工作空间

文章信息

黄俊, 张诗颖, 王翻翻, 李月寒, 吴鹏, 宋吟玲. 2015
同步脱氮除硫菌的筛选鉴定及其生长特性研究
生物技术通报,2015,31(10): 184-190

Huang Jun, Zhang Shiying, Wang Fanfan, Li Yuehan, Wu Peng, Song Yinling. 2015
Screening,Identification and Characterization of Strains Coupling Nitrogen Removal with Sulfide Removal
Biotechnology Bulletin,2015,31(10): 184-190

文章历史

收稿日期:2014-12-08

同步脱氮除硫菌的筛选鉴定及其生长特性研究
黄俊1 , 张诗颖1 , 王翻翻1 , 李月寒1 , 吴鹏1 , 宋吟玲1,2     
1.苏州科技学院环境科学与工程学院,苏州 215009;
2.江苏省环境科学与工程重点实验室,苏州 215009
摘要:为促进反硝化脱硫工艺的工程化应用,从稳定运行的反硝化脱硫UASB中筛选出2株高活性自养反硝化菌H3和H7,并对其进行了鉴定和生长及反硝化特性的研究。结果表明,2株菌均为革兰氏阴性菌,16S rDNA序列分析表明,分别与Pseudomonas stutzeri CONC12和 Pseudomonas stutzeri 19smn4相似性为99.6% 和98.9%。结合生理生化特性和16S rDNA序列分析,确定两菌株都为Pseudomonas stutzeri。对两菌株的生长和反硝化特性研究表明,菌株H3和H7的生长最适起始pH为6.94和6.88,最适反硝化pH分别为6.77和6.56。H3和H7的最适生长温度为30.4℃和30.6℃,最适反硝化温度分别为31.4℃和31.2℃,两株菌种都为非耐盐菌株。
关键词脱氮除硫菌      16S rDNA      反硝化特性      非耐盐菌株     
Screening,Identification and Characterization of Strains Coupling Nitrogen Removal with Sulfide Removal
Huang Jun1 , Zhang Shiying1 , Wang Fanfan1 , Li Yuehan1 , Wu Peng1 , Song Yinling1,2     
1. School of Environmental Science and Engineering,Suzhou University of Science and Technology,Suzhou 215009;
2. Jiangsu Provincial Key Lab of Environmental Science and Engineering,Suzhou 215009
Abstract: In order to promote the engineering application of denitrification and desulfurization process, 2 highly-active autotrophic denitrifying bacterial strains H3 and H7 were screened from stable UASB with denitrification and desulfurization, and the strains were identified and characterized. Two strains were both gram negative bacteria, the 16S rDNA sequence analysis revealed that strain H3 and H7 had a similarity of 99.6%, 98.9% with Pseudomonas stutzeri CONC12 and P. stutzeri 19smn4 respectively. Combing the morphologic, physiobiochemical characteristics and the analysis of its 16S rDNA, 2 strains were identified as P. stutzeri. The results of growth and denitrification of 2 strains demonstrated that the optimal initial pH for H3 and H7 growth were 6.94 and 6.88 respectively, for denitrification were 6.77 and 6.56 respectively. The optimal temperatures for growth were 30.4℃ and 30.6℃, for denitrification were 31.4℃ and 31.2℃ respectively, both of H3 and H7 were non-resistant strains to salt.
Key words: desulfurization denitrifying bacteria      16S rDNA      denitrification characteristic      non-resistant strain to salt     

近年来,随着制药、化工、发酵等工业的迅速发展,产生了大量含氮含硫废水。氮是导致水体富营养化的主要原因,而硫化物会损害人体健康,同时可对金属产生氢脆破坏、也能加速建筑材料和艺术品等非金属材料的老化[1, 2, 3],须将其去除。一般来说,生物脱氮除硫需要反硝化细菌和硫细菌两种微生物来去除,但近年来研究证明,一些微生物能够以硝酸盐为电子受体将硫化物氧化成单质硫,相较于传统生物法分别进行脱氮、除硫,同步脱氮除硫具有节省耗氧量、缩短反应时间、减少占地面积以及可以产生单质硫利于回收等优点,对于此类能够同时利用硝酸盐和硫化物的微生物,将其称为反硝化脱硫细菌(NR-SOB)[4]

目前,对同步脱氮除硫菌的研究主要集中在脱氮硫杆菌(Thiobacillus denitrificans)。Subletee等[5]使用脱氮硫杆菌对CSTR反应器进行接种发现,其对H2S具有较高的去除率,Koenig等[6]利用富集得到的脱氮硫杆菌对以硫磺颗粒为填料的UASB进行接种,结果表明硝酸盐的去除率几乎可达100%,刘玲花等[7]以脱氮硫杆菌为工程菌,硫与石灰石为填料的滤柱去除地下水中的NO3-,结果发现去除率可以达到98%。车轩[8]、刘宏芳[9]和范立民[10]等对脱氮硫杆菌的特性研究得到菌株脱氮效果最佳的初始pH为6.85,温度为32.8℃,生长最快的初始pH为6.90,温度为29.5℃。但对于其他同步脱氮除硫菌的研究还较少,因此本研究拟从实验室稳定运行的反硝化脱硫UASB反应器中富集高效同步脱氮除硫菌,旨在提高反硝化脱硫过程的效率,优化反硝化脱硫工艺性能,还可为此工艺提供生产菌种,促进该工艺的工程化应用。

1 材料与方法 1.1 材料 1.1.1 污泥来源

 用于分离菌株的污泥来自于实验室稳定运行的UASB同步反硝化脱硫反应器中,污泥的湿密度为1.038 g/mL,MLSS=12.03 g/L,MLVSS=7.67 g/L。稳定运行时进水硫化物(以S计)、硝酸盐(以N计)和乙酸盐(以C计)的质量浓度分别为300、132和113 mg/L,当水利停留时间为12 h,进水pH在7.5左右时,去除率分别为91.4%、89.4%和87.3%,单质硫产率为83.1%。

1.1.2 培养基的制备

由于硫化物易氧化且不容易控制培养基的pH,故培养基中以硫代硫酸盐代替硫化物,富集培养基成分[10]如下:0.5% Na2S2O3·5H2O,0.4% KNO3,0.05% NH4Cl,0.05% MgCl2·6H2O,0.2% KH2PO4,0.1% NaHCO3,0.001%FeSO4·7H2O,用0.01 mol/L的NaOH调节pH至7左右,121℃灭菌20 min,Na2S2O3·5H2O滤膜过滤除菌后待培养基灭菌冷却后另外加入。分离培养基和穿刺培养基在富集培养基中分别加入2%和0.5%的琼脂。

脱氮除硫试验培养基为:Na2S·9H2O 0.9 g,KNO3 0.1 g,NaHCO3 1 g,MgCl2·6H2O 0.5 g,KH2PO4 2.0 g,蒸馏水1 000 mL,pH调节为7左右,硫化钠在滤膜过滤除菌后待培养基灭菌冷却后加入。

1.2 方法 1.2.1 菌株的富集培养和纯化分离

 取1 g反应器内污泥加入到含有99 mL无菌水的培养瓶中,并加入几粒玻璃珠,制成稀释浓度为10-2的污泥悬浮液,然后从浓度为10-2的悬浮液中取1 mL到含有9 mL无菌水的培养瓶中即成10-3污泥稀释液,依次重复稀释到10-8,将10-2到10-8污泥稀释悬浮液分别取1 mL接入含有50 mL富集培养基的培养瓶中,封口置于30℃生化培养箱中静置培养3-7 d。将产气多、浑浊度大的富集培养物进行平板划线分离,挑出单菌落进行纯化。

1.2.2 菌株的脱氮除硫实验

 将纯化分离出的菌株进行脱氮除硫试验,即将初筛菌株接种至含有100 mL脱氮除硫培养基的灭菌锥形瓶中,做2个重复,同时以未接种的培养基作为空白对照,30℃下培养2 d。测定培养前后培养液中的NO3--N及S2--S含量,对两个平行实验的结果取平均值,以空白对照的结果进行校正,然后计算各菌株的NO3--N及S2-的去除率。

1.2.3 菌株的生理生化实验和16S rDNA鉴定

 菌株的生理生化实验参照文献[11]进行鉴定,采用Ezup柱式细菌基因组 DNA 抽提试剂盒提取准备鉴定菌株的基因组DNA,以细菌的通用引物27F(5'-AGTTTGATCMTGGCTCAG-3')和1492R(5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3')进行PCR扩增,PCR扩增反应体系为DNA模板(基因组DNA 20-50 ng/μL)0.5 μL;10×Buffer(with Mg2+)2.5 μL;dNTP混合物(各2.5 mmol/L)1 μL;DNA聚合酶0.2 μL;正反引物(10 μmol/L)各0.5 μL;加双蒸水至25 μL。PCR扩增条件为:94℃ 4 min;94℃ 45 s,55℃ 45 s,72℃ 1 min,30个循环;72℃ 10 min,修复延伸;最后4℃终止反应。纯化得到的PCR产物测序委托上海生物工程技术有限公司进行,将测得的16S rDNA序列后将结果输入核糖体数据库(http://rdp.cme.msu.edu/index.jsp)进行BLAST比对,利用DNASTAR软件中MegAlign建立系统发育树。

1.2.4 温度和pH值对分离菌株生长和反硝化代谢的影响

将保存备用的菌株H3和H7分别进行两次活化、划线分离至平板表面为均一的菌落,分别用无菌生理盐水洗下菌苔,在250 mL三角瓶中装入100 mL培养液和5%菌悬液(V/V)NO3--N和S2--S设定为40 mg/L和100 mg/L,初始pH值依次调控至为3、4、5、6、7、8和9,在30℃摇床内以120 r/min振荡培养,通过培养液的OD值(λ=600 nm)的测定和NO3--N去除率的变化来判断菌体的生长和代谢情况。

同样,在250 mL三角瓶中装入100 mL培养液和5%菌悬液(V/V),NO3--N和S2--S设定为40 mg/L和100 mg/L,初始pH值依次调控7左右,温度依次设定为10、15、20、25、30、35和40℃摇床内以120 r/min振荡培养,通过测定培养液的OD值(λ=600 nm)和NO3--N去除率的变化来判断菌体的生长和代谢情况。

1.2.5 菌株的耐盐度实验

 用无菌去离子水配置盐度分别为0%、0.5%、1%、2%、4%和8%的培养基,30℃培养24 h后测定OD600值。

1.2.6 分析项目与测定方法

 所有水样经离心后取上清液进行测定,pH采用雷磁PHSJ-4A型pH计测量,NO3--N采用紫外分光光度法,NO2--N采用N-(1-萘基)-乙二胺光度法,S2--S采用亚甲蓝法分光光度法。

2 结果 2.1 脱氮除硫实验结果

从反应器内共定向分离出7株产气较多的脱氮除硫菌(编号H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7),分别进行脱氮除硫试验,30℃培养2 d后对NO3--N和S2--S去除率进行测定和计算。结果(表 1)表明,相较于空白灭菌对照的脱氮除硫率,7株菌株都具有一定的脱氮除硫率,其中以H3和H7最为显著,脱氮除硫率分别达到71%、47.8%和65.2%、44.8%。因此将H3和H7作为实验菌株进行进一步的鉴定。

表 1 初筛株的脱氮除硫试验结果/(mg·L-1
2.2 筛选菌的生理生化试验与16S rDNA序列测定

H3和H7都为革兰氏染色阴性,在固体琼脂培养基上生长时菌落呈淡黄色,粘液状。H3和H7的生理生化实验结果相似,接触酶和氧化酶测定阳性,不能使明胶液化,可水解淀粉,葡萄糖产酸实验阳性。

图 1为H3和H7的16S rDNA全长PCR扩增结果,用等量的水代替模板作阴性对照无条带出现,证明PCR扩增结果可信,菌株H3和菌株H7的16S rDNA序列长度分别为1 444 bp和1 430 bp,16S rDNA序列测定结果表明菌株H3与Pseudomonas stutzeri CONC12菌株的序列同源性为99.6%,与Pseudomonas sp. Da2菌株的序列同源性为98.8%,菌株H7与Pseudomonas stutzeri CONC12,Pseudomonas stutzeri ST27MN3和Pseudomonas stutzeri 19smn4的序列同源性都为98.9%。

图 1 H3 和H7 的16S rDNA 全长扩增结果

菌株H3和H7在系统分类中的位置如图 2图 3所示,结合菌株的菌落特征、生理生化特点以及16S rDNA基因序列,确定H3和H7都为施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)。

图 2 菌株H3 和H7 与参考菌株基于16S rDNA 序列构建的最大似然法系统发育树
图 3 菌株H3 和H7 与参考菌株基于16S rDNA 序列构建的最大简约法系统发育树
2.3 菌株的最适生长pH值和最适反硝化pH值

图 4图 5所示,起始pH由3.0增加至9.0,H3和H7的生长量都呈现先升后降的趋势,对图进行非线性拟合,可知H3的生长最适起始pH为6.94,最适反硝化pH为6.77。而H7的生长最适起始pH为6.88,最适反硝化pH为6.56。

图 4 pH 对菌株H3 生长速率和反硝化速率的影响
图 5 pH 对菌株H7 生长速率和反硝化速率的影响

图 6图 7所示,温度对菌株H3和H7的生长和反硝化活性都有明显的影响,但温度对生长的影响规律并不同于其对反硝化代谢活性的影响。当温度从10℃上升到30℃时,菌体的生长速率和反硝化代谢活性是逐渐增大的;但当温度继续升高后,菌体生长速率逐渐降低,而反硝化代谢活性会继续增加然后降低。可见,菌体H3和H7的最适反硝化温度都高于最适生长温度。对图 5结果进行非线性拟合,可得菌株H3的最适生长温度为30.4℃,最适反硝化温度为31.4℃,而菌株H7的最适生长温度为30.6℃,最适反硝化温度为31.2℃。

图 6 温度对菌株H3 生长速率和反硝化速率的影响
图 7 温度对菌株H7 生长速率和反硝化速率的影响
2.4 NaCl浓度对生长的影响

图 8显示,NaCl浓度低于1%时,对菌株H3和H7生长的影响不大,但当NaCl浓度在1%以上时,菌株H3和H7的生长受到较严重的影响。结果表明,菌株H3和H7都为非耐盐菌株。

图 8 NaCl 浓度对菌株H3 和H7 生长的影响
3 讨论

同步脱氮除硫是存在于某些菌体内的一种特殊的代谢途径,其原理是以低价硫化合物为电子供体,以硝酸盐氮为电子受体进行电子传递从而获得生长所需的能量。本实验从稳定运行的UASB工艺反硝化脱硫反应器中筛选出2株同步脱氮除硫菌,脱氮除硫率分别可以达到71%、47.8%和65.2%、44.8%。16S rDNA序列测定结果显示H3与H7都与施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)的同源性较高。目前有一些对施氏假单胞的相关报道,如周国勤等[12]为了有效控制养殖水体中的氮素污染,研究了假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)的生长特性和反硝化活性,最适生长pH为7.0-8.0,最适生长温度为30-35℃。孔瑛等[13]以二苯并噬吩(DBT)为模型化合物,筛选到一株石油生物脱硫菌Pseudomonas stutzeri,该菌能够在较短时间内将DBT降解为可溶于水的化合物。周晓黎等[14]从缺氧生物滤池筛选纯化得到一株具有高效反硝化能力的异养菌,经鉴定为施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri),且该菌的亚硝酸盐还原酶能力较强。同样,弓湃等[15]也曾研究了施氏假单胞菌亚硝酸盐还原酶基因 nirS 的转录特性,李献等[16]也曾发现Pseudomonas stutzeri菌株能够在厌氧条件下具有脱氮除硫作用,但并未对其生长及反硝化特性进行更深入的研究。本研究筛选出了同步脱氮除硫功能菌并鉴定其种属,确定了其生长和反硝化的最佳条件,但其对氮、硫的去除效果与实际工程应用的要求还有一定的差距,尤其是除硫方面,应该继续通过反应底物的定量分析确定其同步脱氮除硫的机理,来推进该菌株在高浓度含氮含硫废水处理中的应用。

4 结论

通过对稳定运行的UASB工艺反硝化脱硫反应器中的污泥进行反硝化脱硫菌的筛选分析,得到如下结论:(1)初筛了7株同步脱氮除硫菌,根据脱氮除硫实验结果筛选出2株脱氮除硫率最高的菌株H3和H7,经过菌落形态、生理生化实验和16S rDNA基因序列鉴定,确定两株都为施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri),为非耐盐菌株;(2)菌株H3和H7的生长最适起始pH为6.94和6.88,最适反硝化pH分别为6.77和6.56。H3和H7的最适生长温度为30.4℃和30.6℃,最适反硝化温度分别为31.4℃和31.2℃,两株菌种都为非耐盐菌株。

参考文献
[1] Chen Y, Cheng JJ, Creamer KS. Inhibition of anaerobic digestion process:a review[J]. Bioresource Technology, 2008, 99(10):4044-4064.
[2] Moore PK, Bhatia M, Moochhala S. Hydrogen sulfide:from the smell of the past to the mediator of the future?[J]. Trends in Pharmacological Sciences, 2003, 24(12):609-611.
[3] Mahmood Q, Zheng P, Cai J, et al. Sources of sulfide in waste streams and current biotechnologies for its removal[J]. Journal of Zhejiang University Science A, 2007, 8(7):1126-1140.
[4] Nica D, Davis JL, Kirby L, et al. Isolation and characterization of microorganisms involved in the biodeterioration of concrete in sewers[J]. International Biodeterioration & Biodegradation, 2000, 46(1):61-68.
[5] Sublette KL, Sylvester ND. Oxidation of hydrogen sulfide by continuous cultures of Thiobacillus denitrificans[J]. Biotechnology and Bioengineering, 1987, 29(6):753-758.
[6] Koenig A, Liu LH. Autotrophic denitrification of landfill leachate using elemental sulphur[J]. Water Science and Technology, 1996, 34(5):469-476.
[7] 刘玲花, 王占生. 硫/石灰石滤柱去除地下水中硝酸盐的研究[J]. 环境工程, 1995, 13(3):11-16.
[8] 车轩, 罗国芝, 谭洪新, 等. 脱氮硫杆菌的分离鉴定和反硝化特性研究[J]. 环境科学, 2008, 29(10):2931-2937.
[9] 刘宏芳, 汪梅芳, 许立铭. 脱氮硫杆菌生长特性及其对 SRB 生长的影响[J]. 微生物学通报, 2003, 30(3):46-49.
[10] 范立民, 裘丽萍, 陈家长, 等. 养殖池塘系统脱氮硫杆菌(Thiobacillus denitrificans)的分离, 生长特性及脱氮特征研究[J]. 农业环境科学学报, 2013(1):153-159.
[11] 布坎南RE, 吉本斯NE. 中国科学院微生物研究所《伯杰细菌鉴定手册》翻译组译. 伯杰细菌鉴定手册[M]. 第8版. 北京:科学出版社, 1984:643-650.
[12] 周国勤, 陈兵, 吴伟. 假单胞菌Pseudomonas stutzeri的生长特性及其反硝化活性[J]. 湛江海洋大学学报, 2004, 24(1):46-50.
[13] 周晓黎, 孔瑛, 赵金生, 等. 石油生物脱硫菌Pseudomonas stutzeri UP-1的筛选[J]. 微生物学通报, 2004, 31(3):36-41.
[14] 孙迎雪, 沈丹丹, 杨哲, 等. 一株施氏假单胞菌Pseudomonas stutzeri DN-LWX19的脱氮性能[J]. 环境工程学报, 2015, 9(1):247-252.
[15] 弓湃, 王丽英, 尚立国, 等. 固氮施氏假单胞菌亚硝酸盐还原酶基因nirS转录特性及功能鉴定[J]. 微生物学通报, 2015, 42(1):93-100.
[16] 李献, 马光庭. 生物脱氮除硫(S2-)菌株的分离和特征[J]. 广西农业生物科学, 2006, 25(1):52-55.