2. 甘肃省动物卫生监督所, 兰州 730000
2. Gansu Animal Health Inspection Institute, Lanzhou 730000, China
在我国农业生产中,各种富含木质纤维素的植物废弃物数量巨大。然而长期以来,受生活方式、加工技术及其本身饲用性差等因素影响,这类废弃物没有得到合理利用。白蚁肠道是一个重要的生态系统,寄生着多种微生物,包括细菌、原生生物、真菌和古生菌[1],其肠道内微生物的相互作用是木质纤维素有效降解的重要原因[2-3]。Zhou等[4]从白蚁肠道分离出4株可降解纤维素、半纤维素的菌株,证明白蚁肠道的确存在可降解纤维素的细菌。因此,本试验旨在从低等白蚁肠道中筛选出纤维素降解能力高、易于培养、繁殖的菌株,以期为植物废弃物的生物降解技术提供优势菌株。
1 材料与方法 1.1 试验材料白蚁购自安徽滁州,均为低等木食黄胸散白蚁。细菌基因组DNA试剂盒、细菌PCR试剂盒、革兰染色液、荚膜染色液、芽胞染色液均购于北京索莱宝科技有限公司;羧甲基纤维素钠培养基(CMC-Na)、羧甲基纤维素钠刚果红培养基(CMC-Na刚果红培养基)、刚果红购于山东拓扑生物工程有限公司。
1.2 白蚁的处理取白蚁20只,75%酒精消毒5 min。无菌操作台下取出肠道组织,匀浆混匀后取菌液梯度稀释液100 μL涂布于CMC-Na,LB琼脂和血平板,有氧/厌氧,37 ℃倒置培养24 h/72 h,刚果红染色后测量透明水解圈直径(D)和菌落直径(d), 计算D/d比值。每个稀释梯度做3个平行试验。
1.3 纯化挑取单个菌落,点种于初筛选的培养基上,37 ℃划线培养3次,挑取生长良好的单个菌落纯化,经刚果红染色后,对有透明圈的菌株进行革兰染色与镜检,并进行编号。
1.4 纤维素酶的活力测定按8%的接菌量分别取培养菌种,接种于装有100 mL CMC-Na、滤纸及脱脂棉球培养基,37 ℃,120 r·min-1培养48 h。取发酵液2 mL,5 000 r·min-1离心5 min,取上清液(粗酶液)。采用DNS法分别检测纤维素内切葡聚糖酶(CMCase)、滤纸酶(FPA)、纤维素外切葡聚糖酶(CX)活力[5]。
酶活力计算公式:酶活力(IU)=(还原糖的量×稀释倍数×1 000)÷(180×0.5×反应时间)。
1.5 产纤维素酶菌株的种类鉴定采用革兰染色、荚膜染色、芽胞染色法,观察菌株的显微染色形态。采用肠杆菌科生化鉴定管对CX2~5菌株进行鉴定;采用VITEK2微生物生化自动鉴定仪对CX8、CX9、CX10进行鉴定。提取细菌基因,采用通用16S rDNA引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R (5′-TACGGTTACCTTG-TTACGACTT-3′),扩增16S rDNA全序列基因,送上海生工进行测序分析。
2 结果 2.1 产纤维素酶菌株的筛选37 ℃有氧/厌氧条件下,分别在3种培养基上对白蚁肠道菌进行菌株初筛,选择生长状态良好的10株细菌,依次命名为CX1~CX10,菌株透明水解圈与菌落直径的比值(D/d)为1.50~2.78,其中CX10的D/d值最大。
2.2 酶活力的测定如图 1所示,在10株菌中CMCase酶活较高的为CX8、CX9和CX10,活力分别为67.8、70.4和95.0 IU·mL-1;FPA酶活最高的为CX10号菌株,活力为49.51 IU·mL-1;CX酶活较高的为CX8、CX9和CX10,活力分别为20.96、25.23和23.26 IU·mL-1。综合3种纤维素酶活力的叠加结果,CX10、CX8、CX9高于其他菌株。
CX10革兰染色为阳性杆菌,采用荚膜染色和芽胞染色的方法,对CX10进一步观察,结果如图 2所示,CX10无荚膜,可见内生芽胞。
参考《常见细菌系统手册》、《伯杰氏系统细菌学手册》,初步判断CX2、CX4为肠杆菌科沙雷菌属(Serratia),CX3、CX5为肠杆菌科枸橼酸杆菌属(Citrobacter);初步判断CX8、CX9、CX10为芽胞杆菌科芽胞杆菌属(Bacillic),其中3株细菌在苦杏仁苷(AMY)、D-山梨醇(dSOR)、β-D-葡萄糖醛酸酶(BGUR)、D-甘露醇(dMAN)项有差异。
2.3.3 16S rDNA的PCR扩增及系统发育树的构建将克隆得到的菌株经16S rDNA基因扩增产物进行测序,在NCBI数据库中进行BLAST比对。可知CX2和CX4均来源于沙雷菌属(Serratia)的基因序列,一致性大于95%。CX3和CX5均来源于枸橼酸杆菌(Citrobacter)的基因序列,一致性大于95%。CX8、CX9和CX10菌株均来源于芽胞杆菌(Bacillus)的基因序列(一致性高于95%),其中CX10菌株与坚强芽胞杆菌(Bacillus firms)一致性高达97%,CX9菌株与Bacillus sp.171544一致性高达96%。
3 讨论木食黄胸散白蚁,属于低等白蚁,其肠道内细菌种类十分丰富,但大多数为不可培养的微生物[6]。本研究以羧甲基纤维素为基质, 建立富集培养基并通过刚果红染色、细菌透明水解圈D/d比值测定等手段,从低等白蚁肠道中共分离纯化出10株菌,主要为芽胞杆菌、枸橼酸杆菌、沙雷菌,其中CX10经16S rRNA基因鉴定为坚强芽胞杆菌,在已有文献中未见报道。本研究中没有分离到嗜纤维杆菌、肠球菌、厌氧中温梭菌等在白蚁肠道中出现的菌属[7-8],这可能与在白蚁肠道中兼性微生物是清除氧气和创造厌氧条件有关[9],也可能与试验选择的培养基,培养条件有关。除此之外,白蚁的种类也可能是一个重要因素[10-11]。研究表明,纤维素降解能力最强的菌株大多与芽胞杆菌有关[12-13],本研究通过测定菌株中CMCase、FPA、CX三种酶系的酶活,筛选出的CX8、CX9、CX10,均为芽胞杆菌,较之其他菌株,在产纤维素酶及酶活性方面都有很大优势,而分离的肠杆菌CX2~5产酶量较少。
4 结论从低等木食黄胸散白蚁肠道筛选出10株产纤维素酶菌株,主要为芽胞杆菌、枸橼酸杆菌、沙雷菌,其中芽胞杆菌为主要产酶菌株。产纤维素酶最高的坚强芽胞杆菌CX10具有进一步深入研究的价值。
[1] | HUSSAIN A A, ABDEL-SALAM M S, ABO-GHALIA H H, et al. Optimization and molecular identification of novel cellulose degrading bacteria isolated from Egyptian environment[J]. J Genetic Eng Biotechnol, 2017, 15(1): 77–85. DOI: 10.1016/j.jgeb.2017.02.007 |
[2] | HONGOH Y, OHKUMA M, KUDO T. Molecular analysis of bacterial microbiota in the gut of the termite Reticulitermes speratus (Isoptera; Rhinotermitidae)[J]. FEMS Microbiol Ecol, 2003, 44(2): 231–242. DOI: 10.1016/S0168-6496(03)00026-6 |
[3] | OHKUMA M. Termite symbiotic systems:efficient bio-recycling of lignocellulose[J]. Appl Microbiol Biotechnol, 2003, 61(1): 1–9. |
[4] | ZHOU H Z, GUO W, XU B, et al. Screening and identification of lignin-degrading bacteria in termite gut and the construction of LiP-expressing recombinant Lactococcus lactis[J]. Microb Pathogenesis, 2017, 112: 63–69. DOI: 10.1016/j.micpath.2017.09.047 |
[5] |
何力, 郝勃, 谢从新, 等. 草鱼肠道纤维素酶产生菌主要种类的分离与鉴定[J]. 应用与环境生物学报, 2009, 15(3): 414–418.
HE L, HAO B, XIE C X, et al. Isolation and identification of major cellulase-producing Fungi in Intestines of Grass Carp[J]. Chinese Journal of Applied and Environmental Biology, 2009, 15(3): 414–418. (in Chinese) |
[6] | MIKAELYAN A, DIETRICH C, KÖHLER T, et al. Diet is the primary determinant of bacterial community structure in the guts of higher termites[J]. Mol Ecol, 2015, 24(20): 5284–5295. DOI: 10.1111/mec.13376 |
[7] |
徐荣.木食性高等白蚁肠道内纤维素降解菌的筛选及酶活性分析[D].武汉: 华中师范大学, 2013.
XU R. Isolation of cellulose-degrading bacteria from wood-feeding higher termites and the analysis of the cellulase and xylanase activities of these bacteria[D]. Wuhan: Central China Normal University, 2013. (in Chinese) http://cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-10511-1015570061.htm |
[8] |
陈娟.两种木食性白蚁肠道内共生细菌多样性的比较研究[D].武汉: 华中师范大学, 2011.
CHEN J. Comparative studies on the diversity of intestinal symbiotic bacteria between two different wood-feeding termites[D]. Wuhan: Central China Normal University, 2011. (in Chinese) http://cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-10511-1011138261.htm |
[9] |
孙新新, 宁娜, 谭慧军, 等. 白蚁肠道微生物多样性和作用研究进展[J]. 应用与环境生物学报, 2017, 23(4): 764–770.
SUN X X, NING N, TAN H J, et al. Effects of tannic acid on salt ion availability of saline-alkali soils in the Yellow River Delta[J]. Chinese Journal of Applied and Environmental Biology, 2017, 23(4): 764–770. (in Chinese) |
[10] |
宁娜, 张倪, 吴燕, 等. 台湾乳白蚁和黄翅大白蚁消化道主要木质纤维素降解酶活性比较[J]. 应用与环境生物学报, 2015, 21(4): 678–682.
NING N, ZHANG N, WU Y, et al. Comparison of lignocellulolytic enzyme activities of the fungus-growing termite Macrotermes barneyi and the lower termite Coptotermes formosanus[J]. Chinese Journal of Applied and Environmental Biology, 2015, 21(4): 678–682. (in Chinese) |
[11] | HUANG X F, BAKKER M G, JUDD T M, et al. Variations in diversity and richness of gut bacterial communities of termites (Reticulitermes flavipes) fed with grassy and woody plant substrates[J]. Microb Ecol, 2013, 65(3): 531–536. DOI: 10.1007/s00248-013-0219-y |
[12] | YOON K A, KIM J H, HWANG C E, et al. Cellulase gene expression profiles in termites according to habitat and diet[J]. J Asia-Pacific Entomol, 2015, 18(3): 369–375. DOI: 10.1016/j.aspen.2015.04.007 |
[13] |
邹昌瑞, 魏国清, 刘朝良, 等. 柞蚕肠道菌群分析及产酶菌的筛选与鉴定[J]. 中国农业科学, 2011, 44(12): 2575–2581.
ZOU C R, WEI G Q, LIU C L, et al. Analysis of bacterial community and screening and identification of enzyme-producing bacteria in intestine of Antheraea pernyi[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2011, 44(12): 2575–2581. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.12.021 (in Chinese) |