(allopurinol)、非布司他(febuxostat)[16]和托比司他(topiroxostat)[17] (图 1)。别嘌呤醇是一种经典的嘌呤类XOI, 1966年被美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration, FDA) 批准上市, 在临床上已应用了50多年, 但其嘌呤骨架带来了很多危及生命的不良反应[18, 19]。非布司他于2009年被FDA批准上市, 托比司他于2013年在日本被批准上市, 二者均属于新型的非嘌呤类XOI, 比别嘌呤醇药效更好, 不良反应更小。然而, 研究表明托比司他可能会增加痛风性关节炎的发病率[20], 非布司他也于2019年被FDA发布黑框警告称其会增加心脏死亡相关风险。因此, 研究和开发药效更好、不良反应小的新型XOI十分必要。
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Figure 1 Chemical structures of classical XOIs |
在结构上, 非布司他及其衍生物可以分为两个主要的部分(图 2): A部分一般为取代苯环; B部分为羧基取代的五元或六元杂环。在XO的结合口袋中(图 3), 非布司他及其衍生物苯环上的氰基可与氨基酸残基Asn768形成氢键; 芳香杂环可与氨基酸残基Phe914和Phe1009形成π-π相互作用, 杂环上非极性的甲基可占据酶的疏水口袋; 羧基可与氨基酸残基Arg880和Thr1010形成氢键。通过这些相互作用, 非布司他及其衍生物与XO结合, 抑制其催化活性[21, 22]; 非布司他对XO的半数抑制浓度(IC50) 在低的纳摩尔级水平(3~30 nmol·L-1)[23]。目前对非布司他的结构改造和衍生主要基于两种经典的药物设计策略, 一是基于电子等排原理替换A或B部分的芳环结构, 二是采用骨架迁越方法在A和B部分之间加入连接基团。本文汇总了近10年报道的非布司他衍生物及其新型骨架, 并就其各部分构效关系结合分子对接进行了分类概述, 旨在为设计和开发新型XOI提供参考, 也可为电子等排和骨架迁越的药物设计策略的运用提供案例和参考。
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Figure 2 Febuxostat and its derivatives |
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Figure 3 (a) The crystal structure of bovine xanthine oxidase (PDB: 1N5X); (b) The binding mode of febuxostat |
在农业和医药化工中, 吲哚环常用作各种蛋白抑制剂的活性支架[24-26]。2015年, Song等[27]将非布司他中的苯环扩大为吲哚环, 以二取代的1H-吲哚-5-羧酸为原料合成了一系列的三取代2-(吲哚-5-基) 噻唑衍生物(图 4)。构效关系研究表明, 在吲哚环1位引入疏水基团和3位引入吸电子基团及噻唑环4位引入疏水基团有利于增强对XO的抑制活性。其中, 化合物1活性最佳, 效价与非布司他相当。分子对接结果表明, 吲哚环并没有影响化合物与靶标的相互作用(图 5)。2016年, Song等[28]还将吲哚环翻转180°合成了一系列的2-(吲哚-2-基)-噻唑类XOI, 但该类化合物的抑制活性总体上不如翻转前吲哚环衍生物。吲哚环衍生物为非布司他苯环的替换和改造提供了新的可能性, 可进一步修饰和衍生, 设计和合成结构新颖的XOI。
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Figure 4 The design strategy of indole derivatives and their structures |
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Figure 5 The binding mode of compound 1 in the xanthine oxidase protein |
吡唑环是许多农药、医药以及光电材料分子的重要结构单元[29-31]。2001年, Ishibuchi等[32]对别嘌呤醇进行了结构改造, 保留吡唑环, 在其吡唑并[3, 4-d]嘧啶N-1位置引入一个苯基, 并用羧基取代4-羟基嘧啶部分, 以二取代的苯肼为原料合成了一系列非嘌呤类的XOI (图 6)。其中, 化合物2 (Y-700) 活性最佳, 相较于别嘌呤醇(IC50 = 260 nmol·L-1) 具有更好的抑制活性。构效关系显示, 苯环上仅4位单取代无活性, 但再在3位引入氰基、溴和硝基等亲电基团后, 对XO的抑制活性明显增强, 其中氰基取代最佳; 吡唑环4位的羧基是药效活性的关键基团。此外, 苯环4位引入大体积取代基对活性有利, 引入极性基团对活性不利[33]。
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Figure 6 The design strategy I of pyrazole derivatives and their structures |
2017年, Li等[34]用吡唑环直接替代非布司他的噻唑环, 分别以5-溴-2-羟基苯甲腈和4-溴-1-氟-2-硝基苯等为原料, 合成了两个系列的1-苯基吡唑衍生物(图 7)。活性测试结果表明, 系列I大部分化合物的活性均低于非布司他, IC50值大于100 nmol·L-1; 系列II大部分化合物的IC50值小于100 nmol·L-1, 化合物3活性最佳, 表现出与非布司他相当的XO抑制活性。同时发现, 吡唑环3位R1的分子体积和抑制活性的大小有直接关系, R1体积越大, 抑制活性越差; 但在-NR处引入适当的取代基, 可增加活性。
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Figure 7 The design strategy II of pyrazole derivatives and their structures |
异噁唑衍生物具有抗炎、抗菌、镇痛、抗结核等多种生物活性, 近些年已成为药物设计的研究热点之一[35, 36]。2010年, Wang等[37]用异噁唑环代替非布司他的噻唑环, 以1-(4-羟基苯基) 乙酮为原料合成了一系列的5-苯基异噁唑-3-羧酸衍生物(图 8)。该类化合物大部分表现出微摩尔或亚微摩尔级的XO抑制效力, 化合物4的XO抑制活性最佳。构效关系研究表明, R1氰基取代比硝基取代更有利于活性, R2基取代以异丁基为最佳。分子对接结果显示(图 9a), 除与非布司他相同的关键相互作用外, 异噁唑环上的O原子还可与Glu802形成氢键, 但异噁唑环上N原子与苯环的距离较非布司他中噻唑环N原子与苯环的距离更远, 与蛋白相互作用可能较小, 所以该类化合物虽有较好的活性但远不如非布司他。
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Figure 8 The design strategy of isoxazole derivatives and their structures |
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Figure 9 Binding modes of febuxostat derivatives with five-membered heterocyclic isosteres in the XO protein. (a) compound 4; (b) compound 5; (c) compound 6; (d) compound 7; (e) compound 10; (f) compound 11 |
一些含硒杂环化合物被报道有多种生物活性[38, 39], 2014年Guan等[40]用硒唑环代替非布司他的噻唑环, 以对羟基苯甲腈为原料合成了一系列2-苯基-4-甲基-1, 3-硒唑-5-羧酸衍生物(图 10)。该类化合物大多数都对XO显示出了较好的抑制活性(IC50 = 5.5~82.5 nmol·L-1), 化合物5的活性最佳。构效关系研究表明, 苯环3位的氰基比硝基更有利于增加活性; 苯环4位取代基体积越大活性越强, 且支链烷氧基活性大于直链烷氧基; 硒唑环上的羧基是关键药效基团。分子对接结果显示(图 9b), 硒唑环上的N原子可与Glu802形成氢键, R2位的烯丙基可能与Phe649形成额外的π-π堆积作用。
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Figure 10 The design strategy of selenazole derivatives and their structures |
1, 2, 3-三唑环是药物和生物活性分子的重要结构片段之一[41-43]。2016年, Shi等[44]用三唑环代替非布司他的噻唑环, 以对硝基苯酚为原料合成了一系列2-苯基-5-甲基-2H-1, 2, 3-三唑-4-羧酸/碳酰肼衍生物(图 11)。大部分化合物对XO表现出中等抑制活性, 其中化合物6活性最佳。构效关系研究表明, 苯环3位的氰基比硝基更有利于抑制活性; 苯环4位取代基体积越大活性越强; 三唑环上的羧基是关键药效基团。分子对接表明, 除与非布司他相同的关键相互作用外, 化合物6三唑环上的N原子可与Glu802形成氢键, 三唑环可与Phe1009形成π-π堆积作用(图 9c)。
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Figure 11 The design strategy I of triazole derivatives and their structures |
2017年, Zhang等[45]提出在非布司他噻唑环4位加入极性N原子可能会增强相互作用, 以2-羟基苯甲腈为原料合成了一系列1-苯基-1H-1, 2, 3-三唑-4-羧酸衍生物(图 12)。其中, 化合物7活性最佳, 但比先导化合物Y-700 (IC50 = 16 nmol·L-1) 效力低13倍。分子对接未发现3位N原子可形成关键的相互作用(图 9d), 相反, N原子对C原子的替换使亲水性和极性增大, 不利于效价。此外, R基碳链增长可提高分子的亲脂性, 有利于活性。
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Figure 12 The design strategy II of triazole derivatives and their structures |
咪唑环也常用作药物分子尤其是抗菌药物的活性骨架[46, 47]。2015年, Chen等[48]用咪唑环代替非布司他的噻唑环, 以3-溴-4-羟基苯甲醛为原料合成了一系列的1-羟基/甲氧基-4-甲基-2-苯基-1H-咪唑-5-羧酸衍生物(图 13)。其中, 1-羟基类化合物表现出极强的XO抑制活性, 化合物8~10的活性优于非布司他。这表明在苯环和羧基之间引入一个羟基可能有利于提高XOI的抑制活性。分子对接结果表明, 相较于非布司他, 咪唑环上的羟基可与Thr1010形成一个额外的氢键(图 9e)。
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Figure 13 The design strategy I of imidazole derivatives and their structures |
2020年, Zhou等[49]以其课题组前期合成的吡唑衍生物WN1703为基础, 将吡唑环替换为咪唑环, 合成了4个系列的1-苯基咪唑-4-羧酸衍生物(图 14)。大多数化合物对XO均具有较好的抑制活性, IC50值在纳摩尔水平。化合物11活性最佳, 与非布司他相当。构效关系研究表明, 烷基胺类化合物对XO抑制活性优于烷氧基类化合物; 当XR (X = O, N) 相同时, 系列II化合物活性优于系列III, 这表明苯环与咪唑环的连接方式会影响XO抑制活性; 系列III中, 在R2位引入甲基导致活性降低, 这证明经咪唑环替换后, 五元环上的甲基对XO抑制活性不再是必须的; 系列IV中, 苯环的对位取代优于邻位取代。分子对接结果表明(图 9f), 咪唑环可位于Phe914和Phe1009之间, 形成π-π堆积作用。
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Figure 14 The design strategy II of imidazole derivatives and their structures |
在药物的发现和开发中, 六元杂环化合物作为结构片段在药物分子中有着广泛的应用, 也有许多根据生物电子等排原理将五元杂环替换为六元杂环的成功案例[50, 51], 这种改造策略也被应用于XOI的研究中。
2.2.1 嘧啶衍生物嘧啶环是许多天然和合成产物的重要支架[52-54]。2018年, Shi等[55]通过分子对接, 选择六元巯基嘧啶环代替非布司他五元噻唑环, 以二取代的苯乙酮为原料合成了一系列的2-巯基-6-苯基嘧啶-4-羧酸衍生物(图 15), 该类化合物大多对XO表现出亚微摩尔水平的抑制活性。化合物12活性最佳, 但仍然和非布司他相差一个数量级。构效关系研究表明, R1取代基类型是影响XOI抑制活性的关键因素, 氰基取代优于硝基或溴取代; R2疏水基团的体积增加会导致活性下降, 且支链烷氧基比直链烷氧基对活性更有利。分子对接结果表明(图 16a), 与非布司他及其他类似物不同, 该类化合物嘧啶环上的N原子以及苯环上的氰基由于和活性位点距离较远, 没有和关键氨基酸残基形成有效的氢键作用, 但该类化合物的巯基可与Glu802形成氢键。
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Figure 15 The design strategy of thiol dihydropyrimidine derivatives and their structures |
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Figure 16 Binding modes of febuxostat derivatives with six-membered heterocyclic isosteres in the xanthine oxidase protein. (a) compound 12; (b) compound 13; (c) compound 14; (d) compound 16; (e) compound 17 |
2019年, Mao等[56]在其课题组前期合成的咪唑环衍生物的基础上进行扩环, 以邻羟基苯甲醛为原料合成了一系列的2-(4-烷氧基-3-氰基) 苯基-6-氧代/亚氨基-1, 6-二氢嘧啶-5-羧酸衍生物(图 17)。该类化合物对XO表现出明显的抑制活性, 化合物13活性最佳, 与非布司他相当。构效关系研究表明, 缩短R1碳链长度会使活性降低; 嘧啶环上4位甲基位于亲水表面, 不利于活性; 而将羰基改为亚氨基后, 化合物效价基本保持不变。分子对接结果表明(图 16b), 嘧啶环可通过π-π堆积作用处于Phe914和Phe1009之间, 嘧啶环上的亚氨基可与Glu802形成一个额外的氢键, 因此, 从咪唑环到嘧啶环的扩环可能有利于化合物对XO抑制活性的提高。
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Figure 17 The design strategy of oxy/imino dihydropyrimidine derivatives and their structures |
由于四唑环中4个N原子都可以作为氢键受体与活性氨基酸残基更好地形成氢键[57], 所以四唑环也常用于药物的改造和开发中[58, 59]。2019年Zhang等[60]用四唑环代替氰基作为氢键受体, 继续对嘧啶环衍生物进行结构改造, 以对羟基苯甲腈为原料合成了一系列的2-[4-烷氧基-3-(1H-四唑-1-基) 苯基]-6-氧代-1, 6-二氢嘧啶-5-羧酸衍生物(图 18)。该类化合物表现出了明显的XO抑制活性, 其中化合物14活性最佳, 与非布司他相当。构效关系分析表明, R基疏水基团对XO抑制活性较为重要, 增加饱和烷氧基的体积有利于提高活性。分子对接结果表明(图 16c), 引入的四唑环可能与Asn768和Lys771形成氢键作用。
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Figure 18 The design strategy of oxydihydropyrimidine derivatives and their structures |
2021年Sun等[61]基于化合物13的结构进一步探究了氨基和羟基是否可以作为嘧啶类衍生物的关键药效团(图 19)。其中6位羟基单取代的系列衍生物活性最佳, IC50值在46~282 nmol·L-1之间, 较无取代系列化合物效力提高了23~60倍, 6位氨基单取代系列化合物较无取代活性也提高了6~8倍。化合物15活性最佳, 在XO中关键相互作用与化合物13相似。由于此类化合物的良好抑制作用, 氨基和羟基可以作为嘧啶类衍生物的关键药效团。
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Figure 19 The design strategy of dihydropyrimidine derivatives and their structures |
2012年, B-Rao等[62]通过虚拟筛选和分子对接发现异胞嘧啶环可以作为XOI的基本骨架。同年, 该课题组的Khanna等[63]用异胞嘧啶环代替非布司他的噻唑环, 以二取代的溴苯为原料合成了一系列的化合物(图 20)。该类化合物对XO有显著的抑制活性效力, 其中化合物16活性最佳, 效价与非布司他相当。构效关系研究表明, R2基为苯环、巯醚或醚会使活性提高。此外, 分子对接结果表明, 异胞嘧啶中的烯醇结构可与Arg880和Thr1010形成氢键, 氨基可与Glu802形成氢键, 化合物16中R2位的苯环可能与Phe649和Phe1013产生额外的π-π相互作用(图 16d)。2018年, 同一课题组的Subhajit等[64]对异胞嘧啶环衍生物和关键氨基酸残基的相互作用进行了进一步的探究和验证。
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Figure 20 The design strategy of isocytosine derivatives and their structures |
2013年, 为提高此类衍生物的口服生物利用度, 同一课题组的Bajaj等[65]通过增加极性以改善溶解性和提高疏水性以增加渗透性两种方法继续对化合物16进行了结构改造, 得到了一种新型的含异胞嘧啶的XOI骨架结构。策略一在R2基引入羧基和酯基以增加极性, 所合成化合物IC50值保持在纳摩尔范围内, 且口服10 mg·kg-1后的药峰浓度(Cmax) 较化合物16增加1~41倍, 曲线下面积(AUC) 增加1~65倍。策略二去除极性基团羟基或氨基以增强渗透性, 该系列化合物体外生物活性稍有下降但口服利用度明显提高, Cmax增加了4~17倍, AUC增长了2~10倍。
2.2.3 哒嗪环哒嗪类化合物是一类重要的杂环支架材料, 具有多种生物学特性, 广泛应用于医药和农业领域的分子设计中[66-68]。2019年, Zhang等[69]用六元的哒嗪环代替非布司他的噻唑环, 以二取代的苯乙酮为原料分别合成了3-氧代-6-芳基-2, 3-二氢哒嗪-4-碳酰肼/羧酸两个系列的非布司他衍生物(图 21)。其中, 羧酸类化合物没有明显抑制作用, 而酰肼类化合物对XO表现出了微摩尔水平的抑制活性, 化合物17活性最佳, 但远不及非布司他。构效关系研究表明, R1为氰基比硝基更利于XO抑制活性; R2疏水基团是必需的, 支链烷烃比直链烷烃更利于活性, 烷氧基体积增大会降低抑制活性。分子对接结果表明, 酰肼结构可与Arg880和Glu802形成重要的氢键作用(图 16e), 因此, 对于此类非布司他衍生物来说, 4位上的酰肼结构是关键药效结构之一。
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Figure 21 The design strategy of pyridazine derivatives and their structures |
采用骨架迁越方法对连接部分进行结构修饰也是一种新的设计策略[70], 即在非布司他A部分噻唑环和B部分苯环之间插入连接基替换单键可得到XOI新型骨架。虽然此类衍生物的分子形状可能发生变动, 但分子的共轭性、关键药效团及与XO的关键相互作用有可能继续保持, 同时连接基团中增加的杂原子可能与XO中氨基酸残基形成额外氢键(图 22), 有利于活性的维持。
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Figure 22 Binding modes of febuxostat derivatives with a linker of methylene amino or formylamino group (a) compound 18; (b) compound 19; (c) compound 20; (d) compound 21 |
2016年, Ali等[71]在噻唑环和苯环之间插入一个亚甲氨基, 以2-氯乙酰乙酸乙酯和硫脲为原料合成了一系列的2-取代苄基氨基-4-甲基-1, 3-噻唑-5-羧酸衍生物(图 23)。该类化合物对XO表现出一定的抑制活性, 化合物18活性最佳, 但远低于非布司他。分子对接结果表明(图 22a), 连接基团中的氨基可与Ser876形成氢键。
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Figure 23 The design strategy of febuxostat derivatives with a linker of methylene amino group |
2017年, Ali等[72]尝试以甲酰胺基为连接基以2-氯乙酰乙酸乙酯为原料合成了一系列的2-苯甲酰胺基-4-甲基噻唑-5-羧酸衍生物(图 24)。该类化合物对XO表现出一定的抑制活性, 化合物19活性最佳。构效关系研究表明, R基为吸电子基比给电子基更利于抑制活性, 且对位比邻位取代更有利。分子对接结果表明(图 22b), 甲酰胺基中的N原子可与Ser876形成氢键。2017年, Zhang等[73]在该系列化合物的基础上继续探究了酰胺类衍生物的构效关系, 以4-羟基苯甲醛等原料合成了两个系列的化合物, 并测定了10 μmol·L-1浓度下对XO的抑制活性。部分化合物展现了一定的XO抑制活性, 化合物20活性最佳, 抑制率达到57.1%。构效关系表明, 酰胺氮甲基化后活性明显下降。分子对接结果表明, 插入连接基后, 噻唑环可能会发生翻转, 缺少了羧基与Thr1010的氢键作用(图 22c)。
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Figure 24 The design strategy I of febuxostat derivatives with a linker of formylamino group |
2020年, Kaur等[74]对酰胺类衍生物构效关系进行了进一步的探究, 以2-氯乙酰乙酸乙酯和硫脲为原料合成了一系列的2-取代苯甲酰胺基-4-甲基噻唑-5-羧酸衍生物(图 25)。该类化合物对XO的抑制作用低于非布司他, IC50值在450~44 450 nmol·L-1之间, 其中化合物21活性最佳。构效关系分析表明, 单取代苯环化合物活性低于双取代苯环化合物。分子对接结果表明(图 22d), 甲酰胺基上的羰基作为氢键受体可与Ser876形成氢键。
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Figure 25 The design strategy II of febuxostat derivatives with a linker of formylamino group |
XO是治疗HUA和痛风的重要作用靶点。近些年来, 对于XOI的研究越来越广泛, 本文总结了近年来非布司他衍生物的研究进展及其构效关系, 并按其结构改造策略进行了分类概述。研究表明: ①非布司他及其衍生物的A部分(图 2) 多为3位吸电子基团取代和4位疏水基团取代的苯环, 其中3位以氰基为最佳, 4位疏水基团中支链烷氧基比直链烷氧基更利于活性。非布司他A部分的苯环替换为其他芳香杂环的报道较少, 用吲哚环替换后的衍生物表现了较好的抑制活性, 说明了苯环的替代可行性, 值得进一步的研究和探索。② B部分为五元或六元的取代杂环; 根据生物电子等排体原理, 该部分用不同芳环替换和修饰的范围十分广泛, 多种类型的芳环或杂环替换均有报道。其中, 硒唑环、咪唑环、异胞嘧啶环以及二氢嘧啶环替换的衍生物对XO的抑制活性最佳, 与非布司他相当, 三唑环类化合物活性次之, 吡唑环、异噁唑环和哒嗪环类衍生物也有较好的活性, 但低于非布司他。此外, 该部分中的羧基被证明是关键的药效基团。③应用骨架迁越的策略, 将A和B部分之间的连接单键修饰为亚甲基氨基或甲酰胺基等基团, 所合成衍生物对XO表现出一定的抑制活性, 虽不及非布司他, 但为今后的研究提供了一个可行的新思路。同时, 采用生物电子等排和骨架迁越策略对非布司他结构的修饰和衍生, 也可为其他药物的研发提供很好的案例和借鉴。
目前已报道的非布司他衍生物中, 不乏一些很有潜力已进入临床研究的化合物, 它们有望发展成为新型的抗痛风药物。非布司他衍生物构效关系的深入探究和分析, 可为新型XOI先导物的设计与筛选提供新思路, 相信随着不断的创新研究与筛选, 定会研发出有效性、耐受性和安全性更好的新型抗痛风药物。
作者贡献: 李文烨负责文献检索及综述撰写; 翟纳负责图片修改和内容评估; 巨修练负责综述内容评估; 刘根炎为综述撰写思路并对稿件进行修改和审校。
利益冲突: 所有作者均声明不存在利益冲突。
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