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刘宇程, 邱恋, 梁晶晶, 李玲丽, 马丽丽
一株聚丙烯酰胺降解菌的筛选及降解特性研究
生物技术通报, 2019, 35(9): 178-183

LIU Yu-cheng, QIU Lian, LIANG Jing-jing, LI Ling-li, MA Li-li
Screening and Degradation Characteristics of a Strain Degrading Polyacrylamide
Biotechnology Bulletin, 2019, 35(9): 178-183

文章历史

收稿日期:2019-04-09

一株聚丙烯酰胺降解菌的筛选及降解特性研究
刘宇程1, 邱恋1, 梁晶晶1, 李玲丽1, 马丽丽1,2     
1. 西南石油大学化学化工学院,成都 610500;
2. 南开大学环境污染过程与基准教育部重点实验室,天津 300350
摘要:从含聚丙烯酰胺(Polyacrylamide,PAM)污泥中筛分出一株聚丙烯酰胺降解菌,该菌能同时以PAM为唯一碳源和唯一氮源生长。在PAM起始浓度为1.2 g/L、温度为35℃、pH为7.0时,PCX菌株(接菌量5%)在48 h内对PAM的降解率可达43%。经生理生化和16S rDNA序列分析,确定该菌株为克雷伯氏菌属(Klebsiella sp.),命名为PCX。聚丙烯酰胺(分子量:3×103 kD)降解后其产物分子量为0.619 kD。结合红外光谱结果,推断其分子链上的酰胺基水解成羧基,侧链降解。生物急性毒性分析结果表明,其EC50为106 mg/L,说明降解产物对水生生物无毒害作用。
关键词菌株鉴定    克雷伯氏菌    聚丙烯酰胺    降解特性    
Screening and Degradation Characteristics of a Strain Degrading Polyacrylamide
LIU Yu-cheng1, QIU Lian1, LIANG Jing-jing1, LI Ling-li1, MA Li-li1,2     
1. School of Chemistry and Chemical engineering, Southwest Petroleum University, Chengdu 610500;
2. Ministry of Education Key Laboratory of Pollution Processes and Environmental Criteria, Nankai University, Tianjin 300350
Abstract: A bacterial strain degrading polyacrylamide was screened from the sludge containing polyacrylamide(PAM). The bacterium can grow with polyacrylamide as the sole carbon source and nitrogen source. The degradation rate of PAM by the strain(inoculation 5%)reached 43% within 48 h when the initial concentration of PAM was 1.2 g/L, the temperature was 35℃, and the pH was 7.0. The strain was identified as Klebsiella sp., named PCX, after physiological, biochemical and 16S rDNA sequence analysis. The molecular weight of the degraded product of PAM(molecular weight:3×103 kD)was 0.619 kD. Combined with the results from infrared spectroscopy, the amide group on the molecular chain was hydrolyzed to carboxyl group and the side chain was degraded. The results of acute biological toxicity analysis showed that the EC50 was 106 mg/L, indicating that the degraded products had no toxic effect on aquatic organisms.
Key words: strain identification    Klebsiella    polyacrylamide    degradation characteristics    

聚丙烯酰胺(Polyacrylamide,PAM)以其相对高分子量、高黏度的特性,在石油工业、水处理、造纸业和化学工业等具有广泛的应用[1-3],其中石油行业是我国PAM使用量最大的领域[4]。PAM作为三次采油的驱油剂注入地下后,产生大量含有高浓度聚合物的产出水,严重影响了后续油水分离过程[5]。虽然PAM本身无毒,但其单体丙烯酰胺能损伤人和动物神经系统[6]

PAM在水环境中的迁移和积累对生物及人体健康具有潜在影响,因此亟待开展PAM的高效降解研究[7]。微生物降解是自然环境中有机污染物完全矿化的主要方法。微生物可通过利用或合成酶类、非蛋白质类和胞外其他物质等分解PAM[8-9]。PAM可作为氮源被微生物利用[10]。PAM也可作为碳源进行微生物生长[11-12]。本实验从受PAM污染的污泥中筛选出一株能以PAM作为唯一碳、氮源的降解菌株,研究了该菌株的降解特性,相关结果可以为受PAM污染环境的修复提供参考。

1 材料与方法 1.1 材料 1.1.1 样品及试剂

菌种来源:陕蒙交界地区的大牛地油田含聚丙烯酰胺污泥。聚丙烯酰胺:分析纯,购自成都科龙化工试剂厂,分子量3×103 kD。

1.1.2 培养基

营养培养基:酵母浸粉5 g/L,蛋白胨10 g/L,氯化钠5 g/L,调pH为7。基础培养基:聚丙烯酰胺,酵母浸粉0.05 g/L,氯化钠0.5 g/L,磷酸氢二钾1 g/L,七水合硫酸镁0.2 g/L,琼脂15 g/L(固体培养基),调pH为7。富集培养基:聚丙烯酰胺0.3 g/L,酵母浸粉5 g/L,胰蛋白胨10 g/L,氯化钠10 g/L,琼脂15 g/L(固体培养基),调pH为7。聚合物培养基:聚丙烯酰胺1.2 g/L,氯化钠5 g/L,磷酸氢二钾0.5 g/L,磷酸二氢钾0.5 g/L,七水合硫酸镁0.2 g/L,pH为7。牛肉膏蛋白胨培养基:牛肉膏3 g/L,蛋白胨10 g/L,氯化钠5 g/L,琼脂15 g/L(固体培养基),调pH为7。

实验所用试剂均为分析纯,购自成都科龙化工试剂厂。

1.2 方法 1.2.1 降解菌株的驯化及分离

取3 g污泥样品接种于100 mL营养培养基中,在30℃、140 r/min的条件下培养48 h,富集污泥中微生物。后取5 mL菌液接种于100 mL基础培养基中,其中PAM浓度按梯度依次为0.6 g/L、0.9 g/L、1.2 g/L、1.5 g/L、1.8 g/L和2.0 g/L逐渐增大,在相同条件下培养7 d后吸取5 mL驯化液转接到新的基础培养基培养,驯化周期为7 d,连续驯化3个周期后,分别吸取1 mL菌液涂布到富集培养基平板上,30℃下倒置培养24 h-48 h,挑取平板上长出的不同菌落进行划线纯化,保存分离菌株。

在基础培养基的前提下,去掉酵母浸粉,分别加入葡萄糖、氯化铵和不加营养物质配置出限制氮源培养基、限制碳源培养基、限制营养源培养基。

1.2.2 菌株鉴定

将纯化后菌液均匀涂在牛肉膏蛋白胨培养基上恒温培养24 h-48 h后,选择分布适中的单菌落进行观察:大小与形状、隆起、边缘、表面、硬度、透明度等。

使用TIANGEN细菌基因组DNA试剂盒提取菌株DNA,利用通用引物27F(5'-AGAGTTTGATCC-TGGCTCAG-3')和1492R(5'-GGTTACCTTGTTACGT- TACGACTT-3')对细菌16S rDNA基因进行PCR扩增,PCR扩增条件为94℃下预变性4 min;94℃变性1 min,53℃退火90 s,72℃延伸2 min,30个循环;72℃延伸10 min。扩增产物送至上海生工生物公司进行测序,所得结果经NBCI数据库比对后,挑选相关序列,采用MEGA 5.0软件构建系统发育树。

1.2.3 PAM浓度的影响

将聚合物培养基中PAM的浓度依次调整为0.3 g/L、0.6 g/L、1.2 g/L、2.4 g/L、3.6 g/L、4.8 g/L、7.2 g/L和9.6 g/L。将挑选出的菌种接种至培养基中,放入摇床中(30℃,140 r/min)震荡培养48 h后,分别测定细菌浓度和PAM降解率。利用淀粉-碘化镉测定PAM浓度[13]

1.2.4 培养温度的影响

将菌种接种至聚合物培养基中,分别在20、25、30、35和40℃水浴恒温振荡器中培养,140 r/min,震荡培养48 h后,分别测定细菌浓度和PAM降解率。

1.2.5 培养基初始pH的影响

将聚合物培养基初始pH值分别调节为3.5、4.5、5.5、6.8、7.5、8.5和9.5,并接种菌种至培养基中,放入摇床(35℃,140 r/min)震荡培养48 h后,分别测定细菌浓度和PAM降解率。

1.2.6 降解曲线的测定

在上述所测量的最适PAM初始浓度和pH基础上,PCX接种到以PAM为唯一营养源的培养基中,放入摇床(35℃,140 r/min)震荡培养48 h后,分别测定细菌浓度和PAM降解率。

1.2.7 PAM降解产物分析

将降解后的培养液6 000 r/min离心5 min,弃沉淀保留上清液,然后上清液和无水乙醇以1:2体积比震荡混合均匀,静置10 min后以3 000 r/min离心15 min,收集沉淀。沉淀物真空干燥后即得待测样品。凝胶渗透色谱测定降解产物的分子量,采用安捷伦PLGPC220色谱分析仪,以四氧呋喃(THF)为流动相,测定样品的分子量。利用傅里叶变换-红外光谱仪对PAM及其降解产物进行分析,分析波长介于400-4 000 cm-1之间。本实验采用费氏弧菌(Vibrio fischeri NRRL B-11177)测定聚丙烯酰胺降解产物的生物急性毒性,利用发光细菌分析仪BioFix® Lumi-10测定细菌光强度的变化,用SPSS软件的Probit工具计算PAM降解产物的半数效应浓度(EC50)。

2 结果 2.1 降解菌株的分离筛选

从分离菌株中筛选出3株菌,分别命名为PCS、PCX、PW,为了研究3株菌对PAM的利用,将3种细菌的菌悬浮液分别接种到限制氮源培养基、限制碳源培养基、限制营养源(碳源、氮源)培养基。当PAM作为唯一氮源时,如图 1所示,PCS、PCX、PW对PAM的降解率分别为42%、37%和31%,普遍高于PAM为碳源和PAM为唯一营养源的降解效果;同时3株降解菌的细菌浓度分别为2.13×108 CFU/mL、2.69×108 CFU/mL、2.44×108 CFU/mL,同样高于PAM为碳源和PAM为唯一营养源的培养基。当PAM作为唯一碳源和唯一碳、氮源时仅剩菌株PCX生长情况最好,细菌浓度大于108 CFU/mL,对PAM的降解率仍大于30%,因此选择PCX作为后期实验菌种。

图 1 PAM为碳源、氮源、同时为碳氮源条件下3株菌的降解率
2.2 优势降解菌PCX的鉴定

由菌落形态和个体形态观察发现,该细菌菌落形态特性呈现为:圆形、乳白色、有光泽、整齐、光滑及不透明;个体形态特性为:短杆状、革兰氏染色G-、无芽孢和无荚膜。进一步通过对PCX的16S rDNA检测发现:PCX的16S r DNA序列(GenBank登录号MK571603),与Klebsiella sp. NBRC 100048(登录号AB681138.1)有99.9%的相似度;根据测序结果,利用NCBI提供的Blast工具,经过16S rDNA测序及同源性对比,通过MEGA 5.5邻接法(Neighbour-joiningmethod,NJ)构建出系统发育树如图 2所示,因此鉴定菌株PCX为克雷伯氏杆菌属。

图 2 降解菌PCX基于16S rDNA序列的系统发育进化树
2.3 菌株PCX的降解特性 2.3.1 PAM浓度对菌株生长的影0响

图 3所示,当PAM初始浓度在1.2 g/L时,培养48 h后,PCX对PAM的降解率最高,达到35%。但当PAM的浓度大于3 g/L时,PAM的降解率受到抑制,基本低于20%。

图 3 PAM浓度对菌株生长和降解率的影响
2.3.2 温度对菌株生长的影响

培养温度对降解效果和菌体的生长的影响如图 4所示。在20-35℃条件下,随着温度的升高,PAM的降解率升高。在35℃时,PCX生长状况和降解效率最好,分别达到了2.44×108 CFU/mL和43%。因此选取35℃作为PCX的最适培养温度。

图 4 温度对降解的影响
2.3.3 培养基初始pH对菌株生长的影响

图 5所示,初始pH值的不同对PAM溶液中的PCX的生长产生了一定的影响,同时过高或过低的pH值都不利于PAM的降解,对于本实验的菌株PCX,适宜降解PAM的pH值范围是5.0-7.0,最适pH为7.0。

图 5 初始pH值对降解的影响
2.3.4 PAM的降解曲线

PCX接种到以PAM为唯一营养源的培养基中,随时间变化的生长曲线和降解曲线,如图 6所示。PCX在接种后2 h进入对数增长期,菌体数量不断增加,PAM降解率也随之明显升高,说明PCX能以PAM作为唯一营养源生长,同时使得PAM发生降解。培养40 h后细菌进入稳定期,细菌代谢产物不断积累,细菌繁殖速度下降,PAM降解率趋于平缓,降解率达43%左右。

图 6 降解菌PCX的降解曲线
2.4 降解产物的分子量变化

聚丙烯酰胺经过降解菌PCX降解后的产物的凝胶色谱结果如表 1所示,降解产物的数均分子量(Mn)、重均分子量(Mw)和峰位分子量(Mp)分别为0.602 kD、0.647 kD和0.619 kD。聚丙烯酰胺降解前的分子量为3×103 kD,表明在微生物的作用下,PAM主碳链发生断裂,被降解成为小分子物质。

表 1 PAM降解产物的凝胶色谱测定结果
2.5 降解产物的红外光谱分析

对微生物降解前后的PAM进行了红外光谱分析,如图 7所示,与生物降解前PAM样品的光谱中的峰相比,生物降解后的PAM样品的光谱中的C=O伸缩振动峰由1 665 cm-1移动到更高波数的位置1 672 cm-1处,2 925 cm-1为亚甲基反对称伸缩振动的特征吸收峰,2 854 cm-1为亚甲基对称伸缩振动的特征吸收峰。红外光谱分析表明C-N伸缩振动峰(降解前吸收峰在1 405 cm-1处)和N-H弯曲振动(降解前吸收峰在1 452 cm-1处)消失,3 300-3 500 cm-1波长范围内变成了一个宽大的吸收峰,表明PAM的酰胺基从PAM主链上剥落并被微生物利用,酰胺基通过微生物的降解完全转化为羧基。

图 7 PAM降解前后的红外光谱图
2.6 PAM降解产物的生物急性毒性评价

半数效应浓度(EC50)是导致发光细菌发光强度产生50%变化时的测试样品的浓度。用SPSS软件计算PAM降解产物的生物急性毒性,软件分析结果表明聚丙烯酰胺降解产物在30 min内对费希尔弧菌的EC50为106 mg/L,其95%置信区间为28-489。根据欧盟指令(Directive93/67/EEC)给出的化学品水生生物急性毒性分类规则,降解产物的半数致死浓度大于100 mg/g无毒性[14],可以判定克雷伯氏菌降解PAM的产物对水生生物无毒害作用,表明降解产物中可能无丙烯酰胺单体。

3 讨论

从若干分离菌株中筛选出3株菌(PCS、PCX和PW),PAM作氮源时,降解菌的生长状况和对PAM的降解率普遍优于PAM做碳源和PAM为唯一营养源时;说明PAM更易于被微生物作为氮源利用。但对于PAM来说,只有当它作为碳源被利用时才更有利于聚合物的解链和彻底降解。在本研究中当菌株生长在限制碳源和限制营养源培养基中时,菌株PCX生长情况最好,细菌浓度大于108 CFU/mL,对PAM的降解率仍大于30%,说明该菌株可以将PAM既作为氮源又作为碳源而进行利用。

PCX对PAM的适宜浓度是1.2-2.4 g/L,当培养基中PAM浓度较高时,体系的黏度也会上升,影响PCX菌体的扩散,同时PAM自身的絮凝、架桥作用使得微生物更难利用[15-16]。在高PAM浓度下,PCX需要更长的时间来适应环境。相反地,当PAM的浓度低于1.2 g/L时,PCX菌体的增殖速率略缓,最终菌体数量较低。温度对PAM降解率的影响较大。随着培养温度上升使酶促反应加快,有助于菌株PCX的代谢生长,利于微生物对底物PAM的降解[17]。不同的微生物在其不同的生长阶段和生理、生化过程中,最适宜的pH值也不同[18]。pH在5.0-7.0范围内,还原酶、胞外酰胺酶活性最好,对于底物的利用率最高,从而对PAM的降解效果最好[19-20]

通过对PAM降解产物的生物急性毒性评价发现,降解产物对水生生物无毒害作用。红外光谱分析表明聚丙烯酰胺在降解菌PCX的作用下,酰胺基已经转化为羧基被PCX作为氮源利用。PAM可同时被降解菌PCX作为碳源和氮源加以利用,将其分解代谢为小分子物质。克雷伯氏菌属在降解聚丙烯酰胺聚合物上具有一定的应用前景,为后续处理难降解聚合物提供新的思路。

4 结论

本研究从聚丙烯酰胺污染的污泥中初步筛选出3株好氧的PAM降解菌种,其中PCX在限制碳源和氮源的培养基中生长情况最好,对PAM的降解率达到了43%。PCX的形态特征、生理生化鉴定和16S rDNA序列鉴定的结果表明,PCX为克雷伯氏菌属,命名为Klebsiella sp. PCX。

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