2. 山东农业大学动物科技学院/动物医学院基础兽医学系, 泰安 271018;
3. 山东农业大学山东省动物生物技术与疾病预防控制重点实验室, 泰安 271018
2. Department of Basic Veterinary Medicine, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University, Tai'an 271018, China;
3. Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Biotechnology and Disease Control and Prevention, Shandong Agricultural University, Tai'an 271018, China
A型流感病毒是流感病毒中最常见的,可以感染人类、猪、狗、马等动物[1-2]。根据血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的抗原性可将A型流感病毒分为不同的亚型,已知A型流感病毒HA有18种亚型,NA有11种亚型[3-6]。猪呼吸道中同时含有类禽样唾液酸(sialic acid, SA)-α-2, 3Gal受体和类人样SA-α-2, 6-Gal受体[7-9],可以同时被禽源、人源流感病毒感染。不同种属来源的病毒在猪体内产生重组病毒,这些重组病毒可以导致跨种感染,对人类及动物产生危害。
日前,在世界各地猪群中主要传播H1N1、H1N2和H3N2 3种猪流感病毒(swine influenza virus,SIV)亚型,这些SIV亚型的起源以及抗原和遗传特征不同[10-12]。经典H1N1 SIV被认为是随着1918年西班牙流感大流行进入猪群[13]。中国大陆于1991年发现有经典H1N1病毒[14-15]。欧亚类禽H1N1病毒2001年在中国香港购入的猪中检测到,经典H1N1和欧亚类禽H1N1病毒间重排的毒株出现,并在临床上流行[16]。引起2009年的大流行病毒为3源重排病毒,之后由2009年大流行病毒片段和其他来源的SIV的重排病毒也已从不同国家分离[17],给公共卫生带来巨大的威胁。
不同类型流感病毒在猪体内重排产生的新的毒株,具有潜在的引起猪流感大流行的可能性,需要对SIV进行实时监控。因此,本实验室于2018年4月份在河南省某猪场采集鼻拭子样品150份,分离到1株H1N1亚型SIV,进行了分离病毒全基因组的序列测定与分析及小鼠的致病性研究,研究结果丰富了我国猪流感分子流行病学调查内容,为进一步开展SIV的防控提供重要的理论依据。
1 材料与方法 1.1 临床样品及病毒分离2018年4月,从河南省南阳市猪场采集150份鼻拭子样品,将样品上清液经尿囊腔接种于10日龄SPF鸡胚(0.2 mL·胚-1),置于37 ℃孵化箱孵育72 h,收获尿囊液并通过HA试验检测其血凝效价及使用鉴定引物扩增流感病毒NP节段。将分离的病毒用SPF鸡胚纯化,用Reed-Muench方法测定病毒的EID50。
1.2 病毒亚型的鉴定及测序SIV分型引物及各基因片段扩增引物均由本实验室设计、上海生工生物工程技术服务有限公司合成。采用TRIzol法提取病毒RNA,利用通用引物Uni12(5′-AGCAAAAGG-3′)将RNA反转录为cDNA,以反转录产物为模板进行亚型鉴定及8个基因片段的扩增。扩增产物送上海生工生物工程技术服务有限公司测序。
1.3 病毒的遗传进化与分子特征分析应用DNASTAR软件包中的Seqman软件进行拼接;Megalign软件进行同源性比较和氨基酸特征分析;用MEGA7软件绘制进化树;利用NetNGlyc 1.0 Server糖基化位点预测器(http://www.healthtech.dtu.dk in the future),对氨基酸潜在糖基化位点进行预测分析。
1.4 病毒对小鼠的致病性试验将16只6周龄BALB/c雌性小鼠随机分成感染组和对照组,每组8只。每只小鼠经鼻腔接种106EID50病毒,对照组用相同的方法接种PBS。每天观察小鼠临床症状并称量体重。感染后第3天每组随机各剖杀3只小鼠,无菌采集各组织器官备用。
2 结果 2.1 病毒分离鉴定及同源性分析分离出1株SIV,通过RT-PCR鉴定为H1N1亚型,命名为A/swine/Henan/NY20/2018(H1N1)。利用Megalign软件将参考毒株分别与分离病毒进行核苷酸同源性比较,结果显示,PB2、PB1、NA和NS均与A/swine/Guangxi/NNXD2023/2013(H1N1)相似性最高,在98.4%以上,PA与A/swine/Guangxi/1874/2012(H3N2)相似性最高,为98.8%,M和A/swine/Guangdong/NS2883/2012(H3N2)相似性最高,为98.9%,HA与A/swine/Guangxi/3858/2011(H1N1)相似性最高,为98.2%,NP与A/swine/Guangxi/BB1/2013(H1N1)相似性最高,为99%。
2.2 遗传进化分析对分离病毒8个基因片段进行遗传进化分析。结果显示,分离病毒H1基因属于欧亚类禽H1N1分支,N1基因与H1基因具有相同的分支(图 1)。相比于表面基因,内部基因聚集成相同的聚类模式,除了NS基因属于经典H1N1分支,剩余内部基因全部属于2009年甲型H1N1分支。
对分离病毒A/swine/Henan/NY20/2018(H1N1)基因上的关键氨基酸位点进行了分析,HA蛋白的裂解位点对流感病毒的毒力和致病性具有决定性的作用[18-20]。HA蛋白的裂解位点为PSIQSR↓ GL,具备低致病性流感病毒的分子特征。HA蛋白的受体结合位点发生了T155V(对应H3 HA基因编码位点),T159N、G225E位的突变,T155V和T159N位的突变是禽流感适应猪群的必需突变[21]。HA蛋白225位能够提高病毒颗粒的组装和出芽效率,且225E的病毒比携带225G的病毒复制得更快[22]。分离株的225位为E,对流感病毒的传播起到重要作用。研究发现,HA蛋白226 Q和228 G容易与SA-α-2, 3-Gal受体结合,L226和S228则容易与SA-α-2, 6-Gal受体结合[23]。分离株226位和228位分别为Q和G,表明该病毒容易与SA-α-2, 3-Gal受体结合。HA蛋白糖基化位点分别为14NST16、26NVT28、277NCT279、484NGT486和543NGS545。NA蛋白糖基化位点分别为57NNT59、62NQT64、67NVS69、87NSS89、145NGT146和234NGS236。PB2蛋白的627和701位的被认为是哺乳动物适应性的突变,单个E627K或D701N突变可能会增加病毒的致病性[24]。有相关报道表明,PB2蛋白的591R对于2009甲型H1N1流感病毒对哺乳动物适应很重要[25]。PB2蛋白的627位和701位均未发生突变,但是591位出现了突变。最常见的NA蛋白耐药性的突变存在于N1亚型的H275Y和N295S[26-27],N1蛋白的275位和295位未发生突变,表明对神经氨酸酶抑制剂类药物敏感。有相关报道表明,2009甲型H1N1流感病毒在M2蛋白的31N已经发生突变,对金刚烷胺药物具有耐药性[28]。M2蛋白31位出现S到N的突变,表明具有金刚烷胺类药物的耐药性。
2.4 小鼠致病性试验感染组小鼠第3天开始表现出活动量和采食量减少、扎堆、皮毛皱纹、体重下降等临床症状,体重于感染后的第8天降到最低,最大下降比19.67%,随后体重逐渐恢复。
对照组保持健康且体重保持平稳状态(图 2A)。脏器滴定结果显示,感染组小鼠在肺中检测到的病毒含量为4.25 lg EID50·mL-1,在鼻甲中检测到的病毒含量为2.67 lg EID50·mL-1,在脑、脾和肾中均未检测到病毒复制。对照组未检测到病毒(图 2B)。对小鼠肺HE染色,组织病理变化主要表现为肺泡壁毛细血管充血、出血,肺泡壁增厚,炎性细胞浸润等。对照组未见明显的病理变化(图 2C)。
由于猪具有A型流感病毒“混合容器”的作用,所以当多种流感病毒亚型的共同循环可导致基因重排新病毒的产生[29-33]。2009年,在墨西哥和美国出现人感染2009甲型H1N1,随后的一段时间内迅速传播至多个国家[34]。在发生人感染2009甲型H1N1之后,在加拿大发现猪感染2009甲型H1N1的病例[35-36]。在我国香港发现第1个重配的H1N1病毒,其基因片段来源于2009甲型H1N1(NA),欧亚类禽H1N1(HA),6个内部基因3重重组SIV[37]。目前,猪群中经常分离到含有2009甲型H1N1基因的新型重配病毒[32]。本研究中,A/swine/Henan/NY20/2018(H1N1)为1株3源重排H1N1病毒,其基因片段来源于欧亚类禽H1N1 (HA和NA)、2009甲型H1N1(PB2、PB1、PA、NP、M)和经典H1N1(NS)。此种基因型在2013年广西省曾报道过[25]。此次分离的病毒5个内部基因来源于2009甲型H1N1,再次验证了含有2009甲型H1N1基因已经相对稳定的存在猪群中。
为了评估分离株在哺乳动物物种中的致病性,笔者将BALB/c小鼠作为感染模型,研究结果发现分离株在小鼠肺和鼻甲能够有效的复制,肺出现明显的病理学变化,没有出现小鼠的死亡。说明分离株对小鼠的有一定的致病性,但致病力不强,其具体的致病性还有待于到猪体内验证。
2009甲型H1N1可以从猪群传染给人类,也可以从人类传播到猪群[38]。含有2009甲型H1N1基因片段的重配病毒已在全世界的猪中广泛传播[39-40]。含有2009甲型H1N1基因的流感病毒是否会引发下一次的流感大流行,将是关乎公共卫生学意义的重要事情。因此,需要加强SIV流行病学的监测。
4 结论在河南省流行病学调查中分离到1株H1N1亚型SIV,该分离株属于1株3源重排H1N1病毒,对小鼠呈现一定的致病力。提示需要进一步加强对SIV监测,为流感的防控及流感大流行的预测提供重要的理论依据。
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