畜牧兽医学报  2022, Vol. 53 Issue (9): 3121-3131. DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2022.09.026    PDF    
猫细小病毒的遗传演化及分离毒株的致病性分析
程宝钰, 李子荷, 崔燕蕾, 李嘉慧, 杨鑫玮, 于永乐, 杨海燕, 单虎, 张传美     
青岛农业大学动物医学院,青岛 266109
摘要:本研究旨在了解猫细小病毒(feline parvovirus,FPV)流行株的遗传演化情况及分离毒株的致病性。2018—2020年,在山东地区采集54份疑似猫瘟粪便拭子,并通过PCR和VP2基因克隆进行VP2基因全长测序,构建遗传进化树,并推导出氨基酸序列并与疫苗株进行比对,分析遗传变异情况。用F81细胞分离培养1株FPV毒株,命名为FPV-QDC20,经电镜观察、间接免疫荧光、血凝试验、TCID50测定、全基因测序及动物回归试验研究该毒株生物学特性。结果表明,采集样品中16份样品VP2基因全长测序成功,其中,15份为FPV,1份为猫源犬细小病毒(CPV)。构建系统进化树显示,本研究的FPV毒株均处于同一大分支,与中国其他地区已发表的FPV毒株亲缘关系较近,与欧洲分离株以及疫苗株亲缘关系较远。氨基酸序列分析表明,某些关键位点的改变可能导致宿主范围和感染性的改变,有可能导致免疫失败情况发生。毒株QDBL2毒株中出现了80、93、103三个FPV保守位点的变异,或许与犬猫细小病毒的共感染和重组有关。动物回归试验表明,毒株FPV-QDC20有较强致病性,试验猫出现典型的临床症状和病理变化,并最终死亡。本研究有助了解我国FPV毒株遗传演化方向,为将来的疫病监控和疫苗研究提供参考。
关键词猫细小病毒    VP2基因    遗传演化    致病性    
Genetic Evolution of Feline Parvovirus and Pathogenicity of an Isolated Strains
CHENG Baoyu, LI Zihe, CUI Yanlei, LI Jiahui, YANG Xinwei, YU Yongle, YANG Haiyan, SHAN Hu, ZHANG Chuanmei     
College of Veterinary Medicine, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China
Abstract: This work aimed at investigating the genetic evolution and pathogenicity of feline parvovirus (FPV). From 2018 to 2020, 54 fecal samples suspected of cat distemper were collected in Shandong province, and the VP2 gene was sequenced by PCR and VP2 gene cloning. In order to analyze the genetic variation, the phylogenetic tree was constructed and the amino acid sequence was deduced and compared with the vaccine strain. A strain named FPV-QDC20 was isolated and cultured on F81 cells. Its characteristics were studied by electron microscopy, indirect immunofluorescence, hemagglutination assay, TCID50, complete gene sequencing and animal challenge test. VP2 gene of 16 samples was sequenced successfully, of which 15 were FPV and 1 was canine parvovirus (CPV) from cat. Phylogenetic tree construction showed that the strain in this study was in the same branch, and was closely related to the published strains in other regions of China, but far related to the European strain and the vaccine strain. Amino acid sequence analysis showed that mutations in some key sites may change host range and infectivity, which may lead to immune failure. Interestingly, the variation of conserved loci 80, 93 and 103 appeared in the QDBL2 strain, which may be related to coinfection and gene recombination of canine and feline parvovirus. The animal challenge test showed that the FPV-QDC20 strain was highly pathogenic, and the cats showed typical clinical symptoms and pathological changes, and finally died. In this study, the genetic evolution of FPV strains in China was investigated to provide reference for future disease control and vaccine research.
Key words: feline parvovirus    VP2 gene    genetic evolution    pathogenicity    

猫细小病毒(feline parvovirus,FPV)又称猫泛白细胞减少症病毒,俗称猫瘟病毒,是一种侵害猫科动物的重要病原体,幼龄动物更易感,具有分布广、变异较快的特点。FPV属于食肉动物、细小病毒科、细小病毒属,该种属中其他成员有犬细小病毒(canine parvovirus, CPV)、浣熊细小病毒(raccoon parvovirus, RaPV) 以及水貂肠炎病毒(mink enteritis virus, MEV)[1]。FPV可感染猫科、獴科、浣熊科等多种动物[2]。FPV具有高度接触传染性,易感动物的发病率和死亡率高达25%~90%。1928年,由法国人Verge等首次鉴定FPV,1957年,Bilin等首次成功分离出FPV毒株[3-4]。我国20世纪50年代初有此病记载,1984年,首次从自然病例分离到FNF8株[4],以后陆续有该病毒分离的研究报道。

FPV核酸全长约5 kb,为单股线性负链DNA分子,有两个主要的开放阅读框(ORF)。3′端ORF编码非结构蛋白NS1和NS2,5′端ORF编码结构蛋白VPl和VP2。其中,非结构蛋白参与DNA复制、组装和转运,结构蛋白中VP2含有584个氨基酸,分子量为67 ku,占病毒粒子的90%,是主要的衣壳蛋白。VP2蛋白可以刺激宿主产生中和抗体,其关键氨基酸位点的突变会影响抗原特性和宿主范围[5-6]。FPV凝集细胞谱较窄,可在4 ℃、pH6.5条件下凝集猪和恒河猴的红细胞[7]。FPV对外界环境有着较强的抵抗能力,常常存在于环境中长达几年,不易被杀灭[8-9]

由于FPV在猫科动物中危害很大,而我国流行病学数据有限,本研究采集54份猫粪便拭子,PCR方法检测FPV并进行VP2基因克隆与测序,测序成功16份。进一步分析山东省FPV的流行和遗传进化情况。将阳性样品接种至F81细胞,对分离获得的FPV毒株进行电镜观察、间接免疫荧光、血凝试验、TCID50测定、全基因分析及动物回归试验,旨在阐明我国FPV的分子流行病学特点、遗传演化情况及分离毒株的致病特性。

1 材料与方法 1.1 试验材料

8周龄健康田园猫6只:猫血清中FPV HI抗体效价<8,FPV、猫冠状病毒(FCOV)、猫疱疹病毒(FHV)、猫杯状病毒(FCV)、猫白血病毒(FeLV)抗原检测均为阴性。猫肾细胞系(F81细胞)由本实验室保存。Viral RNA/DNA Extraction Kit、Prime STAR® Max DNA Polymerase购自TaKaRa公司;抗细小病毒单克隆抗体购自山东绿都生物科技有限公司;Goat Anti-Mouse IgG(H+L)-FITC购自Affinity公司。1%浓度猪红细胞购自广州洪泉生物科技有限公司。

1.2 临床样品的PCR检测

2018-2020年,于山东省多家动物医院采集54份临床初诊疑似的猫粪便拭子,用pH 6.4的PBS稀释,离心,取上清液,-80 ℃冰箱保存备用。使用TaKaRa公司Viral RNA/DNA Extraction Kit试剂盒提取样品中的病毒核酸,并进行PCR检测,引物FPV-559 F/R为自行设计(表 1),擎科生物科技有限公司合成。采用25 μL PCR反应体系:12.5 μL 2×Taq酶,模板DNA 2 μL,上下游引物各1 μL,ddH2O 8.5 μL。反应程序:94 ℃ 2 min;94 ℃ 40 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,35个循环;72 ℃ 5 min。

表 1 FPV扩增引物 Table 1 FPV gene amplification primers
1.3 FPV的VP2基因测序及遗传进化分析

对PCR检测为阳性的临床样品,进行VP2基因扩增,引物FPV VP2 F/R由作者设计(见表 1),PCR反应体系为25 μL,其中,12.5 μL 2×Phanta Max Master Mix酶,模板DNA 2 μL,上下引物各1 μL,ddH2O 8.5 μL。反应程序:94 ℃ 5 min;94 ℃ 40 s,51 ℃ 30 s,72 ℃ 2 min,35个循环;72 ℃ 10 min。阳性PCR扩增产物送擎科生物科技有限公司测序。在GenBank中下载24株参考序列(表 2),使用DNAStar软件对病毒的VP2基因序列进行同源性分析,并推导其氨基酸序列。用MEGA 7软件的ClustalW方法比对,使用Neighbor-Joining方法构建系统发育进化树,Bootstrap值为500。

表 2 24株细小病毒参考序列 Table 2 24 parvovirus reference sequences
1.4 病毒的分离与鉴定

1.4.1 样品采集   选取1例因自然感染猫瘟病死的青岛农业大学教学动物医院临床病例,取病猫生前新鲜粪便与PBS按照1∶9比例稀释,12 000 r·min-1离心10 min。然后将上清液吸出,将上清液与氯仿等比例混合,12 000 r·min-1离心5 min,取上清,-80 ℃冰箱保存备用。

1.4.2 病毒分离   采用吸附接毒的方法,取长满细胞培养瓶50%~60%的F81细胞,将细胞用PBS (pH=7.2~7.4) 洗两遍后,分别接入1 mL细胞维持液和1 mL处理后的病毒液,细胞维持液为对照组。37 ℃ 5% CO2培养箱中吸附1 h后,将9 mL细胞维持液加入到细胞瓶中;每天观察细胞状态,当细胞发生明显病变并且开始脱落时,冻融并离心,取上清液,-80 ℃保存备用。

1.4.3 电镜观察   取10 μL病毒液,小心夹取碳包膜铜网,将正面接触铜网表面10 min后,将多余水分去除,用1%的磷钨酸染液染色(不超过5 min),透射电子显微镜下观察。

1.4.4 间接免疫荧光试验(IFA)   将F81细胞以2×106 cell·mL-1的密度接入6孔板,每孔2 mL,培养细胞量至60%,以10%的病毒量感染F81细胞,48 h见明显CPE后,固定液固定,加入500 μL以1∶200稀释的鼠抗VP2单克隆抗体,37 ℃避光孵育1 h,再加入500 μL以1∶200稀释的FITC标记的羊抗鼠IgG,37 ℃避光孵育1 h。荧光倒置显微镜观察细胞。

1.4.5 血凝试验(HA)   按常规微量HA操作方法在96 V型孔板中进行血凝试验。

1.4.6 TCID50的测定   以1× 105cells·mL-1细胞量接种96孔细胞培养板,每孔100 μL,37 ℃,5% CO2培养箱培养过夜。病毒液进行10倍连续梯度稀释,将稀释好的病毒液接种入96孔板中(孔板细胞量为50%~60%),从病毒稀释倍数最高的病毒液由高到低依次接种,各稀释度病毒液接种8个孔,每孔加入100 μL病毒液。第11、12两列各加100 μL细胞维持液作为细胞对照。观察细胞,7 d后用Reed-Muench氏法计算病毒的TCID50

1.5 FPV全基因测序分析

参照文献[7]合成FPV全基因扩增引物(表 1),并进行PCR扩增。F1、F2、F3引物扩增FPV基因组中间序列,U1、U2、Y1、Y2引物扩增FPV基因组两端发卡结构。电泳鉴定正确的PCR产物使用TaKaRa胶回收试剂盒进行胶回收。用5 min TA/Blunt-Zero Cloning Kit将7个片段分别连接载体,转化到E. coli DH5α感受态细胞中。培养菌液,将电泳检测阳性的送擎科生物科技有限公司测序。

1.6 动物回归试验

选取3只8周龄的幼猫,以口服方式按2 mL·kg-1接种病毒滴度为104.5 TCID50·mL-1的FPV病毒液。接种后每天监测体重、体温,观察试验猫状态,采集肛拭子检测感染排毒情况。攻毒后隔天采血,监测血常规,HI试验检测抗体水平。动物死亡后,剖检观察各组织的病理变化,并用10%福尔马林固定,HE染色,制作病理切片,显微镜观察病理组织学变化。

2 结果 2.1 FPV VP2测序及遗传进化分析

将阳性样品进行VP2基因扩增,得到约为2 211 bp大小的扩增条带(图 1),测序分析得到15株FPV毒株VP2基因序列和1株CPV毒株VP2基因序列。

M. DL5000相对分子质量标准;+. 阳性对照;-. 阴性对照;C20. QDC20毒株 M. DL5000 DNA marker; +. Positive control; -. Negative control; C20. QDC20 strain 图 1 FPV-QDC20 VP2检测电泳图 Fig. 1 Virus sample QDC20 VP2 PCR detection electropherogram

将本试验获得的序列与表 2中的24株已发表的细小病毒参考序列进行比较与分析,构建系统发育进化树。结果表明,除QNBL2、QNBL3 2株以外,另外13株FPV毒株处于同一个大的分支上,与20世纪末美国发表的FPV-377毒株以及20世纪末到21世纪初中国上海、长春、山东、桂林等地分离的FPV和MEV毒株亲缘关系较近,与辉瑞公司疫苗株Felocell以及芬兰、加拿大、葡萄牙等地分离的一些毒株亲缘关系相对较远。QDC20毒株与1986―2017年在中国山东、长春、上海、桂林等地分离到的FPV和MEV亲缘关系较近,可以认为是1株在中国境内有广泛分布的经典FPV毒株(图 2)。通过比对16株毒株的VP2蛋白关键氨基酸位点80、93、103、232、305、323、375、564、568[8],确定15株为FPV毒株,1株为CPV毒株。以Felocell疫苗株为参考毒株进行氨基酸位点分析比对发现,15株FPV在16、31、80、91、93、101、103、232、267、300、322、440、562等多个氨基酸位点有变异,其中,91、232、562 3个位点变异毒株较多(表 3)。

▲.本实验室分离测序毒株;△.美国辉瑞公司疫苗毒株 ▲. Isolate sequencing virus strains in this study; △. Pfizer vaccine strain 图 2 FPV VP2基因的遗传进化分析 Fig. 2 Genetic evolution analysis of FPV VP2 gene
表 3 VP2蛋白氨基酸位点变异分析 Table 3 VP2 Protein amino acid position variation comparison
2.2 病毒分离鉴定结果

将处理后的临床样品接种F81细胞48 h后,在显微镜观察下出现细胞伸长、拉丝、结网、脱落等典型的细胞病变,盲传3代获得1株FPV毒株,命名为FPV-QDC20。电镜观察病毒粒子为无囊膜、二十面体立体对称,直径约22 nm(图 3),病毒样颗粒与细小病毒的典型形态相符合。间接免疫荧光试验(IFA)鉴定为FPV阳性(图 4),其第3代细胞毒HA效价为211,病毒滴度为104.5 TCID50·mL-1。扩增QDC20的VP2基因后,分析VP2蛋白上15个关键氨基酸位点(Lys-80、Met-87、Lys-93、Ile-101、Val-103、Val-232、Ser-297、ALA-300、ASP305、Asp-323、Asp-375、ASN-426、VAL-555、ASN-564和ALA-568),确定该毒株为FPV。

图 3 FPV-QDC20的电镜观察结果(25 000×) Fig. 3 Electron microscope observation of virus strain QDC20 (25 000×)
图 4 FPV-QDC20的IFA鉴定结果(200×) Fig. 4 Fluorescence identification of FPV-QDC20(200×)
2.3 全基因测序分析

测序并分析全基因序列,FPV-QDC20全基因长5 123 bp,其中3′Y型结构全长125 bp,5′U型结构全长188 bp;ORF1全长2 007 bp,编码非结构蛋白NS1、NS2;ORF2全长2 157 bp,编码结构蛋白VP1、VP2(图 5)。

图 5 FPV-QDC20的全基因扩增电泳图 Fig. 5 Feline parvovirus strain QDC20 complete gene PCR electrophoresis
2.4 动物回归试验

2.4.1 临床症状   幼猫于攻毒后第3天开始持续排毒直至死亡。攻毒初期被毛杂乱,精神沉郁,食欲减退,轻微腹泻,攻毒后5 d体重开始下降;攻毒后7 d开始体温有升高,9 d开始出现明显的临床症状,体温明显升高,食欲减退至废绝,呕吐,腹泻,脱水,病程持续3~4 d后,3只猫全部死亡。

2.4.2 血常规检查结果   在攻毒后1、3、5、7、9、11、13 d给试验猫采血,进行血常规检查。结果表明,攻毒组的淋巴细胞、白细胞、中性粒细胞数量均出现明显下降(图 6)。

图 6 试验组猫血常规结果 Fig. 6 Blood routine data of infected cats

2.4.3 抗体检测结果   攻毒猫于0、1、3、5、7、9、11、13 d分别采血,分离血清,HI检测抗体,结果显示,抗体在5 d明显变高,9 d抗体效价<8,低抗体状态一直持续到猫死亡(图 7)。

图 7 试验组猫抗体效价 Fig. 7 Antibody titer of infected cats

2.4.4 剖检及病理组织学观察结果   攻毒猫均在攻毒后14~15 d死亡,剖检可见肛门周围有粪便,小肠黏膜充血水肿,以十二指肠和直肠病变最为突出,肠道内容物有血丝。肝肿大呈暗红色,脾肿大,充血出血,脾边缘出现梗死性病灶(图 8)。心肌组织间隙增宽,心肌纤维出血,横纹肌断裂,心肌细胞变性;肝血管壁通透性增加,出血,部分细胞变性坏死,肝索细胞变性;肺泡腔空隙间小,肺泡壁增厚,出现肺实变。肺出血、淤血,炎性细胞浸润;肾小管闭锁,肾小球略有萎缩,变性坏死;脾出现部分坏死,局部有充血,出血现象。十二指肠肠壁水肿,出血、淤血。空肠肠壁水肿,出血、淤血。回肠壁水肿,红细胞少量弥漫在组织间隙(图 9)。

图 8 攻毒组猫肠、肝病变 Fig. 8 Intestinal and liver pathological changes in challenged cats
A、B. 心肌组织间隙明显增宽,心肌纤维出血,横纹肌断裂;C、D. 肝血管壁通透性增加,出血,肝细胞变性;E、F. 肺泡壁增厚,上皮细胞变性,肺出血、淤血,部分肺泡壁断裂,炎性细胞浸润;G、H. 部分肾小球坏死变小,局部出血;I、J. 脾出血严重,出现干酪样坏死;K、L. 回肠肠壁出血,水肿;M、N. 空肠壁出血,水肿,上皮细胞变性。左侧图片放大倍数为100×,右侧图片放大倍数为400× A, B. Myocardial tissue gap widened significantly, myocardial fiber bleeding, striated muscle rupture; C, D. Hepatic vascular wall permeability increased, bleeding, hepatocyte degeneration; E, F. Alveolar wall thickening, epithelial cell degeneration, pulmonary bleeding, congestion, part of alveolar wall fracture, inflammatory cell infiltration; G, H. Partial glomerulus necrosis became smaller, local hemorrhage; I, J. The spleen is hemorrhaging badly, showing caseous necrosis; K, L. Ileum wall hemorrhage, edema; M, N. Jejunum wall hemorrhage, edema, epithelial cell degeneration. The magnification of the picture on the left is 100×, and that on the right is 400× 图 9 攻毒猫各组织病理切片 Fig. 9 Pathological section of infected cats
3 讨论

本研究于2018—2020年采集山东省多家动物医院疑似猫瘟样本54份,PCR扩增VP2基因并进行测序,成功对16株病毒株的VP2基因全长进行测序,推导出氨基酸序列,与NCBI中的参考序列进行比对和分析。通过比对关键氨基酸位点15株为FPV,1株为猫源CPV。除QNBL2、QNBL3两株外,本实验室获得的山东地区FPV毒株序列在进化树上处于一个大的分支上,与20世纪末的美国毒株以及20世纪末到21世纪初中国上海、长春、山东、桂林等地分离的FPV和MEV毒株亲缘关系较近,与辉瑞公司疫苗株、芬兰、加拿大、葡萄牙等地分离的一些毒株亲缘关系相对较远,本研究分离的所有毒株都与欧洲毒株亲缘关系较远。QDC20毒株与20世纪末到21世纪初在中国各地分离到的FPV和MEV亲缘关系较近,可以认为是一株在中国境内有广泛分布的经典型FPV毒株。

VP2蛋白形成FPV病毒的大部分衣壳结构,决定病毒株的抗原特性与宿主范围[10]。VP2蛋白氨基酸中Loop 1 ~ Loop 5构成5个主要环状三级结构区域。Loop 1、2、4既构成VP2蛋白质折叠单元纤突顶端部分,又与第93、222、224和426位氨基酸位点共同构成抗原位点A(site A);Loop 3不但构成蛋白质折叠单元的肩部,而且还与第299、300和302位氨基酸位点共同形成抗原位点B (site B)[11-12]。研究表明,FPV是CPV和MEV的共同的祖先,决定FPV的宿主范围氨基酸位点为80、93、103、323、564、568位点[11, 13-14]。以Felocell疫苗株为参考毒株进行氨基酸位点分析比对发现,本研究的15株FPV序列在16、31、80、91、93、101、103、232、267、300、322、440、562共13个氨基酸位点有变异,其中在91、232、562三个位点有变异的毒株较多,其他变异位点较为分散。

第91位氨基酸位点突变位于Loop 1中,第232位氨基酸位点突变位于Loop 2中,这些位点的突变可能改变VP2蛋白折叠构象,也可能改变抗原位点A的特性,从而影响传统疫苗株产生的中和抗体对抗原A位点的识别,逃避免疫监视;第562位氨基酸位点不位于已知的关键区域内,其功能还需要进一步探究。这些变异数量较多的突变位点有可能是在疫苗压力下产生的,可能导致免疫失败,需要有针对性的进行下一步研究。第93位氨基酸残基是抗原位点A(site A)中的一个关键位点[15],它的突变可能会改变病毒粒子的抗原性和宿主范围。出现此变异可能提高FPV毒株在犬细胞中的感染性,降低毒株在猫细胞上的感染性。有研究表明VP2蛋白93位氨基酸残基对CPV与犬转铁蛋白受体(transferrin receptor, TfR)结合能力及感染宿主细胞有影响,对宿主范围起重要作用[11, 16]。第300位氨基酸残基是抗原位点B(site B)中的一个关键位点,可能与中和抗体的产生有关[15],此突变有可能使疫苗株产生的中和抗体效力降低。有研究表明第300位氨基酸的变化可能改变宿主范围,还能协调其他变异位点改变病毒与TfR受体的结合从而改变感染效率[17]

有研究表明在猫科动物的体内有多种细小病毒共感染的病例[18-19],不同的细小病毒共感染猫科动物可能导致病毒基因重组,使宿主范围进一步扩大。本研究中发现QDBL2毒株中出现了80、93、103三个氨基酸位点变异,一般认为这些位点在FPV上是保守的,这些变异通常出现在CPV中[14],这3个变异位点的出现,或许跟CPV与FPV的重组有关。FPV自1928年被发现以来,一直是猫科动物危害最大的传染病病原之一,进一步监测细小病毒的变异情况对细小病毒传染病的预防十分重要。

本研究的分离株FPV-QDC20动物回归试验结果显示,该分离株可以感染猫并引起显著的临床症状,最终导致试验猫死亡。未来还需要进行进一步的广泛的流行病学调查,监测FPV的遗传变异情况及目前使用的FPV疫苗的有效性。

4 结论

本研究得到15株FPV VP2基因序列,遗传进化树显示,与20世纪末的美国毒株以及20世纪末以来中国内地分离毒株亲缘关系较近,与欧洲毒株亲缘关系较远。以Felocell疫苗株为参考毒株进行氨基酸位点分析比对发现,本研究的15株FPV序列在13个氨基酸位点有变异。成功分离1株FPV,命名为QDC20。该毒株滴度为104.5 TCID50·mL-1;动物回归试验结果显示,该分离株有显著的致病性,最终导致试验猫死亡。

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(编辑   白永平)