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徐雅梦, 姜晓冰, 于涛
单核细胞增生李斯特菌LadR蛋白对外排泵MdrL的调控机制研究
生物技术通报, 2018, 34(12): 166-171

XU Ya-meng, JIANG Xiao-bing, YU Tao
Regulation of Efflux Pump MdrL by LadR in Listeria monocytogenes
Biotechnology Bulletin, 2018, 34(12): 166-171

文章历史

收稿日期:2018-05-10

单核细胞增生李斯特菌LadR蛋白对外排泵MdrL的调控机制研究
徐雅梦1, 姜晓冰1, 于涛2     
1. 河南师范大学生命科学学院,新乡 453007;
2. 新乡学院生命科学技术学院,新乡 453003
摘要:研究单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,Lm)调控子LadR对外排泵MdrL的调控作用及方式。采用同源重组技术构建ladR基因缺失菌株ΔladR;通过实时荧光定量PCR检测mdrL基因在野生株EGD-e和突变株ΔladR中的转录水平;构建重组蛋白表达菌株BL21(DE3)-ladR并纯化重组蛋白His6-LadR;通过凝胶阻滞试验检测LadR蛋白与mdrL基因启动子区域的结合活性。成功构建ladR基因缺失菌株ΔladR。与野生株EGD-e相比,突变株ΔladRmdrL基因的转录水平提高约51倍;成功构建重组蛋白表达菌株BL21(DE3)-ladR,纯化得到浓度为1 mg/mL的重组蛋白His6-LadR;凝胶阻滞实验结果显示,重组蛋白His6-LadR可与mdrL基因的启动子区域特异性结合。Lm的调控子LadR通过与mdrL基因启动子区域特异性结合实现对外排泵MdrL的负调控。
关键词单核细胞增生李斯特菌    LadR蛋白    外排泵    调控    
Regulation of Efflux Pump MdrL by LadR in Listeria monocytogenes
XU Ya-meng1, JIANG Xiao-bing1, YU Tao2     
1. College of Life Sciences, Henan Normal University, Xinxiang 453007;
2. College of Life Sciences and Technology, Xinxiang University, Xinxiang 453003
Abstract: The aim of this study is to investigate the role of LadR in the regulation of efflux pump MdrL in Listeria monocytogenes. The mutant strain ΔladR was constructed from the wild type strain EGD-e by homologous recombination. The transcriptional levels of mdrL in the wild type strain EGD-e and the mutant strain ΔladR were tested by quantitative reverse transcriptase PCR. The expression strain BL21(DE3)-ladR was constructed, and then the recombination protein His6-LadR was purified. Electrophoretic mobility shift assay(EMSA)was employed to assess the binding activity of LadR to the mdrL promoter. As results, the mutant strain ΔladR was constructed successfully. Compared to the wild type strain EGD-e, the transcriptional level of mdrL in ΔladR showed about 51-fold up-regulation. The expression strain BL21(DE3)-ladR was also constructed successfully, and the concentration of the purified recombinant protein His6-LadR was 1 mg/mL. Results of EMSA showed that His6-LadR protein was able to bind to the promoter of gene mdrL specifically. Conclusively, the regulator LadR negatively regulates the efflux pump MdrL by specifically binding to the promoter of mdrL.
Key words: Listeria monocytogenes    LadR    efflux pump    regulation    

单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,Lm)是一种重要的食源性致病菌,该菌在自然界分布广泛,易对熟肉制品、乳制品、海产品和蔬菜等食品造成污染。摄入被Lm污染的食品可引起李斯特菌病(Listeriosis)的爆发和流行[1]。老人、孕妇、新生儿以及免疫力低下者是李斯特菌病的易感人群,临床症状主要表现为败血症、脑膜炎、孕妇流产等[2]。李斯特菌病在全球范围内的发病率较低,但是其致死率却高达25.9%[3],严重威胁人类的健康。为了防止食品被致病菌污染,食品企业通常使用消毒剂来抑制或杀灭食品加工环境中的微生物。苯扎氯铵(Benzalkonium chloride,BC)属于季铵盐类消毒剂,被广泛应用于食品工业领域。BC的长期使用可能会促使耐药菌株的出现,影响其消毒效果。

许多文献报道,从食品加工环境和市售食品中分离的Lm菌株对BC敏感性下降[4-6]。目前研究者普遍认为外排泵是介导Lm对BC耐受的主要机制。外排泵属于膜转运蛋白,在细菌中广泛存在。除了参与细胞的正常物质运输和代谢,外排泵还能够去除细菌细胞和胞膜中的有害物质,帮助细菌抵御外界不良环境的影响[7]。研究报道,一些外排泵可将抗生素、消毒剂、重金属等作为底物排出菌体外使细菌产生耐药性[8]。我们先前的研究发现,主要易化子超家族(Major facilitator superfamily,MFS)外排泵MdrL在Lm对BC耐受中起作用。根据Lm全基因组序列可知,ladR基因反向位于mdrL外排泵基因的上游,编码的LadR蛋白由176个氨基酸分子组成,属于PadR转录负调控蛋白家族。Huillet等[9]推测,mdrL基因的启动子区域可能存在调控蛋白LadR的结合位点,但这一推测并没有被进一步证实。本研究以Lm标准菌株EGD-e为研究对象,利用同源重组技术[10]构建ladR基因缺失菌株ΔladR,通过实时荧光定量PCR(Quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction,qRT-PCR)、凝胶阻滞试验(Electrophoretic mobility shift assay,EMSA)等调查LadR蛋白对外排泵MdrL的调控作用及调控方式。

1 材料与方法 1.1 材料 1.1.1 菌株及质粒

Lm标准菌株EGD-e由华中师范大学罗勤教授惠赠;穿梭质粒pMAD和表达载体pET32a由本实验室保存;大肠杆菌DH5α和BL21(DE3)感受态细胞购自北京博迈德基因技术有限公司。

1.1.2 培养基及主要试剂

脑心浸液培养基(Brain Heart Infusion,BHI),购自北京陆桥生物技术有限公司;苯扎氯铵,购自上海阿拉丁生化科技股份有限公司;细菌基因组DNA提取试剂盒和质粒小提试剂盒,购自北京天根生化科技有限公司;胶回收试剂盒、PCR产物纯化试剂盒、T4连接酶、限制性内切酶,购自美国Thermo Fisher;Taq DNA聚合酶和dNTP,购自大连宝生物工程有限公司;His标签蛋白纯化试剂盒、BCA蛋白浓度测定试剂盒、EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5×),购自碧云天生物技术研究所;引物由上海捷瑞生物工程有限公司合成。

1.1.3 仪器与设备

DH360型电热恒温培养箱,北京科伟永兴仪器有限公司;THZ-82气浴恒温振荡器,金坛天竟实验仪器厂;TGL-16B型离心机,上海安亭科学仪器厂;ETC811型基因扩增仪,北京东胜创新生物科技有限公司;DYY-8C型电泳仪,北京市六一仪器厂;LightCycler@96实时荧光定量PCR仪,瑞士Roche;UNIVERSAL HOOD Ⅱ凝胶成像分析系统、Gene PulserXcellTM电转仪,美国Bio-Rad。

1.2 方法 1.2.1 ladR基因缺失突变株的构建与分子鉴定

以EGD-e基因组DNA为模板,分别用1408-1/1408-2和1408-3/1408-4两对引物扩增ladR基因的上下游同源臂,引物序列见表 1。利用重叠延伸PCR(Splicing by Overlap Extension,SOE-PCR)技术[11]融合上下游同源臂,融合片段经切胶回收后与穿梭载体pMAD分别用限制性内切酶BamH Ⅰ和Mlu Ⅰ进行同步双酶切。酶切产物经纯化后进行连接反应,将构建好的重组质粒pMAD-ΔladR转化至大肠杆菌DH5α中,将阳性转化株送至北京博迈德基因技术有限公司进行测序。

表 1 PCR扩增所用引物

采用青霉素G法制备EGD-e感受态细胞[12]。将测序正确的重组质粒pMAD-ΔladR与EGD-e感受态细胞混匀,电击后立刻加入500 μL BHI培养基于30℃培养3 h。将菌液均匀涂布于含红霉素(5 μg/mL)、和X-gal的BHI平板上,30℃培养48 h。挑取蓝色单菌落于含红霉素(5 μg/mL)的BHI液体培养基,39℃培养24 h。稀释菌液选择合适梯度的稀释液涂布于含红霉素(5 μg/mL)和X-gal的BHI平板上,39℃培养48 h。挑取蓝色单菌落于BHI液体培养基,30℃培养24 h。将菌液转接至新鲜的BHI,39℃培养。稀释菌液选择合适梯度的稀释液涂布于含X-gal的BHI平板上,39℃培养48 h。挑取白色单菌落用引物1408-1和1408-4进行PCR扩增检测缺失条带,最终获得ΔladR突变株。

1.2.2 mdrL基因转录水平检测

将野生株EGD-e和突变株ΔladR分别接种至BHI中(各6管),37℃振荡培养至OD600 nm≈0.6。将菌株平均分为两组,第一组为不加任何药物(作为对照组),第二组为加入BC(2 μg/mL),37℃继续培养30 min。立即加入10%的反应终止液(苯酚:无水乙醇=1:9)[13],冰上放置10 min。

按照细菌RNA提取试剂盒的使用说明提取细菌总RNA,测定RNA的浓度和纯度后用于后续试验。利用cDNA第一链合成试剂盒将RNA反转录为cDNA,-20℃保存备用。根据GenBank的基因序列设计靶基因mdrL和参照基因16S rRNA的引物(表2)。以cDNA作为模板,使用RealMasterMix(SYBR Green)试剂盒进行qRT-PCR。采用ΔΔCT[14]进行目的基因表达量的分析。

1.2.3 ladR基因的克隆

以EGD-e的基因组DNA作为扩增模板,用引物ladR-q1和ladR-q2(表 1)扩增ladR全基因序列。ladR扩增产物与表达载体pET32a分别用限制性内切酶BamH Ⅰ和Xho Ⅰ进行同步双酶切,酶切后的产物经纯化后进行连接反应,将构建好的重组表达载体pET32a-ladR转化至大肠杆菌BL21(DE3),挑选阳性转化株送至北京博迈德公司测序。

1.2.4 LadR蛋白的表达与纯化

将LadR蛋白表达菌株接种于5 mL含Amp(100 μg/mL)的LB液体培养基,37℃过夜培养。过夜培养物按1:100分别接种至50 mL含Amp(100 μg/mL)的LB液体培养基,37℃振荡培养至OD600 nm≈0.6。将菌液分两组,一组不做任何处理,另一组加入终浓度为0.5 mmol/L[15]的IPTG,37℃继续培养8 h。离心(4 000×g,5 min)收集细胞。按照His标签蛋白纯化试剂盒的步骤提取纯化重组蛋白His6-LadR。取10 μL纯化蛋白进行SDS聚丙烯酰氨凝胶电泳(SDS-Polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)[16]。利用BCA蛋白浓度测定试剂盒测定重组蛋白His6-LadR的浓度。

1.2.5 凝胶阻滞试验

利用引物pmdrL-F/pmdrL-R扩增mdrL的启动子区域,同时随机挑选一段编码区DNA(recA)作为阴性对照。将纯化后的DNA(200 ng)与纯化后的重组蛋白His6-LadR在EMSA/Gel-Shift结合缓冲液中混合,室温放置20 min。利用6%非变性PAGE电泳进行结合活性检测[17]

2 结果 2.1 ladR基因缺失菌株的构建与分子鉴定

用引物1408-1/1408-2扩增得到ladR基因上游同源臂480 bp,用引物1408-3/1408-4扩增ladR下游同源臂168 bp。通过SOE-PCR得到648 bp的上、下游同源臂融合片段ΔladR,条带均与预期结果一致(图 1-A)。融合片段ΔladR与穿梭质粒pMAD连接获得重组质粒pMAD-ΔladR。双酶切验证结果如图 1-B

图 1 ladR基因缺失株的构建 (A)M:DL2000;1,3:阴性对照;2:ladR上游同源臂;3:ladR下游同源臂;5,6:融合片段ΔladR。(B)M1:DL2000;M2:DL10000;1,2:融合片段ΔladR;3:pMAD-ΔladR双酶切产物;4:pMAD双酶切产物;5:pMAD质粒。(C)M:DL2000;1,2,4,5:质粒丢失但未发生同源重组的菌株;6:质粒尚未丢失的菌株;3:ΔladR突变菌株;7:融合片段ΔladR;8:野生株EGD-e;9:阴性对照

测序正确的重组质粒pMAD-ΔladR电转至EGD-e感受态。筛选得到的阳性菌株用检测引物1408-1/1408-4只能扩增出648 bp的片段(图 1-C)。测序结果表明已成功缺失ladR基因,获得ΔladR突变株。

2.2 mdrL基因转录水平分析

图 2可明显看出,与野生株相比,突变株ΔladRmdrL基因的转录水平提高约51倍。BC胁迫下,野生株EGD-e的mdrL基因转录水平提高约1.6倍,突变株ΔladRmdrL基因的转录水平约1.4倍。该结果表明LadR对mdrL基因有负调控作用。

图 2 qRT-PCR检测mdrL基因转录水平
2.3 ladR基因的克隆

以EGD-e基因组DNA为模板扩增得到长度为525 bp的ladR全基因片段(图 3);构建得到的重组质粒pET32a-ladR经双酶切验证及测序,验证结果一致表明已成功获得表达菌BL21(DE3)-ladR

图 3 表达菌BL21(DE3)-ladR的构建 M1:DL2000;M2:DL10000;1:质粒pET32a;2:双酶切质粒pET32a;3:双酶切PCR产物ladR;4:双酶切质粒pET32a-ladR;5,6:ladR
2.4 LadR蛋白的表达及纯化

IPTG诱导后,表达宿主菌在35 kD附近出现一条明显的蛋白条带,与预期的蛋白分子量大小(36.5 kD)十分相近(图 4),表明目的蛋白在宿主菌已得到成功表达。利用His标签蛋白纯化试剂盒处理后可以得到高纯度的His6-LadR蛋白;经BCA蛋白浓度测定试剂盒测定可知其浓度为1 mg/mL。

图 4 聚丙烯酰氨凝胶电泳图 M:蛋白maker;1:纯化蛋白;2:阴性对照;3~5:IPTG诱导
2.5 凝胶阻滞试验

EMSA结果(图 5-A)显示,LadR蛋白可与mdrL基因启动子区域结合,并且该结合作用在一定范围内随LadR蛋白浓度升高而增强;而在所有蛋白浓度下,阴性对照recA基因均未出现阻滞条带(图 5-B)。结果表明,LadR蛋白可与mdrL启动子序列发生特异性结合作用。

图 5 重组蛋白His6-LadR与启动子区域结合活性 1-5:重组蛋白His6-LadR的浓度依次为0、0.1、0.2、0.4、0.6 mg/mL;(A)DNA:mdrL启动子序列;(B)DNA:recA编码序列
3 讨论

Tamburro等[18]研究报道,BC胁迫下mdrL基因出现明显过表达现象,推测MdrL外排泵在Lm对BC耐受中起作用。Romanov等[19-20]通过检测不同Lm菌株中mdrL基因的表达量发现,BC胁迫下mdrL基因的转录水平升高4-20倍,该结果表明在BC刺激下不同菌株的mdrL基因表达量呈现差异性。我们先前的研究结果显示,与野生株EGD-e相比,mdrL基因缺失突变株∆mdrL在亚致死浓度BC胁迫下的生长迟滞期延长、平均最大生长率和平均最大光密度值均降低;在致死浓度BC作用下的存活率降低2个log值,表明MdrL外排泵在Lm对BC耐受中起作用。本研究结果显示,BC作用下,mdrL基因在野生株EGD-e中的转录水平提高约1.6倍,表明BC能够诱导mdrL基因的表达。不过,与前人的研究结果相比,本研究中mdrL基因转录水平升高的倍数较低。其原因可能有三点:一是菌株自身的差异性;二是BC刺激的时期不同;三是BC作用的浓度不同。

Huillet等[9]利用Northern blot技术检测mdrL基因的表达水平,结果发现LadR蛋白对mdrL基因具有负调控作用,并推测在正常生长条件下(BHI培养基),LadR与mdrL基因的启动子区域结合,从而抑制mdrL外排泵基因的转录。本论文在前人研究的基础上,深入调查LadR蛋白对MdrL外排泵的调控机制。qRT-PCR结果显示,无BC刺激时,mdrL基因在ladR基因缺失突变株中的转录水平比野生株EGD-e高51倍,表明LadR蛋白可能负调控mdrL基因的转录;BC作用下,mdrL基因在突变株中的转录水平比EGD-e高1.4倍,我们推测在BC胁迫下,除了LadR蛋白可能还存在其他的调控蛋白参与mdrL的调控。EMSA试验[21]结果显示,LadR蛋白能够与mdrL基因启动子区域结合,并且其结合活性随蛋白浓度的增加而增强,当蛋白浓度大于0.4 mg/mL时,结合活性没有明显变化。LadR蛋白与recA基因的编码区没有发生结合作用,表明LadR与mdrL基因启动子区域的结合具有特异性。

4 结论

本研究以Lm标准菌株EGD-e为研究对象,深入调查LadR对MdrL外排泵的调控作用及其调控方式。结果表明,BC能够诱导mdrL基因的表达。LadR蛋白负调控mdrL基因的表达;在正常生长条件下,LadR与mdrL基因的启动子区域结合,抑制外排泵基因mdrL的表达。

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