吉林大学学报(医学版)  2019, Vol. 45 Issue (03): 577-581     DOI: 10.13481/j.1671-587x.20190318

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高芳, 马立聪, 董文杰, 田旭阳, 党彤, 贾彦彬
GAO Fang, MA Licong, DONG Wenjie, TIAN Xuyang, DANG Tong, JIA Yanbin
整联蛋白α亚基1基因单核苷酸多态性与非贲门胃癌发病风险的关联性分析
Analysis on association between single nucleotide polymorphisms of ITGA1 gene and risk of non-cardia gastric cancer
吉林大学学报(医学版), 2019, 45(03): 577-581
Journal of Jilin University (Medicine Edition), 2019, 45(03): 577-581
10.13481/j.1671-587x.20190318

文章历史

收稿日期: 2018-09-19
整联蛋白α亚基1基因单核苷酸多态性与非贲门胃癌发病风险的关联性分析
高芳1 , 马立聪2,3 , 董文杰2 , 田旭阳3 , 党彤3 , 贾彦彬2,3     
1. 包头医学院医学技术学院微生物与免疫检验教研室, 内蒙古 包头 014060;
2. 包头医学院基础医学与法医学院病原生物学教研室, 内蒙古 包头 014060;
3. 包头医学院第二附属医院内蒙古消化病研究所, 内蒙古 包头 014030
[摘要]: 目的: 探讨整联蛋白α亚基1(ITGA1)基因单核苷酸多态性(SNP)与非贲门胃癌发病的关联性,阐明ITGA1基因多态性在非贲门胃癌发病中的作用。方法: 采用病例-对照研究设计,在内蒙古自治区包头市汉族人群中选取288例非贲门胃癌患者为病例组,社区体检281人为对照组。采用TaqMan方法对2组研究对象ITGA1基因rs1862610、rs2432143和rs2447867位点的SNP进行基因分型,采用Haploview 4.0软件构建单体型,并采用非条件性Logistic回归计算比值比(OR)及其95%可信区间(95%CI),以评估各等位基因和基因型频数分布及单体型与非贲门胃癌发病风险的关联性。结果: 2组研究对象ITGA1基因rs1862610、rs2432143和rs2447867位点的SNP与非贲门胃癌发病风险无关联(P>0.05);rs1862610和rs2432143位点的SNP存在强连锁不平衡(D’=1),构成单体型块,与携带单体型CT者比较,携带单体型CC者非贲门胃癌的发病风险升高(CC vs CTOR=1.42,95% CI1.02~1.99)。结论: 在内蒙古自治区包头市汉族人群中ITGA1基因多态性可能在非贲门胃癌的发病中起一定作用,携带SNP rs1862610-rs2432143 CC单体型者非贲门胃癌的发病风险升高。
关键词: 整联蛋白α亚基1    基因多态性    胃肿瘤    遗传易感性    
Analysis on association between single nucleotide polymorphisms of ITGA1 gene and risk of non-cardia gastric cancer
GAO Fang1 , MA Licong2,3 , DONG Wenjie2 , TIAN Xuyang3 , DANG Tong3 , JIA Yanbin2,3     
1. Department of Microbiology and Immunology Laboratory, School of Medical Technology, Baotou Medical College, Baotou 014060, China;
2. Department of Pathogenic Biology, School of Basic Medicine and Forensic Medicine, Baotou Medical College, Baotou 014060, China;
3. Inner Mongolia Institute of Digestive Diseases, Second Affiliated Hospital, Baotou Medical College, Baotou 014030, China
[ABSTRACT]: Objective: To investigate the associations between single nucleotide polymorphisms (SNP) of integrin α-subunit 1 (ITGA1) gene and the risk of non-cardia gastric cancer, and to elucidate the roles of ITGA1 gene polymorphisms in the risk of non-cardia gastric cancer. Methods: The case-control study design was used. A total of 288 patients with non-cardia gastric cancer were selected as case group, and 281 community physical examinees were selected as control group in Han population in Boatou City in Inner Mongolia Autonomous Region. The SNP of rs1862610, rs2432143, and rs2447867 sites of subjects in two groups were genotyped by using TaqMan method, and the haplotype was constructed by Haploview software 4.0. The odds ratio (OR) and 95% confidence intervals (95%CI) were measured by conditional Logistic regression analysis to evaluate the correlations between the frequencies of allele, genotype, and haplotypes and the susceptibility to non-cardia gastric cancer. Results: The SNP of rs1862610, rs2432143, and rs2447867 sites in ITGA1 gene were not associated with the risk of non-cardia gastric cancer (P>0.05). The SNP of rs1862610 and rs2432143 sites were in strong linkage disequilibrium(D'=1) and formed a block. Compared with those who carried haplotype CT, those who carried haplotype CC had an increasing risk of non-cardiac gastric cancer(CC vs CTOR=1.42, 95% CI1.02-1.99). Conclusion: The ITGA1 gene polymorphisms may play a role in the risk of non-cardia gastric cancer in Han population in Baotou in Inner Mongolia Autonomous Region. The risk of non-cardia gastric cancer in the person who carries the SNP rs1862610-rs2432143 CC haplotype is increased.
KEYWORDS: integrin α-subunit 1     polymorphism     stomach neoplasms     susceptibility    

中国胃癌的发病率和死亡率均较高,胃癌是一种常见的恶性消化道肿瘤。国际癌症研究机构(IARC)报告[1]显示:78%的胃癌是由幽门螺杆菌感染引起的。全球有半数以上的人感染幽门螺杆菌,却只有极少数发展成胃癌,幽门螺杆菌引起的胃损伤在不同个体间的差异较大,提示宿主的遗传因素在胃癌的发生发展过程中发挥了重要作用。目前一些全基因组扫描和病例-对照关联研究结果显示个体的单核苷酸多态性(SNP)与胃癌的遗传易感性有关联,如王琦等[2]采用全基因组扫描的方法发现在高频的杂合性缺失(loss of heterozygosity, LOH)位点附近,可能存在胃癌发病相关基因;荟萃分析[3-4]结果显示:SNP与胃癌的遗传易感性有关联。然而同一个SNP在不同的人群中对疾病的发病风险所起的作用可能不同。

整联蛋白超家族成员是以αβ异二聚体形式存在的受体蛋白,介导细胞之间以及细胞和细胞基质间的相互联系[5],目前已发现18种α亚基、8种β亚基,形成了24种整联蛋白受体[5]。研究[6]显示:整联蛋白α亚基1(integrin α-subunit 1, ITGA1)基因的SNP在韩国人群中可能与胃癌的遗传易感性有关联,但在其他人群中关于二者之间的关系尚未见报道。本研究探讨了中国内蒙古自治区包头市汉族人群中ITGA1基因多态性与非贲门胃癌发病风险的关联性,旨在为胃癌的早期诊断和防治提供依据。

1 资料与方法 1.1 一般资料

选择2008年9月—2010年6月内蒙古自治区包头市肿瘤医院经组织病理学诊断为非贲门胃癌的患者288例作为病例组;患者均未接受过化疗和放疗,排除继发病例和复发病例;其中男性224例,女性64例,年龄26~83岁,平均年龄为(59.48±11.23)岁。对照组研究对象来自同期社区体检人群,共281人;均无癌症病史和明显的胃部疾病,排除高血压和糖尿病等疾病;其中男性220人,女性61人,年龄26~85岁,平均年龄为(59.10±11.57)岁。所有研究对象均为汉族,在内蒙古自治区包头市居住5年以上。对照组研究对象与病例组患者年龄和性别相匹配(年龄:t=0.40, P=0.69;性别:χ2=0.02, P=0.88)[7-9]。所有研究对象均签署知情同意书,本研究获得包头医学院伦理委员会批准。

1.2 SNP选择和基因分型

SNP的选择遵循以下规则;①根据HapMap数据库(http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov)中国人的资料,使用Agorithm-Tagger-Pairwise Tagging软件筛选标记单核苷酸多态性(TagSNP),设置MAF> 5%、r2> 0.8。②在筛选出的TagSNP中,选择有文献报道的可能与疾病有关联的SNP进行研究。YIM等[6]研究显示:ITGA1基因rs1862610、rs2432143和rs2447867位点的SNP在韩国人群中与胃癌的发病风险有关联。因此本研究探讨上述3个SNP与非贲门胃癌发病风险的关系。

采用血液基因组DNA提取试剂盒(北京天根公司)提取人外周血白细胞中的基因组DNA。采用TaqMan方法进行基因分型,引物、FAM和VIC标记探针均由美国Applied Biosystems公司设计并合成,实验设阴性和阳性对照,严格按照说明书进行操作。3个SNP基因分型的成功率均大于98%,该步骤由北京诺赛基因组有限公司完成。

1.3 统计学分析

采用SPSS 16.0统计软件进行统计学分析。2组研究对象的平均年龄以x±s表示,组间比较采用t检验;性别构成比组间比较采用χ2检验。采用χ2检验检测对照组研究对象的基因型分布是否遵循Hardy-Weinberg平衡;采用Haploview 4.0软件对SNP位点进行连锁不平衡分析,并采用D’置信区间法划分单体型块(LD block)。采用非条件性Logistic回归评估各等位基因、基因型和单体型与非贲门胃癌发病风险的关系,以比值比(odds ratio, OR)和95%可置信区间(confidence interval, CI)表示。以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果 2.1 2组研究对象3个位点的SNP与非贲门胃癌发病风险的关联性

对照组研究对象rs1862610、rs2432143和rs2447867位点SNP的基因型频数分布均符合Hardy-Weinberg平衡(rs1862610: χ2=0.029, P=0.864; rs2432143: χ2=0.649, P=0.420; rs2447867: χ2=0.335, P=0.562)。3个位点的SNP均与非贲门胃癌发病风险无关联。3个SNP位点的等位基因和基因型频数分布见表 1

表 1 2组研究对象3个位点的SNP与非贲门胃癌发病风险的关联 Tab. 1 Associations between SNP of three sites and risk of non-cardia gastric cancer
Group n rs1862610 rs2447867 rs2432143
CC AC AA AC/AA C A CC CT TT CT/TT C T TT CT CC CT/CC T C
Control 281 106 (38.41) 129 (46.74) 41 (14.86) 170 (61.59) 341 (61.78) 211 (38.22) 199 (72.63) 67 (24.45) 8 (2.92) 75 (27.37) 465 (84.85) 83 (15.15) 109 (38.93) 135 (48.21) 36 (12.86) 171 (61.07) 353 (63.04) 207 (36.96)
Case 288 97 (34.04) 147 (51.58) 41 (14.39) 188 (65.96) 341 (59.82) 229 (40.18) 118 (41.11) 120 (41.81) 49 (17.07) 169 (58.89) 356 (62.02) 218 (37.98) 191 (67.02) 81 (28.42) 13 (4.56) 94 (32.98) 463 (81.23) 107 (18.77)
OR (95% CI) 1 1.13 (0.69-1.86) 0.91 (0.55-1.52) 0.83 (0.59-1.17) 1 0.92 (0.72-1.17) 1 0.82 (0.57-1.18) 1.27 (0.77-2.10) 0.92 (0.65-1.28) 1 1.05 (0.82-1.33) 1 0.75 (0.29-1.90) 0.59 (0.24-1.46) 0.77 (0.53-1.11) 1 0.78 (0.57-1.06)
Note:Sum of column did not add up to total study subjects because of missing data; OR:Odds ratio (95% CI) was adjusted for age and gender.
2.2 单体型与非贲门胃癌发病风险的关联性

对ITGA1基因的3个SNP进行连锁不平衡分析,结果显示rs1862610和rs2432143之间存在强连锁不平衡(D’=1),构成单体型块(Block 1),与携带CT单体型比较,携带CC单体型可使非贲门胃癌的发病风险增高。见表 2

表 2 单体型与非贲门胃癌发病风险的关联性 Tab. 2 Associations between haplotypes and risk of non-cardia gastric cancer
Block Haplotype Control
(η/%)
Case
(η/%)
OR (95% CI)b
Block 1a
CT 47.15 41.35 1
AT 38.08 40.14 1.20(0.93-1.55)
CC 14.77 18.51 1.42 (1.02-1.99)
a:SNP order was rs1862610-rs2432143;b:Adjusted for age and gender.
3 讨论

胃癌是复杂的多基因疾病,环境因素和个体的遗传因素共同作用导致了胃癌的发生。在中国和韩国等胃癌高发国家,大多数胃癌患者是由幽门螺杆菌感染导致的。幽门螺杆菌感染可引起炎症,使患者逐渐发展为慢性浅表性胃炎,进而经历慢性萎缩性胃炎、肠上皮化生等癌前病变,最终发展成胃癌[10]。幽门螺杆菌能通过cagL蛋白与胃上皮细胞的整联蛋白结合,从而使其主要的毒力因子cagA进入细胞,引起疾病[11]。研究[12-13]显示:整联蛋白能通过调控不同的信号通路调节细胞的增殖、分化、存活和基因的转录等功能。同时,整联蛋白也参与了机体大量的病理过程,在癌变的发生发展中发挥重要作用[14]

ITGA1基因位于染色体5q11.2,编码ITGA1。研究[15-16]提示:ITGA1参与了胃癌的发生发展,例如在胃癌细胞中ITGA1表达水平升高,参与了胃癌细胞的腹膜播散,在胃癌迁移和侵袭过程中发挥了重要的作用。ITGA1能通过小凹蛋白1(caveolin-1)与酪氨酸激酶FYN结合,进而募集生长因子受体结合蛋白2(Grb2)活化Ras/ERK信号通路,调控细胞的增殖[17]。而caveolin-1和Grb2均在胃癌的发生发展中起重要的作用[18-19]。ITGA1基因是研究胃癌遗传易感性的重要候选基因,其基因多态性可能与胃癌的发病风险有关联。

目前,关于ITGA1基因多态性与胃癌发病风险的关系仅见1篇报道[6]。在韩国中部地区人群中,YIM等[6]收集了477例经组织病理学诊断为胃癌的患者和年龄、性别与患者相匹配的正常对照者477人,探讨了ITGA1基因多态性与胃癌发病风险的关联性,结果显示:rs1862610、rs2432143和rs2447867位点的SNP与胃癌发病风险有关联。rs1862610携带AC+AA基因型者胃癌发病风险高于携带CC基因型者(AC+AA vs CC: OR=1.337, 95%CI:1.029~1.737);rs2432143携带TC基因型者发生胃癌的风险是携带TT基因型的1.517倍(TC vs TT: OR=1.517, 95%CI:1.144~2.011);rs2447867携带TC + TT基因型者胃癌发病风险高于携带CC基因型者(TC + TT vs CC: OR=1.412, 95%CI:1.061~1.881);rs1862610和rs2432143形成的单体型CC可降低胃癌的发病风险。然而,同一个SNP在不同的人群中对胃癌发病风险所起的作用可能不同。因此,本研究以中国内蒙古自治区包头地区汉族人群为样本,探讨3个位点SNP与非贲门胃癌发病风险的关联性,发现rs1862610、rs2432143和rs2447867位点的SNP与非贲门胃癌的发病风险无关联。但SNP rs1862610和rs2432143位点的SNP之间存在强连锁不平衡(D’=1),构成单体型块,与单体型CT比较,单体型CC可增加非贲门胃癌的发病风险(CC vs CT: OR=1.42, 95% CI=1.02~1.99),这与YIM等[6]研究结果不同。

本研究与YIM等[6]研究结果有差异可能与以下因素有关:①研究样本来自不同的人群,由于人种结构的差异造成了结果的不同。②病例的选择标准差异造成。由于胃非贲门癌和贲门癌在病因、病理、癌变以及预后等方面均存在较大差异[20],为了保证样本的均质性,本研究将患者限制为非贲门胃癌。而YIM等[6]研究的纳入标准并无这一限制。③胃癌的发生是遗传因素和环境因素共同作用所致,本研究并未涉及环境因素,而YIM等[6]的研究也只调整了吸烟和饮酒的影响,二者研究结果的不同可能是样本暴露于不同的环境因素造成的,但具体的原因还需进一步研究确定。本研究存在一些不足,首先样本量相对较少;其次所研究SNP位点的功能尚不清楚,因此本研究结果还需扩大样本量并进一步进行功能实验来证实。

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