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殷子斐, 王丽娜, 王园, 凌晨. 2015
提高重组型腺相关病毒转导效率的研究现状
生物技术通报,2015,31(9): 49-59

Yin Zifei, Wang Li’na, Wang Yuan, Ling Chen. 2015
Research Advances on Increasing the Transduction Efficiency of Recombinant Adeno-associated Viral Vectors
Biotechnology Bulletin,2015,31(9): 49-59

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收稿日期:2014-11-04

提高重组型腺相关病毒转导效率的研究现状
殷子斐1, 王丽娜1, 王园1, 凌晨2    
1. 中国人民解放军第二军医大学,上海 200433;
2. 佛罗里达大学,美国佛罗里达州 32610
摘要: 重组型腺相关病毒(recombinant adeno-associated virus,rAAV)载体是目前基因治疗研究中常用的、非常有前景的载体之一。欧洲第一个批准上市的基因治疗药物正是基于rAAV。然而,rAAV 的转导效率相对有限,导致其治疗成本过高;且过 高剂量的rAAV 可以激发人体的免疫反应,降低其疗效。因此,如何提高rAAV 的转导效率一直是基因治疗领域研究的热点之一。目前常用的提高rAAV 转导效率的方法有:使用组织特异性强的血清型/ 变体、应用蛋白酶体抑制剂、突变衣壳蛋白表面裸露氨基酸、增加单链DNA 的第二链合成、构建自身互补型双链载体等。就这些方法各自的原理、应用现状及优劣势进行系统地综述。
关键词重组腺相关病毒载体     基因治疗     转导效率    
Research Advances on Increasing the Transduction Efficiency of Recombinant Adeno-associated Viral Vectors
Yin Zifei1, Wang Li’na1, Wang Yuan1, Ling Chen2     
1. Second Military Medical University,People’s Liberation Army,Shanghai 200433;
2. University of Florida,Florida 32610
Abstract:The recombinant adeno-associated virus(rAAV)vector has emerged as one of the promising and commonly-used vectorsin gene therapy research. The first gene therapy drug in clinic approved in Europe is based on rAAV. Due to the relatively limited transduction efficiency, the cost of the rAAV-mediated treatment is expensive. Additionally, high dose of rAAV may trigger host immune response, resulting in the curative effect reduced. Therefore, how to enhance the transduction efficiency of rAAV has been a hot issue in gene therapy. Hitherto there are five common methods to achieve this goal :selecting tissue-specific tropism serotypes and variants, using proteasome inhibitors, mutating capsid surface-exposed amino-acids, increasing second-strand DNA synthesis, and producing self-complementary vectors. In this paper we systemically review the above methods from the aspects of principle, status of application, advantages and disadvantages.
Key words: recombinant adeno-associated virus vector     gene therapy     transduction efficiency    

腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV)是一种无包被,直径约22 nm 的单链DNA 病毒。它是一种非致病病毒,目前尚未发现与AAV 相关的人类或其他哺乳类疾病。与其他基因治疗载体相比,重组型腺相关病毒(Recombinant adeno-associated virus,rAAV)载体具有安全性好、免疫原性低、物理性质稳定、感染细胞谱广等优点,可在体内外有效介导外源基因长期稳定表达,被视为最有前途的基因治疗载体之一。目前,rAAV 已经被用于血友病、先天性黑矇、囊性纤维变性等多项基因治疗的临床研究中[1, 2, 3]。此外,全球第一个基因治疗药物——Glybera 已经于2012 年底批准上市,主要用于治疗脂蛋白脂酶缺乏遗传病,而它的载体正是AAV1。

然而rAAV 转导效率相对较低,必须使用大量的病毒才能达到有效的治疗效果,从而导致其治疗费用相对较高[4]。此外,过高剂量rAAV 的衣壳蛋白会激发宿主的免疫排斥反应,限制基因治疗载体的转导效率[5, 6]。因此,如何提高rAAV 转导效率成了近年来基因治疗领域的研究热点之一。由于目前已有学者针对如何通过调控免疫反应,增加rAAV的转导效率进行了系统的综述[5, 6, 7, 8, 9],故笔者现主要针对rAAV 从进入细胞到在细胞中实现转基因表达的各个环节,探讨能够有效提高rAAV 转导效率的方法,并对这些方法的原理及优劣势进行分析。

1 AAV 基本生物学特征

成熟的AAV 衣壳是由VP1、VP2 和VP3 三种衣壳蛋白装配而成,其分子量大小分别为87、73、62 kD,三者的分子数目比例约为1∶1∶10。野生型(wide-type,wt)AAV 的基因组为单链(Single-stranded,ss)、约4 800 个碱基的线形DNA,其两末端为145 个碱基组成的倒置末端重复序列(Invertedterminal repeat,ITR)。在ITR 序列之间为病毒蛋白编码区,包含两个开放阅读框架,产生复制蛋白质(Rep)、衣壳蛋白质(Cap)和包装激活蛋白质(Assembly-activating protein,AAP)。基因治疗载体rAAV 仅仅保留了AAV 基因组末端的ITR,而将Rep、Cap 及AAP 的基因以目的基因盒替代(图 1)。在ITR 结构中,有3 段回文结构和一段非回文结构,3 段回文结构形成发夹状,非回文结构为D 序列,其中含有末端断裂位点(Terminal resolution site,trs)。在AAV 的复制过程中,其以自身3'-OH 为引物,产生2 个等长的具有一个共价连接末端的复制中间体(子/母链)(图 1)。之后,Rep 蛋白发挥核酸内切酶的作用,在母链trs 处产生一个缺口。新产生的3'-OH 作为DNA 聚合酶底物,合成新的ITR。经过新一轮复制,可形成一个新的单链AAV 病毒基因及一个子/母链共存二聚体[1, 2, 10]

图 1 AAV 结构示意图

在AAV 感染细胞的过程中,病毒颗粒不停地撞击靶细胞,直至衣壳蛋白与细胞表面相应的受体、共受体结合,借助于细胞内吞作用形成内含体进入细胞,随后因内含体酸化后从内含体中逸出,并向细胞核内运输,运输过程中,其衣壳蛋白表面会被磷酸化、泛素化,从而被蛋白酶体降解。未被降解而进入细胞核内的病毒颗粒逐渐脱壳,释放出其中的ssDNA。ssDNA 不能作为mRNA 转录模板,必须进一步合成为双链(Double-stranded,ds)DNA,最终通过转录、翻译过程实现目的基因的表达[1, 11, 12, 13, 14]图 2)。此外,也有报道高尔基体/ 内质网参与到了AAV 在细胞质内的转运过程[15]

图 2 AAV 在细胞中的生物学过程示意图
2 提高腺相关病毒转导效率的方法 2.1 选择组织特异性强的血清型/变体

根据衣壳蛋白抗原的不同,AAV 可以分为1-13 个血清型,且不同血清型的组织靶向性不完全相同。通过系统注射和局部注射的方法,现已经证实:AAV3、AAV8 和AAV9 对肝脏靶向性较强;AAV6、AAV8 对心脏、胰腺的特异性突出;AAV4、AAV9 对肺的特异性明显;AAV2 对肾的特异性较强;AAV1、AAV2、AAV5 和AAV9 对脑组织的特异性较好;对骨骼肌选择性较强的载体有AAV1、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8 和AAV9 ;另外,AAV2、AAV5 对角膜的靶向性优于其他血清型[16, 17, 18]。为了更加精确地针对特殊细胞群进行治疗,越来越多的研究者针对特定组织中的某一类细胞筛选rAAV 不同血清型。例如,本课题组[19, 20, 21]的研究表明:rAAV3 能使用人肝细胞生长因子受体作为共受体,对肝癌细胞的靶向性很强;Markakis 等[22]发现AAV5 在神经元蛋白阳性、胶质原纤维酸性蛋白阳性的细胞中转导效率最佳;Aschauer 等[23]报道:rAAV8 主要在脑星形细胞中表达,而脑皮层神经元是rAAV9 的主要靶向组织。

近年来,借助于现代分子生物学技术,通过点突变、DNA 体外重组技术(DNA shuffling)、衣壳蛋白引入新肽段等方法,建立起了包含成千上万种AAV 变体的大型AAV 文库,为筛选靶向性更强的rAAV 载体提供了有效的保障[24]。点突变技术是指应用易错聚合酶链反应(PCR)技术,将单个或多个碱基进行突变的方法。利用点突变技术,可以将AAV 中Cap 基因序列进行突变,从而形成一个或多个位点氨基酸不同的变体(图 3-A)。Perabo 等[25]对rAAV2 Cap 序列中353-767 的氨基酸序列进行了突变,产生了2.5×107 个AAV 变体,并从中进一步筛选出了能够降低被人血清抗体中和的变体。DNA体外重组(shuffling)技术是指使用核酸酶,将基因剪切后产生大量的片段,在此基础上,使之互为引物和模板进行PCR 扩增,从而发生基因重组。使用此技术,将多种AAV 的Cap 序列剪切后,发生随机重新组合,就可以产生大量的变体[26, 27, 28]图 3-B)。如Yang 等[28]采用这种方法,建立了AAV文库,并从中筛选出变体M41,其对心脏的靶向性与目前报道的心脏靶向性最强的rAAV9 相当,且在肝脏中的转基因表达明显较低。细胞表面特异性的受体是基因治疗载体结合的位点。因此,如果AAV表面有与特异性受体结合的配体,那么,其靶向性将大大提高。随机肽段插入法是指在目的基因中插入一段可表达特异性肽段的DNA 序列。在AAV 的Cap 基因中,用直接结合法或转座子介导突变等方法,可以在不影响AAV 包装的前提下在特定的位点插入一段能够表达特异性肽段的DNA 序列,从而形成大量新的AAV 变体[29, 30, 31]图 3-C)。Müller等[30, 31]使用这种方法建立了载体文库,并从中筛选出的AAV9 变体对人脐带血内皮细胞的亲和力为wtAAV9 的200 倍。

图 3 AAV 文库的构建方法

值得指出的是,目前对于rAAV 血清型/ 变体的筛选主要停留在细胞和动物实验上,并不能直接地指导临床应用。例如,AAV8 能够靶向小鼠的肝脏细胞,却在人的肝脏细胞中转导效率不高。因此,如何构建更加能够反映人的某种组织特异性的动物模型,并在此基础上筛选鉴定最佳的AAV 血清型/ 变体,是亟需解决的问题。Lisowski 等[32]将一位患者的新鲜肝脏细胞接种在免疫缺陷的FRG 小鼠肝脏上,从而构建了人- 鼠肝的杂合体。这种动物模型对于AAV 在肝脏疾病中的应用具有极高的应用价值,值得借鉴。其次,AAV 文库的出现为大规模筛选靶向性更强的载体提供了可能,但不同的方法建立的文库中的变体的结构、组织靶向性不尽相同。因此,有必要加大多个文库间的比较,并从中筛选出对某一特定的组织靶向性最强的变体。此外,许多文库面临一个问题:大多数变体并不能有效地包装rAAV 载体。如何整合并优化现有的构建文库方法,建立变体数量不庞大、但却含有高效变体的文库,也需要进一步的研究。Marsic 等[33]通过计算机模拟的方法,先根据AAV 衣壳蛋白的结构特点,结合目前已知的150 个变体,在不影响AAV 衣壳蛋白包装的前提下,仅针对衣壳蛋白表面的部分可变氨基酸位点进行调整,最终产生了大约8×105 的rAAV2 变体,大大减少了那些不能被包装的AAV 变体的产生。

2.2 采用蛋白酶体抑制剂

泛素- 蛋白酶体系统是细胞降解错误以及外源蛋白质的主要途径,在细胞周期、细胞凋亡等方面发挥着重要的作用[34, 35]。不仅如此,泛素- 蛋白酶体系统也在rAAV 进入宿主细胞后的生物学过程中发挥了重要作用[36]。当rAAV 进入细胞,离开内含体之后,其衣壳蛋白被泛素化标记。被泛素化标记的rAAV 会被泛素- 蛋白酶体系统降解,导致rAAV的转导效率下降[37, 38]。在这个机制被揭示后,关于应用蛋白酶体抑制剂提高rAAV 转导效率的报道相应地增加。

Duan 等[37]最早报道:半胱氨酸蛋白酶抑制剂LLnL、泛素蛋白酶体抑制剂MG132 等能明显将rAAV2 在支气管上皮细胞的转导效率提高10 倍左右。Jennings 等[39]以类风湿性关节炎患者病变部位的人滑膜细胞为研究对象,发现蛋白酶体抑制剂zLLL 能够明显增加含有白介素IL-10 治疗基因的rAAV2 的转基因表达。此外,蛋白酶体抑制剂MG132 还可以提高rAAV 在人黑色素瘤细胞M21、人胶质瘤细胞U87 等多种肿瘤细胞中的转导效率[40]

硼替佐米(Bortezomib) 是目前已经被美国食品及药品管理局批准用于临床的蛋白酶体抑制剂,主要用于多发性骨髓瘤的治疗。现有不少学者针对这个药物在rAAV 基因治疗中的应用进行了研究。Neukirchen 等[41]研究发现Bortezomib 可以明显提高细胞中rAAV 介导的p53 基因的表达水平,且二者具有协同的抗非小细胞肺癌的作用;Monahan等[42]在使用含有第八凝血因子治疗基因的rAAV2和rAAV8 治疗A 型血友病的狗时,同时注射了Bortezomib,结果发现仅Bortezomib 单次给药就能使rAAV2 和rAAV8 的转导效率分别提高6 倍和3 倍,并能使血友病狗的凝血时间恢复正常,出血率降低90%。此外,研究显示,一种新的蛋白酶抑制剂卡非佐米(Carfilzomib)能够特异性地抑制糜蛋白酶样蛋白酶体的活性,其提高rAAV 的转导效率[36]的效能与Bortezomib 相当。

目前在rAAV 转导效率研究中常用的蛋白酶体抑制剂大多为化学合成,但从中药中分离的一些化合物也有抑制蛋白酶体活性的作用,可提高rAAV的转导效率[43, 44, 45]。Zhang 等[43]发现从中药雷公藤中提取出来的单体——雷公藤红素可以明显在细胞诱导分化前后增加前脂肪细胞3T3-L1 中rAAV1 的转导效率,其原因是雷公藤红素可以抑制蛋白酶体活性,增加rAAV 入核。Wang 等[44]进一步发现雷公藤红素的结构类似物——扁塑藤素也能通过同样的机制在体内外提高rAAV 的转导效率,且扁塑藤素的作用较雷公藤红素强。

蛋白酶体抑制剂在提高rAAV 转导效率的同时,它们的毒性作用也必须引起注意。例如,Bortezomib可导致胃肠道不适、周围神经病变、心力衰竭等不良反应,不少患者不得不减少使用剂量,甚至终止治疗[46, 47, 48],因此,在利用蛋白酶体抑制剂联合rAAV 治疗疾病时,必须尽可能地将蛋白酶体的剂量控制在安全、有效的范围内。与此同时,现已证明一些中药单体具有蛋白酶体抑制剂的活性,能提高rAAV 的转导效率,这为新的蛋白酶体抑制剂的研发开辟了新的方向,但是,也必须对它们的毒副作用进行严格的评估。

2.3 衣壳蛋白定点突变

在研究泛素化- 蛋白酶体对rAAV 影响时,Yan等[38]发现,经热处理的衣壳蛋白更容易被泛素化,提示衣壳蛋白在泛素化之前可能发生了构象变化或经历了某种修饰。随后,Zhong 等[12, 49, 50]研究显示,细胞内的上皮生长因子受体酪氨酸激酶(Epidermal growth factor receptor protein tyrosinekinase,EGFR-PTK)能够将rAAV 衣壳蛋白表面酪氨酸(Tyrosine,Y)残基磷酸化,磷酸化的衣壳蛋白将通过泛素化- 蛋白酶体途径被降解,导致rAAV转导效率降低。两年后,同一课题组对rAAV2 衣壳蛋白中的表面裸露的7 个酪氨酸(Y)残基位点突变成苯丙氨酸(Phenylalanine,F),各个突变体均能有效提高rAAV2 的转导效率,且Y730F 能够分别在HeLa 细胞和小鼠肝脏中的将转导效率提高10、30 倍,能在小鼠体内将治疗血友病基因的第九凝血因子的表达效率提高10 倍[12]。在此基础上,该课题组还尝试对 rAAV 多个酪氨酸残基位点进行点突变,结果显示,AAV2-3M(Y444+500+730F)在小鼠肝脏细胞中的转导效率较AAV2 单个位点的突变体高3 倍,较wtAAV2 提高至少30 倍[51]。此外,Qi 等[52]对rAAV2 同时进行了3 个和6 个位点的突变,结果显示:新构建的突变体AAV2-6M(Y252+272+444+500+704+730F)在肾小管上皮细胞中的转导效率最高。关于通过Y 残基定点突变提高rAAV 转导效率的研究主要集中在AAV2 上,但这项技术对AAV6 等血清型也适用[53]。不仅如此,衣壳蛋白Y 残基定点突变还能进一步提高AAV 变体的转导效率。如Klimczak 等[54]对AAV 变体ShH10 进行定点突变(Y445F),新的载体在Müller 细胞的转导效率较ShH10 进一步提高,且能实现治疗基因——胶质细胞源性神经营养因子在视网膜中的稳定表达,减缓大鼠视网膜退行性变的病情进展[55]

虽然,目前的衣壳蛋白突变大多将Y 残基进行突变,但是Aslanidi 等[56]用丝氨酸(Serine,S)/ 苏氨酸(Threonine,T) 蛋白激酶JNK、p38MAPK 处理细胞后,携带有增强绿色荧光蛋白(Enhancedgreen fluorescence protein,EGFP) 报告基因的rAAV2 在细胞中基因表达明显增高,这表明对衣壳蛋白表面暴露的S 和/ 或T 磷酸化能降低病毒载体的转导效率。在此基础上,该课题组分别对AAV2衣壳蛋白上的S、T 位点进行突变,结果发现,将S或T 突变成缬氨酸(Valine V)的rAAV2 载体的转导效率更强[56, 57]

对rAAV 衣壳蛋表面的Y、S、T 残基进行定点突能显著提高其转导效率,这种技术已经被越来越多的学者证实并采纳[58, 59, 60, 61]。然而,衣壳蛋白突变不一定对所有的血清型有效。例如,Qiao 等[62]构建了突变体AAV8(Y447F、Y733F)、AAV9(Y446F、Y731F),结果显示,突变后的AAV 与wtAAV 在基因转导效率上并无明显差别。这究竟是突变位点不佳,还是衣壳蛋白定点突变的方法对这两种血清型无效,尚待进一步的分析。其次,衣壳蛋白上能被磷酸化的位点有很多,但究竟对哪个位点、多少个位点进行突变,是突变某一种氨基酸还是多种氨基酸的残基位点,才能获得具有最强的转导效率的突变体,还需要深入的研究来证实。目前,已经有学者针对这个问题进行了初步的尝试,结果显示,AAV2-4M(Y444+500+730F+T491V)突变体的转导效率比突变体AAV2-3M(Y444+500+730F)还高2-3倍[57]。然而,这样的突变组合对于其他血清型的rAAV 是否适用,还需要进一步的分析。

2.4 增加第二链的合成

虽然wtAAV 能感染多种哺乳类细胞,但在缺乏辅助病毒或其他辅助因子情况下,其自身基因表达几乎检测不到。同样的,rAAV 自身介导的转基因表达水平低下。其中一个重要原因是其ssDNA 必须变成dsDNA 才能完成转录和翻译,这个DNA 第二链合成rAAV 介导的转基因表达的限速环节[63]

单链D 序列结合蛋白(Single-stranded D-sequence-binding protein,ssD-BP)在rAAV 基因组第二链合成的过程中发挥着重要的作用。Qing 等[11, 64, 65]在20 世纪90 年代发现,当ssD-BP 的Y 残基位点被EGFR-PTK 磷酸化后,它能与AAV 基因组中的ITR中的D 序列结合,从而导致DNA 从3' 端的复制受阻,影响dsDNA 的合成。随后的研究表明:ssD-BP中的部分氨基酸序列与一种细胞内源性的可与免疫抑制药物FK506 结合的蛋白(FK506-binding protein52,FKBP52) 相同。除了Y 磷酸化,S 或T 磷酸化的FKBP52 亦能显著抑制rAAV 基因组的第二链合成[66]

随着以上机制的揭示,关于通过调控FKBP52去磷酸化从而增加转基因表达的方法也逐渐增多。如Qing 等[67]发现Y 磷酸化的FKBP52 是T 细胞蛋白酪氨酸磷酸酶(T-cell protein tyrosine phosphatase,TC-PTP)的底物。HeLa 细胞和小鼠过表达TC-PTP后,FKBP52 的磷酸化程度显著降低,伴随着ssAAV的转导效率明显提升;Zhong 等[68]将TC-PTP 基因包装进入rAAV 组成新的病毒载体rAAV-TC-PTP,并将其与携带有报告基因的ssAAV 病毒载体同时感染细胞,这种共感染的方法能安全有效的提高ssAAV 的转导效率;Zhao 等[69] 发现细胞磷酸酶5(Protein phosphatase 5,PP5) 能够介导FKBP52在S 或T 残基上的去磷酸化,增加单链rAAV 的第二链合成;Jayandharan 等[70]用3 种rAAV 载体共同感染小鼠,即携带有报告基因的ssAAV,过表达TC-PTP 及PP5 的病毒载体。这种方法能使靶细胞内FKBP52 的Y、S、T 残基均去磷酸化,最大程度降低第二链合成的抑制作用,结果显示,该方法使ssAAV 的报告基因在小鼠肝脏中的表达效率提高了16 倍。Ma 等[71]在传统的三质粒包装rAAV 的基础上,增加了含有PP5 基因的质粒,这样包装纯化后的病毒含有rAAV2-EGFP 和rAAV2-PP5 两种病毒,这种混合的病毒在体内外的转导效率较单独的rAAV2-EGFP 高5-10 倍。

ssD-BP、FKBP52 的发现阐明了ssAAV 转导效率有限的根本原因,TC-PTP、PP5 的应用能够使FKBP52 残基去磷酸化,从而将抑制第二链合成的作用降低,增加rAAV 介导的转基因表达效率。然而,需要注意的是,虽然通过构建过表达TC-PTP、PP5基因的细胞或小鼠,有助于阐明其作用机制,但是过表达这些基因对细胞或小鼠的生理功能是否有影响,目前尚无确切的研究报道。其次,直接将携带有TC-PTP、PP5 基因的辅助rAAV 注射到人体内,其安全性同样也需要深入评估。

2.5 将单链病毒载体改造成自身互补型双链载体

自然条件下存在的AAV 的基因组是ssDNA。虽然人们已经发现了影响其第二链合成的关键酶,并且可以通过对关键酶的调控增加rAAV 转基因表达效率,但将传统ss rAAV 病毒载体直接改造成ds 载体,则能更加快速有效地提高rAAV 的转导效率。

早在2001 年,McCarty 等[72]将原来的rAAV2的包装的基因组的长度从4 474 碱基减少至2 299 碱基,首次分离了自身互补性(Self-complementary,sc)的rAAV 载体,这种scAAV 一端为正常的ITR,另一端为ITR 的二聚体,中间的基因组是互补的双链,从而解除了在ssAAV 病毒载体基因表达过程中合成第二链的限制。体外研究证实,scAAV 的转导效率是ssAAV 的5-190 倍。随后不久,McCarty[73]等进一步研究表明:只要去除rAAV 的一端的ITR的trs,就能避免末端ITR 在复制后被Rep 蛋白质剪切。这个新合成的DNA 会在分子内部通过碱基配对的作用进行折叠,从而形成scAAV 载体。动物实验显示:ssAAV2 在小鼠肝脏中的表达效率仅有5%-10%,而scAAV2 的表达效率却高达25%-50%。此后,Wang 等[74]进一步将一端ITR 中的部分D 序列和trs 一起删除,合成双链的scAAV2。这种新的rAAV载体不仅能在体外实现对黑色素瘤、肺癌等多种肿瘤细胞的转基因表达,并能在体内肝脏中高效表达转基因,并维持长达6 个月。

这种新型的scAAV 较传统的ssAAV 的转基因表达效率大幅提高,可用于多种血清型、多种疾病的基因治疗中。例如,Nathwani 等[75]研究发现:scAAV8 能够快速地在细胞中形成有活性的双链线性基因组,并使人凝血因子IX 的转导效率较ssAAV提高20 倍左右,更加有效地纠正小鼠的出血状态;Gao 等[76]合成的scAAV7、scAAV8 在食蟹猕猴的肝脏细胞中的转导效率较传统ssAAV2 有2 个指数倍数的提高;Liu 等[77]将scAAV2 直接注射到大鼠感觉运动皮质、红核、背根神经节,结果显示这些地方沿着轴突有很强的报告基因表达。

然而,scAAV 也有着一定的局限性。首先,scAAV 提高转导效率是建立在牺牲基因装载容量的基础之上的,因为传统的ssAAV 能包装约4 500 碱基的基因,而scAAV 载体的基因装载量只有2 300碱基左右,约为ssAAV 的一半,这并不适合杜氏肌营养不良等治疗基因较长的疾病;其次,虽然目前研究者们已经成功地实现了scAAV 在肝脏、肌肉、骨髓、眼等多种组织和细胞中的转导,但并非所有细胞都能被scAAV 感染[78]。如Ding 等分别使用携带有报告基因的scAAV2、ssAAV2、scAAV5、ssAAV5 感染人极化气道上皮细胞,结果发现scAAV与ssAAV 之间没有区别,这说明可能在某些细胞中,从单链合成双链并非转基因表达的限速环节[78, 79]。再次,scAAV 较ssAAV 能够激发更强的免疫反应。如Martino[80]等研究结果表明,与注射ssAAV 后的小鼠相比,注射scAAV 后的小鼠体内的肿瘤坏死因子a、单核细胞趋化化蛋白1、g 干扰素诱导蛋白等炎性因子明显升高,且肝脏中的中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞明显增多,这说明scAAV 较ssAAV 对机体产生的免疫反应更强;Wu 等[81]研究发现,scAAV 能够较ssAAV 明显增加转基因产物特异的CD8+ T 细胞的数量。由于过强的免疫反应不仅会导致抗体的产生,降低后续基因治疗的疗效,且对机体也有损伤,因此,如何合理控制scAAV 的使用剂量,在提高疗效的同时,保证机体的安全是亟需探讨的。

3 结语

基因治疗不仅是遗传性疾病的最佳疗法,也在肿瘤、心血管疾病、自身免疫性疾病的治疗中有着重要的价值。rAAV 免疫源性低、感染谱广,是目前基因治疗领域中的热门载体。然而,由于AAV 血清型有限且对组织的靶向性不强,AAV 进入细胞后会被蛋白酶体降解,且ssAAV 必须实现向dsAAV 的转变才能完成基因的表达,而第二链合成的过程在很大程度上受细胞内特异性蛋白抑制,rAAV 的转导效率不尽如人意,限制了其广泛应用。

随着研究的不断深入,通过对AAV 生命周期更加全面的了解,现已经建立了一系列有效的提高rAAV 转导效率的方法。野生型的AAV 只有13 种,但在现代分子技术上建立的AAV 文库包含了大量的变体,使载体数量有了几何倍数的提高,这为将来筛选特异性强的AAV 载体提供了宝贵的资源;通过直接使用蛋白酶体抑制剂,或者对衣壳蛋白进行定点突变,均可以显著降低衣壳蛋白被泛素- 蛋白酶体系统的识别,保障rAAV 的转基因表达;TC-PTP、PP5 的应用可以将细胞中限制第二链合成的蛋白活性降低,加速rAAV 载体在靶细胞中的第二链合成;新合成的scAAV 载体则可以直接跳过合成双链这个环节,快速地实现转基因的转录、翻译。除了目前最常用的这5 类方法外,还可通过使用三氧化二砷增加细胞内活性氧、紫外线改变细胞内环境、在rAAV 的衣壳蛋白上连接化学基团改变其对靶细胞的亲和性等方法提高rAAV 的转导效率[63, 82, 83, 84]。正是由于这些方法的发现、验证和应用,rAAV 的转导效率大幅度提升,可用其进行基因治疗的疾病范围也逐渐扩大。目前,全球第一个以rAAV 为载体的基因治疗药物——Glybera 已经于2012 年上市,并且还有关于rAAV 基因治疗的多项临床试验正在进行中,有望早日应用于患者。

在今后的研究中,需要注意的是,现报道的提高rAAV 转导效率的方法部分尚处于细胞和动物实验阶段,能否安全、有效地应用于临床,还需要进一步的判断评估。本综述中介绍的这些方法分别在rAAV 衣壳蛋白与细胞绑定、胞内运输与降解、基因复制与转录等环节中发挥作用。因此,十分有必要将这些方法进行联合应用,以实现转导效率的最大化。可以采取以下策略,首先,在常规血清型和rAAV 文库的基础上,筛选对某一特定组织靶向性最强的载体,并进一步根据载体的结构,突变其表面的部分衣壳蛋白的氨基酸残基,合成感染效率更佳的rAAV 突变体;其次,若目的基因较小,则合成scAAV,若只能使用ssAAV,则可联合含有TCPTP、PP5 的rAAV 同时应用;最后,结合安全剂量下的蛋白酶抑制剂,实现目的基因的表达。事实上,在最近一次的乙型血友病临床试验中,科学家们已经将几种方法联合应用,包括本文介绍的以及没有介绍的,从而增加rAAV 介导的转基因表达。这些方法包括:转基因DNA 序列人源化、AAV8 血清型、scDNA 的基因组以及联合使用免疫抑制剂地塞米松等[85]。相信在不远的将来,通过科研和临床工作者们不断的深入探索和有效的交流合作,rAAV 可以为维护人类的健康作出更加重要的贡献。

 
参考文献
[1] Grieger JC, Samulski RJ. Adeno-associated virus vectorology,manufacturing, and clinical applications[J]. Methods Enzymol,2012, 507 :229-254.
[2] Griesenbach U, Alton EW. Current status and future directions ofgene and cell therapy for cystic fibrosis[J]. BioDrugs, 2011, 25(2):77-88.
[3] Mingozzi F, High KA. Therapeutic in vivo gene transfer for geneticdisease using AAV :progress and challenges[J]. Nat Rev Genet,2011, 12(5):341-355.
[4] Tal J. Adeno-associated virus-based vectors in gene therapy[J]. JBiomed Sci, 2000, 7(4):279-291.
[5] Masat E, Pavani G, Mingozzi F. Humoral immunity to AAV vectorsin gene therapy :challenges and potential solutions[J]. DiscovMed, 2013, 15(85):379-389.
[6] Mingozzi F, High KA. Immune responses to AAV in clinicaltrials[J]. Curr Gene Ther, 2011, 11(4):321-330.
[7] Hareendran S, Balakrishnan B, Sen D, et al. Adeno-associated virus(AAV)vectors in gene therapy :immune challenges and strategiesto circumvent them[J]. Rev Med Virol, 2013, 23(6):399-413.
[8] Logan GJ, Alexander IE. Adeno-associated virus vectors :immunobiology and potential use for immune modulation[J]. CurrGene Ther, 2012, 12(4):333-343.
[9] 刁勇, 许瑞安. 重组腺相关病毒载体诱导的天然免疫反应及机制[J]. 微生物学报, 2012, 52(5):550-557.
[10] 张凤兰, 文朝阳, 丁卫. 腺相关病毒基因治疗载体的改良与应用[J]. 首都医科大学学报, 2009, 30(4):565-572.
[11] Qing K, Khuntirat B, Mah C, et al. Adeno-associated virus type2-mediated gene transfer :correlation of tyrosine phosphorylationof the cellular single-stranded D sequence-binding protein withtransgene expression in human cells in vitro and murine tissues invivo[J]. J Virol, 1998, 72(2):1593-1599.
[12] Zhong L, Li B, Mah CS, et al. Next generation of adeno-associatedvirus 2 vectors :point mutations in tyrosines lead to high-efficiencytransduction at lower doses[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2008,105(22):7827-732.
[13] Seisenberger G, Ried MU, Endress T, et al. Real-time singlemoleculeimaging of the infection pathway of an adeno-associatedvirus[J]. Science, 2001, 294(5548):1929-1932.
[14] Nonnenmacher M, Weber T. Adeno-associated virus 2 infectionrequires endocytosis through the CLIC/GEEC pathway[J]. CellHost Microbe, 2011, 10(6):563-576.
[15] Johnson JS, Gentzsch M, Zhang L, et al. AAV exploits subcellularstress associated with inflammation, endoplasmic reticulumexpansion, and misfolded proteins in models of cystic fibrosis[J].PLoS Pathog, 2011, 7(5):e1002053.
[16] Wu Z, Asokan A, Samulski RJ. Adeno-associated virus serotypes :vector toolkit for human gene therapy[J]. Mol Ther, 2006, 14(3):316-327.
[17] Gao GP, Alvira MR, Wang L, et al. Novel adeno-associated virusesfrom rhesus monkeys as vectors for human gene therapy[J]. ProcNatl Acad Sci USA, 2002, 99(18):11854-11859.
[18] Miyake K, Miyake N, Yamazaki Y, et al. Serotype-independentmethod of recombinant adeno-associated virus(AAV)vectorproduction and purification[J]. J Nippon Med Sch, 2012, 79(6):394-402.
[19] Ling C, Lu Y, Cheng B, et al. High-efficiency transduction of livercancer cells by recombinant adeno-associated virus serotype 3vectors[J]. J Vis Exp, 2011(, 49):doo :10.3791/2538.
[20] Ling C, Lu Y, Kalsi JK, et al. Human hepatocyte growth factorreceptor is a cellular coreceptor for adeno-associated virus serotype3[J]. Hum Gene Ther, 2010, 21(12):1741-1747.
[21] Cheng B, Ling C, Dai Y, et al. Development of optimized AAV3serotype vectors :mechanism of high-efficiency transduction ofhuman liver cancer cells[J]. Gene Ther, 2012, 19(4):375-384.
[22] Markakis EA, Vives KP, Bober J, et al. Comparative transductionefficiency of AAV vector serotypes 1-6 in the substantia nigra andstriatum of the primate brain[J]. Mol Ther, 2010, 18(3):588-593.
[23] Aschauer DF, Kreuz S, Rumpel S. Analysis of transductionefficiency, tropism and axonal transport of AAV serotypes 1, 2,5, 6, 8 and 9 in the mouse brain[J]. PLoS One, 2013, 8(9):e76310.
[24] Bartel MA, Weinstein JR, Schaffer DV. Directed evolution of noveladeno-associated viruses for therapeutic gene delivery[J]. Gene Ther, 2012, 19(6):694-700.
[25] Perabo L, Endell J, King S, et al. Combinatorial engineering ofa gene therapy vector :directed evolution of adeno-associatedvirus[J]. J Gene Med, 2006, 8(2):155-162.
[26] Gray SJ, Blake BL, Criswell HE, et al. Directed evolution of a noveladeno-associated virus(AAV)vector that crosses the seizurecompromisedblood-brain barrier(BBB)[J]. Mol Ther, 2010,18(3):570-578.
[27] Kienle E, Senis E, Börner K, et al. Engineering and evolution ofsynthetic adeno-associated virus(AAV)gene therapy vectors viaDNA family shuffling[J]. J Vis Exp, 2012,( 62). pii :3819.doi :10.3791/3819
[28] Yang L, Jiang J, Drouin LM, et al. A myocardium tropic adenoassociatedvirus(AAV)evolved by DNA shuffling and in vivoselection[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2009, 106(10):3946-3951.
[29] Koerber JT, Schaffer DV. Transposon-based mutagenesis generatesdiverse adeno-associated viral libraries with novel gene deliveryproperties[J]. Methods Mol Biol, 2008 :434161-434170.
[30] Muller OJ, Kaul F, Weitzman MD, et al. Random peptide librariesdisplayed on adeno-associated virus to select for targeted genetherapy vectors[J]. Nat Biotechnol, 2003, 21(9):1040-1046.
[31] Varadi K, Michelfelder S, Korff T, et al. Novel random peptidelibraries displayed on AAV serotype 9 for selection of endothelialcell-directed gene transfer vectors[J]. Gene Ther, 2012, 19(8):800-809.
[32] Lisowski L, Dane AP, Chu K, et al. Selection and evaluation ofclinically relevant AAV variants in a xenograft liver model[J].Nature, 2014, 506(7488):382-386.
[33] Marsic D, Govindasamy L, Currlin S, et al. Vector design tour deforce :integrating combinatorial and rational approaches to derivenovel adeno-associated virus variant[s J]. Mol Ther, 2014, 2(2 11):1900-1909.
[34] Engel K, Bassermann F. The ubiquitin proteasome system and itsimplications for oncology[J]. Dtsch Med Wochenschr, 2013, 138(22):1178-1182.
[35] Shen M, Schmitt S, Buac D, et al. Targeting the ubiquitinproteasomesystem for cancer therapy[J]. Expert Opin TherTargets, 2013, 17(9):1091-1108.
[36] Mitchell AM, Samulski RJ. Mechanistic insights into theenhancement of adeno-associated virus transduction by proteasomeinhibitors[J]. J Virol, 2013, 87(23):13035-13041.
[37] Duan D, Yue Y, Yan Z, et al. Endosomal processing limitsgene transfer to polarized airway epithelia by adeno-associatedvirus[J]. J Clin Invest, 2000, 105(11):1573-1587.
[38] Yan Z, Zak R, Luxton GW, et al. Ubiquitination of both adenoassociatedvirus type 2 and 5 capsid proteins affects thetransduction efficiency of recombinant vectors[J]. J Virol, 2002,76(5):2043-2053.
[39] Jennings K, Miyamae T, Traister R, et al. Proteasome inhibitionenhances AAV-mediated transgene expression in humansynoviocytes in vitro and in vivo[J]. Mol Ther, 2005, 11(4):600-607.
[40] Przystal JM, Umukoro E, Stoneham CA, et al. Proteasome inhibitionin cancer is associated with enhanced tumor targeting by the adenoassociatedvirus/phage[J]. Mol Oncol, 2013, 7(1):55-66.
[41] Neukirchen J, Meier A, Rohrbeck A, et al. The proteasome inhibitorbortezomib acts differently in combination with p53 gene transfer orcytotoxic chemotherapy on NSCLC cells[J]. Cancer Gene Ther,2007, 14(4):431-439.
[42] Monahan PE, Lothrop CD, Sun J, et al. Proteasome inhibitorsenhance gene delivery by AAV virus vectors expressing largegenomes in hemophilia mouse and dog models :a strategy for broadclinical application[J]. Mol Ther, 2010, 18(11):1907-1916.
[43] Zhang FL, Jia SQ, Zheng SP, et al. Celastrol enhances AAV1-mediated gene expression in mice adipose tissues[J]. GeneTher, 2011, 18(2):128-134.
[44] Wang LN, Wang Y, Lu Y, et al. Pristimerin enhances recombinantadeno-associated virus vector-mediated transgene expression inhuman cell lines in vitro and murine hepatocytes in vivo[J]. JIntegr Med, 2014, 12(1):20-34.
[45] Ling C, Wang Y, Zhang Y, et al. Selective in vivo targeting ofhuman liver tumors by optimized AAV3 vectors in a murinexenograft model[J]. Hum Gene Ther, 2014, 25(12):1023-1034.
[46] Rampen A J, Jongen J L, van Heuvel I, et al. Bortezomib-inducedpolyneuropathy[J]. Neth J Med, 2013, 71(3):128-133.
[47] Voortman J, Giaccone G. Severe reversible cardiac failure afterbortezomib treatment combined with chemotherapy in a non-smallcell lung cancer patient:a case report [J]. BMC Cancer, 2006,(6):129.
[48] Petrucci MT, Giraldo P, Corradini P, et al. A prospective,international phase 2 study of bortezomib retreatment in patientswith relapsed multiple myeloma[J]. Br J Haematol, 2013, 160(5):649-659.
[49] Zhong L, Zhao W, Wu J, et al. A dual role of EGFR protein tyrosinekinase signaling in ubiquitination of AAV2 capsids and viralsecond-strand DNA synthesis[J]. Mol Ther, 2007, 15(7):1323-1330.
[50] Zhong L, Li B, Jayandharan G, et al. Tyrosine-phosphorylation ofAAV2 vectors and its consequences on viral intracellular traffickingand transgene expression[J]. Virology, 2008, 381(2):194-202.
[51] Markusic DM, Herzog RW, Aslanidi GV, et al. High-efficiencytransduction and correction of murine hemophilia B using AAV2vectors devoid of multiple surface-exposed tyrosines[J]. MolTher, 2010, 18(12):2048-2056.
[52] Qi YF, Li QH, Shenoy V, et al. Comparison of the transductionefficiency of tyrosine-mutant adeno-associated virus serotypevectors in kidney[J]. Clin Exp Pharmacol Physiol, 2013, 40(1):53-55.
[53] Qiao C, Zhang W, Yuan Z, et al. Adeno-associated virus serotype 6capsid tyrosine-to-phenylalanine mutations improve gene transferto skeletal muscle[J]. Hum Gene Ther, 2010, 21(10):1343-1348.
[54] Klimczak RR, Koerber JT, Dalkara D, et al. A novel adenoassociatedviral variant for efficient and selective intravitrealtransduction of rat Muller cells[J]. PLoS One, 2009, 4(10):e7467.
[55] Dalkara D, Kolstad KD, Guerin KI, et al. AAV mediated GDNFsecretion from retinal glia slows down retinal degeneration in a ratmodel of retinitis pigmentosa[J]. Mol Ther, 2011, 19(9):1602-1608.
[56] Aslanidi GV, Rivers AE, Ortiz L, et al. High-efficiency transductionof human monocyte-derived dendritic cells by capsid-modifiedrecombinant AAV2 vectors[J]. Vaccine, 2012, 30(26):3908-3917.
[57] Aslanidi GV, Rivers AE, Ortiz L, et al. Optimization of the capsid ofrecombinant adeno-associated virus 2(AAV2)vectors :the finalthreshold?[J]. PLoS One, 2013, 8(3):e59142.
[58] Zolotukhin I, Luo D, Gorbatyuk O, et al. Improved adeno-associatedviral gene transfer to murine glioma[J]. J Genet Syndr GeneTher, 2013, 4(133):12815.
[59] Dai X, Han J, Qi Y, et al. AAV-mediated lysophosphatidylcholineacyltransferase 1(Lpcat1)gene replacement therapy rescuesretinal degeneration in rd11 mice[J]. Invest Ophthalmol Vis Sci,2014, 55(3):1724-1734.
[60] Hakim CH, Yue Y, Shin JH, et al. Systemic gene transfer revealsdistinctive muscle transduction profile of tyrosine mutant AAV-1, -6, and -9 in neonatal dogs[J]. Mol Ther Methods Clin Dev,2014, 1 :14002.
[61] Mowat FM, Gornik KR, Dinculescu A, et al. Tyrosine capsid-mutantAAV vectors for gene delivery to the canine retina from a subretinalor intravitreal approach[J]. Gene Ther, 2014, 21(1):96-105.
[62] Qiao C, Yuan Z, Li J, et al. Single tyrosine mutation in AAV8 andAAV9 capsids is insufficient to enhance gene delivery to skeletalmuscle and heart[J]. Human Gene Therapy, Part B :Methods,2012, 23(1):29-37.
[63] Ferrari FK, Samulski T, Shenk T, et al. Second-strand synthesis is arate-limiting step for efficient transduction by recombinant adenoassociatedvirus vectors[J]. J Virol, 1996, 70(5):3227-3234.
[64] Qing K, Wang XS, Kube DM, et al. Role of tyrosine phosphorylationof a cellular protein in adeno-associated virus 2-mediated transgeneexpression[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 1997, 94(20):10879-10884.
[65] Mah C, Qing K, Khuntirat B, et al. Adeno-associated virus type2-mediated gene transfer :role of epidermal growth factor receptorprotein tyrosine kinase in transgene expression[J]. J Virol, 1998,72(12):9835-9843.
[66] Qing K, Hansen J, Weigel-Kelley KA, et al. Adeno-associated virustype 2-mediated gene transfer :role of cellular FKBP52 protein intransgene expression[J]. J Virol, 2001, 75(19):8968-8976.
[67] Qing K, Li W, Zhong L, et al. Adeno-associated virus type2-mediated gene transfer :role of cellular T-cell protein tyrosinephosphatase in transgene expression in established cell lines invitro and transgenic mice in vivo[J]. J Virol, 2003, 77(4):2741-2746.
[68] Zhong L, Chen L, Li Y, et al. Self-complementary adeno-associatedvirus 2(AAV)-T cell protein tyrosine phosphatase vectors ashelper viruses to improve transduction efficiency of conventional single-stranded AAV vectors in vitro and in vivo[J]. Mol Ther,2004, 10(5):950-957.
[69] Zhao W, Wu J, Zhong L, et al. Adeno-associated virus 2-mediatedgene transfer :role of a cellular serine/threonine proteinphosphatase in augmenting transduction efficiency[J]. GeneTher, 2007, 14(6):545-550.
[70] Jayandharan GR, Zhong L, Li B, et al. Strategies for improving thetransduction efficiency of single-stranded adeno-associated virusvectors in vitro and in vivo[J]. Gene Ther, 2008, 15(18):1287-1293.
[71] Ma W, Li B, Ling C, et al. A simple method to increase thetransduction efficiency of single-stranded adeno-associated virusvectors in vitro and in vivo[J]. Hum Gene Ther, 2011, 22(5):633-640.
[72] McCarty DM, Monahan PE, Samulski RJ. Self-complementaryrecombinant adeno-associated virus(scAAV)vectors promoteefficient transduction independently of DNA synthesis[J]. GeneTher, 2001, 8(16):1248-1254.
[73] McCarty DM, Fu H, Monahan PE, et al. Adeno-associated virusterminal repeat(TR)mutant generates self-complementaryvectors to overcome the rate-limiting step to transduction invivo[J]. Gene Ther, 2003, 10(26):2112-2118.
[74] Wang Z, Ma HI, Li J, et al. Rapid and highly efficient transductionby double-stranded adeno-associated virus vectors in vitro and invivo[J]. Gene Ther, 2003, 10(26):2105-2111.
[75] Nathwani AC, Gray JT, Ng CY, et al. Self-complementary adenoassociatedvirus vectors containing a novel liver-specific humanfactor IX expression cassette enable highly efficient transduction ofmurine and nonhuman primate liver[J]. Blood, 2006, 107(7):2653-2661.
[76] Gao GP, Lu Y, Sun X, et al. High-level transgene expression innonhuman primate liver with novel adeno-associated virus serotypescontaining self-complementary genomes[J]. J Virol, 2006, 80(12):6192-6194.
[77] Liu Y, Keefe K, Tang X, et al. Use of self-complementary adenoassociatedvirus serotype 2 as a tracer for labeling axons :implications for axon regeneration[J]. PLoS One, 2014, 9(2):e87447.
[78] McCarty DM. Self-complementary AAV vectors ; advances andapplications[J]. Mol Ther, 2008, 16(10):1648-1656.
[79] Ding W, Yan Z, Zak R, et al. Second-strand genome conversionof adeno-associated virus type 2(AAV-2)and AAV-5 is notrate limiting following apical infection of polarized human airwayepithelia[J]. J Virol, 2003, 77(13):7361-7366.
[80] Martino AT, Suzuki M, Markusic DM, et al. The genome of selfcomplementaryadeno-associated viral vectors increases Toll-likereceptor 9-dependent innate immune responses in the liver[J].Blood, 2011, 117(24):6459-6468.
[81] Wu T, Topfer K, Lin S W, et al. Self-complementary AAVs inducemore potent transgene product-specific immune responses comparedto a single-stranded genome[J]. Mol Ther, 2012, 20(3):572-579.
[82] Mitchell AM, Li C, Samulski RJ. Arsenic trioxide stabilizesaccumulations of adeno-associated virus virions at the perinuclearregion, increasing transduction in vitro and in vivo[J]. J Virol,2013, 87(8):4571-4583.
[83] Le HT, Yu QC, Wilson JM, et al. Utility of PEGylated recombinantadeno-associated viruses for gene transfer[J]. J Control Release,2005, 108(1):161-177.
[84] Ponnazhagan S, Mahendra G, Kumar S, et al. Conjugate-basedtargeting of recombinant adeno-associated virus type 2 vectors byusing avidin-linked ligands[J]. J Virol, 2002, 76(24):12900-12907.
[85] Nathwani AC, Tuddenham EG, Rangarajan S, et al. Adenovirusassociatedvirus vector-mediated gene transfer in hemophilia B[J].N Engl J Med, 2011, 365(25):2357-2365.