疾病监测  2017, Vol. 32 Issue (7): 603-608

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赵红庆, 徐萍, 周声安, 胡守奎
ZHAO Hong-qing, XU Ping, ZHOU Sheng-an, HU Shou-kui
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌不同来源株耐药性及流行特征分析
Analysis of epidemiological characteristics and drug resistance of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains with different sources
疾病监测, 2017, 32(7): 603-608
Disease Surveillance, 2017, 32(7): 603-608
10.3784/j.issn.1003-9961.2017.07.018
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌不同来源株耐药性及流行特征分析
赵红庆1, 徐萍2, 周声安3, 胡守奎1,4     
1. 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所, 传染病预防控制国家重点实验室, 北京 102206;
2. 合肥市51中学, 安徽 合肥 230061;
3. 日照市莒县人民医院, 山东 日照 276500;
4. 北京大学首钢医院, 北京 100144
摘要目的 探索耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)在动物食品、动物临床及人医临床中的分布和流行情况,对其耐药情况进行研究分析,为控制MRSA的感染和临床用药提供理论支持。方法 对采集安徽省不同地区动物食品、动物临床及人医临床的标本进行分离培养。采用法国生物梅里埃公司的Vitek全自动微生物分析系统,对分离菌株进行细菌鉴定和药敏试验;应用聚合酶链反应(PCR)方法检测mecA基因;应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对MRSA进行脉冲电泳,BioNumerics软件进行聚类分析。结果 从安徽省淮北、合肥和马鞍山地区共采集动物性食品450份、动物临床标本90份、人医临床标本150份。共分离MRSA 82株,其中动物性食品MRSA(Food-MRSA)14株、动物临床MRSA(La-MRSA)23株、人医临床MRSA(Hu-MRSA)45株,分离培养率为3.1%、30.0%和25.6%;不同来源的MRSA菌株对万古霉素、达福普丁和利奈唑胺100%敏感;对青霉素和苯唑西林100%耐药;对头孢唑啉、红霉素、克林霉素、四环素、庆大霉素、左氧氟沙星、利福平、甲氧嘧啶和氨苄西林有不同程度的耐药,但不同来源MRSA间无差异。82株不同来源的MASA经PFGE分型可分为49个型别,同源性较低。结论 动物临床标本和人医临床标本的MRSA的分离培养率显著高于动物食品的分离率,不同来源的MRSA在药物敏感性方面差异无统计学意义。PFGE和聚类分析显示,安徽省不同地区不同来源的MRSA其亲缘关系较远,显示其菌株来源的多克隆特征。
关键词金黄色葡萄球菌    分离鉴定    耐药性分析    流行特征    
Analysis of epidemiological characteristics and drug resistance of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains with different sources
ZHAO Hong-qing1, XU Ping2, ZHOU Sheng-an3, HU Shou-kui1,4     
1. State Key Laboratory for Communicable Disease Prevention and Control, Institute for Communicable Disease Prevention and Control, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 102206, China;
2. No.51 Middle School of Hefei, Hefei 230061, Anhui, China;
3. Juxian County People's Hospital, Rizhao 276500, Shandong, China;
4. Peking University Shougang Hospital, Beijing 100144, China
This study were supported by National Major Science and Technology Project for the Prevention and Control of Priority Infectious Disease (No.2011ZX10004101 & 2013ZX10004101), Youth Scholar Scientific Research Foundation of Chinese Center for Disease Control and Prevention (No.2015A102)
Corresponding author: HU Shou-kui, Email:hushoukui@icdc.cn.
Abstract: Objective To understand the distributions and drug resistance of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains isolated from animal food samples, animal clinical samples and human clinical samples, and provide theoretical support for the control of MRSA infection and clinical treatment. Methods Animal food samples, animal clinical samples and human clinical samples were collected from different areas of Anhui province for MRSA isolation and culture. The identification and drug susceptibility testing were done using Vitek auto-microbiological analysis system. The mecA was detected with PCR, and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and homology analysis of MRSA with software BioNumerics were conducted. Results A total of 690 samples of 3 kinds of samples, including 450 animal food samples, 90 animal clinical samples and 150 human clinical samples, were collected from Huaibei, Hefei and Maanshan of Anhui and 82 MRSA strains were isolated, including 14 strains from animal food samples (3.1%), 23 strains from animal clinical samples (30.0%) and 45 strains from human clinical samples (25.6%). The drug susceptibility test indicated that all the 82 isolates were sensitive to vancomycin, linezolid and dalfopristin, but resistant to penicillin and oxacillin, and all the isolates had different resistances to cefazolin, erythrocin, clindamycin, tetracycline, gentamicin, levofloxacin, rifampicin, sulfamethoxydiazine and ampicillin, the differences among the isolates with different sources were not significant. PFGE results showed that the 82 isolates had 49 PFGE patterns, indicating that they shared low homologies. Conclusion The isolation rates of MRSA in animal clinical samples and human clinical samples were higher than that in animal food samples. The differences in drug susceptibility among the isolates with different sources had no significance. PFGE and homology analysis showed that all the isolates had weak genetic relationship, indicating polyclonal characteristics of the isolates.
Key words: Staphylococcus aureus     Isolation and identification     Analysis of drug resistance     Epidemiological characteristics    

随着抗菌药物的广泛使用,耐药性细菌的出现成为全球不容忽视的严重问题,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)是目前世界范围内人医和兽医临床上的常见病原菌[1-3]。自1961年英国首次发现MRSA之后,便以惊人的速度在世界各地蔓延。近年来,MRSA的临床分离率呈明显上升趋势,并且对各种常用抗生素耐药,给临床治疗带来了严峻挑战,因此受到了全球广泛关注和重视[4-6]。Devriese等[7]报道在患乳腺炎的奶牛奶汁中检出MRSA以后,许多不同种动物如犬、猫、马、羊、猪、牛及家禽中均检出MRSA。有证据表明农场中家畜和人携带的MRSA存在交叉传播,且养殖猪、牛等的农场中MRSA的分离率高于养鸡场[8-9]。本研究对安徽省MRSA在动物食品、动物临床及人医临床中的分布和流行情况进行分析,对其耐药情况进行研究,旨在为控制MRSA的感染和临床用药提供理论支持。

1 材料与方法 1.1 菌株来源

质控菌株为金黄色葡萄球菌ATCC29213和粪肠球菌ATCC29212,购自中国食品药品检定研究院。食源、动物源和人源菌株于2012年3-12月期间,分别采集于安徽省淮北、合肥和马鞍山地区的农贸市场、屠宰场,奶牛场及三甲医院。每个市选取10家农贸市场,每个农贸市场采集15份标本。

1.2 仪器和试剂

聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)仪器购自美国BIO-RAD公司;VITEK-32微生物分析仪及配套比浊仪购自法国生物梅里埃公司;DYY-10C型电泳仪购自北京六一仪器厂;CHEF-MAPPER脉冲场电泳仪及Universal Hood Ⅱ凝胶成像仪购自美国BIO-RAD公司。GPI鉴定卡和GPS药敏卡由法国生物梅里埃公司生产;头孢西丁纸片(FOX 30 μg)购自Oxoid公司;PCR引物由上海生物工程公司合成;Taq DNA聚合酶、dNTP、上样缓冲液及DNA Marker DL2000购于大连宝生物公司;琼脂糖购自上海东海制药厂;MH琼脂购自杭州天和微生物试剂厂。

1.3 方法 1.3.1 样品的采集、菌株的分离培养及鉴定

动物性食品标本的采集:分别采集淮北、合肥和马鞍山地区农贸市场的家畜及家禽肉类25 g。盛放于无菌试管或容器中,具体分离培养参照GB 4789.10-2010进行。动物临床标本的采集:采集合肥市某屠宰场刚宰杀的猪鼻腔拭子60份,快速放入装有2 ml 7.5% NaCl肉汤的5 ml试管中,封口摇匀,做好标记。标本接种于羊血琼脂平板上,35 ℃孵育培养18~24 h。人医临床标本的采集:采用常规方法采集门诊和住院患者的标本,主要是其炎性组织液或带血的脓性分泌物。标本接种于羊血琼脂平板上,35 ℃孵育培养18~24 h。

1.3.2 MRSA菌株的筛选

所有MRSA菌株按细菌鉴定程序,采用法国生物梅里埃公司的VITEK-32全自动微生物分析系统的GPI卡进行鉴定,鉴定为金黄色葡萄球菌,同时进行补充试验,包括革兰染色、触酶试验、血浆凝固酶试验,所有MRSA菌株均为阳性。应用临床实验室标准化委员会(CLSI)推荐的头孢西丁纸片扩散法进行筛选。抑菌圈≤19 mm为耐药,≥20 mm为敏感。抑菌圈内有任何小菌落生长都应判断为MRSA。

1.3.3 MRSA的确认

用PCR方法检测mecA基因进行确认。引物序列和扩增条件参照文献[10]进行。引物由上海生物工程公司合成。模板的提取采用煮沸方法,PCR反应体系25 μl,其中Taq酶0.2 μl、10×Buffer缓冲液2.5 μl、dNTP 1 μl、上游引物1 μl、下游引物1 μl、模板1 μl,无菌双蒸馏水补足25 μl;热循环参数为:94 ℃预变性5 min,94 ℃ 30 s,48 ℃ 30 s,72 ℃ 45 s,循环30次,最后72 ℃延伸5 min;电泳并在紫外凝胶成像仪下观察及记录结果。

1.3.4 药物敏感试验

采用VITEK-32微生物分析仪GPS109药敏板对82株MRSA进行检测,共检测MRSA对14种抗菌药物的耐药性。14种抗菌药物分别为万古霉素、利奈唑烷、利福平、喹努普汀/达福普汀、四环素、甲氧苄啶/磺胺异恶唑、头孢唑啉、左氧氟沙星、庆大霉素、氨苄西林、氯洁霉素、红霉素、苯唑西林和青霉素G。操作过程严格依照说明书进行。

1.3.5 脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel eletrophoresis, PFGE)

参照美国CDC的PulseNet实验手册[11]。从培养皿上刮取适量细菌,均匀悬浊于2 ml细胞悬浮液(cell suspension buffer, CSB)中,浊度仪调节其麦氏浊度值为4.0,取400 μl CSB 37 ℃孵育5 min后加入20 μl蛋白酶K混匀。将菌悬液与400 μl 1% Seakem Gold:1%SDS慢慢混匀后加入模具,避免产生气泡,室温下凝固10~15 min后制成胶块。将胶块移入装有5 ml细胞裂解液(cell lysis solution, CLB)中,54 ℃水浴摇床(转速约130 r/min)中孵育2 h。弃去CLB后加入50 ℃预热的纯水,于50 ℃水浴摇床中清洗2次。每次10 min,然后用TE清洗4次,重复以上步骤,每次15 min。切取2 mm宽的胶块放入150 μl Sma Ⅰ酶切缓冲液中37 ℃缓冲10~15 min。吸出缓冲液,加入酶切液,每个菌株用酶40 U,H9812使用Xba Ⅰ酶切。确保胶块在液面下,37 ℃至少孵育2 h。吸出酶切液,每管加入200 μl 0.5×TBE,将胶块黏在梳子齿上,室温静置5 min后,用100 ml 1%金胶琼脂糖(Seakem Gold Agarose, SKG)将胶条浸润,室温凝固30 min后电泳。电泳条件为0.5×TBE,电压6.0 V/cm,120 °夹角,脉冲切换时间为2~50 s,时间22 h。电泳结束后,将胶块放入1 μg /ml EB中,染色300 min,然后用纯水脱色60 min,读胶仪中观察拍照。

2 结果 2.1 样品的采集和不同来源MRSA的检出结果

分别从安徽省淮北、合肥和马鞍山地区采集人医临床标本、动物源性食品标本、猪鼻腔拭子和养牛场奶牛乳液标本。经分离培养和鉴定,MRSA的检出结果见表 1

表 1 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分离情况 Table 1 Isolation of MRSA
样品类别 数量 耐甲氧西林金黄色
葡萄球菌菌株数
耐甲氧西林金黄色
葡萄球菌阳性率(%)
人医临床标本 150 45 30.0
动物食品标本 450 14 3.1
动物临床标本 90 23 25.6
合计 690 82 11.9
2.2 MRSA的鉴定结果

经头孢西丁纸片扩散法筛选到82株MRSA,对其进行mecA基因检测,凝胶成像系统观察310 bp处出现荧光条带,82株MRSA均携带mecA基因。部分PCR结果扩增电泳见图 1

图 1 部分菌株mecA基因PCR扩增产物电泳结果 Figure 1 Electrophoretogram of mecA PCR products of some MRSA isolates
2.3 不同来源MRSA药敏实验结果

所有菌株对青霉素G、氨苄西林100%耐药,对红霉素、苯唑西林、头孢唑啉、克林霉素、庆大霉素及左氧氟沙星的耐药率较高,对甲氧苄啶/磺胺异恶唑、利福平、四环素的耐药率较低,对万古霉素、奎努普丁/达福普丁和利奈唑胺均100%敏感。82株菌株药敏实验结果见表 2

表 2 不同来源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌药敏检测结果 Table 2 Drug susceptibility test results of MRSA strains with different sources
抗生素 人源(n=45) 动物源(n=23) 动物食品源(n=14)
耐药株数 耐药率(%) 耐药株数 耐药率(%) 耐药株数 耐药率(%)
青霉素 45 100 23 100 14 100
苯唑西林 45 100 23 100 14 100
氨苄西林 45 100 21 92 13 93
庆大霉素 35 78 18 77 10 75
红霉素 35 78 15 67 11 80
四环素 25 56 12 52 8 55
克林霉素 39 87 20 89 12 81
利福平 10 23 4 19 3 20
左氧沙星 40 89 19 83 12 81
甲氧嘧啶 30 66 14 60 9 67
头孢唑林 41 92 21 91 12 86
达福普丁 0 0 0 0 0 0
利奈唑胺 0 0 0 0 0 0
万古霉素 0 0 0 0 0 0
2.4 MRSA的PFGE结果

82株不同来源的MRSA经Sma Ⅰ酶切,PFGE电泳,所得图像经BioNumerics 5.0软件进行聚类分析,应用非加权平均法(UPGMA),聚类相似性系数采用基于条带比较的Dice。Dice=2×N/(N+M),N表示能匹配的条带个数,M表示所有的条带个数(2株菌带型上的条带数总和减去匹配的条带数)。结果见图 2,不同来源株MASA经PFGE分型可分为49个型别,不同来源MRSA的PFGE型别各不相同,同源性较低。

图 2 安徽省82株不同来源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌PFGE-SmaⅠ酶切结果 Figure 2 PFGE patterns digested by SmaⅠ of 82 MRSA strains with different sources in Anhui
3 讨论

MRSA自1961年初次发现以来,随着时间的推移,其感染几乎遍及世界各地的各级医院和临床各注:M:DL2000 DNA Marker,1:人医临床分离株;2:动物食品标本分离株;3~5:动物临床标本分离株;6:ATCC259237(阴性对照);7:ATCC43300(阳性对照)科室,在我国也呈逐年增多趋势。由于抗生素的大量使用,MRSA耐药率逐年增高,耐药程度不断增大,多重耐药现象也日趋严重,MRSA感染的流行和暴发时有发生。MRSA与乙型肝炎、艾滋病共同被列为世界范围内最难解决的三大感染性顽疾[12],是临床医学非常关注的严重感染问题。因而加强MRSA的监测、耐药机制研究及分子流行病学研究变得尤为迫切,其结果有助于指导临床制定针对性的预防和控制措施。

MRSA的感染和耐药在人医临床和兽医临床均有报道[13-14],然而将人源、动物源与食源性MRSA综合在一起进行分析和研究,国内尚未见报道。本研究分别从安徽省淮北、合肥和马鞍山3个地区采集标本,3个地区分别处于安徽的皖北、皖中及皖南,地理位置覆盖安徽全境,有一定的区域代表性。本研究结果显示:动物性食品如鸡腿,猪肉等MRSA的携带率相对较低(3.1%),而人医临床(浓汁及伤口分泌物等)和动物标本(猪鼻腔拭子及奶牛场生奶)MRSA携带率较高,分别达到30.0%和25.6%。在我国,医院和社区获得性感染革兰阳性细菌耐药监测研究显示,2001年MRSA的分离率为37.4%[15-16],2002-2003年增加到41.0%[17]。2005年我国5家教学医院革兰阳性球菌耐药监测研究显示,MRSA分离率已达到51.3%,其中上海市的发生率高达78.4%[18]。本研究中安徽地区的MRSA的分离阳性率略低于全国平均水平。

本试验证明MRSA已经在与人类生活密切相关的动物身上出现。其中在奶牛乳房炎感染中,MRSA菌株的出现呈上升趋势,可能与近年来给动物(尤其是奶牛等经济价值较高的动物)滥用抗生素,导致金黄色葡萄球菌产生耐药相关。本研究发现合肥地区奶牛MASA携带率高达30%。MRSA在奶牛和动物身上的检出对食品卫生安全将是一个非常严峻的考验。

本研究显示,不同来源的MRSA菌株对万古霉素、达福普丁及利奈唑胺100%敏感,结果表明糖肽类抗生素如万古霉素仍可有效治疗MRSA感染;而对包括甲氧西林在内的所有β-内酰胺类抗生素都产生了耐药性,如青霉素和苯唑西林100%耐药;不同来源MRSA对头孢唑啉、红霉素、克林霉素、四环素、庆大霉素、左氧氟沙星、利福平、甲氧嘧啶和氨苄西林有不同程度的耐药,但不同来源MRSA间无差异。

PFGE是目前国内外流行病学研究广泛接受的分型方法之一,与其他方法相比,具有重复性好、分辨率高、分辨力强、结果稳定、易于标准化的优点,能在细菌基因组很庞大的情况下,尽可能反映较多的变异信息,被誉为细菌分子生物学分型技术的“金标准”[19]。PFGE方法主要被广泛应用于追踪监测细菌传染性疾病的暴发流行[20],还有助于识别散发病例的传染源。最近的研究证实,PFGE与公认的适合于MRSA的MLST结果相比符合率超过95%。PFGE同样能鉴别MRSA的稳定谱系,同样可以用于追踪这些谱系克隆洲际的长时期传播[21-22]。但是使用PFGE研究金黄色葡萄球菌的长期进化在总体上,特别是MRSA的适用性仍存在争议[23]。本研究将82株MRSA分为49个PFGE型别,不同来源MRSA的PFGE型别各不相同,同源性较低,显示不同来源MRSA的多克隆性。PFGE是一种较为有效的分型及同源性分析的科学方法,能够从基因水平上阐释菌株之间的同源性关系,将在食源性疾病的防控及食品污染控制等方面有良好的应用前景。

作者贡献:

赵红庆  ORCID:0000-0002-4423-0612

徐萍  ORCID:0000-0002-6788-7289

赵红庆:文章撰写,审阅、定稿

徐萍:数据收集,结果分析

周声安:实验研究

胡守奎:实验设计,文章修改

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